Külpraktika

Külpraktika

Mire számíthatunk Trumptól a továbbiakban? (Cikkem egy héttel ez előttről, G7)

2020. november 14. - Marton Péter

Ez a cikkem egy hete jelent meg a G7-en. Trump személyiségével foglalkozik. Várható lépéseinek az előrejelzéséhez ad ezzel fogódzót, de nem a konkrét lépésekről nyilatkozik. Azokkal kapcsolatban legelőször is az várható, hogy sokáig és változatos eszközökkel folytatja majd szubverzióját. Hogy konkrétan mikkel, az külön elemzés tárgya lehetne, de példaként talán elég a járványhelyzet "kezelésére" gondolni.

***

Az amerikai elnökválasztásról nagyon sok mindent írtak már az elmúlt napokban. Még olyanok is bőbeszédűen kommentálták az eseményeket, akiket sokadik alkalommal is meglepetésként tudott érni, hogy az Egyesült Államokban az elnökválasztás mechanizmusa közvetett, a demokrata jelöltek a választói földrajzból következően sok millióval több szavazattal sem feltétlenül tudnak nyerni, ellenben sok helyütt az urbánus területekről érkező szavazatokkal erősítenek a helyzetükön az időben később összesített városi voksok révén, ahogyan a számlálás előrehalad.

Az idei választás igazi különlegességét — hogy kimondjuk a nyilvánvalót — a levélszavazatoknak jelentős szerepet osztó koronavírus-járvány, illetve a levélszavazatokba látványosan és már jó előre belekötő Trump elnök személyisége és sajátos politikai megközelítése adta.

Az alábbiakban a Trump jövőjére vonatkozó spekulációt vesszük napirendre, hogy Donald Trump élettörténetének, bizonyos emlékezetes megnyilvánulásainak és elnöki döntéshozatali teljesítményének ismeretében támogassuk meg néhány fogódzóval a személyiségét és a várható lépéseit firtató latolgatásokat.

1. Nem szeret veszíteni

Ezt nagyjából mindenki tudja. Volt ezzel kapcsolatban nyilatkozat és ráutaló magatartás is Trump részéről bőven. De egy kicsit még erősebben lehet érezni a fenti tétel jelentőségét, ha felidézzük néhány kijelentését ezzel összefüggésben.

Egy 2005-ös coloradói üzleti fórum keretében tartott „motivációs előadásán” – amire a közönség azért ült be, hogy egy ismert üzletember auráját szippantsa magába az akkor még koronavírustól mentes levegővel – Trump például ilyen frázisokkal rukkolt elő: „Valamit meg kell mondjak a vesztesekről. Imádom a veszteseket, mert nekik köszönhetően érezhetem magam olyan csodálatosan a bőrömben.” Ugyanitt hozzátette, hogy „aki vesztes, azzal senki sem akar beszélni”, és hogy „ha valaki kiszúr veled, azzal szúrjál ki tízszer jobban”.

Tanulság: Trump identitásának a része, hogy ő az, akit a világ nem láthat vesztesnek. Ha ideiglenesen mégis ez a látszat alakulna ki, akkor vissza kell vágnia valahogyan.

2. A fel nem adásban a saját legfőbb erényét látja

Ha pusztán a kijelentéseiből indulunk ki, a kitartó versengést önmagában is erénynek tekinti, a körülményektől, sőt az ilyen erőfeszítések eredményességétől függetlenül.

Amikor 2016-ban az ABC News által szervezett elnökjelölti vita keretében Trumpot és Hillary Clintont arról kérdezték, mit tisztelnek egymásban — felkérve őket némi bájolgásra a gyorsan mérgesedő politikai viszonyok közegében —, Clinton mondott pár felejthető, de alapvetően hízelgő dolgot Trump gyermekeiről. A kérdést az emberi oldalról ragadta meg. Második hozzászólóként Trump azt mondta, nem tudja, hogy ezt Clinton tényleg bóknak szánta-e, de becsüli Clintonban, hogy „nem adja fel”.

Clintonnal kapcsolatban más fórumokon, más alkalmakkor viszont mintha még ezt sem egészen tartotta volna tiszteletben. A fel nem adás doktrínáját ellenben számos alkalommal gyakorolta a saját életében.

David Cay Johnston oknyomozó újságíró könyvében* például szerepel egy eset, amikor Trump hiába kérte egy alkalmazottját, hogy amaz egy bankár ismerősétől Trump cége számára szívességet kérjen. Az alkalmazott etikai megfontolásokra hivatkozva megtagadta ezt, mire Trump, aki ezt cserbenhagyásként élte meg, saját összegzése szerint azzal reagált: „mindent megteszek, hogy megnyomorítsam az életét”.

Amikor az NFL amerikai fociliga versenytársaként versenyjogi eljáráson keresztül próbálta jobb lehetőségekhez juttatni a USFL fociligát, és a bíróság elutasította a követeléseiket, Trump utóbb azt nyilatkozta a nyilvánvaló kudarcról: „Azért jó móka volt. Klassz kis per volt.” Vagyis működésbe lépett a fenti 1-es szabály, és az eredményt szándékainak eredetileg is megfelelő végkimenetelként normalizálta — legalábbis a nyilvánosság előtt.

Adódhat a feltételezés, hogy a 2020-as elnökválasztás eredményével kapcsolatban kezdeményezett számos jogi eljárásra is így tekint majd vissza egyszer. Legalábbis a nyilvánosság előtt, még ha belül nem is így érez igazából.

3. Személyes kockázatvállalás tekintetében nem megy el a végsőkig

Számos helyzet adódott már, ahol Trump nem vagy csak nagyon nehezen tartott ki egy előre átgondolt stratégia végrehajtása mellett, ha az nem jelentéktelen kockázattal járt együtt.

David Cay Johnston már említett könyvében lehet például olvasni arról is, hogy 1990 májusában Jess Marcum matematikus dolgozott ki Trump kaszinója számára egy nyerő stratégiát a múltban sokakat megkopasztó, híres-hírhedt szerencsejátékos Akio Kashiwagi japán üzletemberrel szemben. A megközelítés lényeges eleme volt, hogy sok-sok játszmára lesz szükség ahhoz, hogy az ügyesen kockáztató Kashiwagi megváljon a pénzétől. Csak türelmesen lehetett csapdába csalni, napokon át tartó játékkal. A maratoni bakkaracsatát Trump ezek után alig bírta idegekkel. Menet közben felvetette, hogy Kashiwagi talán csal (miközben éppen ők dolgoztak azon, hogy kelepcébe csalják), és aggódott, hogy a japán mágnás nyerő szériájának soha nem fog vége szakadni.

Elnöksége során érdekes rálátást engedett Trump viselkedésére számos döntéshozatali helyzet is. Idén januárban például az általános vélekedés szerint jelentős kockázatot vállalt, amikor az amerikai erőket Irak területén, iráni támogatással ért támadásokra reagálva jóváhagyta Szolejmáni tábornok likvidálását. Valójában nem a legkockázatosabb lépés mellett döntött, ugyanis kabinetje az iráni katonai erőkre mért (például hajók és rakétaütegek elleni) közvetlen csapásokat is kilátásba helyezett opcióként, ő pedig ennek a felvetésnek ellenállt.

A jelen kontextusban ebből az következhet, hogy Trump aligha várja meg, hogy a hóna alá nyúljon valaki, és kihurcolja a Fehér Házból. Mindig is szívesebben tartózkodott Mar-a-Lagóban (golfozni) vagy éppen a New York-i Trump Towerben. A gallércibálós dráma csak vesztesként tüntetné fel. Máskülönben sokáig nem fogja teljesen feladni a küzdelmet. Megpróbálja majd megtartani a Republikánus Párttól elcsent politikai tábort a saját gyülekezeteként, és a tíz körömmel a bútorzatba kapaszkodásnál minden bizonnyal kreatívabban választ ehhez eszközöket (januárra jó eséllyel már amúgy is Biden bútorai lesznek a Fehér Házban, ha a hagyományokból indulunk ki).

4. Elveszítheti mindenki támogatását, mert személy szerint nagyon kevesek fontosak neki

Soha nem volt igazán stabil csapata. Már 2018-ra is rekordokat döntögetett az adminisztrációja vezetésében végrehajtott személycserék számát tekintve.

A messzebbi múltból könnyen eszünkbe juthat a The Apprentice című televízió-műsor, ahol Trump főnökösködésének egyik jellegzetes visszatérő eleme volt, ahogyan akár egy-egy rossz szóért is kirúgott bárkit. „Minek védi azt a másikat? Magának nem ez a dolga. Ki van rúgva.” És így tovább. Az a vezető, aki minden alkalmazottjában hibákat lát, végső soron bármikor állíthatja, hogy az alárendeltek gyengesége volt az alapvető kudarcok magyarázata.

Viszont így nem is nagyon lesz a partnere senki hosszú távra.

5. Hiányzik belőle a magabiztosság? Annál kitartóbb…

Tony Schwartz, Trump Az üzletkötés művészete című könyvének szellemírója mondta az elnökről: „Két Trump létezik. Az egyik nagyhangú, agresszív és magabiztos. A másik az ő belső világának örök kísértője, egy ijedt kisgyerek, aki rettegett a minduntalan kritikus, elnyomó apjától, és akit rideg és távolságtartó édesanyja soha nem vett a védelmébe.”

Meglepő, mondhatni intuíció ellen való konklúzió lehet az önbizalom hiányára jutni a számtalan alkalom után, amikor Trump még szerénységben is kiválónak nyilvánította saját magát, vagy például azok után, hogy egykori külügyminiszterét, Rex Tillersont szó szerint „IQ-párbajra” hívta ki annak idején. De nem nehéz belátni, hogy legalábbis lehetséges ezt a belső bizonytalanság jeleként értelmezni.

Aki az alulmaradást bárhol, bármiben katasztrofálisnak fogja fel, mi több, egyedül maradásként éli meg, az kényszeresen nagyíthatja fel a saját érdemeit — akár igazi meggyőződés nélkül, egyfajta stratégiai szerepjáték részeként.

„Legyetek paranoidok” – tanácsolta a már fentebb idézett coloradói üzleti fórumon. „Különben megnyúznak titeket” — sugallta az egybegyűlteknek.

Koronavírus: Winter is coming

Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

2020.10.26-11.01.

  • Az már kora tavasszal tisztán láthatóvá vált, hogy (1) a COVID nem szimpla légúti betegség, hanem éppenséggel egy szisztemikus kihívás a szervezet számára, mely súlyosan érintheti többek között a szívet, a májat, a vesét és a hasnyálmirigyet is, akár az aszimptomatikus hordozók esetében is, és hogy (2) ráadásul még neurológiai következményei is lehetnek, emellett pedig (3) roncsolja a vaszkuláris endotheliumot (az erek falát belülről), és súlyos vérrögképződési folyamatokkal jár. Mostanra pedig már azt is kimondhatjuk, hogy (4) autoimmun rendellenességekkel is nagy arányban jár együtt a súlyos eseteknél. Források: I. típusú interferon elleni antitestek előfordulásáról (IFN-α2 és IFN-ω ellen, vizsgált súlyos esetek 10%-ánál), antifoszfolipid antitestek előfordulásáról (vizsgált súlyos esetek 47%-ánál) és a szervezet saját elemeit még szélesebb spektrumban támadó autoreaktív antitestek (pl. anti-centromer és anti-RNP ANA-k) megjelenéséről sokaknál. Mindezt figyelembe véve igazán "lenyűgöző" perspektíva az idővel hanyatló immunitás nyomán következő újrafertőződésekre gondolni.
  • Ha minden igaz, Észak-Korea amiatt aggódik, hogy Kína felől érkező homokvihar hátán támadhatja le őket a koronavírus. A média nagy része ezt azonnal körberöhögte. Pedig... Más kérdés, hogy jelenleg pont Kína miatt kell ilyen tekintetben a legkevésbé aggódniuk.
  • Ez a cikk említi a brit Common Cold Research Unit különleges történetét a SARS-CoV-2 kapcsán tervezett "human challenge trialekhez" kapcsolódóan. A  CCRU a British Medical Research Council különleges intézménye volt, ahol többek között a régebb óta közöttünk keringő koronavírusokkal is megfertőztek önkénteseket az ott folyó kutatások részeként, helyileg Salisbury-ben (ugyanott, ahol a Szkripalék elleni merénylet történt 2018-ban), egészen a program 1989-es lezárásáig.
  • Müller Cecília ma megjegyezte, hogy Magyarországon is voltak már újrafertőződött személyek.
  • Figyelemre méltó új blog a láthatáron. Hogy egy dolgot kiemeljek... Ha valaki all-cause mortality adatokat nézeget manapság, és úgy gondolja, hogy úgy nézve nem is olyan szörnyű a helyzet egyes országokban (bár másutt már jókora halálozásnövekmény van), az nem árt, ha felismeri, hogy ezt a következő években így tartani lesz az igazán nagy kunszt: "... approximately 60% of responding member state countries have experienced a decrease in outpatient volumes due to patients canceling appointments. More than half of these countries have partially or completely disrupted services for hypertension treatment; 49% for diabetes treatment; 42% for cancer treatment, and 31% for cardiovascular emergencies. Additionally, to preserve healthcare system capacity for COVID-19, more than 50% of countries have suspended population screening programs." Háttérnek ehhez lásd még ezt a WHO-felmérést is.
  • Német tereptanulmány: a vámpírdenevérek kevésbé érintkeznek a társaikkal, ha fertőzöttnek érzik magukat. Más fajoknál is előfordul ez, pl. még homároknál is. A fizikai és a társadalmi távolságtartás előnyei járvány idején, Captain Obvious.
  • Fontos cikk a Remdesivirrel zajló hazai vizsgálatról. Hát, végül is nézzük a jó oldalát! Van, aki kap Remdesivirt. Talán még olyan is, akinek még akkor adják, amikor a virális replikáció még zajlik a szervezetében.
  • A 2019-2020-as szezon kvadrivalens influenzaoltása a COVID relatíve jó megelőzőjének bizonyult immunmodulatív hatásával, úgy tűnik, jelenti egy preprint. (RR = 0.61 (95% CI: 0.4585 - 0.8195; P = 0.001)).
  • Érdekfeszítő részletek elrejtve ebben a cikkben: a Pfizer-féle vakcina -70 °C-on, a Moderna-féle pedig -20 °C-on tárolandó jelen állás szerint, csak így stabilak. A világnak van néhány országa, ahol ezeket így gyakorlatilag lehetetlen lesz felhasználni :( Szóval van még min dolgozni.
  • Ha 365 ezer felnőtt vizsgálata nyomán úgy tűnik, hogy az antitest-titerek hanyatlanak, akkor azt most már aztán tényleg illik komolyan venni.
  • Miközben az újrafertőződésekről elmélkedünk, akadhat itt reaktiváció is olykor. Például egy 55 éves New York-i hölgynél, aki akut limfoblasztos leukémia immunoszuppresszív kezelése kapcsán lett újra PCR-pozitív akkor, amikor NY-ban alig volt terjedés.
  • És ha már immunszuppresszió, a kommentek közül kiemelném: a nemrég elhunyt ukrán koronatagadó testépítő sem segített magán azzal, ha szedett netán szteroidokat.
  • Miután Niger New York-i ENSZ-képviseletén végigsöpört a mostani fertőzéshullám, az ENSZ felfüggesztette a személyes találkozók tartásának lehetőségét a New York-i központjában.
  • Trumpika szerint az orvosok pénzt csinálnak abból, hogy a COVID-hoz kötnek haláleseteket. Szerintem Trumpika pénzt (is) csinál abból, hogy ekkora hazugságokat mond. Tegyük emellé oda, hogy az Affordable Care Actet (ACA, avagy "Obamacare") hogyan szabotálta már eddig is a Trump-adminisztráció, és hogy a Legfelsőbb Bíróság feletti, az elektori elnökválasztáséhoz hasonlóan igazságtalan mechanizmus alapján erősödő konzervatív kontroll folytán az ACA jövője kérdésessé válhat. Emellett pedig jöhet előbb-utóbb az abortuszpolitika "latinamerikanizációja" is (=tilalmak a nyugodt konzervatív lelkiismeret érdekében in return for több illegális abortusz és több egészségkárosodás)...
  • Szlovákiában tesztelnek ezerrel, és felröppent, hogy ha 136904 ember tesztelése után 3,8% volt fertőzött, akkor biztos ennyi az országos adat is. Amitől George Gallup kicsit forog a sírjában szegény, pláne amikor elolvassa, hogy "a járvány által leginkább sújtott szlovákiai régiókban kezdték el a tömeges tesztelést".
  • Orvosok jogállásával kapcsolatos tervezett hazai reformok be like... such winning, much success.
  • Bizonyos értelemben hajmeresztő helyzetet említ ez a cikk: COVID-beteg és családja közötti videóhívás az eü. személyzet asszisztenciájával... és akkor felbukkan a másik oldalon sok családtag egyszerre, mert, mint kiderül, összejöttek a hívás kedvéért. Nem is egy alkalommal volt ilyen, azt mondják.
  • Mosómedvéknél, úgy tűnik, enyhe a lefolyás fertőződés esetén (n=12; i=8) (h/t Epikurosz). Viszont, hogy van lefolyás, az már nem olyan jó hír nekik. A humánjárvány elleni emberi védekezés lefolyása náluk annál súlyosabb lehet — ha a nyércekkel történtekre gondolunk :(
  • Jönnek az újabb korlátozó intézkedések, esik az olajár.
  • Egy ábra arról, mennyire súlyos a sertéshelyzet Kínában (többek között az ASFV miatt). Miközben a legtöbb amerikai termény és termék importjáért komolyan szkandereznie kellett velük a Trump-adminisztrációnak, malacból több fogyott, mint amit a kínaiak venni ígértek. Az amerikaiaknak malacuk van. Forrás.

sarscov2_usforpol_tradeinusgoods_sinous.png

  • Az S-614G (D614G) változat fokozott fertőzőképessége és replikációja, adatok (preprint).
  • Oroszország: kötelező maszkviselés, embersűrűben szabadtéren is.
  • Sok, már megszokott rizsa egy kormánytól, amelyik mindig is rettegett a döntéshozatali transzparenciától, mint a leprától. Most már az ITM tudományos csapatára sem kívánnak támaszkodni. Hát hajrá, ezzel akkor a kormányé a teljes felelősség.
  • Méltán népszerű szemléltető ábrák a transzmisszió feltételeiről. Függetlenül attól, mit terjesztenek egyesek, azon, aki éppen beszél, rohadtul muszáj maszknak lennie. Mindenkinél fontos, de az ő esetében a leginkább.
  • A mediterrán bodorrózsa olaja a koronavírus ellen. Egyelőre szövettenyészeti eredmények alapján. Lehet benne valami, mert az antivirális hatását már más patogének ellen is igyekeztek kamatoztatni.
  • Egy igen fontos tanulmány. Outbreak investigations. Idézek egyet a felvezetőből: "the risk of laboratory accidents is increasing as more high-containment laboratories are built and higher risk experiments are conducted around the world". A nemzetközi és globális biztonsággal foglalkozó kollégák írták, akik számára evidens az elemzést azzal kezdeni, hogy "The origin of the SARS-CoV-2 virus that causes COVID-19 has yet to be determined".
  • Egy rutin PCR-tesztnél eltörött a mintavételező vattapálca, és a tesztelt személy tüdejében landolt, úgy kellett kioperálni onnan (UK).
  • A kommentek között már előkerült, és biztos, hogy innentől az én figyelmemet is élvezi: Az A222V mutáció a tüskében. Ha a spanyol nyaralások után terjedt szét úgy Európában, ahogy spekulálnak a szerzők, két kérdés vetődik fel: (1) transzmisszívebb-e az eddigieknél?; (2) képes-e nagy számban újrafertőződéseket okozni a változások nyomán, amiken átment? Befolyásolják-e az immunválaszt ezek a változások?
  • Forgalmi anomáliák Párizs körül. Wuhan reloaded, de sajátos módon a mobilitáskorlátozások előtt hazatérőkkel kombinálva.
  • Fontos hír a futball világából: az Újpest csapatának több olyan tagja is beteg most, aki már másfél hónapja is volt pozitív.
  • Eddig nem is említettem, de írtam a G7-re megint cikket. Öt kontrafaktuális forgatókónyv a jelen pandémia margójára. Miután leadtam a cikket, eszembe jutott még öt, de hát le kellett adni a cikket...
  • Brit anyag a long COVID-ról. Érdkessége, hogy gyakorlatilag négy különböző szindrómával számol: szervi károsodások elhúzódó hatásainak jelentkezése, virális fertőzés utáni kimerültség, intenzív osztályi kezelés utóhatásai, elhúzódó tünetesség.
  • A tömeges szlovákiai tesztelésben magyar orvosok is részt vesznek, belügyi közvetítéssel (150-200-an).
  • A britek komoly korlátozó intézkedések mellett döntöttek, és a Johnson-kormány már kapja is a kritikát a saját pártjától, hogy "megadta magát a tudományos tanácsadóknak". (Legalább értik, mit mondanak a tudományos tanácsadók, ez is valami.)
  • Belgiumban a mai napra a hivatalos adatok szerint is meghalt a populáció 0,1%-a COVID-ban. Belgium a harmadik ilyen ország San Marino és Peru után. Megkockáztatom, hogy Irán a valóságban ugyancsak ezek közé az országok közé tartozik már (Andorra pedig a hivatalos adatai alapján hamarosan). Közben Venezuelával, Nicaraguával és Szerbiával együtt 67 olyan ország van már, ahol 1000 felett van a hivatalosan jegyzett halálesetek száma. Hogy jó hír is legyen: Ausztrália közben megállt 900 felett, ami óriási eredmény.

2020.11.02-08.

