Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

• 2020. január 28-tól 2020. február 23-ig;
• február 24-től március 6-ig;
• március 7-től március 21-ig;
• március 22-től április 3-ig;
• április 3-től 14-ig;
• április 15-től 25-ig;
• április 26-tól május 15-ig;
• május 16-tól június 1-ig;
• június 1-től június 14-ig;
• június 15-től június 30-ig;
• július 1-től július 20-ig;
• július 21-től augusztus 31-ig;
• szeptember 1-től szeptember 27-ig,
• szeptember 28-tól október 25-ig,
• október 26-tól november 22-ig;
• 2020. november 23-tól 2021. január 8-ig.

2020. január 9-én regisztrálták az első COVID-halálesetet Kínában. Azóta hivatalosan 1,924 millió fő vesztette életét a járványban világszerte. Emellett dokumentálható — konzervatív módszerekkel (azaz minimálisan) — 714312 fő addicionális járványhalálozás, ami nem csoda egy olyan járványnál, ahol a fertőzés nyomán embereket gyakran vérrögök ölnek meg különféle érkatasztrófák nyomán, illetve ahol a világ számos egzotikus országából jönnek úgynevezett "hivatalos adatok". Az összesített járványhalálozás így konzervatívan 2,6 millió fő felett van a halálozások első teljes éve nyomán (2 638 312<).

Az alábbi táblázat a járvány teljes populációhoz viszonyított mortalitását tekinti át a legsúlyosabban érintett területek esetében. Az ilyen mortalitás azért érdekes információ, mert az itt szereplő arányoknál a fertőzési-halálozási arány (Infection Fatality Rate, IFR) nem lehet alacsonyabb az adott populációkban. Csak magasabb — a továbbiakban. Ha pedig a hivatalosan nem-regisztrált halálesetekre gondolunk, igazából már most magasabb az itt jelzettnél a teljes népességhez viszonyított járványmortalitás. Viszonyításképpen: a 0,25-ös érték pl. azt jelenti, hogy az adott populációból hivatalosan is minden négyszázadik ember meghalt COVID-ban a jelzett időszakban (2020.01.09-2021.01.08.).

 ------------------------

Közben a vírus evolúciója halad előre, és különösen a dél-afrikai változat mutatkozik egy potenciális vakcinaszökevény előfutárának (egyelőre a vakcinák szerencsére működőképesnek ígérkeznek ellene). Engedtessék meg itt némi — más körülmények között elvetendő — vírusantropomorfizáció, hogy a stratégiai gondolkodás jegyében egy ellenlábas szereplő magatartásaként modellezzük azt, ami a vírus effektív hatása az ökoszisztémára, melyben kering. A SARS-CoV-2 trükkös. Úgy öl, hogy az emberiség gondatlanabbik és részvétlenebbik egyedeinek tömegeivel együttműködve tovább ölhessen. Ha nem vigyázunk, sakkmattot ad a maga türelmes módján. Ezt a sakkmattot természetesen nem kihalásként kell értelmezni, hanem a világgazdaság és az egészségügyi rendszerek tartósan visszatérő jellegű szabotálásaként — a majdan méltóságteljesen leélni remélt időskori évek szabotálásáról nem is beszélve. Mindez talán éppen eléggé rossz lenne.

Úgyhogy a SARS-CoV-2 terjedését fel kellene számolni, felszámolás pedig csakis globálisan lehetséges. Mivel a globális populáció kritikus hányadának gyors átoltása sajnos életszerűtlen várakozásnak tűnik jelen állás szerint, a kontaktkutatós járványkezelést a terjedési láncolatok elvágása érdekében előbb-utóbb el kell kezdeni komolyan csinálni, a vakcinációval párhuzamosan. Mármint komolyan komolyan.

2021.01.09-01.17.