  • Otthoni ápolásokhoz hasznos egy ilyen útmutató.
  • A kommentek között előkerült, úgyhogy ide is kiteszem, mert még nem volt. A COVID-os köhögésekről adatbázis. Példaként egy tipikus COVID-os köhögés hanggörbéje. És M.I. is bevonható segítségnek. Azzal együtt még a nyilvános terek háttérzajaiból is kiszűrhető az ilyesmi, javítható a betegségmonitorozás teljesítménye. Persze már jó ideje 1984-et írunk, úgyhogy más tekintetben nagyon nem örülnék plusz egy szenzornak a nyilvános terekben.
  • 44 országban 1500+ fő ápolószemélyzet vesztette eddig életét a járványban. Ennyi országból van adata az ápolók világszövetségének. Világszinten, minden eü. dolgozót tekintve 20 ezer fő lehet a veszteség az International Council of Nurses kivetítéses becslése szerint. (Az Egyesült Államokban jelenleg elnöklő emberszabású szerint persze pénzt kaptak ezért, talán még a saját halálukért is, nyilván.)
  • Astroturfing botokkal. Így fűtik a nyájimmunitásról szóló diskurzust magukat érdekeltnek gondoló (de azért alapvetően inkább simán idióta) szerepelők mesterségesen. A Great Barrington Nyilatkozat című szirénénekről tweetelőknek pl. 45%-a volt bot.
  • Iránban orvosi források a halálesetek számát a hivatalos háromszorosára teszik, azaz 105 ezerre. Eddig 27 ezer extra halálesetet számoltam (az az augusztus eleji állás volt). Ezzel így most +43000 haláleset adódik. G.a.h.: +424191+n.
  • Jemenben eddig +348 halálesetet számoltam a hivatalos adatok mellé. A temetkezési folyamatokat műholdas képek alapján elemzők áprilistól szeptemberig 2100 fő halálozásnövekményt állapítottak meg, ami részben a járvány által elszigetelt segélyfüggő ország általános állapotának következménye, részben magáé a járványé. Hivatalosan volt eddig 600 haláleset, úgyhogy a következő kivonásokkal élek: 2100/2-(600+348). Így jön ki felszámítandó +102 fő. G.a.h.: +424293+n.
  • Ami a vér-agy gátra rombolóan hat, azt nem szeretjük. Ezt a hatást in vitro a tüske S1 funkcionális alegysége önmagában is kiváltotta.
  • Lehet, hogy lesz orális vakcina is, bár még csak az I. fázisos tesztelésnél tart (San Francisco, Vaxart).
  • Egy igazán remek összefoglaló a vakcinafejlesztésekről Kemenesi Gábortól.
  • Izgalmas részletek a SARS-CoV-2-re adott immunválasszal kapcsolatos kutatásról, az elnyomott interferon-jeladásról és a felerősített citokin-jeladásról, aminek nyomában a szervezet reakciójára találóan kényszer-szőnyegbombázásként utalnak. Továbbá az is, hogy találtak sejtet, melyben az ott fellelhető RNS-ek 60%-a virális volt — ilyen mértékben vette át az irányítást a sejt gépezete felett a SARS-CoV-2.
  • Ezt a tanulmányt már csak az 1. ábráért is érdemes lenne megnézni. Bemutatja a vírus bejutását a sejtbe, és utána az endoplazmatikus retikulum és a Golgi-apparátus kiaknázását a replikáció folyamata során.
  • Magyarország... Próbálom megfejteni, mi a célja a — nyilván nem véletlenül — csak nagyon korlátozott hatás kiváltására és (pl. az önkormányzatok irányában) felelősséghárításra irányuló intézkedéseknek. Hogy az ünnepi szezonra könnyebb legyen súlyosabb korlátozásokat alkalmazni...? Hogy legyen tartalék ilyen értelemben...? Kieg.: mások is elmélkednek, csak számomra picit ijesztő módon (és ennek ellenére nem életszerűtlenül leképezve mások lehetséges gondolkodását). "Nyájimmunitás@30%", "mingyáleszvakcina", "nullegészötalattleszamortalitás". Wishful fucking thinking. Gandalf azt mondaná: "Run, you fools."
  • Kieg.: az, ahogy a kormány ragaszkodik a "Szülők Hangja" helyett a "nemzeti konzultációhoz" mint irányadóhoz az általános iskolákkal kapcsolatban, érdekes adalék mindehhez.
  • A kínai és az orosz vakcina itteni bevetni szándékozásával kapcsolatban is van üzenetem: "never go full retard", hogy klasszikust idézzek (Tropic Thunder).
  • SZFE-s maszkkal nem engedtek be a XVI. kerületi Kertvárosi Egészségügyi Szolgálat Jókai Mór utcai rendelőjébe egy embert.
  • Egyesült Államok. Ha pl. Biden nyerne, nem árt szem előtt tartani, hogy csak január 20-án léphet hivatalba. Nem akarok nagyon részletesen forgatókönyvezni arról, mit jelenthet ez a járványhelyzet szempontjából... Január 20. után pedig ott lesz neki örökül egy nem annyira barátságos Szenátus.
  • Dánia: where the really scary shit is happening. Nyércfarmon jelentkezett olyan mutáció, amely visszaterjedt emberekre, és azt írják, hogy úgy tűnik, hogy korlátozott ellene a fertőzésen átesettek immunitása. 12 emberi eset. A nyérceknek is rossz hír, mint azt már megszokhattuk. A tét jelentős (a vakcinafejlesztés).
  • Boncolás nyomán (n=41). A tüdőben syncytiumok, torzult sejtek több sejtmaggal. Csak egy részük volt hisztiocita eredetű, nagyobb részük "bona fide" pneumocita (volt valaha). Ilyet találtak ezek előtt a szerzők előtt már mások is egyébként. 
  • Egy kis immunológia (Michel Nussenzweig). Pl. arról is, hogy miért fontos a mAb-koktél, avagy poliklonálisantitest-kezelés, az ígéretes monoklonális antitesteket kikerülő rezisztens vírusmutációk megelőzése érdekében.
  • Vezethet-e a COVID (ritkán) Parkinsonhoz? Vagy valami ahhoz hasonlóhoz? Most már több ismeret birtokában vetődik fel a kérdés. Három eset, prodrómiás (kialakulási) jelek és tünetek nélkül, gyors jelentkezés COVID nyomán. Talán a legérdekesebb fejlemény, hogy a három esetből az egyik később spontán felépült, a másik kettő Parkinson-kezelésre reagált.
  • Steven Bannon lefejezné Anthony Faucit mint "árulót", és kitűzné a fejét a White House tetejére, figyelmeztetésként minden szövetségi kormánytisztviselő számára. Az FBI igazgatójával is ezt tenné.
  • Az AP csinált elemzést: a 376 megye az Egyesült Államokban a népességarányosan (aktuális állás szerint) legtöbb új fertőzöttel 93%-ban Trump javára szavazott.
  • A CDC problémás februári tesztkitje úgy ment ki, hogy tudták, hogy csak 67%-os szenzitivitású. Mielőtt visszahívták volna, és az Egyesült Államok ezzel egy hónapot veszített a járvány elleni védekezésben.
  • Outbreak alert. Ami Dániában megy, annak a fele sem tréfa. A Statens Serum Institut szekvenálta a vírust, az ő figyelmeztetésük nyomán az intézkedések. Bizonyos Kåre Mølbak konkrétan új járvány lehetőségéről beszélt az SSI-től. Brit utazási korlátozások Dániára vonatkozóan. 15-17 millió nyérc levágása tervbe véve. 1100-1200 nyércfarm van Dániában összesen. Az SSI tájékoztatója a témában. Öt fertőzési klaszter a nyércek és nyércfarmok között. Összesen hét különböző nem-csendes pontmutációt figyeltek meg a spike-ban. A legtovább mutálódott változatban négy együtt, ez az 5-ös klaszter Észak-Jutlandban, és történetesen ez került át 12 emberre. Változások az érintett aminosav-szekvenciában: "H69del / V70del, Y453F, I692V and M1229I". Már korábban is volt 214 emberi minta nyérc-SARS-2-vel, de nem ennyire mutálódott változatok. A mostani négy másik nyérc-klaszter vírusainál pl. nem mutatkozott korlátozott antitest-kötőképesség (in vitro), az 5-ös klaszter vírusánál viszont sajnos igen. 
  • Outbreak alert II. Kanada: elszigetelt esetnek tűnik, de ez a H1N2-es felbukkanás is érdekes.
  • Belém nyilallt, hogy erről nem írtam update-et. Szlovákiában lezajlott a tömeges tesztelés, és kb. 1% volt fertőzött. Ha az antigéntesztek 10 fertőzött közül hétszeregyharmadnál fals negatívat adnak (pl. 77/109 volt egy alkalommal a találati arányuk, azaz 70,64%), akkor 1-1,5%-ról beszélünk ez alapján korrigálva.
  • A páciensek kezeléséről, a teljes spektrumon, gyerekek, terhes nők stb. Megerősíti, hogy az MIS-C gyerekeknél 2-4 héttel a vírusfertőzés kiheverése után következik, ahol következik. Vertikális transzmisszió van, méhlepény fertőzöttsége megfigyelhető (pl. vérrögök is vannak ott is), de azért a vertikális transzmisszió így is ritka. Az ARDS-el kezelteknél vérnyomás tekintetében a kihívás jellemzően a vérnyomás felfelé szabályozása, akármit is művel korábban a vérnyomással (a renin-angiotenzin rendszeren keresztül) a SARS-CoV-2. Alább ábra arról, az előadásból, hogy milyen sorrendben, a tünetek jelentkezése után hányadik napon, milyen időkeretben jelentkeznek komplikációk az intenzív osztályokon látottak alapján.

sarscov2_icudiseasecourse.jpg

2020.11.09-16.

  • Ma este ezt az előadást fogom megnézni (Britt Glaunsinger, koronavírus-biológia). Nagyon érdekes például, amit a replikázkomplexum működéséről elmond. A tipikus RNS-vírus másológépezeténél kevesebb hibát vét, mert rendelkezik javítóképességgel (proofreading mechanism; ExoN-enzim), és így relatíve kevesebb a koronavírus mutációja. Alább megtekinthető, mennyi különböző fehérje alkotja a komplexumot az RdRp-vel együtt (ábra: B. Glaunsinger).
  • sarscov2_replicasecomplex.jpg
  • Ezzel a komplexitással összhangban a SARS-CoV-2 (és a koronavírusok) jóval több bázisból állnak. Emlékeztetőül (ábra: B. Glaunsinger):
  • sarscov2_rnaviruslength.jpg
  • Odabent, a sejt belsejében a SARS-CoV-2 nem-strukturális fehérjéi (nsp3 és nsp4) ezek után fogják az endoplazmatikus retikulumot, kinyújtják és feltekerik, és csinálnak belőle dupla membrános kis privát tereket, ahol a vírusreplikáció végbemehet. Ez is hozzájárul a virális fertőzés detekciójának elkerüléséhez a sejten belüli receptorok által (pl. ha máskülönben dupla szálú RNS jelenlétét észlelnék). A Glaunsinger előadásában szereplő ábrán:
  • sarscov2_endoplasmicreticulumhijack.jpg
  • Így néz ki ez krioelektron-mikroszkópia segítségével leképezve és 3D-modellezve (ugyanonnan). Látszik, hogy a sejt megtelt a dupla membrános kis breakout roomokkal.
  • sarscov2_endoplasmicreticulumhijack2.jpg
  • Ezek után még könnyebben érthető, miért őrül meg annyira az immunrendszer sokaknál, és miért kezd a fertőzött sejtek támadásának részeként autoreaktív antitestek bevetésébe.
  • Az Egyesült Államokban közben csúnyán elszabadulóban a harmadik hullám. Trumpika közben játszik a kis homokozójában, Biden pedig még csak a leendő koronavírus-csapatának az összeállításával foglalkozik. Utóbbival kapcsolatban fogadjunk, hogy Eric Feigl-Ding (Harvard) benne lesz. Veszek magamnak egy túró rudit, ha igen. Akkor is, ha nem.
  • Egy amerikai őslakos ("indián") család lesújtó története.
  • A koronavírus az idiótákat sem kíméli. Ez a televangelista pl. a házasság előtti szexszel hozta összefüggésbe a járványt.
  • Poszt-COVID mentális zavarok és betegségek gyakorisága (69 millió ember, köztük 62 ezer COVID-beteg adatai alapján). Jelentős relatív kockázat a kontrollokhoz képest új mentális kondíció diagnosztizálásának tekintetében.
  • Anekdotikus információ, nyilván, de... 12 éves vesztette el fogát (nem tejfogat) a COVID során az ereit ért károsodás miatt, kilenc hónappal a betegség után.
  • A Sinovac-vakcina (attenuált vírusos) brazíliai tesztelésének felfüggesztése kivizsgálandó eset kapcsán. A linkelt cikkből kiderül, hogy a Sinovac III. fázisos vizsgálatot csinál jelenleg Törökországban és Indonéziában is. Kieg.: már folytatódik is a program. Közben egy másik cikkben olvastam, hogy Bolsonaro a felfüggesztésnek örült, mert ő az oxfordi vakcinát (ORG/AstraZeneca) szeretné befutónak (ezen kicsit meg is lepődtem).
  • November 11. Tegnap este hallottam egy étterem-tulajdonost az egyik híradóban mesélni, hogy mivel hirtelen jött a kormány bejelentéscunamija, már berendeltek egy csomó élelmiszert, mivel ők csakis frissből dolgoznak. Magyarul, ha nem rajtütésből zajlana ez a kormányzás nevű izé, és például két hétre előre megmondták volna, hogy a kórházba kerülők számának növekedése esetén ez és ez következik, akkor jóval kisebb lenne az érintettek közvetlen vesztesége. Fel tudtak volna készülni. Ezek után döbbenetes, hogy a népet kényszeresen meglepetésekkel lerohanó kormány még a döntéseiről szóló jogszabályokat sem szállította észszerű időben. Ezért jelenik meg róluk most ilyen cikk, meg ilyen cikk, meg ilyen cikk például, teljesen indokoltan. És akkor még nem tettük hozzá, hogy a járványügyi intézkedések nagy részét nem is ők találták ki, mivel — miután az ITM tanácsadó csapatától megszabadultak — alapvetően megelégedtek az osztrák intézkedések copy-paste jellegű megközelítésével, néhány apróságot leszámítva. De a kőbe vésett alkotmányunk kétezerötszázadik módosítására napi politikai szempontok alapján persze jutott idő. És a helyi iparűzési adó elvételének gondolatával játszani Parragh "Javaslattevő" László kezdeményezésére szintén jut energia (vesd össze, blast from the past márciusból: "a vírus elleni küzdelemnek anyagi gátja nem lesz Magyarországon").
  • Jöhetnek nem sokára a T-sejt alapú immunitást tesztelő eszközök. Az ilyen jellegű immunitás tovább élhet, illetve tovább lehet kimutatható, mint a hanyatló antitest-titerekből származó. Így a múltbéli fertőzés kimutatására is alkalmasabbak lesznek, még ha az újrafertőződés lehetőségének megítélésére csak empirikus adatok fényében lehet is majd következtetni.
  • Dániában meggondolták magukat. Azért azt érdemes tisztázni, hogy a nyérceket sajnálom, de a populációjukat ember hozta létre mindenféle nem-nélkülözhetetlen dolgokra, és ha most itt kitermelünk új mutációkat növekvő számban, az előbb-utóbb tényleg rossz lesz. Hiába relatíve stabilak a koronavírusok, ha plusz x millió egyedben terjednek.
  • A koronavírus-genom igen sajátosan kódol géneket, mint arról fentebb Dr. Glaunsinger is beszámol előadásában (egy gén poliproteineket kódol, és ezeket aztán a saját RNS-dependens RNS-polimerázával darabolja a szükséges elemekre + szub-genomikus RNS-szekvenciákat replikál sajátos, lottószerű rendszerben, és mellesleg így árasztja el a virális RNS-sel a sejteket). Most egy újabb releváns, génként proteineket kódoló szakaszt sikerült kiolvasni, mely sajátos módon más gének szekvenciájával átfedésben van ott, és az Open Reading Frame 3d (ORF3d) nevet kapta.
  • Tanulmány kórházba kerültekről. "Of 1648 patients with COVID-19 admitted to 38 hospitals, 398 (24.2%) died during hospitalization and 1250 (75.8%) survived. Of 1250 patients discharged alive, 975 (78.0%) went home whereas 158 (12.6%) were discharged to a skilled nursing or rehabilitation facility (Table 1). By 60 days after discharge, an additional 84 patients (6.7% of hospital survivors and 10.4% of intensive care unit [ICU]-treated hospital survivors) had died, bringing the overall mortality rate for the cohort to 29.2%, and 63.5% for the 405 patients who received treatment in an ICU." Tehát a kórházból elengedés után is figyelni kell, pláne ahol a kórházakból rákényszerülnek helyhiány miatt idejekorán elengedni az embereket.
  • Három orosz medikus/medika, akik a Sputnik V. ellenére elkapták a fertőzést. A vakcinafejlesző előbb bekamuzta, hogy placebósok voltak, aztán Altaj régió közigazgatása részéről szólt valaki közbe, hogy "nem volt ideje az immunrendszerüknek felépítenie a választ, azért kaphatták el a fertőzést". (A Sputnikból kell ismétlőoltás három hét után, és az után három héttel él elvileg a védettség, vagyis az első oltás után hat héttel, úgyhogy ez alapján kell ellenőrizni a második verziót).
  • A vakcinája előállításához és terítéséhez a Pfizerrel partnerségre lépett BioNTech sztorija... Török-német házaspár alapította 2008-ban, Özlem Türeci és Ugur Sahin. Gastarbeiterek gyermekei, Sahin még Törökországban született.
  • A láma-nanotestek után jönnek a csirke-antitestek is (IgY) mint fejlesztés alatt álló terápiás alkalmazás. Kinyerés tojás sárgájából, bevetés intranazálisan, teszt egyelőre hörcsögökön. Kérdés: védenek-e? meddig tartanak? reagál-e ellenük a megvédendő gazda immunrendszere?
  • Az Európai Unió nem kívánja tolerálni a játékot az orosz vakcinával (a 2001-es, szükséghelyezektre vonatkozó irányelv ide vagy oda), és erről majd sok politikus vitatkozik úgy, mint a viccbeli lóról: ha lenne lovam, nekem adnád? már mi az, hogy nem adnád nekem? Az orosz vakcinát ugyanis tömeges gyártani is tudni kellene, olyan apróbb kihívások mellett, mint a biztonságosság és a hatásosság. És pontosan ez az, amiért az EU-nak a GSK-Sanofi és a J/J vakcina a választása az AstraZeneca mellé. Mert végül az előbbi kettő, bár később érkeznek, könnyebben tömegtermelhető és teríthető lehet, utóbbit (teríthetőség) pl. vakcinatárolási hőmérséklet szempontjából nézve. A GSK-Sanofi, a J/J és a Novavax mind fridzsiderben tárolható vakcinával remélnek előállni. A III. fázist a J/J az év vége előtt reméli csak kezdeni, tehát "lemaradásban" van, csak éppen a praktikum szempontjából mégsem feltétlenül. A J/J vakcina Ad26-ot (humán adenovírus, 26-os szerotípus) használ vektornak koronafehérjék bejuttatásához, a GSK-Sanofi rekombináns fehérje (vírusszerű részecskékké összeállított antigén) alapú vakcinán dolgozik (a Sanofi emellett külön egy mRNS-alapút is fejleszt).
  • Kiegészítésként ehhez, kontextusnak: az EU-nak a GSK-Sanofival (300 millió dózis), az AstraZenecával (300 m dózis) és a J/J-nal (200 m dózis) van előzetes vásárlási szerződése (Advance Purchase Agreement).
  • Kiegészítésként korábbiakhoz: a Sputnik V. vakcina is Ad26-ot használ az első dózishoz, és Ad5-öt a másodikhoz.
  • Republikánus tagállami szenátusi tag“The anti-MAGA media clearly knows that the presidential race is far from over. Look for a lot of news about COVID-19 outbreaks as they try to distract people from the election.” Az a helyzet, hogy itt a retardáció sajnos tényleg elért egy kritikus szintet. Ugyanebből a cikkből egy idahói közegészségügyi testületi tag beszél orvosokhoz: “The question I’d be asking myself if I were you is, something is making these people sick – and I’m pretty sure it’s not coronavirus – so the question you should be asking is, what is making them sick?” Mint említettem. Retardáció.
  • Trump "dolgozik" tovább. Most éppen New Yorkot zárná ki a vakcinaterítésből, mert saját maga is bevizsgálná a szövetségi kormány által biztosított vakcinákat, több más szövetségi államhoz hasonlóan. Itt írtam az "álnök" személyiségéről.
  • A héten volt újabb biztosra dokumentált, genomszekvenált újrafertőződéses eset. Megszámoltam, a 25 ismert esetből 40%-nál (10 eset) járt súlyosabb második lefolyással, 20%-nál (5 eset) a lefolyásról nincs adat, 20%-nál (5 eset) enyhébb volt a lefolyás, 20%-nál pedig (5 eset) változatlan volt a lefolyás jellege. Feltételezve, hogy a "nincs adat" nem súlyos lefolyásról szól, vagy éppen elfogadva, hogy ott is lehetett súlyosabb a lefolyás a második alkalommal, arra jutunk, hogy 40-60%-nál volt súlyosabb a második lefolyás. Persze a dokumentált újrafertőződések közé jóval nagyobb valószínűséggel kerül súlyos lefolyással járó eset, így a 40-60% inkább felfelé tévedés.
  • Némi hasznos vakcinamatematika, és adatok pl. a Pfizer tesztprogramjából: 86 megbetegedés volt a placebósok és csak 8 a valóban oltottak között, ami relatív kockázat szempontjából nyilván elég jóra jön ki. Mindez megfigyelt súlyos mellékhatások nélkül.
  • A helyzet El Pasóban, Texas. Közegészségügyi káosz. A túlcsorduló járvány kapcsán máshogyan dönt a városi, a megyei és a szövetségi tagállami hatóság, és máshogyan a bíróság.
  • A favipiravir hazai gyártásával kapcsolatos várakozásokról. Kritikus rész: "a kórházi kapacitások szűkülésével egyre fontosabb, hogy a gyógyszert a vírusfertőzöttségre utaló tünetek megjelenése után minél hamarabb, akár már az alapellátásban megkapják a betegek". Kár, hogy százezerből kb. ha egy érti jelen állás szerint, hogy ebben az egy mondatban mennyi alvó akna hever szerteszét.

2020.11.16-22.

  • Oroszország, Szamara. Egy orosz modell elhunyt édesapját keresve a hivatalos statisztikák kulisszái mögé nézett.
  • Boris Johnson ismét karanténre szorul, bár egyelőre csak kontakt miatt.
  • Az Egyesült Államokban (is) ott van az emberekben a fatalizmus tömegesen (poll). Az ünnepi szezonra, ami először is a Hálaadással érkezik, az emberek nagy része laza szocializálódásra készül. Közben Biden egyelőre a tranzíciós kormányzati finanszírozáshoz sem fér hozzá (Trump elzárta előle), és hírszerzési felkészítést sem kap.
  • Eset. Autoimmun beteg, immunoszuppresszív kezeléssel. A vírusszáma újra és újra nőtt, visszatérő jelleggel (Ct érték mozgott le és fel), és a 154. napon halt meg ARDS és sokk hatása alatt. Nem újrafertőződött, ugyanaz a vírus perszisztált és mutálódott benne folyamatosan, számos változással a spike, illetve a receptorkötő domén aminosav-szekvenciájában.
  • Ez a tanulmány pedig az N439K (a receptorkötő motívumot, RBM) érintő mutációt találja a humán ACE2 (hACE2) receptorhoz jobban kötődőnek, és azon felül antitestek (köztük monoklonális antitestként gyártottak) jó elkerülőjének.
  • Szigorú svéd intézkedések.
  • A múltkor idéztem egy tweetet, ahol egy szülő a 12 éves gyermeke fogvesztéséről számolt be COVID nyomán, erek károsodásának következtében. Úgy tűnik, nem egyedi eset.
  • A magyar egészségügyben elérhető különszobákról, ahol olyanok helyezhetők el, akiknek a kórtermi jelenléte zavarhatná a megszokott működést... pl. celebritásoké... Forrás: Majka.
  • Dél-Dakota: páciensek tagadják a vírus létezését a végsőkig.
  • DW-doku, meg lehet benne nézni, hogyan lehet PCR-tesztet csinálni egy denevéren. Plusz betekintés egy illegális település életébe őslakos-földeken. Egészségügyi ellátás nincs az illegalitás miatt, evangélikus keresztény templomok vannak. Alább pedig Manaus, az amazóniai metropolisz — időzített ökológiai bomba?
  • manaus.jpg
  • A Moderna közben az előzetes adatai alapján 94,5%-os hatásosságot jelent.
  • Klaszter a genfi WHO-központban.
  • Salát Gergely kollégám igen találóan fogalmazta meg a lényeget az ázsiai és a nyugati megközelítés különbségéről a pandémiával kapcsolatban, pl. hogy Ázsiában "az általános értékrend szerint a szépkorúak nem a liability, hanem az asset rovatban szerepelnek". Ha valaki megkérdez, mi dühít/aggaszt a legjobban a jelenlegi járvány kontextusában, az egyebek mellett az alig bujkáló nihilizmus, ami az "elhunyt x többségében idős, krónikus beteg" mantrában ott van. 
  • Az immunmemóriát vizsgáló  kutatás (preprint). A spike-ot és az RBD-t kötő érett IgG antitestek titerét stabilnak találták 6+ hónap után (feleződés egy hónap alatt, majd hosszú plató hónapokon át), a memória B-sejtek számában még növekedés is volt 6 hónap elteltével (mind az RBD-re, mind a nukleokapszidra érzékeny B-sejteknél), a CD4+ és CD8+ T-sejtek feleződési ideje viszont 3-5 hónap körül van; a nyálkahártyánkat védő IgA-ban gyorsabb hanyatlás, detektálható szint alá 90 napon belül.
  • Olasz kutatók hype-olják erősen hihetetlen eredményeiket. Amiket a saját folyóiratukban hoztak le. Ellentmond mindennek, amit az elmúlt tíz hónapban láttunk, de azért hajrá. Hülyeségből soha nem elég.
  • Egy korábbi állás szerint (amit itt említenek) a Pfizer programjában 8 átoltott lett fertőzött, szemben 86 kontrollal. Az alapján volt anno 90%-os hatásosság jelentve. Most ez felment 94%-ra, és a kontrollok között már 162 fertőzöttet említenek, miközben az átoltottak közül senki új nem lett fertőzött. A kontrollok bátrabban viselkedtek a kelleténél a hatásosságról szóló korábbi hírek hallatán? Csak hogy egy jóhiszemű magyarázatot említsek arra vonatkozóan, hogyan léphet fel torzítás ebben. A puszta lehetőség is mutatja, hogy ezért nem célszerű előzetes adatjelentésekkel szórakozni.
  • 1109 kórház jelent személyzethiányt az Egyesült Államokban (megbetegedő eü. személyzet + beözönlő-ellátandó betegek miatt). Az ottani kórházak 22%-a, vagyis akkor 5009 kórházuk van, ezek szerint.
  • Hét entitás, ahol nyérceknél mutálódott SARS-CoV-2-es átkerült emberekre: Utah (USA), Feröer-szigetek, Svájc, Dél-Afrikai Köztársaság, Dánia, Hollandia, Oroszország.
  • Ez egy érdekes YouTube-csatorna, már korábban is idéztem (RUN-DMC). Itt pl. arról közöl felmérési adatokat (megszólalni kész long-haulerek self-reported adatain alapul, úgyhogy óvatosan kell kezelni), miszerint az influenzaoltással a COVID-tünetek elhúzódása valamivel valószínűbbé válhat. Ez a videó pedig a long COVID okairól spekulál: enter the Mast Cell Activation Syndrome. Továbbá: virális perszisztencia a vékonybélben. Fennmaradó antigén-jelenlét: tán csak nem a vírus által breakout roomnak feltekert endoplazmatikus retikulum buborékainak visszamaradásával (?), kérdem én. És persze a tartósan megmaradó autoreaktív antitesteknek is lehet szerepe.
  • A sziráki mAb-gyárról, Lukács Noémi cégéről (English & Scientific Consulting (SciCons)), mely a szintén magyar inputtal (Katalin Karikó) dolgozó BioNTech-nek is beszállítója.
  • DW-tudósítás a nyérchelyzetről Dániában. Meg lehet nézni, hogyan zajlik a leölés: CO2-vel, speciális tartályokban, utána pedig elégetik a tetemeket, tehát a szőrmét sem hasznosíthatja a tenyésztő. Anders Fromsgaard dán kutató mondja: "a vírus úgy mutálódik a nyércek között, ahogy ezt az embereknél nem látjuk". Hát igen. Ez a vírus a kezdetektől a hACE2-re volt optimalizálódva, mint azt már korábban is megállapíthattuk.
  • Tanulmány: eredményei szerint a pandémia előttről származó, az OC43-as koronavírusra válaszul megjelent, és akár a SARS-CoV-2-re is kimondottak reagáló antitestek nem bizonyultak a SARS-CoV-2-t hatékonyan neutralizálónak, és nem biztosítanak immunitást úgy, ahogyan abban egyesek reménykedtek.
  • A CNN kicsit zagyva beszámolója a Sinopharma vakcinájáról, melyet már némi sikerrel használtak, részben tesztjelleggel, részben külföldre készülők átoltátásra. A Huawei mexikói irodájában pl. 99-ből 81 átoltott nem lett beteg, tíz átoltatlan viszont igen. Kis utánajárással és dedukcióval az is kiderül, hogy inaktivált vírusos vakcináról van szó.
  • Az ilyen történetek kapcsán látszik, hogy ami számos nyugati országban történik az a védelemre szoruló populációk nem-teljesen tudatos döntés általi meg-nem-védése mindenféle egyéb érdekek és érdeklődések folytán. Az angliai kontaktkutató és mintatesztelő (test and trace) programot kiszervezték, és az NHS szinte teljes kihagyásával mindenféle cégekre bízták, köztük totál kóklerekre is. Alább ábra arról, ki mindenkinek jutott falat (BBC).

sarscov2_british_test_and_trace.png

  • Az amerikai Hálaadás ünnepe vegyes előjelekkel szolgál. Emberek özönlenek tesztekért, így sok fertőzött kiszűrhető lesz. Viszont azért özönlenek, mert amúgy alig várják, hogy vegyülhessenek. Szóval... :(
  • Gyors körülnézés a vírusok világában a koronán túl. A madárinfluenza fenyegetése fokozódik a baromfiállományok szempontjából Európában. Egy tavalyi bolíviai Chapare-vírus-kitörés nyomán megerősítve, hogy volt átadás emberről emberre — ez VVL, azaz vírusos vérzéses láz, és az ilyesmiről tájékozott embernek a cocoliztli-járványokra illik gondolnia, hogy ne vegye a dolgot fél vállról. Végül: algákban komplett makrovírus-genomokat találtak beépülve a gazda DNS-ébe. Az ilyen genom a gazdasejt számára fontos géneket is kódol érdekes módon, nem is keveset, a teljes együttélésre van tehát berendezkedve. Mindez a vírusok eredetét illetően is érdekes spekulációknak teremt alapot.
  • A Roche/SD Biosensor-féle antigén-gyorstesztek egyáltalán nem is olyan rosszak, pláne ha magas vírusszámmal (Ct <30) nevez valaki tesztelésre, vagy pl. a tünetek jelentkezésétől 7 napon belül. (Blast from the past: amikor az NNK ennek az ellenkezőjét hirdette.)

Új bejegyzésben folytatom.

Koronavírus: The Fall Semester II.

Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

"Nem érdemes a saját magatartásunkkal akár csak kockáztatni is egy olyan helyzetet, ahol a gazdaság megbénítása és a gazdaságnak a járvány általi letarolása közötti látszólagos választás adódik csak. Azt hívják úgy, hogy vereség." Írtam — viszonylag fontosnak gondolva ezt — július 23-i cikkemben, annak idején. Szeptember 28-án visszatekintve azt kell, hogy mondjam, nem volt sem teljesen elkerülhető, sem teljesen elkerülhetetlen, ami azóta következett. A lehetséges jövők kitáruló spektruma így működik. És mindez az elkövetkezőkre is igaz.

2020.09.28-10.04.

  • A Worldometers naprakész összesítésében már egymillió felett a hivatalosan regisztrált halálesetek száma.
  • Indonézia: egy data science-es, crowdsourcingra is épülő elemzés kihozta, hogy augusztus közepéig tízezer fővel többen halhattak meg ott COVID-ban, mint amit a hivatalos adatok mutatnak (igen gyenge tesztelési kapacitások mellett, úgy, hogy a szigetvilág egy részében az állam jelenléte csekély). Egy ausztrál epidemiológus is hasonló következtetésre jut, említve, hogy az indonéz hatóságok is játszanak az "amúgy is beteg vót" logikával a halálokok megállapításakor. Az általam Indonézia kapcsán eddig figyelembe vett plusz haláleseteket (2983+450) levonva ez így +6567 fő halálozás a hivatalos adatok fölé. Globális addicionális halálozás (g.a.h.) így: +307219+n.
  • A teljes globális halálozás konzervatív (azaz csakis alsó értéknek felfogható) állása 1,3 millió felett van tehát. Kevésbé konzervatív felmérések ebben a tárgyban már 1,8 milliónál járnak, szóval az enyémet így tessék nézni.
  • A SARS-CoV-2 elleni vakcinagyártás őrületes nyomást helyezhet a szkvalénkínálatra, azon keresztül pedig a világ cápapopulációjára, mivel ez az olaj a cápák májából származik elsődlegesen, és ún. adjuvánsként használják vakcinákhoz, mely feljavítja a vakcina hatását, erősítve az immunválaszt, tartósabban kitéve az immunrendszert a számára prezentált antigén stimulációjának. Vannak amúgy növényi szkvalénforrások is, pl. az olíva.
  • Mint az alábbi linken letölthető jelentés trendjei után a jelen helyzetet odagondolva látszik, HIV/TB fronton brutálisan kedvezőtlen következmények várhatók a SARS-CoV-2 világturnéja nyomán.
  • Az RTL híradója említett ma vízilabdázókat, akik közül egyikük kétoldali tüdőgyulladással, a másik kétoldali tüdőembóliával küzd a COVID szövődményeként — utóbbi felépülését edzője hónapok nyomán várja. Talán ideje lenne ezekről az esetekről írni részletesen, és nem csak annyit elmondani, hogy "meghalt x idős, krónikus beteg". Talán elég annyit mondani, hogy elhunyt x ember. Ha minden áron az epiteton ornans kell a jelzett szó helyett, akkor rövidítsék: "elhunyt x IKB" - végül is ennek a diskurzusnak az áldozatok dehumanizálása a lényege, és akkor ez úgy őszintébb lenne.
  • A brit egyetemek újranyitása nagyon rosszul sült el, már most bizton elmondható.
  • Jönnek a hírek arról, hogy gyerekek bántják egymást azon az alapon, hogy valaki "koronás" (hetekkel a fertőzöttsége után is), hát felidéztem ezt a kis cikket korábbról, Izsákról, ahol ugyanígy "koronás" család stigmatizálásával egybekötve volt polgármesterváltás. Never understimate the cultural determinants of health.
  • Upsz, ez a cikk elkerülte a figyelmemet. JAMA. Fiatalok súlyos COVID-dal, Hollandia (4 fő, közülük egy meghalt). Genetikai eltéréseket kerestek náluk, és ami közös: "loss-of-function variants of the X-chromosomal TLR7". Vagyis (sejtszinten) a 7-es tollszerű receptoraik kevésbé jók vírusok azonosításában, pl. 4 nukleotidos törlődés miatt, vagy egyéb genetikai alapokon, következményként lefelé szabályozott interferon-jeladással.
  • Retrospektív tesztelési adatokból nézve (influenzaszerű megbetegedés nyomán vett toroktörletekből) Seattle-ben lehetett 6500+ tünetes fertőzött március 9-re.
  • A Universal Health Services kórházláncot ért ransomware-támadásról, az Egyesült Államok mellett az Egyesült Királyság is érintett. Az orosz vagy észak-koreai eredetű Ryuk zsarolóvírust használták a támadók, akik persze akárkik lehettek jelen állás szerint.
  • Így néz ki, ha az ECDC adatai alapján összehasonlítjuk Magyarországot Németországgal, korcsoport szerinti bontásban nézve a fertőzések számának alakulását. A német siker lényeges eleme, hogy a sok teszteléssel megtalálják és elkülönítik a fiatal fertőzötteket, és mellesleg az idős fertőzötteket is relatíve korán fedezik fel. Nálunk (Európában nem egyedülálló módon) az idősek között is elindul sajnos felfelé a görbe, és ez a halálesetek számában is megmutatkozik. A legsötétebb színű vonalat érdemes követni. A németeknél marad lapos az ősz elérkeztével is, egyelőre.

sarscov2_hungary_v_germany_byagegroup.jpg

És még egy fontos ábra, akkor már. A svédeket annyira emlegetik Pannonfalváról a semmittevés üdvösségének példájaként, hogy íme, lehessen már megtekinteni, pontosan miket csináltak a járvány ellenében. Köszönjük, ECDC! (Ehhez képest a svédeknél meglepően rosszak az eredmények — talán éppen a maszkviselést illetően követte el a legnagyobb hibát a Tegnell-féle társaság, hiszen egyebekre valójában odafigyeltek ők is. By the way, most már kifejezetten sokat tesztelnek, kb. dupla annyit, mint mi, népességarányosan nézve.)

010_sarscov2_swedenmeasures.jpg

  • 20 dokumentált, laboratóriumilag megerősített eset eddig a Reinfection Tracker adatai szerint. (Négy új Katarban.) Ha figyelembe veszem, hogy itt jelentős látencia lehet (mert vagy az első, vagy a második alkalommal, vagy mindkét alkalommal, nem megy valaki orvoshoz, pláne ha aszimptomatikus, plusz nem fogják minden ilyen esetben szekvenálni a benne lévő vírust), és hogy a populáción belül kisebbséget képező fertőzött populációval való érintkezés valószínűsége messze nem 100%-os, pláne kontaktredukciót célzó intézkedések és a fertőzöttek elkülönítésére irányuló erőfeszítések mellett, és mondjuk 1000 esetet feltételezek, akkor ez az eddig regisztrált esetek 0,003%-a lenne például. Persze ez csak egy guesstimate. Ha 10000 ilyen eset volt eddig, akkor az eddigi regisztrált esetek 0,03%-áról beszélünk. Lehet-e még több is? Valószínűleg lehet, aszimptomatikusan, pont a relatív védettség miatt, ami után a tünetmentes fertőződés (sajnos fertőzőképesség mellett) reális lehetőségnek tűnik. Ha ez így van, akkor ez a járvány sokáig tud égni.
  • Ukrajnában tegnap 4000+ új eset és 64 halott volt. Közben láttam a hirdetésüket, hogy szeptember 28-tól újra fogadnak turistákat.
  • Fontos: az ACT Accelerator kezdeményezés (ACT=Access to COVID Tools) részeként jönnek a dél-koreai és amerikai gyártású gyorstesztek (eredmény 15-30 percen belül) az alacsony és közepes jövedelmű országok számára — és másoknak is. A gyártó cégek a dél-koreai SD BioSensor és az amerikai Abbott. A Gates Alapítvány a finanszírozók között, a WHO koordinál, gazdag donorországok is beszálltak. Ez egy antigénteszt egyébként. Kieg.: itt a kezdeményezés hivatalos oldala. A résztvevő országok között nincs ott az Egyesült Államok; "governments of Austria, Belgium, Canada, France, Germany, Italy, Mexico, Morocco, New Zealand, Norway, Saudi Arabia, South Africa, Spain, and the United Kingdom, and the European Commission have so far committed".
  • Figyelemre méltó adalékok Gődényék és más egyének és szervezetek kapcsolatairól...
  • Moszkvában beteltek a kórházak. Október 5-től 18-ig iskolai szünet lesz.
  • Donald Trump a legfőbb dezinformátor a COVID-válság során (is) az Egyesült Államokban. Az "is" zárójelben tőlem került oda, a többi kvantitatív elemzés eredménye. Viszont a tanulmány azért nem tökéletes, mivel a Trumpot dezinformációval összefüggésben említő cikkeket számolja, azok pedig tévedhetnek is, vagy pl. sokat lovagolhatnak egy-egy témán, és ennek részeként több cikket is írhatnak egy-egy megnyilvánulásról.
  • A Lancetben gyűlnek a tanulmányok, melyek szerint napokon át semmiképpen sem maradnak fertőzőek cseppekkel beköhögött felületek. Itt van egy. Itt meg még egy, ez az újabb.
  • Schengen egén felhők gyülekeznek. Már régebb óta, legalább a 2015-ös migrációs hullám és az iszlamista merényletek óta, de a COVID miatt megsokasodtak. A színkódos országosztályozós rendszer kísérlet a tagállami önkény korlátozására a járványhelyzet megítélésében, várhatóan nem túl nagy hatékonysággal.
  • A Moderna tavasz előttre nem ígér vakcinát elérhetőnek. A Pfizer/BioNTech nem ennyire óvatos a maga mRNA-vakcinájával, úgyhogy már volt is szakmai nyilatkozat, amely lassításra intette őket. A háttérben ott van a novemberi elnökválasztás is az Egyesült Államokban, és hogy Trumpika elmondhatja-e, hogy ledöfte a koronavírust.
  • A nyár híre volt, hogy Szerbia csak a COVID-halálesetek felét jelentette le. Azóta kiderült, hogy inkább csak a harmadát. Az ezt beismerő tisztviselő magyarázata: algoritmushiba. Minden másra pedig a rakija a megoldás, nyilván.
  • Van olyan szakfolyóirat, hogy "A korosodó férfi" (The Aging Male), és török kutatók jelentik benne, hogy súlyos COVID-nál eshet a tesztoszteron, elvész vele annak gyulladáscsökkentő hatása stb. Más virális fertőzéseknél is van ilyen, szóval még lehet is benne valami.
  • Christian Drosten előrejelzései. Érdemes figyelni, milyen időhorizontokban gondolkodik. 
  • Trump pozitív.
  • Az "agyturkálós" orrba nyúlós mintavétel intrakraniális hipertenzió miatt korábban beültetett sönt után sajnos átcsusszanhat konkrét agyturkálásba nagyon-nagyon ritka esetben. Annyira ritka, hogy erről az egy esetről tudunk itt, ni.
  • Kanadában elmondták a lakosságnak, hogy 2-3 héten belül lesz néhány százezer gyorsteszt az Abbottól, majd utána a következő év elején lesz még kétmillió-valamennyi. A járvány aktuális alakulása mellett ezek elég fontos eszközök lesznek.
  • Eszembe jutott, vajon aktiválhat-e TB-fertőzést a COVID, mivel ez logikus lenne. Úgy tűnik, hogy az ilyesmi előfordul.
  • A sem a GDP-hez nem elengedhetetlen, sem a diákok által nem igényelt egyetemi tantermi oktatás körüli piszkos játékról. És hozzá az emberi hülyeség egy arany keretbe foglalható példája: "...after years of pushing to expand online learning and “lecture capture” on the basis that it is what students want, university managers have decided that what students really want now, during a global pandemic, is face-to-face contact. This sudden-onset fetish reached its most perverse extreme in the case of Boston University, which, realising that many teaching rooms lack good ventilation or even windows, decided to order “giant air circulators”, only to discover that the air circulators were very noisy. Apparently unable to source enough “mufflers” for the air circulators, the university ordered Bluetooth headsets to enable students and teachers to communicate over the roar of machinery."
  • El ne felejtsem leírni: minden tiszteletem dr. Jakab Ferencé a határozott kommunikációért, amit a napokban folytat. És én is leírom: a lázmérőzés nettó teatralitás. A járványhelyzet pedig igen randa!
  • Az Egyesült Államokban eddig 935 esete fordult elő az MIS-C szindrómának, vagyis a gyerekeknél COVID-hez kapcsolódóan fellépő többszervi gyulladásnak, eddig 19 halálos áldozat mellett. A szindrómát most már felnőtteknél is leírták, úgyhogy innentől van MIS-A (Multisystem Inflammatory Syndrome in Adults). Csúnya dolog, hogy a MIS-C és a MIS-A gyakran már vírusnegatív embereknél lépnek fel.
  • A kommentek közül érdemes ide kiemelni: a favipiravir, ami Japából jött, antivirális szer. Víruska reprodukálódik. 2-ből lesz 4, 4-ből 8, 8-ból 16 stb. Kis leegyszerűsítéssel. A vírusreprodukciót akadályozni kis számoknál érdemes, nem akkor, amikor valaki már kórházban van súlyos állapotban, amikorra elözönlötték a vírusok. Ezek után nálunk csakis az utóbbi esetben akarják használni ezt a szert. Nem fér a fejembe ez.
  • Nem rossz cikk, de ami fontosabb: a Telexen.
  • Végigkövették a koronavírus-antitesttiterek alakulását 10 holland férfinél az 1980-as évektől (513 mintát tudtak ehhez megnézni), és 3-17 kiugró titernövekmény kapcsán kb. ennyi újrafertőződést valószínűsítenek következtetésként. (Félreértések elkerülése végett: NL63, 229E, OC43 és HKU1 koronavírusokról van szó.)
  • A SARS-CoV-2 hörcsögöknél, részletes adatok. Idősebb egyedek itt is rosszabbul járnak. Ugyaninnen kis "érdekesség": "Mice are not naturally susceptible to SARS-CoV-2, but mouse-adapted virus strains have been developed and used in BALB/c mice". Utánamentem a hivatkozott tanulmánynak, onnan is idézek: "We used reverse genetics to remodel the S and mACE2 binding interface resulting in a recombinant virus (SARS-CoV-2 MA) that could utilize mACE2 for entry" (megj.: S = spike protein; mACE2 = mouse ACE2 receptor).
  • 15 éves szlovák lány, a koronavírus végzett vele. Tavasszal. Utólag derült ki. Öt másik emberről is Szlovákiában. Így lehet a járványnak a hivatalosnál több áldozata, többek között. Ha valakinek — például az életkor miatt — eszébe sem jut a koronavírus, annyit hallotta már az "idős, krónikus beteg" mantrát. Az IKB mantra veszélyes.

2020.10.05-11.

  • Trump betegségével kapcsolatban az egyik legnagyobb kockázatnak azt látom, hogy miután átesik rajta (ő, ellentétben a "virtually nobody" elhunytakkal, korán kapott antivirális szert ugyebár), elő fogja adni az egyéni hülyeségeit a betegség lefolyásáról és a kezelésről, mintha értene hozzá, és mintha nem lenne a COVID lefolyása kb. ezerféleképpen lehetséges egy helyett. Már videóra mondta, hogy "sokat tanultam... már értem, hogy mi ez... és el fogom mondani". 
  • Érdekesség, hogy most már dexametazont is használtak nála, ami súlyos eseteknél a gyulladási folyamatokat mérsékelni hivatott. Viszont Trump közben szerepel, kiment a kórházból autókázni is egyet. A szteroidok nyilván segítik, hogy pörögjön, de az immunszuppresszión keresztül felülfertőzési kockázata van ennek akkor is, ha az állapota esetleg nem is olyan súlyos.
  • Óriási: ahogy korábban a hidroxiklorokinról és a remdesivirről, a lopinavir-ritonavir kombóról is sikerült randomizált vizsgálattal kimutatni, hogy kórházba kerülteknél nincs szignifikáns/kedvező hatása. Kórházba kerülteknél. Virális replikáció elleni szer megdöbbentő módon virális replikáció ellen való. Nem utólag. (Amúgy a "randomizált" vizsgálat azzal együtt értelmezendő, hogy a bekerülni készeket randomizálták, és aki kész bekerülni ilyenbe, az alighanem inkább aggódik, mint nem.)
  • Trumpikának le kell döfnie a koronavírust november 3. előtt. Úgyhogy a vakcinabiztonságosság sem lehet elég fontos szempont, hogy ezt felülírja. 
  • Ha ez nem szuperterjesztős esemény, akkor annál érdekesebb. A linkelt hír szerint 200, valójában mostanra már 320+ fertőzött a MOL tiszaújvárosi telepén, sokan vendégmunkások.
  • Trumpika személyesen gyakorolt nyomást a vakcinafejlesztőkre, hogy fejlesszenek már gyorsabban. 
  • New York államban egy 80 éves férfi elhunyt, miután fellökte egy maszkot viselni nem kívánó szociopata. (G.a.h.: +307220+n.)
  • A magyar intézményrendszernek komoly tesztje következik. Íme, egy október 3-án elhunyt COVID-beteg, aki egyelőre nem tűnt fel a hivatalos számlálóban, ahol életkor alapján felismerhetően közlik a betegek személyes adatait. 39 éves tanár volt. Kieg.: Müller Cecília az igazolás (a már rég meglévő zárójelentés) "igazolódására" vár, és akkor majd biztosan bekerül szerinte ez az eset is a számlálásba. Vajon más igazolások igazolódására is várnak még a Szervek? Ez egy sztenderd folyamat? És akkor a halottak száma sem naprakész? Csak olyan, mint a csillagfény — egy múltbéli állapotot közvetít felénk? Kieg.: október 9-re sikerült pótolni az adatot, úgyhogy az előbb feltett kérdések relevánsak.
  • Közben a tesztelési teljesítmény összeomlott, és elképesztő, hogy ezt a Szervek inkább elfogadják, mint hogy megoldják nem-központi laborok bevonásával. Ennek ára van.
  • A nemzeti konzultációról bevallott (government-self-reported, hogy úgy mondjam) adatok alapján a kijárási korlátozásokhoz is adott többségi támogatás, még ha nem is akkora többség ez, mint pl. a maszkviselés vagy a távolságtartás szükségessége kapcsán. Az említett adatok szerint.
  • A WTF-kategóriás kormányválságról Lengyelországban. Én amúgy a nyércekkel vagyok, 1000%-ig, de az vicces, hogy most, amikor a koronavírus miatt elhalóban a nyércbunda-kínálat, Kaczyński személyes preferenciáiból következően robbant ki kormányzási krízis Varsóban a nyérctenyésztő farmokkal kapcsolatos tilalom, és más, az állatok védelmét célzó szabályozások miatt.
  • Visszatekintve egy kicsit Trumpika kalandjára a VIP-gyógyítás terén: elkerülte a figyelmemet, ami az M.D. és a D.O. diplomákról diskurzusként kibontakozott. Trump orvosa, Sean Conley D.O., és ezért nekiestek, mint a hidroxiklorokinnak — Trumpikával asszociálódni nem jó, és érdemtelen kritikához is vezethet.
  • Még mindig az USA-nál maradva: az alelnöki vita a héten megmutatta, hogy azért értelmesebb és emberibb vitára is sor kerülhet politikai ellenfelek között.
  • Nálunk: az új PCR-teszt kell, mint egy falat kenyér, mert már Oroszi Beatrix is elmondta, hogy a tesztelési kapacitás beomlott. Amit amúgy rég tudunk, de hogy ő is nyíltan beszél róla, az fontos jelzés. Hogy hogyan is állunk, azt indikátorként az is jelezheti, hogy a miniszterelnök "elkezdődött a gazdasági kilábalás" jellegű üzenettel jön az ellentétes előjelű közegészségügyi helyzet közegében. "Ha Varga Mihány azt üzente, azt nyugodtan megkétszerezhetjük" stb. (parafrazeáltam).
  • Közben Facebookon olvastam betegbeszámolót, amiből kiderül, hogy már lövik el a frissen vásárolt Remdesivirt nálunk. Az érintettnél 9 nappal a tünetek jelentkezése után kezdenek ötnapos kezelést vele, már kialakult szövetközi tüdőgyulladás mellett. Háziorvosi bevett eljárás megvolt, a tüneteinek a jelentkezése óta szed antibiotikumot. 
  • A kommentek között szóba került alább, hogy még mindig vannak, akik nem értik, hogy a COVID embereket öl. El lehet mondani, hogy New Jersey populációjának 0,18%-a, Peru lakosságának a 0,1%-a halt meg eddig, vagyis ezeknél az értékeknél kisebb az IFR és a CFR már nem tud lenni, ellenben magasabb még bőven igen. Vagy el lehet mondani azt is, hogy eddig 55 országban emelkedett 1000 fölé a regisztrált halálesetek száma. Szerbiában és Nicaraguában enélkül is valószínűsíthető, hogy volt már 1000 áldozat. Csehország és Magyarország pedig a következő két ország lehet, ahol az ezres határ átlépése bekövetkezik (a "lehet" csak azon múlik, hogy más beelőz-e; az átlépés maga nem kérdéses).
  • Egy immunológus értekezése a COVID hatásairól. Korai extrafollikuláris immunreakció nyomán kikerülő diszfunkcionális antitestekről, melyek egy része szerinte a lupusnál látható ANA-kra (antinukleáris antitestekre) emlékeztet.