• Floridai kórház, Candida auris a COVID-részlegen.
• Izrael (HVG) — gyakorlatilag a különféle vakcinák vizsgálatának IV. fázisát informatikailag és gyors+hatékony vakcinadisztribúcióval jól támogató biolaborként jutottak látványosan sok dózishoz, így törtek az élre.
• Látva az Egyesült Államokból a friss esetszámokat, az 501.V1 nagyot robban sajnos mindenhol. Coming to a theatre near you.
• Így írja újra a járványtörténelmet a Kínai Népköztársaság. És szögezzük le akkor, hogy a járvány nemzetközi bejelentésétől eltelt egy évben a WHO nem vizsgálódhatott náluk a járvány eredetéről, mert az nem lett volna kompatibilis a KKP történelemírásával.
• Miután kénytelenek voltak megválni lejárt vakcinakészletektől, NY állam végre szélesíti azok körét, akik oltáshoz juthatnak. Eddig 1,2 millió dózist szereztek be egyébként, és abból 400 ezer embert tudtak oltani (nagy részüket nyilván csak egy dózissal, egyelőre).
• Az E484K mutáció antitestszökő tulajdonságairól már volt szó korábban. Itt egy újrafertőződéses eset ezzel a spike-mutációval.
• Very long COVID. A DW riportjában látható pl. figyelemre méltóan színvonalas rehab kezelés. Mint korábban már tisztázódott, a long COVID formái lehetnek: szervi károsodások elhúzódó hatásainak jelentkezése, virális fertőzés utáni kimerültség, intenzív osztályi kezelés utóhatásai, elhúzódó tünetesség (talán perszisztáló fertőzés miatt). Itt a riportbeli egyik hölgynél az első ezek közül jelen van, méghozzá, úgy tűnik, a központi idegrendszer érintettségével. Elhangzik egy érdekes elmélet arról, hogy a long COVID forrása a sejteken belül a mitokondrium károsodása is lehet. A beépített erőműveink.
• Miután a capitoliumi bezavargás alatt a képviselőket egy helyiségbe terelték/menekítették, a republikánusok egy része nem viselt maszkot, sőt visszautasította a felkínált maszkokat. Volt fertőzött is a teremben. Bonnie Watson Coleman demokrata képviselő, 75 éves ráktúlélő pedig most már fertőzött. Hogy a bezavargók között mi történt infekciós szempontból, arról spekulálni nyilván lehet.
• E484K meets N501Y... from Brazil, in Japan. A cikk a mutációkat nem említi, de természetesen a D614G is ott van, az mostanra alapfelszereltség a SARS-CoV-2-nél.
• Brazíliában H1N2-influenzavariáns kóstolgatja a humán hardware-t, 2020-ban két zoonózis is volt.
• Brazíliában 50,4%-ra jön ki a Sinovac Coronavac készítményének hatásossága, ha az enyhe eseteket is nézzük a tesztcsoportból, ahogy kell. Szóval leaky vaccine, de azért egyáltalán nem hasztalan, ha súlyos megbetegedések megelőzéséről van szó. Már csak az a kérdés, hogy jött ki Törökországban 91,25% ugyanennek a vakcinának a tesztelésében.
• Olaszországban irónia lengi körül a vakcinációt, miután a jelenlegi vezetés részben az oltásellenességet meglovagolva került hatalomra. Ehhez képest menő, hogy 62% "oltakozna".
• Jön a Sputnik "Lajt" (Спутник Лайт) = Sputnik Light. Ügyesen brandelik ugyanazt a veszélyhelyzeti vakcinahigítást, ami nyugaton is felvetődött.
• Dél-Afrikába még mindig nem érkezett egyetlen dózis vakcina sem. A globális stratégiai gondolkodás gyorsan meghalt ebben a járványban.
• A Nipah vírusról, de ez is "denevérrel írott" történet.
• A WHO megérkezett Kínába, de minek?
• Stephane Bancel (Moderna CEO): a COVID örökre velünk lesz. És sajnos nem az emlékezetünkben. Hacsak nem látjuk be, hogy ez nem jó így, teszem hozzá.
• A modern monetáris elmélet, az amerikai pandémiás segélycsomag(ok) és az amerikai államadósság, alternatíva híján a kitettségüket csökkenteni nem tudó hitelezők, és buborékok a pénzügyi piacokon.
• Tanulmány arról, hogyan lehetne elég vakcinát gyártani az egész világnak a globális átoltáshoz. A szerzők között Kis Zoltán (Imperial College London), aki nem azonos a hazai virológus Kis Zoltánnal.