2020.10.12-18.

  • A Lancet több olyan cikket hozott le az utóbbi időben, miszerint a fertőzött felületeken keresztüli indirekt kontakt útján nincs is nagyon transzmisszió, de kételyeim vannak, amikor ilyen tanulmányokat látok, ahol akár 28 napig is fertőzőképes vírusrészecskéket találnak egyes felületeken (igaz, UV-től és egyéb roncsoló környezeti hatásoktól mentes környezetben).
  • Qingdaóban találtak néhány helyben megfertőzött embert (importált eseteket kezelő kórház körül), ezért az immár hagyományos kínai megközelítésben jön a tömeges, gyors tesztelés. Elvágják a terjedés útjait. Így aztán nincs gazdaság vs. egészség problematika, nem kell az elhunytakat "nemisabbanmeghaltakként" kimagyarázni, izzadni, hogy meddig mehet a pozitivitási ráta, vagy hogy Pistike tartja-e Sanyikától a másfél méter távolságot a játszótéren... Egy helyesbíteni való van persze, és ezzel azt is illusztrálnám, mennyire nem szabad semmit fixnek tekinteni egy ilyen járványhelyzetben: ahogyan jön a tél, valójában Kínának is nehezebb dolga lesz az ilyen kitörések megállításában.
  • Az Egyesült Királyságban e szerint a cikk szerint "mozgalom" lett a human challenge trialek érdekében. Jelentkeznek önkéntesek, hogy ilyen formában essenek át oltáson is, betegségen is. Kérdés, hogy egy placebós csoportot ki tesz ki szívesen fertőzésnek... az AstraZeneca, a Sanofi-GlaxoSmithKline és a BioNTech fejlesztőcsapatok egyelőre elzárkóznak ettől.
  • A Johnson and Johnson-féle III. fázisos vakcinatesztelésben is felbukkant egy megbetegedett személy (az AstraZeneca után), akit először ki kell vizsgálni, mielőtt a program folytatódhat, a vizsgálat eredményének függvényében.
  • Rossz hír Hollandiából: egy újrafertőződött személy elhunyt. 89 éves hölgy volt a beteg, 54 nap telt el a két betegsége között. Az első alkalommal még relatíve enyhe volt nála a lefolyás (láz, köhögés, az akut fázis után tartós kimerültség). Rákos beteg volt (Waldenström-féle makroglobulinémia), és kemoterápiát kezdett kapni közvetlenül az újrafertőződés előtt, aminek itt nyilván jelentősége volt (link az eredeti tanulmányhoz).
  • Idehaza a tesztelés mellett a kontaktkutatás sem tud felpörögni a helyzet kezeléséhez (szeptember 18. óta csökken a karanténezettek száma). Pedig jó lenne megvédeni a gazdaságot, I'm all for it, de pont ezek a dolgok kellenének hozzá, amik itt nem mennek. Az ECDC-nél érdemes megnézni a magyar adatokat, az idősek aránya a fertőzöttek között tovább nőtt, ráadásul gyorsuló növekedéssel, október elején.
  • Tanulságos beszámoló (WaPo).
  • Peter Daszakék jelenleg a Swine Acute Diarrhea Syndrome (SADS) koronavíruson dolgoznak felbukkanó jelleggel jelentkezni képes patogének keresgélése közben, és aggasztónak találják, ahogyan emberi sejteket is fertőzni, és bennük reprodukálódni tud.
  • A WHO részéről üzenet azok számára, akik a WHO üzeneteit szeretik idézni: a nyájimmunitás mint úgynevezett stratégia sikeressége kétséges, természete immorális.
  • Visszatekintés arra, hogyan uralkodott el március 12-13-án egy rövid időre a nyájimmunitás gondolata a brit kormányzaton belül, mielőtt visszakoztak volna.
  • Megálló ismeretlen okból az Eli Lilly monoklonálisantitest-kezelésének vizsgálatában. (Ez egy koktél alapú mAb-kezelés, kétféle antitesttel.)
  • Az Egyesült Államok esetében eddig 43500 fő addicionális halálozást számoltam ezt dokumentáló forrásokból. A JAMA-ban egy tanulmány szerint márc. 1. és aug. 1. között az elvárhatót meghaladó szintű halálozás 20%-os volt (225530 fő halálozástöbblet). A tanulmány ennek 67%-át írja le COVID-halálesetnek (ezzel a kérdéses periódusban gyakorlatilag minden COVID-halálesetet extra halálozásként könyvel el, ami nagyon-nagyon konzervatív eljárás). 74425 főt tesz ki a fennmaradó 33%, ebből a korábbiakat kivonva, a különbözetet felszámítva globálisan a g.a.h. = +338145+n.
  • A linolsav akadályozza a SARS-CoV-2-t, mert a tüskéire akaszkodik, és azokat az ACE2-receptorokkal való kötődéshez kedvezőtlen konformációban tartja.
  • Kicsit hozzászólok a "Great Barrington Nyilatkozat" kérdéséhez is. Erről a következőket kell tudni (5 pontban szedem össze.)
  • 1) Három, szakmailag más körülmények között komolyan vehető tudósember indította a messzi Massachusettsből...
  • 2) ...ugyanők viszont kriminálisan komolytalan dolgokat csinálnak tavasz óta a mostani pandémia kontextusában. Hogy miért, arról csak spekulálni lehet. De Sunetra Gupta pl. addig játszott a paramétereivel, míg kimodellezgette márciusban (!!!), hogy addigra a brit lakosság fele áteshetett már a SARS-CoV-2-fertőzésen, amihez ez úton is gratulálunk neki. Jay Bhattacharya pedig benne volt a Ioannidisék-féle, gazdasági újranyitásban érdekelt légitársaság által pénzelt, minősíthetetlenül rossz kaliforniai szerológiai vizsgálatban.
  • 3) Maga a nyilatkozat kis tömegmészárlás lehetősége árán (persze biztosítanak róla, hogy ők ezt nagyon el akarnák kerülni, és becsszóra mindenki szuperóvatos lesz majd ezen a téren) nagy hosszú távú nyugalommal kecsegtet, ám sajnos a hosszú távú jótétemények ("nyájimmunitás") bizonyítéka nélkül, miközben a vakcina már a láthatáron (akkor meg eleve minek).
  • 4) A nyilatkozat online aláírható akárki által (Dr. Johnny Bananas és Dr. Person Fakename nem is késlekedtek!), és ennyire komoly következésképp véleménykifejezésként.
  • 5) A Trump-adminisztráció szemszögéből a nyilatkozat a támogató lobbizás esete (minthogy azt akarja, amit ők is akarnak), így boldogan rá is haraptak, hiszen a járvány fokozódása pl. fokozza a bizonytalanságot is, és segíti a republikánusok számára évtizedek óta fontos voter suppressiont (a vírustól sokkal inkább tartó demokrata szavazók távoltartását a szavazástól).
  • Más. Vagy nem is annyira más: nyájmészárlás. Egymillió nyérc lemészárlásával járt eddig az emberről menyétfélékre terjedés nyomán a koronavírus elleni védekezés. Értem, miért csinálták, de szomorú vagyok, és nem vagyok benne biztos, hogy nem lehetett volna kifinomultabban eljárni ennél, csak hát nem az volt a prioritás. Tudományos oldalról nézve: az idézett cikkben van utalás arra, hogy sok menyét elpusztult a fertőzéstől is, tehát náluk is van súlyos lefolyás, méghozzá viszonylag gyors, ha minden igaz. Az elhunyt állatok tüdeje (az elhunyt emberekéhez hasonlóan) nehéz, folyadékkal teli.
  • Megszólal és beszámol Tóth Kristóf, a SARS-CoV-2 miatt tüdőembólián átesett 24 éves vízilabdázó.
  • Szükségkórházak építése Csehországban.
  • BMJ case report: hirtelen hallásvesztés COVID nyomán, a második dokumentált eset eddig. Más virális fertőzéseknél is előfordul egyébként, pl. influenza, Lassa esetében — nem feltétlenül neuroinvazivitás, adott esetben inkább a szervezetben végbemenő gyulladás és immunreakció miatt. Itt az utóbbiról lehetett szó, mert a kortikoszteroidok úgy tűnik, javítottak a páciens állapotán.
  • Figyelemre méltó tanulmány (h/t Epikurosz): Influenza A vírus általi fertőzés felfelé szabályozhatja az ACE2 kifejeződését, és ezzel megágyazhat a SARS-CoV-2-nek (légzsáki epitheliális sejteken kipróbálva), amit (egereken) magasabb vírusszámban és tüdőkárosodás mértékében kifejezve is kimutattak. Na, mi jut nekem erről eszembe? Na, mi? Az 1918-as spanyolnátha-járvány. Ahol együtt keringőzhetett az akkori H1N1-variáns az 1889/1890-es szezonban debütált OC43-as koronavírussal. 
  • Szlovákiában lesz valami, csak a hírekből nehéz kihámozni, hogy mi, mert az újságírók máig nem értik a külöbséget vírus-, antitest- és antigéntesztek között. Talán a politikusok sem egészen? Szóval beszereztek sokmillió antigén-gyorstesztet, és lesz sok mintavételi pont, ez tuti. Ha tényleg mindenkit letesztelnek, akkor a cél a terjedés teljes felszámolása lehet(ne akár) (ha nem az, akkor az egész erőfeszítés értéke jóval kisebb). Kieg.: egyelőre nem biztosított, hogy mindenki kötelezhető legyen a részvételre.
  • Back to Square One. Trump tanácsadója újfent a maszkok hasznosságát kérdőjelezi meg. Ennyi rosszindulattal még sokáig fenntartható ez a járvány.
  • Olvastam már róla, hogy a MIS-A (Multisystem Inflammatory Syndrom in Adults) elfordulhat COVID után jelentős időközzel is, de ez az eset különösen randa. 20 éves páciens, aki gyógyulás után három héttel szaladt bele ebbe a kondícióba (intenzívre került vele, de túlélte).
  • Adatok post-COVID kondíciók előfordulásáról egy alacsony kockázatú csoportban. Nagyobbrészt fehérekből (87%), nőkből (70%), krónikus kondíciók által kis mértékben érintett 201 fős minta (kövérség: 20%, hipertenzió: 6%, diabétesz: 2%, szívproblémák: 4%; btw nőknél a kövérség sem számít annyira nagyon, mint férfiaknál), átlagéletkor: 44 év. SARS-CoV-2 megvolt, csak 18% volt hospitalizálva anno. Alacsony kockázatú, és jellemzően nem súlyos lefolyáson átesett minta tehát. Hogy állnak 140 nap fertőzés utáni medián idő elteltével? Fáradtság: 98%; izomfájdalmak (88%); légzési nehézségek (87%); fejfájás (83%). Folytatólagosan érintett szervrendszerek: szív: 32%; tüdő: 33%, vesék: 12%; máj: 10%; hasnyálmirigy: 17%; lép: 6%. Egy szervrendszeri érintettség: 66%; több szervrendszeri érintettség: 25%.

2020.10.19-25.

  • Qingdaóban találtak aktív vírust fagyasztott tőkehal csomagolásán.
  • Belgium csúnyán rácáfol minden félnótásra, aki már hónapokkal ez előtt arról beszélt, hogy a vírusnak hamarosan nem lesz elég fertőzhető ember az útjában.
  • Vietnami esettanulmány, érdekessége, hogy a kontaktkutatást teljes-genomos vírusszekvenálás is támogatta.
  • A magyar lakosság aktuális egészségi állapota krónikus kondíciók tekintetében. 60%-a azoknak, akik nagy hangon magyarázzák, hogy a COVID csak a betegekre veszélyes, nem csak kognitív problémákkal küzd.
  • COVID-haláleset légijáraton.
  • Iránban, ahol jelenleg a harmadik hullámnál tartanak, bejelentették, hogy az eddigi bejelentéseik nem voltak valósak.
  • Spanyolországban megint messze a regisztrált halálesetek felett a járvány áldozatainak valószínűsíthető száma. Július eleje óta 11000 fő elvárható feletti halálozás. Közben 5400 regisztrált COVID-haláleset volt. A különbözet felével (2800) számolva a g.a.h.: +340945+n.
  • Oroszországból +10194 addicionális halálesetet számoltam eddig + lehet tudni, hogy játszanak a számokkal, méghozzá elég nagy léptékben. Most itt vannak friss adatok és információk. Késéssel jelentett, továbbjelentett, majd pénteki késő délutánokon utólag nyilvánosságra hozott adatokból áll össze, hogy áprilistól augusztusig volt 115000 főnyi elvártat meghaladó halálozás náluk. Ha ebből kivonom a 17176 fő aug. 31-ig regisztrált halálesetet (=97824), a maradékot felezem (=48912), és kivonom belőle az eddig felszámolt extra haláleseteket is, akkor jön ki +38718 fő. De ez — ekkora elvártat meghaladó halálozás mellett — már tényleg irreálisan konzervatív számítási mód. Amihez ezzel együtt tartom magam. G.a.h. ezek után: +379663+n. (A teljes halálozás másfél millió felett, konzervatívan számolva.)
  • CDC: 299028 főnyi, az elvártat meghaladó halálozás az Egyesült Államokban október 3-ig bezárólag. 26,5%-os halálozásnövekmény az elvárthoz képest a 25-44 éves korosztályban.
  • Nem tartozik szorosan ide, de elképesztő: miután 2017-ben Trumpék gyerekeket választottak el a szüleiktől bevándorló családoknál, a 2018-as, néhány hónapig élt "zero tolerance" politika "pilot" programjaként (gyakorlati próbájaként), a 2017-es szétválasztottak közül több száz szülőt a gyerekeik nélkül deportáltak az országból. Most ott van 545 gyerek úgy, hogy egyelőre nem tudják, kik a szüleik (nyomoznak, hogy megtalálják őket).
  • Nunavutban egyelőre nincs koronavírus-fertőzött. A területre alig lehet beutazni. Egy ilyen járvány rájuk nézve különösen veszélyes lehet. Emlékszem Duncan Pryde Nunaga: Ten Years of Eskimo Life c. könyvéből egy részre, ahol új röntgenberendezést küldenek a helyiek jobb egészségügyi ellátása érdekében — és azzal együtt sajnos az influenza is megérkezik. Mivel az influenzának az ottaniak a történelmük során nem nagyon voltak kitéve, arat is közöttük csúnyán. (True story.)
  • Észak-Koreában többen köhöghetnek mostanában a szokásosnál, mert az ENSZ Biztonsági Tanácsa egy MSF-missziót hagyott jóvá, sok szankciók alóli felmentéssel orvosi felszerelésekre vonatkozóan, "a koronavírus és a tuberkulózis" miatt.
  • Melania Trump elhúzódó köhögéstől szenved.
  • Dr. Adorján Gusztáv nyíregyházi kórházigazgató halála.
  • Cikk a Magyar Hangban a long-haulerekről, többek között az itt, fentebb is tárgyalt tanulmány kapcsán, ahol elhúzódó tünetesek szervi rendellenességeit nézték.
  • A palesztin Saeb Erekat, a PFSZ vezetésének oszlopos tagja, az oslói megállapodás egykori főtárgyalója palesztin részről, ecmós kezelést kap Izraelben. Nem akarták simán lélegeztetőgépre tenni, mert 2017-ben tüdőfibrózis miatt tüdőátültetésben részesült az USA-ban, és kímélni kell.
  • 28 éves brazil orvos halála (COVID), aki az AstraZeneca-féle oxfordi vakcina tesztelésének résztvevője volt, de, ha minden igaz, a placebós csoportban. Az AstraZeneca részvényeinek árfolyama ezzel együtt reagált, többek között a placebós csoportot nem említő sajtótermékek miatt.
  • Wisconsinban is bekapcsolódik egy "overflow facility" a kórházak betelése nyomán. Kieg. kórházkiesés idehaza is (Mohács, intenzív osztály és aneszteziológia), itt a karanténozások miatt.
  • Ezt a DW-tudósítást érdemes megnézni. Érdemes megnézni, mit csinált az elhúzódó COVID az egészséges, 51 éves Erich Altmannal. Érdekes megfigyelésként elhangzik, hogy a COVID-lefolyás általános súlyossága és a poszt-COVID kondíciók súlyossága között meglepően gyenge a statisztikai kapcsolat.
  • Két friss tanulmány is a kórházi túlélési esélyek javulásáról számol be, ami nem hangzik hiteltelenül a kezelésben történt előrelépéseket tekintve. Csak az a gond, hogy a regisztrált esetek alapján ismert esethalálozási arányban nem látni ezt igazán, és beleszólhat az összesített eredménybe a hospitalizáltak korszerkezete is — bár itt hoznak olyan eredményt, miszerint minden korcsoportban van javulás. Fontos korlát, hogy mindez egyazon ún. "health system" (azaz kórház- és ellátólánc) keretein belülről adott esetben az ott jellemző specifikus ellátási minőség függvénye is lehet (és akkor nem általánosítható).
  • Trump Operation Warp Speedjének irányító testületéből Moncel Slaoui tudós-üzletember részvényérdekeltségeiről. A Moderna-részvényeit eladta, a GSK-részvényeit még megtartaná.
  • Dél-Koreában az influenzaoltással hoztak össze laikusok 13 halálesetet szigorúan anekdotikusan (13 millió oltás lett közben ellőve). Ez a tanulmány fontos értekezés a témában, arról, mit lehet tudni VAE (Vaccine-related Adverse Event) témában általában, és hogy hogyan, milyen lehetőségeket figyelembe véve érdemes erről következtetéseket levonni. (Influenzánál max Guillain-Barré-szindróma alakulhat ki; persze ha az oltóanyagot esetlegesen nem megfelelően tárolták, szállították, az más tészta.)
  • Az intravénásan adott NAC/ACC üdvös hatásai a gyulladáskezelésben.
  • Vita a Lancetben arról, hogy az Ad5-ös (rekombináns humán adenovírusos) vektort használó vakcinák nem vezethetnek-e nagyobb fogékonyságra HIV-fertőzés tekintetében, és hogy miért, ha igen.
  • A Miniszterelnökség idehaza az orosz és a kínai vakcinák felől tájékozódik. Tájékozódni nem baj — csak felelősen, kritikusan tessék.
  • Újrainduló III. fázisos tesztprogramok. Az AstraZenecánál két résztvevőnél volt neurológiai kondíció, amiről úgy találták, hogy nem a vakcina miatt lépett fel, a Johnson and Johnsonnál pedig egy résztvevőnek volt ismeretlen okból egyéb kondíciója.
  • Alina Chanék írtak egy papert arról, hogy a receptorkötő domén hasonlósága alapján rokonként azonosított tobzoska-koronavírusról szóló látszólag különböző (kínai) tanulmányok ugyanabból a (kínai, elfogott maláj csempészszállítmány) mintából dolgoztak, és a résztvevő kutatóknak illene minden adatukat publikussá tenniük. De talán annyit is elég lenne leírni, hogy Wuhan (ahol furin hasítási hely beépítésével is játszadozó BSL-4-labor található) Jünnan tartomány (ahonnét a SARS-CoV-2-höz összességében leginkább hasonló RaTG-13 denevér-koronavírus előkerült) Malájzia (ahonnét a tobzoskaelmélet felállításához hivatkozási alapként szolgáló tobzoskák valók).
  • A helyzet Venezuelában. Nicaragua és Szerbia mellett ez a harmadik olyan ország, ahol jelentős arányban elkamuzzák a haláleseteket, és ezek száma náluk is garantáltan 1000 felett van mostanra (Venezuelával együtt így összesen 63 országban már). Helyi orvosi források szerint csak eü. dolgozók 220-an haltak meg október első hetének végére. Mint a Z kategóriás országok vezetései általában, ők is gyorsan kapnának az orosz vakcina korai tömeges alkalmazása mint mágikus megoldás után. Ez alapján a cikk alapján háromszoros szorzót kell alkalmazni minimálisan. Úgy 2292 halálesetnél járhatnak (+1528). G.a.h.: +381191+n.
  • Lengyelországban Andrzej Duda pozitív, és közben... "Doctors say patients are dying not only of Covid-19 but also of other illnesses that overwhelmed hospitals are no longer able to treat." Közben a volt belga miniszterelnök és jelenlegi külügyminiszter Sophie Wilmes intenzív osztályi kezelést kap.
  • Az Egyesült Államokban újra nagyon csúnyán elszabadulóban a terjedés. A következő hetekben sok idióta mondja majd, hogy úgy tűnik, most kevésbé halálos a vírus, mielőtt 4-5 hét múlva szokás szerint durván felmegy a halálozás. Humans are gonna human. Alább tanulságos illusztráció.
  • sarscov2_usdeathsperday.jpg
  • Bottom line: ami a következő hónapokban jön, az csúnya lesz, a világ nagyon sok országában, és értelemszerűen különösen az északi féltekén :(

Folyt. köv.

Koronavírus: The Fall Semester

Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

2020.09.01-06.

Horvátországból az utolsó pillanatig lehetett behozni a koronavírust Magyarországra, még némi tengernézős ösztönzés is volt hozzá, sőt tevékenyen "példaadó" vezetői eljárás is. Az elmúlt egyhetes időszakban sikerült találni 1042 fertőzöttet úgy, hogy közben volt olyan is, aki szoros kontaktszemélyként nem tudta leteszteltetni magát (van tehát némi látencia, még ha vélhetően nem is akkora, mint tavasszal). Az esetek túlnyomó többsége már jó ideje nem importált. A nyilvánvaló tömeges belföldi terjedés ellenére a kormány egyelőre a külföldi személyek (bizonyos, pl. futballmérkőzéshez köthető kivételek melletti) kizárásával reagált, pedig az "importált" esetek nagy részében is egyébként magyar emberekről volt szó. Közben elsuhant augusztus 20. és néhány tömeges szezonzáró balatoni hétvége. A tévében helyszíni közönséges éneklős műsort láttam a minap, sehol egy maszk a láthatáron a képernyőbe zárt univerzumban. Most itt az iskolakezdés, és az egyetemek egy része is eltökélt — egyelőre —, hogy legyen valamennyi tantermi oktatás. Csak a felsőoktatásban ez diákok tízezreinek — köztük gólyatáborból frissen szabadultaknak — a települések közötti mozgásával jár már most, a (még lefújható) készülődés jegyében. És közben szeptember 1-el alighanem a kiskereskedelem és egyéb szektorok is felpörögnek valamelyest. A "zemberek" egy része pedig mintha nem értené, hogy a maszkozás nem színpadi rituálé, és hogy helyénvaló művelésének tényleges tétje van — a koronatagadókról és a maszkban-nem-hívőkről ezzel még nem is beszéltünk.

Az Egyesült Államokban a Trump-adminisztráció úgy tűnik, végképp elhatározta, hogy nem hat rá a józanság szava, és novemberre, az elnökválasztások idejére ez érdekes állapotokat eredményezhet. Németországban a koronavírus-párti (na jó, pontosabban laissez-faire/liberális járványpolitikát pártoló), nagyrészt szélsőjobboldali tüntetők a Reichstagot rohanták meg. Az Egyesült Királyságban is indul az oktatás, a felsőoktatás esetében kész diáközönnel, miután utólagosan megvariálták a felvételi kritériumokat. Fehéroroszországban továbbra is patthelyzet van, rendszeres nagy tüntetésekkel.

Mit bírnak majd a gazdaságok, ha a járványhelyzet romlásával újabb változások következnek? Mikorra válnak széles körben elérhetővé a monoklonális antitestes kezelések? Mikorra lesz működő és biztonságos vakcina?