• Az, hogy Kína mit művel a járvány eredetének ködösítésében, olyasmi, amit kritizálok sokat. De a vakcináikról így írni nem érdemes. "A" kínai vakcináról beszélni címekben, amikor több cégnek több terméke van, felelőtlen, pláne aznap, amikor a jóval hatásosabb Sinopharm-féle vakcina beszerzéséről született megállapodás.
• Az ausztráloknál a belső, szövetségi államok közötti mobilitási korlátozások ilyen videót inspiráltak.
• Manausban, Brazíliában, ahol napi 30 ezer köbméter orvosi oxigén fogyott a tavalyi járványcsúcson, és egyesek akár 40%-osnak becsülték az átfertőzöttséget, most napi 70 ezer köbméter oxigén fogy. (Kieg.: érdekes felvetés (h/t Girardelli), hogy ehhez akár a Sinovac nem túl hatásos vakcinájának is köze lehet.)
• És közben úgy tűnik, hogy az új variáns(ok) még Kínának is kemény kihívást jelentenek. The more things change, the more they… do.
• Közben robbanékony téma: Norvégia 13 idős ember halálát az mRNS-es koronavírus-oltásokkal kapcsolta össze, allergiás reakciók, émelygés, láz nyomában. Van olyan forrás, amelyik szerint hasmenés is előfordult. Ezt nyilván elég alaposan ki kell majd vizsgálni még kauzalitás szempontjából. Harmincezer dózist oltottak eddig összesen, és ebből volt összesen 29 esetben (súlyosabb?) mellékhatás, 21 nőnél és 8 férfinél. Az elhunytak mind 80 év felettiek voltak, köztük súlyosan és halálos betegek is. (Közben némi zavar forrása, hogy volt 23 haláleset "röviddel oltás után" (amiben az is benne van, ha valakinek tégla esik a fejére, szó szerint vagy metaforikusan), viszont ebből a norvégok csak 13-nál láttak kapcsolatot a vakcina mellékhatásaival. A média egy részének ez már túl sok szám, úgyhogy 23 halálesetről írnak, anyway.) Kieg.: Németország 10 esetnél vizsgálódik, ahol oltás után 4 napon belül volt haláleset.
• Mire Biden átveszi az elnökséget, 400 ezer halotton bőven túl lesz az Egyesült Államok. De a Trump-adminisztráció keze még akkor is benne lesz a járvány súlyos lefolyásában. Nem létező vakcinatartalékokról jelentették be a héten, hogy küldik ezeket, és a fogadó felek most meglepetten és csalódottan néznek.
• Annak idején Trumpék nem kértek 100 milliónál többet a Pfizer/BioNTech vakcinából, pedig az opciót felajánlotta nekik a cég. Most készül viszont egy utolsó elnöki rendelet, hogy "a zamerikaiak vakcináját nem lehet eladni", aminek valószínűleg (szerencsére) zéró hatása nem lesz. Ez van, amikor a pillanatot uraló populisták kormányoznak. Vigyáznak rá, hogyan fest, amit csinálnak, és azon kívül nem vigyáznak semmire.
• Los Angelesben akkora kórházi ellátási krízis van, amekkora lehetséges. Manausi szinteken.
• Írország példás járványkezelés után esik el éppen az új variáns(ok) miatt. Viszont március végére terveik szerint sikerül majd átoltaniuk 700 ezer veszélyeztetett embert.
• A Trump-adminisztráció búcsúnak kijött egy ilyennel. Az egyik első pont benne: "The U.S. government has reason to believe that several researchers inside the WIV became sick in autumn 2019, before the first identified case of the outbreak". Ami lehetne érdekes, de Trumpék a kreténségükkel jó eséllyel megölik az ügy érdemi tárgyalását.
• Duda Ernő virológus autoimmun zavaroktól félti az elölt vírusos kínai vakcinával oltottakat. Kifejthetné részletesebben is, ha tippelnem kell, ennek a 2012-es, a korábbi SARS-vírusról szóló tanulmánynak az eredményei adják az ihletet, amely egerekkel dolgozott, és a hasonló módon oltott, majd később vírusfertőzésnek kitett egyedeknél találta, hogy: "infiltrates among vaccinated animals contained neutrophils and eosinophils that were not seen in the lesions of the animals that had been previously given PBS or alum only (figure 2B) suggesting a T helper cell type 2 hypersensitivity reaction; increased eosinophils are a marker for a Th2-type hypersensitivity reaction".  (Kieg.: az internet futóbolondjai közben már az mRNS-vakcinára próbálják ráhúzni a fentieket, nyilván "honest mistake", hogy elfelejtik, azoknál volt részletes III. fázisos adat.)