Welcome to the Fall Semester. A szokásos szisztémában követjük tovább a fejleményeket.

  • Egyetemisták kicsi, de nem zéró halálozási kockázata. Emellett persze ott van a hospitalizáció, egészségkárosodás ennél nagyobb aránya is. És előbb-utóbb megfertőznek másokat is.
  • Koronatagadást fűtő trollhálózatok. A COVID-ben elhunyt Herman Cain Twitterjét is használják az üzenetük terjesztésére.
  • Oroszország. Eddig a következő tételeket számoltam a hivatalos halálozáson felül. Cseljabinszk: +18; Szentpétervár, május: +1400/2-171=+529; Moszkva: +958 (kb. kilencedrészben május előtt); Dagesztán: +625 (részben május előtt). Összesen: +2130. Ez a cikk május és június hónapokra együttesen mutat ki +26360 szezonális átlagot meghaladó halálozást. Ha ebből nagyon konzervatívan kivonom a COVID-halálesetek teljes hivatalos számát ebben a két hónapban (-8277), majd kivonom a cseljabinszki és szentpétervári tételek egészét (-547) és a moszkvai és a dagesztáni adat nyolckilenced részét is (-1407), kijön +16129. Ezt még el is felezem, hogy nagyon konzervatív legyek — így jön ki +8064 (lefelé kerekítve). G.a.h. így: +251319+n.
  • Indiában is adatmágusok seregei dolgoznak a halálozás (kozmetikai jellegű és célú) javításán. Bhopalban pl. krematóriumban, COVID-protokoll szerint égettek el 180 testet június 24-ig, de csak 91 halálesetet jelentettek. G.a.h.: +251408+n.
  • Debrecen, romló szennyvizes értékek (több vírus).
  • Holland idősotthon, aeroszolos terjedés, amit az érintett épületszárnyban közös és energiahatékony (=ritka) légcserével működő légkondicionáló vitt véghez. Az "elavultabb" (kívülről levegőt gyakrabban beszívó) keringetőrendszerrel felszerelt többi épületszárnyban nem volt fertőzött. Upsz.
  • Oroszi Beatrix, a kormány public health/epidemiológiai tanácsadója is megállapítja, hogy... a határral szórakozni elégtelen, kontaktkutatni pedig sokkal gyorsabban kellene. Elmondja: "...augusztus első négy hetében az 1853 új esetből csupán 163 megbetegedést okozott külföldi fertőzés, mostanra pedig már 10 százalék alá süllyedt ez az arány". Hát igen, ha valaki arról álmodik még, hogy a gazdaságot jó lenne nem leállítani újra, akkor tegnap kell nekiállni a kapcsolatkövetésre ráfeküdni jobban.
  • A kapcsolatkövetés úgy működik jelenleg, hogy 6 nap elteltével hivatalosan 18 fertőzöttet sikerült azonosítani a Corvinus-gólyatáborból, miközben közszájon forog, hogy ennél több van, pl. magántesztek alapján. Ha ez igaz, akkor a magántesztet végzetteket ezek szerint nem keresték eléggé. Közgazdász is vagyok, úgyhogy megjegyezném, hogy ez fájni fog a GDP-nek. Úgy tűnik, a rendszer jelenleg azt tudja viszonylag jól kezelni, amikor egy helyi gócban kell körbemenni ajtókon kopogtatni (pl. Mezőkövesden). Amint országszerte terülnek azok, akiknek utána kellene menni, több helyi szerv koordinálásával, zavar van az erőben. Namármost a GDP termelése sajnos eléggé országszerte terülő folyamat, úgyhogy a védelmében kell tudni alkotni valami látványosat ilyen léptékben is.
  • A Summit nevű szuperszámítógép ráfeküdt a COVID-témára, és arra jut, hogy a fertőzés után fáziskéséssel beálló túlgyulladás (saját terminusként dobom be, szerintem jól leírja a lényeget) azután következik, hogy a renin-angiotenzin rendszernek a vírus általi megzavarása nyomán, részben a zavar enyhítésére bradikininvihar indul a szervezetben, túlkompenzációként (hatásai: vazodilatáció (értágítás), vérnyomás csökkenése (itt a vérnyomás elszállásának megfékezése), gyulladási folyamat). Most nem felvágni akarok, de hónapokkal ez előtt mondtam (mások is mondták), hogy a COVID-nél alapbetegségként leírt magas vérnyomás, stroke, mélyvénás trombózis, infarktus stb. mind igazából a COVID következményei sok esetben. Azóta ez még a diabéteszről is kiderült (hogy a kialakulása esetenként következmény).
  • Lámák nanotestjei (sdAb, single-domain antibody) is hasznosak lehetnek talán, egyszer, az emberi terápiában.
  • Very belated ideas XXVIII. Olaszok felvetése, hogy a tesztelési elvárásokat akár kölcsönösségi alapon is lehetne segíteni teljesíteni, európai keretek közt. Az együttműködés bizony rózsát terem(hetne).
  • Iowában berobbant a járvány, úgyhogy Iowa repub szenátora (Joni Ernst) máris konteókat terjeszt, miszerint az emberek nem is halnak meg COVID-ben.
  • Michael Ojo kosárlabdázó története. Tüdőgyulladás, COVID-pozitív lelet július elején. Július 29-én még rossz vérkép, múló tüdőgyulladás, antitestek. Augusztus elején elkezd edzeni. Eredmény: hirtelen szívhalál. Egyike a sok esetnek, amelyeket aztán senki nem COVID-halálesetként jegyez fel. Pedig... :(
  • Innen szereztem tudomást Ojo esetéről. A COVID nem-ritka szívkomplikációit — miokarditisz, arritmia — feszegető cikk. Német kutatót idéznék belőle: “My personal take is that COVID will increase the incidence of heart failure over the next decades.”
  • Két buszon buddhista szerzetesek utaztak Zhejiang tartományban, az egyiken ült aszimptomatikus fertőzött. Azon a buszon lett 20+ további fertőzött, és a tőle messzebb ülők kitettsége alig volt kisebb (a fertőződés valószínűsége alapján rekonstruálva), mint a közel ülőké. Ez egy januári eset, szóval már akkor is volt aeroszolos terjedés.
  • Fertőzött atléták között 30%+ miokarditiszes komplikációval (US).
  • Az megvan, hogy a brit vakcinát Indiában gyártják majd a mostani helyzetben is? India mellesleg a globális vakcinaellátásra szerveződött GAVI koalíció beszállítója is, úgyhogy a fejlődő világ sorsa is részben az ottani gyártáson múlik.
  • Az Egyesült Államok nem kíván csatlakozni efféle globális kezdeményezésekhez. Itt a poszt-amerikai világ.
  • Sajnos orvosok is nyomatják a vírus "szelídüléséről" szóló elméletet, ami nettó antropomorfizáló emberi hülyeség (preszimptomatikus és aszimptomatikus terjesztés mellett, jelentős nyájimmunitás nélkül nincs evolúciós hátránya a jelenlegi mértékű virulenciának). A koronavírus lekicsinylése is előfordul egyes dr.-ek részéről. A Magyar Orvosi Kamara ki is adott erről egy figyelmeztetést.
  • Polgármester úr (Lakitelek) egyedüliként maszk nélkül az értekezleten... hogy pár nappal később koronavírus-pozitív legyen.
  • Poll a SARS-CoV-2 elleni vakcináról, a beadás hajlandósága, 27 ország. Magyarországon a legtöbb hardcore oltásellenes (28%), összességében a harmadik legtöbb oltásellenző (45%), utóbbit tekintve Oroszország és Lengyelország után.
  • Ezek után nagyon idevág: jó áttekintés a maszktagadásról, történelmileg és a jelenben.
  • Debreceni esküvő, fertőzött menyasszony, aki a lefáradás-belázasodás ellenére végigcsapatta ez egészet, őszintén elbeszéli történetét. Amikor végre kimentek hozzájuk a mentők tesztelni, a férjét azért egyből nem tesztelték le, az érvényben lévő csodálatos protokolloknak megfelelően (melyek alapján az óvodás gyermek azonos óvodába járó testvére sem releváns kontaktszemély). Terápiáról pedig a hölgy által önállóan beszedett algopirint leszámítva nem olvastam. Szóval akkor a hölgy részéről a tesztelés révén adatszolgáltatás történt, és ennyi. Ez aztán a komoly megtérülés az eü. járadék kitartó fizetése nyomán.
  • Dr. Seheult a komorbiditásokról, a hülyék kedvéért, akik sajnos nem nézik meg ezt a videót. (Azok után, hogy a CDC egy anyagában az szerepelt leírva, hogy az elhunytaknak csak 6%-ánál volt az "egyetlen" halálok a COVID-19, és emiatt egyes idióták (=magánszemély ógörögül) meg vannak győződve, hogy akkor 94% nem is COVID-ben halt meg.)
  • Berlusconi valahol szardíniai castellója és Milanóhoz közeli villája között megfertőződött, és most már kétoldali tüdőgyulladása van.
  • 489 fős minta. Emberek, akiknek ismert volna a D-vitaminszintjük egy évvel korábbról. D-vitaminhiányosak 21,6%-a, egészséges szint mellett csak 12,2% lett fertőzött mostanra; szignifikáns különbség; plusz bizonyíték a D-vitamin mellett.
  • Új felvételek a SARS-CoV-2-ről.
  • Az orosz Sputnik-V vakcina tesztelésénél eddig mintha nem egészen alkalmazták volna az elvárható alapelveket. A III. fázisban majd biztos lesz placebós kontrollcsoport is.
  • Úgy tűnik, hogy a Dunning-Kruger-betegség pandémiája Melbourne-t is elérte.
  • Problémák azzal a tanulmánnyal, amelyik a COVID utáni miokarditisz gyakoriságáról közölt súlyos konklúziókat. Aztán a JAMA megválaszolta ezt egy nem kellően megnyugtató válasszal.
  • Alább interaktív ábra a nagy OECD-gazdaságok visszaeséséről a második negyedévben (Q2). Hogy a Q3 és a Q4 kapcsán a tét nagysága világosan áttekinthető legyen. A UK 20,4%-os visszaesése súlyos különösen. Az amerikaiak komparatív nézőpontból nem is jártak olyan rosszul a 9,1%-kal. (V.ö.: euróövezet @ 12,1%.)

  • Izlandi kutatók vs. kínai kutatók? Az izlandiak felgyógyult, korábban teszttel diagnosztizált COVID-betegek 91,1%-nál (1107/1215) találtak antitesteket 4 hónap után. Szerintük az izlandiak 0,9%-a esett át a fertőzésen, és 0,3% volt az IFR.
  • Babos Tímeáék kikerültek a US Open női páros versenyéből, miután Babos partnere a pozitívan tesztelt francia férfi teniszező, Benoît Paire kontaktjai között volt. Ezért csodálkoztam annyira, hogy egy ekkora versenyt bevállalnak a szervezők. Ez így ugyanis a járvány által torzított verseny. És idén már jó eséllyel ilyen lesz a többi is, amelyik következik, ha következik.
  • Merkely Béla ma nyilatkozta, hogy az új eseteket igyekeznek nem lélegeztetőgépre tenni, inkább gyógyszeresen kezelni. Itt az igyekezeten kell, hogy legyen a hangsúly, és ehhez fontos adalék lehet ez a vlog. Szóval az igyekezet jó, de aztán van, amit muszáj lehet megtenni.

2020.09.07-13.

  • Costa Rica: ló-antitestekkel dolgoznak, az eredményeket meg is osztják majd a többi közép-amerikai országgal.
  • Ezt irreálisnak érzem (dr. Merkely): százezres nagyságrendnél szerintem még nem tartunk fertőzöttségben. Több tízezer fertőzött viszont lehet.
  • Hogy ne csak a levegőbe beszéljek ellenvéleményt Dr. Merkely százezres nyilatkozata kapcsán, íme, egy louisianai tanulmány, mely 7,8%-os kitettséget és 1,63%-os IFR-t kalkulált ki az eddigi járvány nyomán (más tanulmányok 0,5-től 1,2%-ig terjedő sávban mozgó IFR-t találtak eddig).
  • És ha már itt tartunk: a Diamond Princessen is rosszabb volt a helyzet, mint azt a minden halálesetet be nem váró tanulmányok kalkulálták. A Diamond Princessről ráadásul az aszimptomatikus esetek magas arányát is szerette sokat idézni az irodalom, csakhogy az aszimptomatikus japán hülyedefiníciója szerint abban az enyhe lefolyású esetek is benne voltak.
  • A közelgő korona/influenza kombóra tekintettel New York az elhunytakat is rendszeresebben tesztelni készül.
  • A járvány kezeléséhez kapcsolódó bonyolult alkuk részeként érdekfeszítő dilemma, hogy lesznek-e kilakoltatva fiatalok a nagyobbrészt idősebbek védelmében hozott intézkedések hatására. Az Egyesült Államokban pl. vegyes a kép államról államra, van, ahol a reponeninggel megszűnt a kilakoltatásokra vonatkozó moratórium, másutt nem. Áttekintéshez.
  • Glasgow, lockdown.
  • Az iskola, melyet Boris Johnson meglátogatott, hogy jelezze, biztonságos az iskolai oktatás újraindítása (Coalville, East Midlands), már be is zárt a járvány miatt.
  • A gyerekeket érintő többszervi gyulladásos szindróma (Multisystem Inflammatory Syndrome in Children, MIS-C), melyet annak idején a Kawasaki és a toxikus sokk szindróma keverékeként írtak le először mostanra alaposabban ki lett tanulmányozva. Itt például a szívkomplikációkról van szó, melyek elég elterjedtek az érintett gyerekeknél, úgy tűnik.
  • Egy szív-MRI specialista kritikája a német szívtanulmány konklúziójáról (miokarditisz gyakorisága enyhe COVID mellett is): egészséges embereket ritkán vizsgálnak így + a más vírusos fertőzések utáni helyzetet is ritkán vizsgálják így. Majd kicsit jobban utánanézek én is.
  • A Nature áttekintése a D614G-ről. Transzmisszívebb (lehet; megjegyzem: valószínű). Sejteket könnyebben fertőz in vitro. Magasabb vírusszám a mintákban D614G általi fertőzöttségnél. Antitestek lekötik ezt is. Szkeptikusabban (részemről): lehet, hogy nem a terjedési előnye miatt terjedt el jobban (furán hangzik, igaz?), hanem a kevés, de nagy impakttal bíró szuperterjesztő esemény szórta szét hatékonyabban véletlenül pont ezt. Egyéb érdekes adalék továbbá, a koronavírus lassú változásáról, tMRCA-elemzések alapjául: "Two SARS-CoV-2 viruses collected from anywhere in the world differ by an average of just 10 RNA letters out of 29,903"; "A typical SARS-CoV-2 virus accumulates only two single-letter mutations per month".
  • Az orosz vakcinatesztelési adatokat gyorsan lejelentették a Lancetben, és már ki is tört a vihar a numerikus anomáliák miatt.
  • Az ilyen esetek miatt nem lehet siettetni a vakcinafejlesztést. Valaki beteg lesz, bármilyen módon, amire a III. fázisban már komoly esély van — ilyenkor meg kell vizsgálni, hogy az oltóanyag kiválthatta-e ezt, közrehathatott-e, súlyosbíthatta-e stb. Most éppen az AstraZeneca állt le az oxfordi csimpánzadenovírusos vakcina tesztelésével. Ezért nyilatkozott a napokban, összefogásban, az AstraZeneca, a BioNTech, a GlaxoSmithKline, a Johnson & Johnson, a Merck, a Moderna, a Novavax, a Pfizer és a Sanofi arról, hogy a vakcinabiztonságosság nem lesz elhanyagolt szempont a sietségben, illetve a sietséget ösztönözni igyekvő politikai nyomás alatt. És ezért nem normális az, ami az orosz vakcinával történik, például hogy legutóbb a fehérorosz miniszterelnöknek adták be, állítólag (politikai megfontolások ebben biztosan nem játszottak szerepet, á, ugyan, dehogy). Emlékeztetőül: ezek a vakcinafejlesztési fázisok.
  • Most, hogy az egyetemista populációkon szalad végig a járvány sokfelé, akik általában nyilván kevésbé veszélyeztetettek, az egyik kockázati faktor a vaping lehet. És a tavalyi EVALI (e-cigarette and vaping associated lung injury) járvány után érdekes figyelni, kimutatható lesz-e összefüggés.
  • Kína COVID-hősöket tüntetett ki, köztünk Dr. Zhong Nanshant, a "SARS-doktort".
  • A brit kormány szeretné az embereket visszatérésre buzdítani az irodákba. A legjobb ok, ha jól értem, méghozzá olyasmi, amit egészen nyíltan meg sem neveznek, az, hogy nélkülük egy csomó szolgáltatás hal éhen az irodaépületek környékén. Ez nem jelentéktelen szempont, de járványügyileg vagy munkaügyileg a felvetés már nehezen indokolható. A home office hatékony az irodai munkában, és a legtöbb felmérésből úgy tűnik, hogy még kreatívabbá és kiegyensúlyozottabbá is tette a legtöbb embert (még a gyermeke(ke)t nevelők is elégedettek többésgükben). Járványügyi szempontból pedig sok felesleges transzmissziónak lehet a felesleges visszatéréssel megágyazni.
  • A MOK-nak most már 5G-ellenes taggal is kell bajlódnia.
  • A brit eü. miniszter azt mondja, van, aki tünet nélkül tesztelteti magát, és ezzel visszaélést követ el, és feleslegesen terheli a rendszert. A példája viszont arról szól, hogy egy iskola egy fertőzött ismertté válása nyomán egész évfolyamnyi gyereket tesztelt le. Ki rendellenesebb? Aki eü. miniszterként nem érti, hogyan lehet a járványt kontroll alatt tartani (pre-szimptomatikus terjesztésre tekintettel minden kontakt alapos felderítésével tünetektől függetlenül), vagy aki kihasználja a ritka adódó alkalmat, hogy kiderítse, van-e bárki fertőzött a környéken?
  • Ugyancsak BBC. Értem én, hogy a pro-aktívabb teszteléssel a tavaszihoz hasonló napi esetszámok nem is annyira hasonlóak, de azért azt is látni kell, hogy a pozitivitási ráta is megy fel közben (az elvégzett tesztekből a pozitív eredmények aránya).
  • 28 éves pedagógus halála Dél-Karolinában.
  • Bob Woodward új könyvéből előkerült pár részlet. Trump a vele készült, hangfelvételre került interjúban (még tavasszal) nyíltan beszélt a SARS-CoV-2 veszélyességéről, amit pontosan értett maga is, és aztán... "I wanted to always play it down. I still like to play it down". Elmondása szerint a pánikkerülés érdekében, csak hát ez az azóta tanúsított magatartásával együtt komolyan vehetetlen.
  • Jamain Stephens amerikai futballista halála (20 éves volt). COVID-pozitív lett, majd nem sokkal később halott. A csapata szerint nem a COVID miatt, a szülők azt mondják, nem tudják. A magas BMI lehetett nála kockázat, az sejthető.
  • Felmérésre érkezett visszajelzésekben 300 ezren jelentettek egy hónapon túl tartó tüneteket, 60 ezren három hónapnál tovább tartó tüneteket COVID nyomán (UK). Ennyire sok lenne a long-hauler?
  • Friss cikk Shi Zhengliék manővereiről az RaTG13 vírus körül, pl. hogy utólag sikerült csak benyögniük az RaTG13 és a BtCoV/4991 azonosságát; hogy ellentmondó nyilatkozatok vannak arról, mikor szekvenálták az RdRp szakaszt és a genom egészét; és hogy mikor, hogyan és milyen lépésekben sikerült rájönniük az RaTG13 és a SARS-CoV-2 jelentős mértékű (96,2%) egyezésére.
  • És még egy hasonló cikk. Kicsit fordulóban a széljárás, úgy tűnik. A cikk főszereplője Alina Chan. Alina Chanék mutatták ki anno, mekkora viszonylagos stabilitással rendelkezik a SARS-CoV-2 a SARS-CoV-1-hez képest; mintha az emberi szervezethez történő adaptáción már az előtt átesett volna, hogy 2019 novemberében kitört a nagyvilágba — amit a zoonóziselmélet nehezen magyaráz.
  • Három idézet az imént idézett cikkből (Boston Magazine), arról, miért nem feszegetik többen az említett anomáliákat a tudományos világban. 1: "“They can’t speak directly,” one scientist told me confidentially ... “Many virologists don’t want to be hated by everyone in the field.”" 2: "avoiding restrictions on research funding, avoiding implementation of appropriate biosafety standards, and avoiding implementation of appropriate research oversight are powerful motivators". 3: "An unhealthy absolutism set in: Either you insisted that any questions about lab involvement were absurd, or you were a tool of the Trump administration and its desperation to blame China for the virus." (Utóbbi faktor — Trump "halálos csókjának" — áldozata lett bizonyos mértékig a hidroxiklorokin terápiás alkalmazásának tanulmányozása is, teszem hozzá.)
  • Ami pedig új nekem, pedig mennyit kerestem ezeket az információkat: a nyércek között az embereknél stabil vírus gyorsan mutálódott tovább... Ez game-changer, ami azt illeti.
  • Konkrétan emberdarálós horror következik. Egyelőre in vitro kísérletezés tapasztalata, de súlyos: a SARS-CoV-2 miszlikbe aprítja a szívizom rostjait. Lehet nézni képen is.