2020.01.18-24.

• Az észak-amerikai fehérfarkú szarvasok is fertőzhetők, úgyhogy a szarvasfarmokon sem árt figyelni.
• Fertőzött macska Szentpéterváron.
• Izraelben a Pfizer első dózisa után enyhe és ideiglenes arcbénultságot tapasztaltak tizenhárman, van orvos, aki ez után nem merné beadni nekik a másodikat.
• Az olaszoknál Guardiagrelében (Abruzzóban) bukkant fel a brit variáns december végén, de két hétig nem csináltak semmit, mikor befutott erről az első infó.
• Az NYT összefoglalója arról, mi ment félre az Egyesült Államokban. Például száz körüli az elbocsájtott vagy felmondott közegészségügyi tisztviselők száma a járvány kezdete óta.
• A kínai gazdaság 2,3%-ot nőtt tavaly. Válság = lehetőség, kihozták a maximumot a helyzetből.
• A manausi P1-es variáns spike-mutációinak listája: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, H655Y, T1027I.
• "Ambuzados". Ha minden igaz, így mondják Manausban, hogy kézzel lélegeztetett. 
• Egy VICE-tudósítás, ahol 16:40-től meg lehet nézni a Bracken Cave belsejét. Vastagon lepi a denevérguanó, gázolni kell benne annak, aki bemegy, és a fényben látható, milyen fantasztikusan jól aeroszolizálódik ez a szikkadt por állagú anyag. A Bracken Cave Reserve (Texas) története amúgy is érdekes: 2013 környékén egy ingatlanfejlesztő 3800 fős lakónegyedet fejlesztett volna mellé, éppen a migráló denevérek vonulási útvonalában, és ezt a Bat Conservation International kivásárlással előzte meg.
• Hihetetlen kommunikációs kavarás megy idehaza a Sinopharm körül. A lényeg: kellenének a III. fázisos vizsgálat adatai. Az, hogy be lehetett adni sok embernek, nem elég. Mi van azokkal az emberekkel, mi lesz azokkal az emberekkel, erre is oda szokás figyelni.
• San Francisco, Bay Area. L452R-variáns, a minták 3,8%-ában december közepén, 25%-ában január elejére.
• A Biden-féle pandémiás tervről jó véleménycikk: meglépi a nyilvánvalót. A szövetségi kormány már azzal rengeteget segít, ha tesz valamit. A FEMA és a Nemzeti Gárda működtet majd sok oltóhelyet, refinanszírozzák a szövetségi tagállamok költségeit, gyártókapacitást bővítenek a vakcinaelőállítás ampullákhoz kapcsolódó szűk keresztmetszetének kezelésére, bővülő tesztkapacitás és vírusgenom-monitorozás stb.
• A WHO-nak van újabb időközi jelentése a COVID-válaszadásról, amint megvan a link, kiteszem. 
• Ha valakinek kétségei lettek volna, Egyiptomban tényleg megtörténtek azok a kórházi kihalásos esetek, ahol leállt a COVID-osztályon az oxigén.
• Akinek van kedve, ideje, kiváló feladat lehet modellezéshez. Ausztráliában a február 8-án kezdődő Australian Open résztvevői közül 72 teniszező van karanténban, amiért valamelyik olyan járaton repültek be az elmúlt napokban, ahol volt fertőzött. A versenyen 128 férfi egyes, 128 női egyes, plusz még valamennyi férfi és női párosjátékos vesz részt a főtáblán. Ehhez jönne még a selejtező mezőnye, de a kvalit ezúttal off-site (sőt off-country!) rendezték, Dohában, még korábban, tehát azokat a számokat most nem kell nézni. És vannak még a juniorok, akiket vagy beleszámoltak a 72-be, vagy nem. Az ismeretlen paraméterek ellenére is gyanítható, hogy viszonylag nehéz olyan járatra ülni, ahol nincs fertőzött.
• Elnézést, "dél-afrikai változatot" mondtam? Már 14 országban kimutatták mostanra. Köztük Németországban (Baden-Württembergben), Svájcban, Hollandiában, az Egyesült Királyságban, Franciaországban, Svédországban, Norvégiában.
• A Wired cikke az eredetnyomozás körüli érdekkonfliktusokról, többek között Peter Dazsak morális integritást teljes mértékben nélkülöző szerepéről, amit a világ szeme láttára művel, fényes nappal.
• A dél-afrikai járványügy bejelentése: a K417N és az E484K mutációk antitestszökővé tették a vírusvariánsukat — mármint nem csak egy kicsit, hanem a megvizsgált "elsőhullámos" vérminták felének az esetében teljesen (másoknál jelentős mértékben). Újrafertőződések történnek nagy számban. Azok a tudatlan barbárok, akik fertőzés útján nyert nyájimmunitásról beszéltek, most menjenek, és... menjenek. Kieg.: itt a dél-afrikai tanulmány (h/t Girardelli). Három terápiás alkalmazásban lévő mAb (monoklonális antitest) sem semlegesíti az 501Y.V2-t (teljes neutralizációvesztés ezeknél).
• Érdekes kérdés lehet, hogy a járványkezelést mikortól írjuk Biden számlájára át, amennyire az ilyesminek egyáltalán értelme van (ha van, ha nincs, beszélni fognak erről). Minimálisan három hetet várni kell a beavatástól, hiszen aki akkor hal meg, az még jó eséllyel előtte fertőződött meg. Úgyhogy itt a CDC előrejelzése február 6-ig: 440-477 ezer halott (h/t Epikurosz).