sarscov2_heartmuscleimpact.jpg

  • Az in vitro hatás persze lehet drasztikusabb az in vivo történéseknél, de tudjuk, milyen, viszonylag gyakori következmény a miokarditisz valamilyen fokon a COVID-nál, és emlékszem még tavaly decemberből az első kínai kórházi esetek egyikére is, akinél konkrétan a szívizom roncsolódott darabjait találták meg a vérében, és ezek a dolgok egybevágnak. Itt az eredeti tanulmány a fentebb említett kísérlettel. Ezek után eléggé úgy tűnik, hogy növekedhet a CVD-hez kapcsolódó halálozás a következő években :(
  • Az Alina Chanről szóló cikk nyomán (lásd fentebb), elő kell vennem egy bizonyos papert, és alaposan feldolgozni. A SARS-CoV-2 strukturális variánsaival foglalkozik az SNP-k (önmagukban álló nukleotidcserélődések, single nucleotide polimorphisms) helyett (a linkért h/t Epikurosz). Strukturális variáns az, ahol a genom egy szakasza pl. áthelyeződött (transzlokáció), inverzálódott, törlődött, vagy valahonnan (pl. rekombinálódási esemény nyomán) beszúródott stb. A cikk a copy-choice errorként kialakuló SV-k jelentkezését többek között a virális RNS másodlagos szerkezetével (az egyszálú RNS pl. hidrogénkötések által is bonyolított unortodox bázispárképzési tendenciájával az RNS-gerinctől távolabbra nyúló "karokon") és az ORF-határok (Open Reading Frame-határok) közelében előforduló TRS-ekkel (transcription-regulatory sequences) hozza összefüggésbe (utóbbiaknál 5’ és 3’ törési pontok találhatók közelségben). A vizsgálódás alapja, hogy más tekintetben relatíve kevés mutáció volt megfigyelhető a SARS-CoV-2-nél; az SV-képződési gócpontok viszont két SARS-CoV-2 között vagy akár más vírusokkal is rekombinálódásra adnak lehetőséget, pl. denevér és tobzoska koronavírusának sejten belüli találkozásakor... hogy továbbra is minden lehetőséget szem előtt tartva vizsgálódjunk.
  • Kicsit off-topic: az "indel" szó a virológiában beszúródásokra és törlődésekre egyszerre utal (insertion/deletion). Gondolkodtam a magyar megfelelőjén, és nagy nyelvújítóként konkrétan a "kibeszás" jutott eszembe. Elnézést — amikor ezt írom, már későre jár, lassan megyek aludni...
  • Na jó, még egy link mára: koronavírusokkal dolgozó labor nem túl tökéletes biztonsággal az USA-ban, példának okáért. Egy 2016-os incidensben a fertőzött egérke harapása után is szabadon bóklászott a kutató künn, a nagyvilágban.
  • Ebben a cikkben olvasom, hogy a GISAID klasszifikációja konszenzusos mostanra a SARS-CoV-2 meghatározó altípusairól: "S, L (containing reference sequence Wuhan-Hu-1), V, G, GH, GR and O (other)". Legyen hát! És íme, az altípusok megoszlása az idő előrehaladtával különböző helyeken, a cikkből:

sarscov2_cladedistributions_over_time.jpg

  • Itt van háttérnek a GISAID-besorolás magyarázata. Érdekes Dél-Amerika és Európa hasonló összképe (Spanyolország fontos kapocs volt ebben) + a különbség Észak-Amerikával. Előbbi esetben a GR altípus (zöld), utóbbiban a GH meghatározó (kék). A markereket tekintve a következő a különbség: GH=C241T,C3037T,A23403G,G25563T includes S-D614G + NS3-Q57H; GR=C241T,C3037T,A23403G,G28882A includes S-D614G + N-G204R. (Az S és az N a spike-ra és a nukleokapszidra utalnak.) Ha a bordó (vagy milyen) színű G altípussal együtt nézzük őket, jól látszik a D614G globális dominanciája (kék+zöld+bordó).
  • A nyércekről, holland epidemiológusok. Erre utalt az Alina Chanról szóló cikk is fentebb, levadásztam. Idézném: "A high diversity in the sequences from some mink farms was observed which most likely can be explained by many generations of infected animals." Ha ez nem volna elég érdekes...: "there was also a relatively high sequence diversity observed in farms which still tested negative one week prior, hinting towards a faster evolution of the virus in the mink population."
  • Idehaza is megmoccantak a moccanni vágyók. A globális együttműködés szétesésében, ami a jelen járvány kontextusában végbement, a globalizmus győzelmét látják. Nincs hozzájuk kérdésem.
  • Reménytelenül nem-hatékonyan működik a kapcsolatkövetés-tesztelés-izolálás kombó Magyarországon. Most már nagyon sok a nagy ívben figyelmen kívül hagyott fertőzöttekről szóló anekdota. Szisztemikus implikáció: a magyar eü. rendszer nagy ívben tesz a betegségmegelőzés másodlagos és harmadlagos szintjére is, az enyhe esetek súlyosbodásának megelőzésére is. Enyhe eset? Ne menjen sehová, mi sem megyünk hozzá. (Emlékeztetőül, a betegségmegelőzés szintjei: háttérokok kezelése, megbetegedést közvetlenül kiváltó hatások megelőzése, súlyos esetek megelőzése, utókövetkezmények megelőzése.)
  • És akkor némi súlyos olvasnivaló Mexikóról. Március közepétől aug. 31-ig 122765 fő szezonális átlagot meghaladó halálozás (aug. 31-ig volt hivatalosan 64158 COVID-haláleset). Több mint ötvenezer ember (a regisztrált COVID-esetek közül; kb. 75%) anélkül halt meg, hogy lélegeztetéssel esélyt kapott volna. A legtöbb szövetségi államban bürokratikusan képtelenné váltak a halálesetek 100%-os feldolgozására (elfogytak a halotti bizonyítványok). Olyan megállapodást kötöttek a Russian Direct Investment Funddal, hogy náluk el lehet lőni 32 millió dózis Sputnik V vakcinát III. fázisú tesztelésként. A maquiladora (külföldi tulajdonú gyárakban dolgozó) munkások között sok fiatal halottjuk is volt, pl. Baja Californiában. Meghalt 1400+ eü. dolgozó. Stb. Eddig Mexikóból 18241 fő extra halálozást számoltam. Most veszem a konzervativizmus jegyében a szezonális átlag feletti adat felét (61382), és abból kivonom a 18241-et, így lesz 43141. G.a.h. ezzel együtt: +294549+n.
  • Trumpék korrumpálták a CDC munkáját (is). Belenyúltak a szervezet kommunikációjába a COVID-mortalitástól a hirdoxiklorokin megítéléséig mindenben. Mindezt részben egy Michael Caputó nevű élőlényre bízták, aki dolgozott már a Gazprom számára is... Putyin Egyesült Államok-beli imidzsének javításán. Nevezett élőlény jelenleg médiaügyekkel foglalkozik a Department of Health and Human Servicesnél.
  • Hogy miért kellett a brit egyetemi felvételiket újragondolni? Pontosan ugyanazért, ami miatt az Amazon munkaerőfelvételi algoritmusát is el kellett vetni két éve. Ha a múltban diszkriminált munkaerő-kategóriákat automatikusan hátrább soroljuk, a múltban gyengébben szerepelt iskolakörzetekből jövőket pedig automatikusan gyengébbnek tekintjük, vagyis ha tudatosan előítéletesek vagyunk, és a hátrányos helyzetű csoportok tagságához automatikus hátrányokat rendelünk, akkor ez történik. Ez nem a mesterséges intelligencia hibája. Ez az emberileg menedzselendő kérdéseket mesterséges intelligenciára bízó idióták idiótasága.

2020.09.14-20.

  • Az AstraZeneca folytathatja a független vizsgálópanel döntése nyomán, de érdekes, hogy az NY Times szerint a beteg résztvevőjüknek haránt-gerincvelőgyulladása volt (myelitis transversa), és nem tudjuk, mi alapján zárták ki a kapcsolatot a tesztprogrammal. Az említett kondíció előfordulását a múltban dokumentálták pl. mumpsz, kanyaró és rózsahimlő szövődményeként.
  • Kis adalék közben az orosz vakcinához. Ők emberi adenovírust (AdHu5 szerotípus) használnak vektornak, és az oxfordi vakcina ezt nem véletlenül cseréli csimpánz-adenovírusra — mivel az AdHu5-re antitestek megléte a beoltottnál elnémítja a kiváltandó immunreakciót, csökkentve a vakcina hatásosságát. Persze csimpánz-adenovírusra pedig az afrikai populáció egy (csimpánzokkal azok természetes élőhelyén kapcsolatba kerülő) részében lehetnek antitestek, szóval minden ilyen döntésnek lehetnek vesztesei. Ezekről a problémákról bővebben itt lehet olvasni.
  • Oroszország: májustól júliusig 57800 fő szezonális átlagot meghaladó halálozás. Május-júniusra számoltam korábban 8064 extra COVID-halálesetet 26360 fő szezonális átlagot meghaladó halálozásból. 57800-26360=31440. 31440/2-3213=28227 (ahol 3213 a júliusi hivatalos COVID-halálozás). EZ +12507 extra COVID-haláleset nagyon konzervatívan számolva. G.a.h.: +307056+n.
  • Izraelben a nagy diplomáciai előretörések közepette borult meg a járványhelyzet csúnyán. Jön a kijárási korlátozás.
  • Atlétáknak, akik átestek fertőzöttségen, ajánlott a szívvizsgálat. Miokarditisz esetén pihenő.
  • Újabb eredmények arról, hogy étteremben enni kockázatos lehet. Viszont lehet, hogy nem éttermi cseppfertőzés, hanem a maszk levétele nyomán, aeroszolok miatt. Beltér, kültér nyilván nem ugyanaz, teszem hozzá.
  • Ez is egy nagyon érdekes tanulmány (h/t Epikurosz), pl. az IgA nyálkahártyán (így pl. a bélben is) kiválasztott antitestek, azon belül leginkább az IgA-dimerek jelentőségéről a szervezet vírus elleni védekezésében.
  • Honnan tudjuk, hogy az iskolákban is van körbefertőzés kicsiny és különleges hazánkban (is), és az ezt tagadó duma csak rossz rizsa? Közösségi alapból magánteszteket végeztető suli esetéből tudjuk (Lauder Javne Iskola). Illetve ezen kívül persze a józan ész is segíthet még, egy kicsit. 
  • Marseilles: telítődő kórházi kapacitások.
  • Pszichiátriai természetű problémák előfordulásáról COVID-betegek felépülése nyomán. Lehangoltság, álmatlanság, szorongás, emlékezetzavarok. 
  • Az Xtreme cég megússza 3000 dollár büntetéssel, hogy Nevada állam szabályait figyelmen kívül hagyva Trump zárt téri kampány-tömegeseményéhez helyszínt biztosított.
  • Indonézia, sírásatás maszkot nem viselőkkel.
  • Antitest-töredékes kezelés lehetősége. Eredmények egyelőre hörcsögökkel, egerekkel.
  • JAMA: április elejétől június végéig 63103 COVID-beteg közül 3222 nem-terhes fiatal felnőtt (5% az összes betegből) volt kórházban a Premier Healthcare Database által lefedett 1030 intézményben az Egyesült Államokban. 684 került intenzív osztályra (21%), 331 kapott gépi lélegeztetést (10%), 88 meghalt (2,7%).
  • A Scientific American Biden mellé állt, pedig a múltjukat tekintve nem szokásuk ilyen formában politizálni. Azt hiszem, magyarázat nélkül is érthető, miért tettek most kivételt.
  • Németország, Dánia, Írország, Lettország és Olaszország részvételével európai szintre is fejleszthető integrált digitális kapcsolatkövető rendszert alakítanak ki, és tesztelték hozzá a gateway servert.
  • ENSZ Közgyűlés: határozat a COVID nyomán szükséges nemzetközi gazdasági együttműködésről. Kuba beleszúratja, hogy jó lenne akadályok nélkül jutni orvosi felszerelésekhez ezzel kapcsolatban. Az Egyesült Államok és Izrael ellene szavaz.
  • Spekuláció arról, hogy a járvány már a december 22-i héten felpörgőben lehetett az Egyesült Államokban, de azért nem vettek meg. Légúti betegség sokféle van, pláne télen.
  • Így hatott az USA imidzsére a válság a világban (Pew Research).
  • 9 éves long-hauler.
  • Így blokkolja (az Nsp1 virális fehérjén keresztül) a SARS-CoV-2 a fertőzött sejtek saját fehérjeszintézisét.
  • Koronavírusos lenne az Edda?
  • Nicaragua, az Observatorio Ciudadano oldala, civil-orvosi járványkövetés a járványtagadó kormány helyett. Szeptember 9-ik az utolsó heti jelentés szerint 2707 COVID-halálesetet tartanak számon. Ez 163 extra eset az általam korábban Nicaraguából számoltakhoz képest (kivonva az összes hivatalos halálesetet is). G.a.h.: +307219+n.
  • Az AstraZeneca gerincvelő-gyulladásos betege futás közben egy testrándulás nyomán botlott egyet, másnap pedig már testtörzsi fájdalmakat, érzékelési zavarokat, járási nehézségeket és végtaggyengeséget tapasztalt, így történt meg a diagnózisa. A botlásos eset 14 nappal a második dózis után következett.
  • Csehországban eRouskának hívják, Ausztriában StoppCoronának, mi az? Digitális kontaktkövető app. Nálunk VírusRadar néven indult, május 13-án. Állítólag vannak gyermekbetegségei. Eddig 35 ezer letöltés történt, ami nyilván nem túl sok (G7).
  • Ezzel a hírrel kapcsolatban a leginkább az érdekel, hogy beetetés-e, hogy a neo-Index ilyen kritikus dolgokat is megír, vagy tényleg hagyják a szerkesztőséget dolgozni.
  • A maximált ár miatt magánszolgáltatók elkezdenek leállni a PCR-teszteléssel (egy szolgáltató már kiesett). Sokuk új berendezések beszerzésén van túl. Cégek és iskolák, akik eddig magánteszteléssel védték a működőképességüket... előbb-utóbb nem fogják tudni így védeni a működőképességüket. Kieg.: a kiesett szolgáltató napi "néhány száz" tesztet csinált eddig, a magánszolgáltatók összesen kb. négyezret, ha minden igaz.
  • Kicsit kizoomolva a koronavírus-válságból: jan. 1-től lehetnek kiszámlázandó sürgősségi beavatkozások a tb-t hat hónapig fizetni nem tudók esetében. Az árat előre közölni kell az érintettel, vagyis nálunk is jön a világ, ami pl. az USA-ban van. Doktor úr, ne tessék lélegeztetőgépre tenni, nincs pénzem.
  • A lélegeztetőgépekkel kapcsolatos problémákhoz. És korábbról (már volt) ugyanerről másik fontos cikk.
  • A nagy vakcinafejlesztők közül néhány nekiállt megosztani a tesztelési folyamatuk protokollját, a transzparencia jegyében. A Pfizeréből (közös a német BioNTech-kel) pl. látszik, hogy nem kicsit sietősen haladnak: "... will have an interim analysis after just 32 people test positive, i.e., if six are positive in the vaccine group and 26 are positive in the placebo."
  • Az amerikai CDC augusztusban újra kitette az agyhalottak tesztelési útmutatóját, miszerint csak tünettel érdemes tesztet végezni. Mint utóbb kiderült, nem meglepő módon mindez politikai ráhatásra történt, nem szakértők akarták így. Most végre visszavonták a rossz útmutatást.
  • Konteózós kínai disszidensek és Kína-ellenes szörpkavarók (Steve Bannonnel az élen) szültek tanulmányt a SARS-CoV-2 laboratóriumi eredetéről. Mivel fullban nyomják a kretént, ezzel lényegében Kína érdekeit védik a témában jogos kérdésekkel kapcsolatban, és persze anélkül, hogy tisztában lennének ezzel.
  • Az aeroszolos terjedés miatt sajnos repülni nem is annyira biztonságos. London-Hanoi esettanulmány. A fertőzések két kivétellel a business class ülései között szóródtak csak (ez jó hír), de ott is simán átugrottak az egyik ablak felőli ülésektől a másik ablak felőliekig + akadt fertőzés 18 sorral hátrébb is, ahová másik mosdók esnek közelebb (így a mosdóhasználat is viszonylag kontrollált változó). Fontos további információ, hogy ez egy március 2-i járat története, tehát már akkor volt aeroszolos terjedés (ahogyan a kínai buszon is volt az év elején, dokumentáltan).
  • Miért gáz, hogy Iránban "harmadik hullám" van? Irán volt az első ország, ahol úgy terjedt szét a koronavírus, hogy a kínaihoz hasonlóan drasztikus intézkedésekre nem került sor. Válasz a kérdésre, beáll-e mindenképpen a nyájimmunitáshoz hasonló akadályozó effektus a vírus terjedése szempontjából viszonylag alacsony átfertőzöttség mellett. Nem.

2020.09.21-27.

  • A CDC-nél most éppen az aeroszolos terjedést tagadja az amerikai járványügy egyik irányadó dokumentuma (miután az azt nem tagadó dokumentumot 1 nap után törölték). Az eleve csúnya helyzet nem létező szépségének hibája, hogy a WHO is ragaszkodik a cseppfertőzéshez mint szívszerelemhez, és ez szerepet játszhatott a történésekben.
  • Súlyos eredmények a vírus nanomechanikai paramétereiről, atomi erő mikroszkóppal (Kiss Bálint, Kis Zoltán, Pályi Bernadett, Kellermayer Miklós). A SARS-CoV-2 lényegében kis T-X terminátorként viselkedik. Összenyomják, erre az alakja helyreáll. A tüskéi félresimulnak, mint az ecset szőre. Ja, és egy megvizsgált egyednek itt 61 tüskéje volt. Nincsen rózsa tövis nélkül, de SARS-CoV-2 meg pláne nincs. Stb.
  • A koronavírus-keresztimmunitás kérdéséről, tanulmány. Spekulál, hogy a Közel-Keleten és Ázsiában ezért van kevés halott (és nem mondjuk az adatmágusok miatt). Azért tartom az ilyesmit erősen kérdésesnek, mert az OC43 vagy a HKU1 pontosan ugyanúgy körbementek a világon, és méghozzá ugyanúgy legelőször is a legforgalmasabb repterek között, szóval nem értem, mitől koncentrálódott volna a hatásuk egyes régiókban. Wishful thinking, dióhéjban.
  • Még márciusból, a francia Raoult-éktól, akiknél sokszor érdemes gyököt vonni az általuk elmondottakból. Január 1. és március 2. között 7059 légúti betegségtől szenvedőtől vett mintákat néztek pl., és 543 lett pozitív valamilyen koronavírusra (de egyik sem SARS-CoV-2-re). Két halott volt: az egyik OC43-ra, a másik HKU1-re volt pozitív. Szorgalmasan még CFR-t is számoltak ebből, amivel az OC43-nál 1,3%, a HKU1-nél 0,36% jött ki. Az mindenképpen látszik, hogy ez további adalék "a régi koronavírusok nem is olyan ártalmatlanok" tézis melletti bizonyítékul. Még februárban írtam itt az OC43-ról, hogy "most underreported pathogen ever", visszakereshető.
  • "It affects virtually nobody", mondta Trump legutóbbi gyűlésén. Parafrazeálnám: "The more you die, the less you matter."
  • Dízelaggregátorok lassú beszerzése, a folyamat beérésére váró hazai kórházakkal, köztük négy járványkórházzal.
  • Sürgősségi ellátás lehetetlenült el Düsseldorfban ransomware-támadás miatt, a mentőnek Wuppertalba kellett mennie, a beteg meghalt. (Azt nem tudom, hogy mi volt a baja, de azért mindez egy járvány közegében...)
  • Idehaza változások, pl. 10 napra csökken a karantén. 14 úgysem lett volna elég két negatív PCR beszerzésére, pláne mióta hatósági áras a magánteszt, plusz a tesztelésért utazgatni tényleges transzmissziós kockázattal járt.
  • A McKinsey a 2021-es Q3/Q4 idejére várja a járvány lecsengését (átfertőződés és megfelelő vakcináció nyomán) a legvalószínűbb forgatókönyvében. Korábban vagy később kevésbé valószínű szerintük. Tegyük ehhez hozzá a Portfolio.hu forgatókönyveit az őszi-téli hazai járványra. Lehet gondolkodni róluk.
  • A COVID hatásai XXVII.: a csontevelőből felszabaduló mieloid sejtekről, ezúttal (tanulmány) + újabb bizonyított újrafertőződéses eset súlyosabb lefolyással, 51 nappal az első fertőzés után. 2 in 1 a Reuterstől. Kieg.: a Reuters által említett tanulmány egyedi immunológiai jegyeket keresett súlyos COVID-lefolyás markereként, és pl. az emelkedett IL-6 és a neutrofil/T-sejt arány változása mellett találtak módosult CD14+ monocitákat és a csontvelőből felszabaduló mieloid sejtekről.
  • Jaj, nehogy elfelejtsem leírni. ATV + Rónai Egon = gratulálok, igazán nagyon professzionális televíziózók vagytok (vagy mi), hogy ilyeneket csináltok (Gődényék szerepeltetése kapcsán).
  • Nézők protestje miatt meghiúsult operaelőadás Spanyolországban, miután az operaház nem gondoskodott a fizikai távolság betarthatóságáról (túl sok jegyet adtak el).
  • Neurodegenerativitás, izraeli eset Parkinsonra emlékeztető jegyekkel.
  • Az arcpajzsok nem is annyira hatékonyak? Na persze, csak ha maszkokkal kombinálják őket, és pl. minden fél visel ilyeneket, akkor ez azért mégsem igaz.
  • A svédek úgy nem csinálnak semmit (a hülyék szerint), hogy valójában nagyon is csinálnak sok mindent.
  • New Yorkban sincs vége a járványnak. Terjedés az ortodox zsidó közösségekben.
  • A D614G mutáció (nem meglepő módon) magasabb vírusszámmal (alacsonyabb Ct-értékkel) jár együtt. És fertőzőképesebb. Egy gondolat: könnyebben jut el új emberekhez, de pont az aeroszolos terjedés miatt valószínűleg erősebben szóródó dózisban, aminek sajátos hatásai lehetnek a járványadatokat tekintve. Több szuperterjesztő incidens, nagyobb klaszterezettség. Még erősebben szóródó lefolyás...?
  • Az aeroszolos terjedésről (Lancet). Inkább a szabály, mint a kivétel légúti betegségeknél. Az 5 mikrométernél (<5 μm) kisebb részecskék az izgalmasak. Emlékeztetőül: 1 nm = 1/1000 μm. SARS-CoV-2 = 70-110 nm, de őt nem magában kell nézni, hanem azzal együtt, amire tapad.
  • A diákságon elég gyorsan keresztül tud szaladni a vírus (University of Colorado Boulder). Erről nyilván lesz, akinek a kontrollált erdőtüzekkel kapcsolatos dilemmák jutnak az eszébe, csak ugye nem árt emlékezni, hogy itt kockázatnak kitett oktatóknak kell a tanítás színlelésével asszisztálniuk az emberkísérlethez.
  • Itt a COVID-19 reinfection tracker. Persze csak a tutira dokumentált eseteket fedi le, ennél több van. Viszont ezek közé is került három eset súlyosabb második lefolyással :(
  • From the country of very interesting public health practices: stadionba 37,8 fokos testhővel be lehet menni (nyilván rájöttek, mennyi ember maradna kint a gagyi termométerek miatt), és után a totális steril leválasztottság jegyében ("különbusszal jönnek és mennek" jeligére) még lehet rá 48 óráig kocsmázgatni (ha pl. bajor szurkoló vagy).
  • Közben halkan megjegyzem, hogy olyan várakozási idők alakultak ki az itthoni tesztelésben, ami az elvégzett tesztek értékét közel zéróra redukálja.
  • Az anyatej gazdag lehet SARS-CoV-2-specifikus, mi több, kifejezetten az RBD-t kötő IgA és IgM/IgG antitestekben.
  • A kínai tapasztalatok is ilyesmik voltak, ha jól emlékszem: a HIV-pozitivitás nem feltétlenül kapcsolódik súlyos COVID-dal (magyar érintettségű tanulmány).
  • Bélrendszeri érintettség fertőzött vékonybéli enterocitákkal... kevésbé súlyos COVID, enyhébb gyulladási folyamatokkal, alacsonyabb IL-6-al, többek között.
  • A dél-koreaiak viselkedéséről: az még ismerős, hogy előbb mobilitásvisszaesés volt keményen, azóta viszont inkább maszkviseléssel kompenzálnak az emberek. Az már kevésbé ismerős, hogy ezt sokkal következetesebben csinálják, mint errefelé, és a maszkviselésre való "szelíd emlékeztetésnek" foganatja van, mikor valakire rászólnak.
  • Diagnosztizálás a COVID-hoz kötődő köhögés sajátos hangjegyei alapján? Naná, hogy lehetséges, pláne némi M.I. segítséggel. Még "aszimptomatikusaknál" is, ha megkérik őket, hogy köhögjenek már párat.
  • A gerincvelőfolyadékba bejutó citokinok szerepe az elhúzódó neurológiai tünetekben. (Az utóbbi hat tanulmányos link kapcsán h/t @Epikurosz.)
  • Elképzelhető, hogy észak-koreai erők azért vallattak egy dél-koreai tisztviselőt a vízben, hogy aztán kivégezzék, és elégessék, mert... féltek a koronavírustól. Az incidensről.
  • És még egy link. A francia teniszező, Benoit Paire kálváriája. Pozitív lett a US Open alatt pár hete, aztán később negatív volt több alkalommal is, gyógyultnak nyilvánítva, majd... most, a hamburgi vesenyen ismét pozitív, sőt beteg. A meccsén összezuhant, fel kellett adnia.
  • Emberről macskára terjedés két macskánál a UK-ben. A macskák minden bizonnyal rajongtak az orofaringeális törletet vételező állatorvosért. Egyiküknek tüdőgyulladása volt. 2-es számú macs vírusa 5 SNP-vel tért el a legközelebbi emberi vírus genomjától... gyors változás a macskaszervezetben, ahogy ezt a nyérceknél is láttuk korábban?
  • Trump talán elengedné a vakcinabiztonságossággal kapcsolatos sztenderdeket is, ha ezen múlik, hogy a választás előtt saját győzelmeként vakcina elérhetőségét jelenthesse be.
  • Az Operation Warp Speed által támogatott fejlesztők (Johnson & Johnson, Moderna, Pfizer, AstraZeneca, Novovax) közül az utolsó is (Novovax) a III. fázisban jár. Az ő vakcinájuk a tüskefehérje nanorészecskés beadására épül, melyet fúzió előtti elrendeződésében (conformation) stabilizálnak, hogy a szervezet megtanulja felismerni.
  • Qingdaóban tengeri ételekkel dolgozó emberek lettek pozitívak munkájukhoz köthetően, majd a tengeri ételek csomagolásáról is találtak vírust. A pekingi és az új-zélandi eset után itt is a fagyasztott áru lenne a bűnös?
  • A betegek egy részénél az I. típusú interferon hiányára auto-antitestek lehetnek a magyarázat... "101 of 987 patients with life-threatening COVID-19 pneumonia had neutralizing IgG auto-Abs against IFN-ω (13 patients), the 13 types of IFN-α (36), or both (52), at the onset of critical disease."
  • A hétvégén tervezek olvasgatni kicsit az aktuális esemény-fősodortól távolabb eső dolgokat is. Itt ez a 2018-as szerológiai jelentés Jünnan tartományból, Kínából. Néztek olyan embereket (218 fő), akik könnyen kapcsolatba kerülhettek denevérekkel ottani falvakban, pl. láttak is saját szemükkel denevért (20 fő), vagy akár kapcsolatba kerültek denevértetemmel is (1 fő). Melléjük pedig néztek kontrollnak... wuhaniakat. Oh, yes. Mert ők nem valószínű, hogy ki voltak téve denevéreknek a városi környezetükben (közvetlenül). Két-két-két SARS-CoV-specifikus antitestre pozitív egyént sikerült azonosítani Dafengkou, Tianjing és Lvxi (sic) falvakból, akik nem nagyon utaztak messzire életükben, egy fő shenzheni kiruccanását leszámítva. (Azt persze tudjuk, hogy denevérek városok zöld területein vadászgatva, romos épületekben lakozva is megvannak azért, ha kell, és akkor a Jangce mentén azért éldegélhetnek akár Wuhanban is.)
  • Szóval van egy gap a kínai urbánus denevérek kutatása terén, és ezt mutatja ez a tanulmány is, mely áttekintés a kínai denevérkutatás trendjeiről.
  • Kis kutakodás kapcsán: a SARS-CoV-2-ben más vírusokhoz képest kevés a CpG dinukleotid és ezzel el tudja kerülni a ZAP (zinc finger antiviral protein) antivirális gazdafehérje reakcióját. Ez is része az immunrendszer megkerülésének esetében.
  • A hírekben mentek pár kört a Dubai után már Helsinkiben is bevetett kutyák, akik kiszagolják a koronavírusos betegeket (nem magát a vírust, természetesen). Úgyhogy: bővebben a kutyák szaglásáról. Még a közelgő epilepsziás rohamot is kiszagolják egész jó biztonsággal, ha felkészítik őket erre. A vércukorszint ingadozásait érzékelniük ezek után akkora kihívás nekik, mint nekünk megfejteni egy olcsó magazin keresztrejtvényét.
  • Paper izgalmas kijelentésekkel, melyekkel kapcsolatban lehet nyomozni (miszerint szigorú felülvizsgálati folyamat kapcsán kerülhetett sor balesetre a WIV-nél, a Wuhan Institute of Virology-nél Wuhanban). Ezen a különös paperen keresztül találtam, archivált forrásként: 2019. november 13-i kínai irányelvek kórházak számára influenza kezelésében. Gondosan felhívják a figyelmet a véroxigénszint figyelésére, akut nekrotizáló enkefalopátia lehetőségére és egyebekre.
  • Az megvan, hogy 2019 júliusa és augusztusa között Lanzhouban, a Zhongmu Lanzhou biopharma telepen, ahol brucellózis elleni vakcinát állítottak elő, lejárt szavatosságú fertőtlenítőszerek használata nyomán aeroszolizálódott patogének borították be a környéket és 3245 megbetegedést okoztak? Ha 2019 őszén a szokásosnál szigorúbb review kezdődött Wuhanban, ahogyan azt a fentebb idézett "izgalmas" paper állítja, úgy ez az eset is belejátszhatott a kínai szervek megkettőzött igyekezetébe, hogy problémákat tárjanak fel.
  • Más. Londonban januártól a brit kormány "human challenge trial" sorozatot tervez indítani: jelentkező önkénteseket átoltanak, majd szándékosan megkísérelnek megfertőzni SARS-CoV-2-vel. Rendkívüli időket élünk.
  • Még egy újrafertőződéses eset. Hatvanas éveiben járó COPD-s beteg, enyhébb második lefolyással, de ott is hospitalizációval, légszomj nyomán. A második fertőzés már D614G-variáns volt.
  • Úgy tűnik, hogy az NY-i ortodox zsidó közösségekben lesz még felderítetlen halálozás is, mert last minute mennek csak a kórházba, vagy még úgy sem.
  • Börtönjárványok, USA. Arkansasban 1000 elítéltből (teljes populáció, nem-fertőzöttek+fertőzöttek) eddig 2,5, Ohióban 2,2, Floridában 1,5, New Jerseyben 3,1, Michiganben 2,1 fő halt meg COVID-ben.
  • Nézzünk egy érdekes forgatókönyvet, ha már olvasgattam mindenfélét. RNS-vírusok konzerválódása jégben pl. letűnt calicivírus-genotípusok újra-felbukkanásának magyarázataként. (+) Tengeri emlősök koronavírusos fertőzésének lehetősége. (=) Hogyan élheti túl a koronavírus esetlegesen a járvány globális felszámolását is.