• Duda Ernő bővebben, a Sinopharm kapcsán.
• Nálunk is megjelenik az ellőni nem tudott maradék vakcinák problémája, viszont itt adminisztratív retorzióktól tartva nem is nagyon próbálja megoldani senki. Ugyaninnen nem jelentéktelen utalás: PCR-tesztekből kevés lehet. A CFR felfelé araszolgat nálunk, ami közvetve problémák jele lehet, talán éppen ez a téren?
• Példa arra, miért elkerülhetetlenül leegyszerűsítés pl. járványok terhét DALY-ban mérni. Egy süketek és halláskárosultak számára Hawaii ASL (American Sign Language) segítségével tolmácsoló hölgy halála. Nincsenek sokan, akik Hawaii ASL-el tudnak jeltolmácsolni. A cserokí őshonos lakosság is ezért kapta meg a vakcinát prioritással, hogy a nyelv ismerete ne vesszen el.
• Kedves Müller Cecília! Tolmácsnak jelentkeznék. Amikor ez az orvos azt nyilatkozta, hogy marad felesleges vakcina, nem azt kérdőjelezte meg, hogy az aznap fogadottak számának megfelelő mennyiségben történik-e a tárolt oltóanyag kiolvasztása. Hanem arról beszélt, hogy van, aki nem jön el az aznap vártak közül, emiatt marad vakcina, és azzal kellene kezdeni valamit. Remélem, így már érthető. A problémát pedig meg lehetne oldani, csak el kell gondolkodni, és rá lehet jönni, hogy ezen a téren ún. "vezetőként" irányt kell mutatni, akár a helyben születő megoldások következetes támogatásával — ha egyszer világos, hogy megoldást találni jó és fontos dolog.
• Francia cikk. Lopott levelezés került ki az EMA-tól (European Medicines Agency), ami alapján bele lehet tekinteni a Pfizer/BioNTech vakcina engedélyezésének hátterébe... és kiderül, hogy az EMA-nál munka folyik, hogy voltak kérdéseik (pl. a kibővített termelésbe bevont üzemekben a minőségbiztosítási folyamatokról, hogy garantálják a biztosan hatásos mRNS-mennyiséget dózisonként), kaptak válaszokat is ezekre a kérdésekre stb. Persze aki a leveleket ellopta (a Rutor dark web site-on kerültek elő...), az a futóbolondokat célozta ezzel a kontenttel, akik automatikusan a meglopottat látják majd egy botrány tárgyának (pedig a saját hülyeségük az igazi botrány).
• Vakcinagyári tűz Indiában (h/t Epikurosz) — hogy minden még jobb legyen. Öten meg is haltak a tűzben, munkások.
• Tanulmány a Science-ben. Az egyik kulcsmondat, általában az emberi koronavírusokról: "A low mean age of primary infection suggests partially transmissible reinfections are common". A sajtóban sokfelé annyi jött le erről, hogy "the coronavirus will resemble the common cold". Lájtos IQ-próba belátni, hogy a SARS-CoV-2 is olyan sokaknak, mint a "common cold", viszont a jövőben is lesz ettől még olyan, aki meghal tőle (az OC43-assal is így van ez). A kérdéses jövő pedig odébb van még. Sokkal. És akkor még nem számoltak a virulencia növekedésének lehetőségével, ami random mutációknál benne van a pakliban.
• Korrekt összegzés a Telexen a magyar oltási hajlandósági helyzetről, miközben a Szputnyik éppen átesett az OGYÉI-vizsgálaton.
• Németország részt venne a Sputnik fejlesztésében, nyilván hogy jobban belelássanak egy potenciálisan mégiscsak szükséges vakcina eddigi fejlesztési folyamataiba.
• A US Capitol Police soraiban már jelentkezik a január 6-i események hatása (fertőzések).
• Have you heard of the sufni-vakcinaipar? Márpedig Kínában ilyen is van, és úgy néz ki, sikerült általa összehozni egy új ASFV-variánst, amelyik krónikus kondíciót okoz és korlátozza a sertésreprodukciót. Yay.
• Elképesztő egy dolog ez, hogy miközben Dél-Afrikából és Brazíliából jönnek az új variánsok, pont ott van az, hogy vakcinakísérletekből lehet csak oltáshoz jutni.
• A Wall Street Journal 2,8 millióra hozta ki a járvány eddigi valószínűsíthető minimális halálozását — a fenti adataim megerősítéseként jelzem.
• Az Egyesült Királyságban Patrick Vallance tudományos tanácsadó és Boris Johnson azt nyilatkozzák, hogy a B117-es variáns valamivel halálosabb is lehet. Viszont mondanak komolytalan dolgokat a koronavírusról (hatvan éves férfiak számára 1-1,4%-os IFR), miközben módszertanilag pedig az a probléma, hogy a B117-et nagyobb valószínűséggel szekvenálják relatíve súlyosabb eseteknél. Kieg.: itt a brit SAGE által használt elemzés, több kutatócsoport eredményeivel, akik közül a legtöbben találtak addicionális halálozási kockázatot. Lásd a mellékletben (Annex). (Volt egy semleges hatást találó, és egy negatív OR-t mutató tanulmány, a többi pozitív RR-t/OR-t jelez; négynek a jelentőségét relativizálja, hogy a konfidenciaintervallum 0 és 1 közé terjed lefelé; hat viszont 1 feletti értéket mutat CI-t figyelembe véve is.)