Szeptember 28-tól új bejegyzést nyitva folytatom.

A koronavírus-járvány: az ősz előzményei

Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

2020.07.21-24.

      • Ha pl. valaki most az USA-ban tartós COVID miatti vesekárosodás nyomán végül transzplantáció szükségének közelébe kerül, fekete-amerikaiként rosszabbak lesznek az esélyei egy bújtatottan rasszista kis vesefunkció-teszt miatt, amelyik magasabbra teszi neki a mércét a kvalifikációnál, mondván, a "feketéknek" (értsd: egy társadalmilag konstruált, nem-objektív kategóriához asszociált embercsoportnak) gyárilag jobb a vesefunkciója — úgyhogy nekik alapból adnak pár plusz pontot, mondván, nekik elbírja a veséjük a kreatinint. Az orvostársadalom egy része dolgozik azon, hogy ez megváltozzon, de ez egy jelenleg is folyó küzdelem.
      • Röpke gondolat: látva, sőt megszokva most már a tesztelési és halálozási adatok alakulását, nyilvánvaló, hogy a hétvége milyen torzítást visz ebbe, szóval komolyan vehető mutatót hét- vagy nyolcnapi mozgó átlagból érdemes csak csinálni.
      • Az oxfordi csimpánz-adenovírusos COVID-vakcina kivált immunválaszt (T-sejtek, antitestek, ismétléssel/két dózissal 100%-nál) és biztonságos 1077 egyénen végzett randomizált tesztelés nyomán (volt, aki a vakcinát kapta, volt, aki placebót). Amit nem árt majd még kideríteni, az az, hogy működik-e, mivel ugye "antitestyevanneki=/=indestructiblebyfire". A tűzteszt még hátravan.
      • Egy nagyon jó kis összefoglaló a teszteléssel kapcsolatos dilemmákról. Mivel most az az uralkodó feltételezés, hogy 30-as vagy akár 25-ös Ct-érték (cycle threshold) alatt válik csak fertőzővé valaki (az annak megfelelően magas vírusszint mellett), ezért jobb lehet a járvány kezeléséhez a kevésbé érzékeny, de tömeges, gyorsabb és olcsóbb tesztelés, pl. a már megjelent, monoklonális antitestekkel kezelt papíros teszt — ára 1-2 dolcsi. Relatíve alacsony Ct-érték (magasabb vírusszám) mellett már elfogadható lehet az érzékenysége is.
      • Trump figyelmének megragadásához videó kell, anélkül nem megy. Ex-FBI-tisztviselő mondja, aki dolgozott az elnök tájékoztatásában résztvevők felkészítésén. 
      • Fontos tanulmány Ausztriából (h/t Epikurosz): ágensalapú modellezésben megmutatva, mennyire fontos lehet pl. a kapcsolatkövetés és a lokációkövetés, azaz fertőzött kapcsán intézkedés az érintett háztartására és munkahelyére, vagy akár egyéb kiemelkedően fontos helyszínekre vonatkozóan is. Én pl. kiemelten kezelném azt is, ha a fertőzött tornatermet látogatott csoportos foglalkozás keretében, vagy pl. énekkarban-kórusban énekelt. Ha az a cél, hogy ne legyen még egy full lockdown, akkor ezt csinálni kell, és nem alibizős jelleggel, nincs mese.
      • Nicaragua: 99 halott máig a hivatalos adatok szerint. 936 extra halálesetet számoltam náluk eddig ("atipikus pneumóniaként írták le ezeket). Orvosok által függetlenül gyűjtött adatokból 2397 esetről érkezik itt hír most. A különbözetet (1461) számolva g.a.h.: +181428+n. (Már a Lancetben is megénekelték az ország helyzetét.)
      • Tanzánia. Itt 240 extra halálesetet számoltam korábban, most már 400+ halálesetről van hír. Különbözet minimuma, mínusz öt, az utolsó számítás óta hivatalosan elismert haláleseteket felszámolva (=160-5), így g.a.h.: +181583+n.
      • Mezőkövesden közben tovább nőtt a fertőzöttek száma. Izgalmas részletek: "a járványügyi hatóság eddig 320 szoros kontaktot derített fel, és az Országos Mentőszolgálat 283 főnél vett légúti mintát".
      • New Yorkban volt olyan szükségkórházi nővér, aki pótlékokkal együtt napi 2000 dollárt kapott, de beteget alig küldtek hozzájuk. Wow. 
      • Latin-Amerikában a helyzet rossz, többfelé fogytán a készletek kritikus jelentőségű eszközökből (JAMA).
      • "Oxfordi tudósok". A különféle keresztimmunitások elegendők lehetnek, hogy ne legyen második hullám, mondják (pre-print). Aztán ha mégsem, majd otthon fognak sörözni. Megjegyzem, a számításaik szerint 20%-os átfertőződés lehet elég a nyájimmunitáshoz (olyasmihez), de a spanyol szeroprevalencia-tanulmány alapján én nemigen várnám, hogy náluk megvan a 20%. Ha tévedek, majd elmegyek sörözni valami jó kis helyre.
      • Nincsenek kontrollált változók (még az idő sem sztenderdizált változó itt, ha jól értelmezem, amit a készítő csinált), és az országszelekció sem igazán reprezentatív, de ezen akkor is érdemes gondolkodni (HXQ).
      • A szezonális átlagot meghaladó mortalitásnak csak mintegy 35%-a nem volt a járványhoz kapcsolódó az Egyesült Államok-beli járvány korai szakaszában, arra jut ez a tanulmány (JAMA). Tekintve, hogy én az ilyen adatokból csak 50%-ot szoktam beszámítani, vagy éppen a teljes hivatalos COVID-halálozást kivonom belőle, hogy csak a tutira extra halálozást lássuk, az én megközelítésem konzervatív voltát illetően ez fontos jelzés. Ha például egy az egyben elfogadnám az idézett cikk számait, akkor most 40 ezerrel több halálesetet kellene jegyeznem az Egyesült Államoknál. Én most 87001/2-25242-vel számolok (azaz +18258; mivel eddig 25242 esetet számoltam az USA-nál). A g.a.h. így: +199841+n.
      • Dél-Afrikában hasonló adat május 6. és június 6. közöttről: 10994 extra haláleset. A felével (5497) számolva g.a.h.: +205338+n. (Megerősítő jelzés, hogy az excess mortality konkrétan ott nagy a leginkább, ahol a járvány is nagy az országon belül.)
      • Alberta, Kanada. Kevesebben mozognak az emberek, de azért nem is a jó idő zárja be őket otthonra ilyenkor, mégis +402 szezonális átlagot meghaladó halálozás. Nézzük a felét, levonva belőle az Albertában eközben hivatalosan COVID-ban elhunytakat (40 fő), úgy +160 adódik. G.a.h.: +205498+n.
      • Ez tehát, mint jelezni szoktam, konzervatív mutató, és a járvány teljes halálozása így konzervatív megközelítésben jár jelenleg 825 ezer felett globálisan (ezért van ott a +n). 
      • Egy látszólag elég érdekfeszítő tanulmányról beszámoló. Ennek utána kell menni. Kritikus állítások: 1) "The D614G strain has further evolved into two major subgroups, one with one extra mutation (C14408T), and the other with two (C14408T, G2556T)." 2) " death rates tended to peak a few weeks after co-circulation". 3) Ahol csak az egyik variáns van jelen, ott: "social distancing should still be maintained to make sure the second strain doesn’t get introduced" (nyilván a nemzetközi utazási korlátozásokra is gondolnak itt). Itt a tanulmány a cikk hátterében (pre-print). Valójában három nem-csendes pontmutációról van szó a nukleotidszekvenciában, amiből az egyik variánsnál kettő van meg, a másiknál három. A kérdéses mutációk: C14408T (az ORF1ab RNS-dependens RNS-polimerázt kódoló régiójában), A23403G (a tüskében; ez a D614G mutáció forrása az S-protein aminósav-szekvenciájában), G25563T (az ORF1a-ban). A szerzők innen jutnak oda, hogy "The high cumulative frequencies of both subclades showed inconsistent but significant association with high cumulative CFRs in some of the regions." És ebből támad elméletük, miszerint "a person may get serially infected. The second infection may trigger a hyperinflammatory response". Szerintem ez így egy statisztikailag valószínűtlen esemény (együtt-fertőződés) vélt tömeges előfordulásából generált makroszintű magyarázat, és mint ilyen... vad. Úgyhogy bizonyíték felleléséig nem vehető kiindulópontnak.
      • A járvány elleni intézkedések izgalmas kérdése: vajon mennyire veti mindez vissza az influenza terjedését? Jelenleg a déli térfélen, akarom mondani féltekén pattog a labda.
      • Bolívia, holttestek begyűjtése az utcáról, kb. 400-at vittek be öt nap alatt. Azt írják, hogy kb. 85% lehetett COVID-beteg, úgyhogy ennyit (340) hozzáadok a náluk jelentett kórházi halálesetekhez. G.a.h.: +205838+n. Közben mi lehet vajon Venezuelában? 
      • A denevérgenom kutatása immunológiai tanulságokért. (Itt ír erről a BBC is.)
      • Járvány apácazárdában (Michigan).
      • Azért az cuki, amikor egy szakértő egy cikkben azt mondja, hogy a rövid időn belüli újrafertőződés esélye csekély, és az újra megbetegedőknél lehet, hogy csak elrejtőzött a vírus a szervezeten belül valahol, és úgy váltott ki újra-megbetegedést. Az tényleg annyival jobb lehetőség, hogy na. 
      • Uganda. 0 halott a koronavírustól — Such official, much data, hogy a klasszikus mémet idézzem. Viszont a rendőrség és egyéb biztonsági szervek már 12 embert megöltek járványügyi jellegű intézkedés közben. G.a.h.: +205850+n.
      • Két jónak tűnő érv Merkely Bélától, arra nézve, hogyan terjedhet látványosan a vírus melegebb klíma mellett is: 1) légkondi (Ázsiában, vagy az Egyesült Államokban képesek 20-25 fokos hőmérséklet-különbséget generálni vele, tényleg elég ártalmas + körbekeringtet mindent beltérben); 2) annyira magas már a hőmérséklet sok helyen, hogy — ahogyan télen is — több a beltérben töltött idő. Persze ez a vírus tavasszal is tudott gyorsan terjedni, meg szegény országokban is, szóval ezek az érvek sem azonosak valamiféle mindent magyarázó Nagyelmélettel.
      • Tegnell beszélget. Szokott. Igazságai persze neki is vannak. A svédek önként visszavettek annyira a mobilitásból, mint mások, én is leírtam korábban. A haláleseteket korrektül számolták, ellentétben másokkal, akik csak a kórházi eseteket könyvelik. Hosszú távon is vakcina hiányában tényleg az idős otthonok védelme, és a kórházi kezelés javítása a legfőbb támadási felületek a járvánnyal szemben. De amit ez az ember a maszkviselésről magyaráz, hogy ő nem lát bizonyítékot a maszkok hasznosságára, azt egyszerűen nem értem. Azt mondja, hogy maszkok nélkül az emberek kevésbé találkozgatnak másokkal. Ez nettó hülyeség. Az általa 0,5%-osnak tippelt IFR-ről (infection-fatality rate) pedig azt, hogy "nem drasztikusan rosszabb az influenzáénál"; csakhogy egyrészt de (és lehetetlen, hogy ezt Tegnell ne tudná), másrészt ez a vírus most megy körbe először (ha nem sikerül felszámolni), az influenza pedig a populációnak csak töredékét érinti szezonálisan.
      • Ha vetünk egy pillantást a halálesetek hivatalos számára New Yorkban és New Jersey-ben, azt látjuk, hogy előbbinél 1 millió főnyi populációra 1679, utóbbinál 1780 eset jut. Ez azt jelenti, hogy a koronavírus CFR-je náluk már semmiképpen nem lehet 0,17% alatt (miközben még messze nem fertőződött meg mindenki). És tegyük hozzá, hogy a hivatalos adatok alulmérik a halálozást. 
      • Írtam egy cikket a G7-nek arról, milyen tanulságokkal szolgálhat a nyári rendkívüli teniszszezon a járvány jövendő őszi és téli szakaszában. 
      • Állatoknál a COVID nem olyan súlyos. Nem alakul ki hipoxia, citokinvihar. Volt a review által áttekintett tanulmányok között szó macskáról, menyétről, egérről, hörcsögről, emberszabásúakról. A vadon élő tobzoskákról jó lenne még tudni, hogy náluk mit okozna. Ha egyszer az RBD az ő vírusukból származik. De ennek a kutatása alapvető akadályokba ütközik.
      • Ez nagyon érdekes: svájci katonák vizsgálata, potenciálisan jó hírekkel. A korlátozó intézkedések előtti és utáni fertőzések lefolyásának összehasonlítása. A megváltozott óvatossági szint mellett alighanem átlagosan kisebb dózisokkal történt a transzmisszió, és így senki nem lett annyira beteg, míg előtte 354-ből száznál többen.
      • Olvasmány (2013-as) Anders Tegnellnek sok szeretettel a maszkok hatékonyságáról.
      • Egy záró gondolat mára, az Indexről: én úgy érzékeltem tavasszal néhány ponton, hogy a határozottabb járványügyi cselekvésben szerepe volt a médiafigyelemnek is. Az őszi szezonba kevesebb sajtókontrollal belemenni már csak járványügyi szempontból is bajos lehet.
      • John Ioannidis. A Stanford és egy picit a tudományos világ szégyene. Konkrétan lockdown-ellenes összeesküvő.

2020.07.25-07.31.

  • 7-6-5-8-11-30-67 (március 12. — március 19. — március 25. — március 30. — április 7. — április 18. — május 18. — július 24.; 5000-től 640 ezerig): a halottak hivatalos számának duplázódásához szükséges napok száma az elmúlt hét duplázódási ciklusra visszatekintve. (Újraszámoltam, az első néhány ciklust pontosítottam.)
  • Kísérlet készül a tömegrendezvények lebonyolíthatóságával kapcsolatban, de alapvető dizájnhibával. Etikai okokból nem lehet FFP2-es maszk nélkül egy arénába ereszteni ennyi kísérleti személyt most, és így az aeroszolos terjedést pont nem fogják modellezni, csak az indirekt kontakton keresztülit, illetve a térközök alakulását és a személyközi interakciókat.
  • Miközben Ioannidis-féle valódi tudósok tudnak végtelenül hamis módon eljárni, a tudományos világba beszivárognak kókler autoritástolvajok is. A minap egy ilyen banda írt cikket az 5G és a koronavírus kapcsolatáról, hihetetlen kamuáradattal.
  • Emlékszünk rá, amikor Michael Levitt (Stanford) 60+ nappal ez előtt azt mondta, hogy mindjárt vége a járványnak, mert 40 napnál nem tarthat tovább? Michael Levitt (akit nem különösebben érdekel, hogy emlékszünk-e) A MAI NAPON azt mondja, hogy az Egyesült Államokban 4 héten belül vége lesz a járványnak. Ioannidisék nyomában legalább most már tudjuk, hogy nem elmebeteg, hanem... valami más. Valami ijesztőbb.
  • Fontos pre-print paper: újabb receptor, melynek a sejtekbe való bejutásnál jelentősége lehet, furin általi hasítás utáni maradványok kötésével. NRP1/Neuropilin-1. Jelen a légúti hámsejtekben és a szaglóhám-sejtekben is (utóbbi jól magyarázhatja a vírus neurotropizmusát is, a központi idegrendszerhez vezető elérési útvonalként). Nekem ebből nagyon az jön le, hogy a sejtekbe való bejutás többféleképpen is lehetséges, furin általi hasítással és anélkül is, és hogy a furinnak a sejtbe való bejutásnál és a sejten belül, a virális replikációban is van szerepe.
  • Egy mondat a Hoffmann et al. tanulmányból innentől fontosabb a szememben: "MERS-S is first cleaved by furin at the S1/S2 site in infected cells, which is required for subsequent TMPRSS2-mediated cleavage at the S2′ site". Szóval a MERS-nél ez a sorrend az interakcióban. Receptorhoz kötődés (a MERS-nél a receptor nem az ACE2, hanem a DPP4), furin általi hasítás az S1/S2 határon, TMPRSS2 általi további hasítás a fúziót vezérlő S2-es szakaszon. Az a beszúródott furin hasítási hely nagyon-nagyon ott van, ahol lennie kell.
  • Ugyancsak Hoffmannéktól: ha nincs TPMRSS2 jelen a sejt felszínén, akkor a bejutáshoz (az old school SARS-hoz hasonlóan) a katepszin B/L (CatB/L) is megteszi a vírusnak.
  • Testvérek (20 és 22 évesek) halála.
  • Még régebbi esetről tanulmány. Franciaországi kóruspróba a résztvevők 36%-át küldte kórházba, 21%-ot az intenzív osztályra. 45 négyzetméteren énekeltek 27-en.
  • Üzenet a portfolio.hu-nak. Amikor azt írjátok, hogy "Fontos kiemelni, hogy már több mint egy hete nincs halálos áldozata a koronavírusnak Magyarországon, ami azt sugallja, hogy a betegség visszaszorult az országban", sajnos elfelejtitek, hogy az új esetek jelentkezésétől várni kell három hetet, míg... érthető? Egy hét lappangás, egy hét gyengélkedés, egy hét intenzív, és akár még egy-két hét lélegeztetőgép. Mivel mostanában láthatóan intenzívebben zajlik a kapcsolatkutatás, van rá esély, hogy az azonosított fertőzöttek kisebb százalékánál, mint eddig, de így néz ki a lefolyás rossz esetben.
  • Öveket bekapcsolni. Az Egyesült Államokban elképesztő esetszám alakult ki már mostanra is. A halálesetek trendje felfelé mutat ennek megfelelően. De mennyire meredeken? Megyei szintű hírből idézem, Texasból (Starr County): "While the county has nine deaths, according to official counts tabulated by the Department of State Health Services, Vazquez reported that there, at least 32 more pending confirmation." A lemaradás akkora, hogy háromszor annyi már megtörtént haláleset utólagos felszámításával kalkulálnak már most. Ilyen lemaradás persze csak a legsúlyosabban érintett területeken alakulhatott ki, de tényező lehet akár az országos szintű adatot tekintve is.
  • A neuropilin-1-ről (NRP1) fentebb említettek kapcsán olvasgattam, és miután a vaszkuláris endothelium növekedési faktor-A-val (VEGF-A) interakcióban szerepet játszik az angiogenezisben (érpályák képződése), ennek mentem volna utána, amikor ez a pre-print jött szembe. Itt a vírus tüskeproteinjének a VEGF-A/NRP1 interakciót blokkoló hatása kapcsán a neuropátiás jellegű fájdalomérzet elnyomásáról esik szó következményként, és a paper ezzel magyarázza az aszimptomatikus betegségélményt, vagyis hogy miként zúzhatja le a vírus valakinek a tüdejét, ereit stb. anélkül, hogy felfigyelne, mi történik benne. És közben az illető így marad mobilis fertőzésforrás a környezete számára.
  • Ez a paper pedig további adalékokkal szolgál a SARS-CoV-2 NRP1-hez kötődéséről. Az RRAR furin hasítási hely az S1-S2 határon a tüskében a szétválás után C-végződést hagy az S1 végén (szabad COOH csoportot), és ez teszi lehetővé az NRP-1 kötését (NRP2-höz is kapcsolódhat).
  • További eredmények a szívet érő terhelésről (JAMA). COVID-diagnózis után eltelt 71 napnyi medián idő után szív-MRI-vel vizsgált egyéneknél 60% mutatott szívizom-gyulladást "alapbetegséghez és betegséglefolyás súlyosságához nem kapcsolódó módon". 
  • Az Egyesült Államokban jelenleg már fennakadásokkal működik csak a halálesetek feldolgozása, és 7-10 napos várakozási idők vannak teszteredményekre (gyakorlatilag megszűnik a tesztek diagnosztikai értéke). Ilyen körülmények között a statisztikáik kezdenek komolytalanná válni. De lehet gondolkodni szükségmegoldásokon. A megfelelően kiképzett kutyák ugyebár ki tudják szagolni a COVID-et, jobb érzékenységgel, mint némelyik teszt.
  • Trump nemzetbiztonsági tanácsadója pozitív lett (Robert O'Brien). A Trump-féle káoszkabinetben "annyira nagy" a súlya (értsd iróniával), hogy már bejelentették, hogy Trump részéről nem volt kockázatnak kitéve (magyarán olyan iszonyatosan sokat nem érintkeztek akkor).
  • A(z egyelőre jó) hazai szennyvizes eredményekről a napokban már a kommentek között is esett szó. Minden megyeszékhelyen van nálunk rendszeres mérés, és jó, hogy van egy ilyen extra érzékszervünk a járványhelyzet felmérésére.
  • Egy hongkongi orvos, Dr. Kwon Yung Yuen január 12-én, Shenzhenben diagnisztizált koronavírust egy családnál úgy, hogy annak csak egyik tagja járt Wuhanban, így már akkor egyértelmű volt számára az emberről emberre átadás lehetősége. De hiába adott kötelező értesítést erről az illetékeseknek, a hivatalos elismerés csak nyolc nappal később történt meg.
  • Texas hozzácsapott az eddigi halálozáshoz +600 esetet halotti bizonyítványok alapján, de ennek sem a JHU-féle, sem a Worldometers-féle adatbázisban nincs nyoma. A kórházak túlterhelése nyomán láthatatlanná válik a járvány jelentős része, és csak utólag lehet majd felmérni, a szezonális átlagot meghaladó halálozásból.
  • Málta korábban leállította a migránsok fogadását a járvány miatt, most 65 embert mentettek ki a tengerről, akiknek kétharmada fertőzött (Észak-Afrikában a hivatalos adatok nem igazán pontosan tükrözik a helyzetet).
  • Nagy a vita a spanyolok részéről az ellenük irányuló utazási korlátozások miatt, de hát ki mint vet, úgy arat. Ha nem akarnák saját magukat is megtéveszteni a hivatalos adataikkal, akkor több lenne a bizalom.
  • Hongkongban a politikai válság mélységével vetekszik lassan a közegészségügyi válság.
  • Trumpék a hidroxiklorokin esélyeit bármiféle terápiás alkalmazásra pillanatok alatt meggyilkolták a mellette való esztelen kampányolással, amitől az egész szürreálissá és átpolitizálttá vált. Most éppen egy kameruni bevándorló orvos hölgyre hagyatkoznak, aki a nőgyógyászati problémákat mellesleg a démonok világából eredezteti. Trumpékat persze a hidroxiklorokin sorsa a legkevésbé sem érdekli: nekik ez jó kifogás lesz, amiért benézték pár százezer ember halálát. "Hiszen nem is kellett volna meghalniuk, volt gyógyszerünk", fogják mondani.
  • Kazahsztánban augusztus 1-től "összevonják" a koronavírusos és az atipikus pneumóniás esetek jelentését (értsd: nem kamuzzák el a járvány nagyobbik részét). Kínai nyomásra, by the way, de még így sem visszamenőleg.
  • A fehérorosz elnök, Lukasenko állítólag fertőzött lett, de állítólag aszimptomatikusan túl is esett már ezen.
  • Zajlik a hádzs, sok korlátozással, de zajlik. Lásd a képet alább. Egy embert látni rajta maszk nélkül, a többiek abban vonulnak, megfelelő térközzel kijelölt útvonalon. A beutazóknál volt előzetes tesztelés, 20-50 évesek mehettek elvileg csak, karanténozás lesz szállodában az esemény után egy teljes hétig még.