2020.01.25-01.31.

• Újabb tanulmány a fertőzhető és a kevésbé fertőzhető vadvilágról.
• Dél-Kaliforniában az ICU-kapacitás továbbra is nulla.
• Gyorsul az evolúciós verseny a vírussal. A mAB-szökevény SARS-CoV-2 neutralizálására a spike RBD-je helyett az NTD-jére (N-terminal domain, az N-terminust tartalmazó szakasz) csatlakozó antitestekkel, work in progress.
• Anthony Fauci és családja elég sok halálos fenyegetést kapott, március 28-tól kezdődően. Egy jó mondat arról, miért nem mondott le: "If I did walk away, the skunk at the picnic would no longer be at the picnic".
• Dr. Seheult összefoglalja a legfrissebb eredményeket a terápiás (magas) dózisú véralvadás-gátlós kezelés hatásaival kapcsolatban. Leginkább azért fontos téma, mert teljesen logikus, hogy az ilyen kezelés hatásos legyen. De kell az empirikus megerősítés, és tavaly szóltak ellene eredmények (súlyos állapotban lévő betegeket már nem sikerült megmenteni). Most viszont vannak elég meggyőző támogató eredmények a nem-súlyos betegeknél.
• A Gamaleja Intézet bemondta az autommun problémák lehetőségére vonatkozó érvet a saját vakcinájával kapcsolatban, többek között autoimmun betegeknek konkrét ellenjavallattal. Várnak még meglepetések ezen a rögös úton mindenkit.
• És ha már autoimmun problémák, itt van ez az ütős tanulmány (h/t Girardelli), a COVID "autoantigén-atlasza". Auto-antigén-dömping auto-antitestekkel a nyomában COVID-nél, mint arra korábban is kitértünk. Az itt közölt eredmények potenciális magyarázói pl. az idegrendszeri szövődményeknek és a tartós problémáknak (long COVID, very long COVID sequelae).
• Ez a vizsgálat sajnos csökkent neutralizációt talált Pifzer-oltás nyomán a B117-el szemben.
• Egy komolyabb tanulmány arról, hogy a gyerekek fertőznek ezerrel.
• Mindenhol szuper komoly oltási tervek vannak, de azért többnyire a gazdagok és szépek vakcinálódnak elsőként. Welcome to Miami.
• A Moderna jó a B117 ellen, de már messze nem annyira jó a dél-afrikai 501Y.V2 ellen.
• Különféle adatok Izraelből különféle szolgáltatóktól arról, mikortól válik szét élesen átoltottak és át nem oltottak fertőződési kockázata (Pfizer-oltás nyomán). (1): 33% különbség 14-18 nappal az első dózis után. (2): 60% különbség 13-21 nap után. A 2-es forrás szerint egy héttel a második dózis után 20/128600 fertőződés történt.
• Gimis bírkozóverseny, kitörés, Florida - ahol az olimpiát is szívesen megrendezik, ha a japánok nem vállalják.
• Denver, 18 éves srác, két hónap után újrafertőződött, tüdőgyulladása volt, és álmában meghalt. Elég valószínűnek tűnik, hogy vérrög végzett vele, a szülei viszont "nem értik, mi okozhatta a halálát". Az ilyen esetek miatt gyanúm, hogy a halálozástöbbletben sok a közvetlenül a járványhoz kapcsolódó eset.
• A CDC élőben közölt adatokat az igen ritka anafilaxiás reakciók előfordulásáról, egymillió átoltottra kettő jut a Moderna, hat a Pfizer-féle oltás esetében.
• Idehaza elég komoly kérdéseknek kellene felvetődniük most az OGYÉI-engedélyezésről a Szputnyik-vakcina kapcsán. Az OGYÉI-folyamatban szerepet kaptak szakértők, de minek, ha hiába kérdezhettek?
• Szlovákiában is volt most olyan eset, ahol egy 79 éves, több krónikus betegséggel élő férfi szervezetét túlterhelte az oltás. Jut eszembe: sokadik ország, ahonnét részletes, számszerű adatokat olvasok az előfordult súlyosabb reakciókról és mellékhatásokról. Magyarországon léteznek ilyen adatok? Erről miért nem hallani semmit? Normális ez? Nem a mellékhatások rendkívüliségétől tartok, hanem attól, hogy nincs adat, mert nem követik. 
• Harmadik booster szükségességéről vagy annak lehetőségéről beszélnek már többen a dél-afrikai variáns miatt. Ez nem kicsit lassítaná a globális átoltást, értelemszerűen.
• A magyar híradók kitartását csodálom. Hetente képesek meglepődni, hogy a hét elején hozott alacsonyabb (hétvégi) adatok után magasabb adatok jönnek a hét közepén. 
• COVID után 90 napon belül 20% mentális problémákkal, 69 millió beteg adatai, köztük 62 ezer COVID-os. Egyébként nekem is van ismerősöm, akinél inszomnia jelentkezett.
• Neuroinvázió, enkefalitisz, és a végén még visszaesés forrása is lehet a központi idegrendszeri szövődmény.
• Kétpárti biovédelmi ajánlások az Egyesült Államok számára.
• Egy izgalmas kérdés: hány laboratórium dolgozik most világszerte SARS-CoV-2-vel? Az Egyesült Államokban van például úgy kétszáz BSL-3-as. De a BSL-2-esek is játszanak, a tesztelésnél. És eszembe jut, hogy a MOK listáján két elhunyt laboratóriumi dolgozó is szerepel. Egy amerikai eset kapcsán a tipikus mondat az ilyen esetekhez kapcsolódó tájékoztatásokban: "he appears to have contracted the SARS-CoV-2 virus in the community, the lab said". Úgy vélem, hogy itt van némi episztemológiai problematika elásva. Nagy járványban bárki, bárhonnan fertőződhet, de pont ezért továbbra is figyelni kellene a lehetőségek teljes spektrumát.
• Mellár Tamás A nagy magyar válságkezelés c. könyve jól összegzi körülbelül tavaly szeptemberig a... válságkezelés hiányát. Let's build the nemzethy oligarch economy anyway, fuck it. Körülbelül ez lett ugyanis a kormány stratégiája. Az ilyesmire is érdemes figyelni. Friss cikk a G7-től a vendéglátás helyzetéről.
• Az AstraZeneca 60%-os termeléselmaradása nyomán is a first-come-first-served elv működik. Ahogyan Hobbes mondaná, "man is first-come-and-thus-first-served to man".
• A vakcináció Indonéziában. Szigetek, kb. 17000 + a dolgozók elsőnek.
• Argentin adatok a Szputnyikról (h/t @rdos), melyek nem rosszak, reakciókról és mellékhatásokról (főleg előbbiekről). Plusz lista a Szputnyikot eddig engedélyezőkről: Algéria, Argentína, Fehéroroszország, Bolívia, Irán, Magyarország, Palesztina, Paraguay, Szerbia, Türkmenisztán, Egyesült Arab Emirátusok, Venezuela.
• Apropó, Venezuela. A hivatalosan csak 1171 halott mellett (ami regionálisan nagyon jónak számít...ana) annyira jól állnak a járvánnyal, hogy Maduro csodaszereket marketingel. A legjobb jelzés, hogy minden nagyon rendben van! (Ha minden igaz, kakukkfű a fő komponens, úgyhogy legalább ezzel nem lesz nagy baj.) Maduróék még októberben lenyúlták a PAHO (Pan-American Health Organisation) által küldött antigén-gyorsteszteket, úgyhogy tesztelés az országban nem nagyon történik. Azt romokban lévő egészségügyi rendszer mellett is eljátszották persze, hogy ők segítik meg a brazil amazóniai régiót szorult helyzetében.
• A Novavax-vakcina jól működik, csak sajnos a dél-afrikai variáns (B.1.351) ellen mégsem (50% alatt!).
• Szerződések a vakcinagyártókkal. Az NYT áttekintése a témában. Túl az elégtelen gyártókapacitásokon, ez is belejátszik a jelenlegi erősen szubotpimális helyzetbe.

2020.02.01-07.

• Az indiai COVAXIN is elölt vírusos oltás, és itt is felvetették sokan, hogy a nem közölt adatok miatt nem lehet megítélni pl. a VAERD (Vaccine-Associated Enhanced Respiratory Disease) kockázatát. Közben meg ott is csodálkoznak politikusék, hogy nahát, információ nélkül nem olyan nagy a hajlandóság.
• Florida: gyorsabban megy a fehér-amerikaiak oltása, mint a fekete-amerikaiaké. Ebbe persze belejátszik az is, hogy pont a fekete-amerikaiaknál magasabb a vakcinafélők aránya, de van benne egyenlőtlenség-alapú különbség is.
• Ennek a Steven Brandenburg nevű erősen zavarodott gyógyszerésznek is dr. lenne a neve előtt Magyarországon. 
• A Johnson & Johnson eredményei. Dél-Afrikában itt is csökkent hatékonyság (57%). 89%-os hatékonyság a súlyos betegség megelőzősében, teszik hozzá.
• Jó cikk a Válasz Online-on. A vakcinaunióra szükségünk van. A sok kis országocska nem tudna jó dealeket kötni. Németország meg pl. tudna, ha akarna. Stb.
• E484K meets B117. "Eek", "Nelly" és "Doug" (E484K, N501Y és D614G) együtt. De úgy is mondhatnánk, hogy a megnövekedett transzmisszivitás és a relatív antitest- és vakcinaszökés állnak így össze párba. Doug és Nelly elegendők lehetnek ahhoz, hogy a vakcinációs nyájimmunitási kritériumot feltolják 80% fölé, viszont ha Eek is csatlakozik hozzájuk, és jól tudnak terjedni együtt, az közelít a sakkmatthoz, amiről a bevezetőben szót ejtettem.
• Remek vlog egy floridai orvos halálával kapcsolatban, mely jelenleg vizsgált eset (akut trombocitopénia, agyvérzés).
• Nigériában is fogy a kórházi oxigén.
• Szputnyik V., III. fázisos előzetes eredmények: 16 teszt, 62 kontroll volt tünetes fertőzött 21 nap után, 91,6%-os hatékonyságot jelentenek a tesztcsop-risk/kontroll-risk alapján. Kieg.: a részletek a Lancetben.
• Dobson Szabolcs oldalát most találtam meg a Facebookon, kár, hogy eddig nem. És akkor két, ott megosztott tanulmányhoz link rögtön: a fertőzésen átesetteknél egy dózis lehetséges elegendőségéről (itt és itt). Jobb gondolat lehet némi spóroláshoz, mint amik kezdettől felmerültek egyesekben (keverés, higítás, időben széttologatás).
• A szaúdi járvány dinamikája is érdekes. Kicsit jobban beleásom majd magam. A hivatalos adatok viszonylag alacsony CFR-t mutatnak (1,73%). Most éppen szigorítanak, növekvő trend nyomán jelentkező napi 300+ eset mellett.
• Gyűlnek az információk a COVID-hez kapcsolódó diabétsz-szerű problémákról súlyos COVID-nál gyakori hiperglükémia nyomán. Akár gyógyulás után némi idő elteltével alakulhatnak ki. Mechanizmus nem tisztázott (a betegség? a kezelés? mindkettő váltja ki?). 1-es (inzulint nem termelős) és 2-es (inzulinrezisztens) cukorbetegség jegyei keverednek. Múlandó lehet sokaknál — erről is van adat.  Akár a súlyos betegek 14,4%-át érintheti. Talán a hasnyálmirigy béta-sejtjeinek károsodása áll a hátterében.
• COVID-osztályi tűzesetek. Január végén Bukarestben, öt halottal, most Kijevben, négy halottal. A múltkori indiai vakcinagyári tűzesettel együtt — ahol 5 halott volt — g.a.h.: +714326+n.
• Egy pozitívra tesztelt szállodai dolgozó miatt kétségek az Australian Open indulásával kapcsolatban.
• Bill Clinton annak idején Richard Preston könyveinek (The Hot Zone, The Cobra Event) hatására döntött orvosi védőfelszerelésekből pandémiás tartalékok felhalmozásáról (amit a H1N1 miatt Obamáék aztán szétosztottak). Matt Hancock brit eü. miniszter pedig a Contagion c. filmből vonta le a következtetést, hogy (kicsit parafrazeálom a dolgokat:) a vakcinákért harc lesz, és ebben ők rögtön az elején full emberevő üzemmódban mennek ki a küzdőtérre.
• Lengyelország "megtalálta" az első fertőzött nyércét. Amúgy már tavaly ősszel volt egy kis kormányválságuk a szőrmeipari tenyésztés betiltására irányuló törvényjavaslat miatt, just sayin', de miért is lett volna annak köze ilyesmihez.
• Az AstraZeneca új, a Lancet platformján közölt preprint szerint hatásosabb, ha a második dózis 12+ hét után jön. Mindez időszerű támogatás ahhoz, amit a gyakorlatban a hatóságok amúgy is kénytelenek... és az ilyesmin kínomban mindig elgondolkodom. 
• Közben az AstraZenecát Holandia sem adja majd 65 év felettieknek (az EU-ban a franciák, németek, belgák, dánok, svédek sem), dacára az EMA-engedélynek.
• Öveket becsatolni. Steven Quay lektorálatlan tanulmánya a SARS-CoV-2 eredetéről. Két része van. Az elsőben bayesiánus valószínűségszámítással hozza ki azt, amit egy éve pedzegetek itt: hogy a laboratóriumi eredet sajnos túl valószínű ahhoz, hogy egyesek csak úgy, csípőből tüzelve, vizsgálat nélkül félre akarják söpörni. Ha valaki kevésbé ér rá, itt egy összefoglaló videó. Fontos érvek: (1): Miközben rengeteg tudós és Kína együttesen sok követ megmozgattak, hogy a természetes eredetet egy kellően közeli rokon vírus formájában kimutassák, ez máig nem jött össze nekik. (2) A kritikus szakasz egy táblázat, ahol figyelhető a Bayesian update valószínűség-átértékelő folyamata különféle pontokon. Amik a laboratóriumi eredetet valószínűségét felértékelik: a) az első esetek éppen a WIV és a Wuhan CDC közelében; b) szerokonverzióra utaló bizonyítékok hiánya Wuhanban és Shanghaiban (értsd: nem találtak olyan vérmintát Kínában a járvány valószínűsíthető kezdete előttről, amely SARS-CoV-2-antitestekre pozitív lett volna); c) alacsony vírusgenomdiverzitás a járvány elején (pontosítás Girardelli megjegyzése nyomán: a kezdetnél egyenesen hiányzó vírusgenomdiverzitás); d) furin által hasítható helyet hordozó közeli rokon koronavírus hiánya; e) CGG kodonok ritka előfordulása, hiányzó CGG-CGG párok a természetben a denevér-koronavírusoknál. Értsd: a természetben előforduló koronavírusokban az arginint (R) kódoló nukleotidhármas (kodon) szinte soha nem CGG, a CGG-CGG pedig különösen valószínűtlennek számít — a SARS-CoV-2-ben mégis több ilyen is van, éppen úgy, mintha valaki kitartóan arginint szerkesztgetett volna bele (kieg.: tekintve, hogy ehhez laborokban éppen CGG-t használnak), ami nagyon lényeges módon éppen a furin által hasítható helyhez kritikus elem. A furin által hasítható hely pedig kritikus az emberek hatékony fertőzéséhez, mint arról itt már sokat írtunk.
• A paper másik része kínai, 2019. decemberi, bronchoalveoláris lavázsból származó, a WIV által elemzett minták alapján állítja, hogy azokban következetesen jelen volt egy olyan adenovírus-szállítóvektor (shuttle vector), amilyet annak idején Kínában a 2003-as SARS-vírus elleni vakcinafejlesztésben használtak. Ez a vektor pedig hordozta a SARS-CoV-2 spike-ját és hordozott amellett egy szintetikus (influenza) H7N9-gént is. Quay korrektül számításba veszi, hogy ez esetleg valamiféle kísérleti terápia nyomán kerülhetett a betegekbe, amikor kínai orvosok mindent megpróbáltak az első esetek megmentéséért. Kieg.: @Girardelli felvetése keresztszennyezettség a mintában, akár társfertőzés miatt.
• A B117 jobban terjed gyerekek között, mint azt pl. Izraelben is látják most. Továbbá: hasonló tapasztalatok Olaszországban.
• Azért ez kemény. 2013 és 2020 között az EcoHealth Alliance a Department of Defense-től is kapott 40 millió dollárt pandémiamegelőzésre.
• Kölni szekvenálásból látszik, hogy bőven terjed már Európában a B117 és a B1351 is, azaz a "brit" és a "dél-afrikai" variánsok.
• További eredmények arról, hogy a B1351 ellen nem ad szignifikáns védettséget a korábbi fertőzöttség.
• Főleg idősebbeknél persze, de 56 napig is emelkedett lehet a mélyvénás trombózis és a tüdőembólia kockázata COVID után (h/t Epikurosz).
• Angliai ortodox zsidó közösség, ahol 64,3%-os szeroprevalenciát sikerült mérni, az országosnak kb. az ötszörösét. Még az 5 év alatti gyermekeknél is 27,6% jött ki (pedig itt nagyrészt a B117 előtti járványról beszélünk). Az eseteknek több mint a fele (37,5%) tünetes volt saját értékelésük alapján (h/t Epikurosz). 
• Fontos kérdés, és még nem tértem ki rá, de jönnek az eredmények szépen, hogy az átoltott terhes nők átadják magzatuknak az antitesteket (h/t Epikurosz).

Lezárva. Folytatás a következő héten, február 8-ától újabb bejegyzésben.