2020july29_hajj_saudiarabiamecca_coronavirusrestrictions.jpg

  • COVID-ben elhunyt Herman Cain, a 2012-es amerikai elnökválasztás republikánus elnökjelöltségéért indulók egyike, 30 nap kórházi kezelés után.
  • Bár a SARS-CoV-2 általában nem öli meg az állatokat, nincs náluk hipoxia, citokinvihar stb., állapította meg egy tanulmány nemrég, de azért a beteg egyedek nyilván közülük is veszélyeztetettebbek, és a kísérleti laborokban nem ilyen egyedek az alanyok... Úgyhogy figyelemre méltó lehet: nyirokrákos, korábban víruspozitív német juhász halála. Légzőszervi tünetei voltak, június 2-án lett pozitív a tesztje. Ennyi idő alatt megszabadulhatott a vírustól a szervezete, de nem lett sokkal jobban, július 11-én pedig vért köhögött fel. "Jött az orrán-száján" a tulajdonosa szerint. Érdemes lenne az esetet jobban megvizsgálni. 
  • Újabb izgalmas részletek az amerikai döntéshozatalról. Jared Kushner összerakott egy csapatot tavasszal, persze nem közegészségügyi szakemberekből, hanem magukat mindenhez értőnek gondoló szupermenedzserekből, de még az ezek által kidolgozott tesztelési stratégiából sem lett semmi a Fehér Házat lakó személy mindent alulmúló hülyesége miatt. Közben a megbeszéléséken olyan is elhangzott a Kushner-féle csapatban (akkoriban, amikor Kaliforniában és New Yorkban volt a legtöbb eset), hogy ez a járvány a "kék államok" (=demokrata államok) problémája, és úgy érdemes kezelni.
  • Szuperterjesztő partiállat esete Franciaországban, 72 származtatott eset. Amikor a terjesztő aktív volt, még csak fejfájása volt.

2020.08.01-05.

    • Érdekes eredmények az ön-mintavétel szélesebb körű alkalmazásával kapcsolatban. A páciensek által vett orrjárati, nyelvfelszíni minták megbízhatósága nem rossz, és a mintavétel így mentesül az eü. személyzet számára jelentkező kockázattól és a PPE-szükséglettől.
    • Gyerektáborozós járványkitörés (USA).
    • Jó, hogy ez is eszébe jutott valakinek: mi van, ha denevérpopulációkat sikerül megfertőzni Ázsián kívül másutt SARS-CoV-2-vel? Az idézett cikkben bemutatott tanulmány itt. Alapvetően nem-elhanyagolhatónak találja a kockázatot.
    • "Úgy fogja érni őket, mint a szputnyik fellövése annak idején", szól az orosz fogadkozás a szuverén orosz pénzügyi alap vezetőjétől azzal kapcsolatban, hogy a világot meglepve mindenkinél gyorsabban gondolnának elkészülni vakcinával. Kicsit aggasztó, hogy az amerikaiak reakciója érdekli jobban a saját népének, vagy esetleg a világnak a sorsánál. Persze az ilyesmi megszokottnak is mondható.
    • Iránból kiszivárogtak kózházi adatok, amelyek alapján vagy kétszer annyi fertőzött és háromszor annyi halott volt mostanra, mint a hivatalosan szolgáltatott adatok szerint. Eddig 4652 halálesetet számítottam náluk, most jön ehhez konzervatívan számolva (a hivatalos iráni haláleseteket 15 ezerre kerekítve, hogy a BBC hülyeújságírója által írt "majdnem 42 ezer" bizonytalanságát kompenzáljam; illetve ezek után a 4652-t még kivonva): +22348. G.a.h.: +228198+n.
    • Hollandiából eddig 3376 extra halálesetet vettem figyelembe halálozástöbblet alapján. A holland statisztikai hivatal (CBS) most kihozta, hogy 8593 és 11691 közötti a hivatalosan nem regisztrált COVID-halálesetek száma (CI 95%). Konzervatívan ebből az alsó értéket nézem, levonva a 3376-os adatot (5217). G.a.h.: +233415+n.
    • Az orosz vakcinát tömegesen bevethetőnek várják októberre, hivatalosan. Nézzük, mivel főznek! Ezzel. Rekombináns humán Ad5-ön alapuló adenovírus-vektoros vakcina, intramuszkulárisan belőve, a SARS-CoV-2 S-fehérjéjét kódoló génnel.
    • 35 ezer fős létszámleépítés az HSBC-nél. Sok a rossz kölcsön, mondják. Kezd érni a járvány gazdasági hatása.
    • Munkanélküliség, fizetésképtelenség, a lakhatási biztonság hiánya tömegesen, Egyesült Államok. Lassú még a munkanélküliségi segélykérelmek elbírálása is, a tömeges jelentkezés miatt, ami persze tovább ront a helyzeten.
    • Egy kutatási jelentés az RaTG13-at vette szemügyre alaposabban, pontosabban a génbankban elérhető szekvenciaadatait (a vírusból nincs már példány, miután a kínai fél szerint egy minta volt csak, és azt vizsgálat során elhasználták). Az SRX772475 jelzésű szekvenciában e szerint a jelentés szerint szokatlanul nagy arányban fordulnak elő a kromoszómavégi telomérekre emlékeztető ismétlések. És egyéb anomáliák. Elég tömény elemzés, a szerző bizonyos Daoyu Zhang.
    • Ez is egy érdekes tanulmány, bár nem egy minőségi kiadvány, hibákkal.
    • Valahol GyMS megyében, családi összejöveteles klaszter, 36 megerősített fertőzött az elmúlt időszakból (több nap terméseként állt össze a kép), plusz sok karanténozott.
    • Trump, aki ellenzékiként ábrázolja magát Anthony Faucival szemben, most már ellenzékiként prezentálja magát Deborah Birxszel szemben is. A saját Coronavirus Task Force-ának a tagjaival. Novemberben IQ-teszt!
    • Kongresszusi meghallgatás. Jim Jordan republikánus képviselő hosszan nyomasztja Faucit, hogy javasolja már a tüntetések betiltását ("Do protests increase virus spread?"), mintha maszkban tüntetni lehetetlen lenne, és mintha a tömegesemények elkerülését javasolni nem lenne elegendő. Ennek az embernek az kell, hogy egy közegészségügyi tisztviselő a belpolitikában álljon ki a tábora mellett, vagy — ha ezt nem teszi — "lepleződjön le", mint áruló. Ahogy a bizottsági elnök elegánsan zárja a "beszélgetést": Do fundraisers without masks increase virus spread?
    • Trump-interjú (HBO). A riporter sincs amúgy a helyzet magaslatán, az interjú is inkább veszekedés sokszor, mint valódi kérdezés, de Trump is hozza a formát. Teljesen értelmetlenül beleszalad egy olyanba, hogy "nem akarok beleszaladni abba ... hogy a dél-koreaiak adatai igazak-e" (a járványról; parafrázisként adom vissza). Az iráni Szolejmani tábornokot az ISIS-szal veszi egy kalap alá következetesen. A portlandi tüntetőket egy ponton konkrétan terroristának nevezi. Stb. Érdemes viszont egy időre eltűnődni azon is, komparatív perspektívából, hogy Trump még ezzel együtt is olyan vezető, aki képes leülni egy nem alányalni hivatott újságíróval, és elvisel konfrontatív kérdéseket.
    • Agyi MRI alapján látszanak tartós változások az agyban COVID-ből felépülőknél. Neuroinvazivitás a szaglóidegen át, a szaglásban domináns szerepet játszó jobb féltekét érintő változások stb. 
    • 17 éves srác egy héten belül vesztette el a szüleit a COVID miatt.
    • Már kitértem itt arra, hogy a börtönök nem zárt rendszerek. A környékükön élő közösségekben hozzájárulhatnak a terjedéshez. Az ezt tanulmányozó kutatók mintha a börtönben dolgozó munkaerőről elfeledkeztek volna a konkrét oksági mechanizmusokat illetően.
    • Olasz szerológiai vizsgálat híre: antitestek az olasz népesség 2,5%-ánál, Lombardia esetében 7,5%-nál. Ezekről az eredményekről mai állás szerint azt gondolom, hogy ez most alábecsülni enged a fertőzésen átesettek arányát. Már nem áll fenn a fals pozitívok arányával kapcsolatos matematikai probléma, ami a tavasszal nyilvánvalóan gazdasági lobbik hatására készült antitest-vizsgálatokat korrumpálta, tudunk viszont az antitest-titerek gyors hanyatlásáról. 
    • A T-sejtes keresztimmunitásról. "A range of preexisting memory CD4+ T cells ... are cross-reactive with comparable affinity to SARS-CoV-2 and the common cold coronaviruses" (OC43, HKU1, NL63, 229E). És amit ez magyarázhat: "at least some of the heteregeneity observed in COVID-19 disease". Én itt egy kifejezést nem szeretek: "common cold coronavirus" — nem igazán komolyan vehető a vélelem, hogy pl. az OC43-as annyira laza kis betegséget tud csak okozni.
    • Mikor a napokban tájékoztatás érkezett GyMS megyei családi rendezvény nyomán kialakult klaszterről, kellemesem meglepődtem, hogy már ilyen részleteket is az állampolgár orrára kötnek a szervek. Azóta egy vicc, ami ebből lett. Hajdúböszörményben van a fertőzöttek nagy része, állítólag, csak erről az ottaniaknak sem ad senki részletesebb információt. Ezzel a hozzáállással ősszel rossz lesz.
    • Nem túl meglepő, viszont ezennel tudományosan megalapozott(abb): interleukin-6-gátlókkal jó eredményeket lehet elérni.
    • Libanon, államcsőd, 2750 tonna műtrágya felrobban, a kikötői gabonakészletek megsemmisülnek, egy COVID-kórházban jelentős károk keletkeztek, mi jöhet még? (Jut eszembe, a járvány margójára: erre a robbanásra vajon mondanák-e egyesek, hogy "csak a kikötő körül élőkre volt veszélyes? Mások számára 0%-os a halálozási arány. Nyugodtan lehet műtrágyát úgy raktározni, ahogyan itt történt.")
    • Remek összefoglaló (Nature) az elmúlt évtizedek pandémiás gyakorlatainak tapasztalatairól, amelyek közé most már az is odatartozik, hogy mennyire nem sikerült ezek alapján előrejelezni a valós problémák egy részét. Szerepel a cikkben pl. utalás arra, hogy mennyire fontos az "opening game", és hogy a vakcina elérhetővé válása után következő "endgame" is persze, de mennyire fontos az is, ami a kettő között van. Itt ugye az a gond, hogy az opening game szánalmasra sikerült, és vakcina elérhetősége nyomán sem biztos, hogy az endgame következik. Mindössze csak ennyi a bökkenő.
    • Menő új amerikai film bemutatója (Christopher Nolantől)... az Egyesült Államokon kívül, 70 másik országban. The shit hits the fans.
    • Salát Gergely elemzése a "második pekingi járvány" felszámolásáról Kínában. Lényeges dolgok: "fel sem merült, hogy megelégedjenek a járványgörbe ellaposításával, nyájimmunitásra törekedjenek, a gazdaságnak vagy az egyéni szabadságjogoknak rendeljék alá a helyzet kezelését, vagy hogy a személyes adatok védelme nehezítse a védekezést. A hatóságok a fertőzések nullára szorítását tűzték ki célul, és ebben a lakosság döntő többsége támogatta őket." Továbbá: "a vírus elleni fellépés nem merülhet ki szakszervek tevékenységében, az egészségügyi, rendészeti, járványügyi, kommunikációs, technológiai stb. intézkedések mellett a lakosság teljes körű tájékoztatására és mozgósítására van szükség". Emellett kiemelném: a PCR-poolingot, a (feltételekkel, de) sokak számára ingyenesen biztosított tesztelést, a mások számára tömegesen előírt kötelező tesztelést és a lakóterületek aprólékosan szegmentált kezelését.
    • Itt egy beszámoló a fiatal hölgytől, akinek a kettős tüdőátültetéséről volt itt szó korábban (USA); még az eltávolított tüdő képét is megosztottam. Jobban van, de nem jól. A kognitív funkciói is megszenvedték a betegséget — egy ponton lehet látni, milyen mozgáskoordinációs gyakorlatot végeztetnek vele többek között, hogy rehabilitálódjon.
    • Azokról a keresztreaktív T-sejtekről, másik vélemény. Idézem: "these cross-reactive T-cells “tell you absolutely nothing about protection.” It’s intuitive to think they would be protective, but immunology is where intuition goes to die. The T-cells might do nothing. There’s an outside chance that they could predispose people to more severe disease."
    • Hidroxiklorokin. In vitro vizsgálatról hír, mely a HXQ-t a vírus sejtbe jutásának blokkolására alkalmasnak találja vesesejtek esetében, viszont nem találja hatásosnak tüdősejtek esetében. Természetesen továbbra sincs szó a HXQ cink-ionoforként játszható szerepéről (a vírusreplikáció sejten belüli blokkolásához). És Trump említése sem maradhat el.
    • The protein expression profile of ACE2 in human tissues. Fontos tanulmány. Az eredmények közül: "ACE2 expression was mainly observed in enterocytes, renal tubules, gallbladder, cardiomyocytes, male reproductive cells, placental trophoblasts, ductal cells, eye, and vasculature. In the respiratory system, the expression was limited". Az utolsó mondatot a "normális" légzőrendszerre utalva mondják, azt nem árt hozzátenni.
    • Még fontosabb tanulmány. Az immunválaszról enyhe és súlyos lefolyásnál. Diszfunkcionális neutrofilek stb.

2020.08.06-10.

  • A kanyarónak sem tett jót a koronavírus, nem tud annyira terjedni a korlátozások és az elővigyázatosság miatt. Így néz ki a trend a szezonális ciklusokkal.
  • Floridában a tesztelésnek és egy kicsit nyilván az ellátásnak is beakasztott a vihar, ami ott járt a napokban.
  • Visszatekintés a gépjárművekben használatos biztonsági övek bevezetésével és használatuk elterjesztésével kapcsolatos küzdelmekre. A maszkok kapcsán.
  • Komolytalankodva megírt cikk, de érdekes: a 48 órán túl tartó csuklás mint COVID-tünet előfordulásáról egy esetben.
  • Iskola Georgiában, egy diák (Hannah Watters) lefényképezte, milyen a biztonságos újranyitás. Felfüggesztették a helyi zsenik válaszul. Erről jut eszembe: zseniális menedzserek kitalálhatják, hogy tanórán x ember lehet csak jelen, de közben a folyosókon van áthaladó forgalom minden szünetben, tömegesen, akkor is. Sokan, sok helyről, sok helyre — az oktatási intézmények használati mintázatának sajátossága.
  • Nem az első eredmények ezen a téren: aszimptomatikus hordozóknál a vírusszám hasonló a szimptomatikusakéhoz, plusz náluk lassabban csökken a Ct (cycle threshold) érték. Vagyis fertőznek.
  • Igazságtalanság a köbön: egészségügyi adósságokkal terhelten örökölt házból kilakoltatott memphisi nő, aki a kilakoltatás közben is COVID-19 miatti légzési nehézségekkel küzdött.
  • Sötét bőrszínnél nem jó irányban tévednek a pulzoximéterek, túl rózsásnak mérve pl. fekete COVID-betegek állapotát.
  • EU-s vakcinabeszerzés, idehaza meg egy kis csúsztatgatás. Ötmillió vakcina amúgy fejenként két dózis mellett két és fél millió honpolgárnak lesz elég maximálisan, just saying. És kérdés, hogy a Sanofi/GlaxoSmithKline befutó lesz-e.
  • Újjászervezés a magyar járványügyben a gócok hatékonyabb kezelésére. A kapcsolatkutatás bizony fontos lesz.
  • Arabica vs. robusta. A duális kávé-világpiac felemás trendjei a válság hatására.
  • Vietnam esete mutatja, hogy az éberségből ennél a járványnál nem lehet engedni.
  • Tanulmány a JAMA-ból: NYC körzetében 40329 fő eü. dolgozó közül 5523-an, azaz 13,7%-nyian bizonyultak szeropozitívnak (csak). Alacsony átfertőzöttség, még akkor is, ha ezt alulmérésnek tekintem a hanyatló antitest-titerek miatt. A valódi arány nem nagyon lehet 20% felett, miközben már most 1688 haláleset jut NY-ban (nem csak NYC) egymillió főre (tehát a teljes populáció 0,168 százaláka halt meg a COVID miatt, miközben messze nem a teljes populáció esett át a fertőzésen).
  • John Ioannidis a Stanfordról már megint okoskodott egy kicsit, és ezúttal megfertőzte a CNN házi doktorát, Sanjay Guptát is. Jó kritikai levezetés arról, hogyan kell valójában átszámolni bármiféle nyájimmunitási küszöböt a keresztreaktív T-sejtek totális hatásosságából kiindulva (ami egyébként jelenleg nem józan feltételezés jelen ismereteink szerint).
  • Orvosi konfliktusokról az Egyesült Államokban, a vérhigítóktól a tocilizumabon át a hidroxiklorokinig bezárólag. Özönlöttek a betegek, ideálisak voltak a körülmények randomizált kontrollvizsgálatokhoz. Ahhoz viszont az is kellhet, hogy az adott beteget ellátó orvos szenvtelenül végignézze a beteg kiszenvedését... anélkül, hogy beadná neki, amit adott pillanatban maga egyébként hasznosnak gondol. Ugyanakkor, mivel sok volt az ilyen értelemben vett önkény a kezelések során, most pl. New York nem adhat Texasnak olyan magabiztosan tanácsot, mint ami maximális következetesség mellett elérhető lett volna.
  • A szaglással kapcsolatos zavarokról COVID-nél. Vírusantigénre pozitív CD68+ makrofágok beszűrődését találták például. És még egy tanulmány a témában, eü. dolgozók anoszmiával (szaglásvesztéssel) kapcsolatos tapasztalatairól.
  • Érdekes fordulat Örményországban, kedvező. Pedig nem csináltak semmi különöset. Ebből egyesek már le is vonták a következtetést, hogy ez egy egyhullámos járvány, és a hullám mindenkit elér előbb-utóbb, csak a gazdasági költség nagyobb ott, ahol tovább harcolnak ellene. "Kis" problémák ezzel az elmélettel: (1) ha van remény vakcinára (márpedig van), akkor érdemes időt nyerni, és ezért áldozatot vállalni; (2) amíg nem lehet biztosat tudni arról, hogy valami egyhullámos, akkor is érdemes időt nyerni, akik pedig hagyták a járványt elszállni az eddigiekben, azok nem biztos tudás birtokában tették ezt, hanem csak mert idióták voltak (talán számít ez a kis különbség); (3) a járvány hálózati struktúrákon fut végig — egy új "hullám" emelkedéséhez a hálózati struktúrák átrendeződése, és következésképp idő kellhet; ilyen átrendeződést hozhat pl. a mobilitási és kontaktmintázatok szeptemberi változása; (4) az eddigi hullámok mérete országonként/területenként brutálisan eltér — most akkor a New York-i vagy az örményországi méretű hullám az elkerülhetetlen az Elkerülhetetlen Hullám Elméletének hívői szerint?; (5) vigyázó szemeiteket pl. Spanyolországra vessétek, vagy pl. Iránra.
  • Részletes áttekintés Trump járványügyi "munkásságáról".

     

    2020.08.11-16.

    • Látszik a növekvő hazai járvány a budapesti és a debreceni szennyvízmintákból is.
    • Fesztivált kaptok, akkor is, ha nem akartok: a Sturgis Motorcycle Rallyt a helyi lakosok 60+%-a nem akarta a városvezetés saját felmérése szerint, de azért megcsinálták. 250 ezer ember a kifejezetten az egészségre nagy ívben nem gondolós fajtából, what could go wrong?
    • Tanulmájny (IJID). A D vitamin (D3) mellé a K2-t ajánlja kiegészítésként, ami bennem érdekes kérdéseket vet fel a K2 véralvadási folyamatokban játszott komplex szerepére tekintettel.
    • Új esetek Új-Zélandon, 102 nap után, négy mindjárt, egy háztartásból, eredet ismeretlen. Kieg.: egy idősök lakhelyéül szolgáló telepen is vannak gyanús esetek.
    • A Guardian-projekt már 922 azonosított, valószínűsíthetően COVID-ban elhunyt amerikai eü. dolgozónál jár.
    • A Kreml bebizonyította, hogy szeretik olvasni Pelevint, Gluhovszkijt és a nagy orosz valóság más kritikusait. Máskülönben miért adták volna a Szputnyik V. nevet a vakcinájuknak
    • Más. Olvasva Kovácsy Zsombor Elfekvő: Gyógyítható az egészségügy? c. könyvét (Progress, 2020), azon tűnődöm (többek között), hogy mennyire alapvető, hogy az eü. rendszer jobb működéséhez valamiféle "fékek és ellensúlyok" szisztémára van szükség (egyebek mellett) — rendszerre a rendszeren belül. És persze hogy easier said than done.
    • Az új-zélandi kitörés rejtélye. Import fagyasztott áru lenne a bűnös? Kínában is felvetődött ugyanez a lehetőség nemrég. 
    • Röpke gondolat. Míg Oroszországban a sztenderd eljárást mellőzve hoznak ki egy vakcinát, hogy Szputnyiknak nevezve tálalhassák a világnak, az Egyesült Államokban 483 millió dolláros szövetségi kormányzati támogatást felhasználva fejleszt oltóanyagot a Moderna cég, hogy aztán dózisonként várhatóan 32-37 dolláros áron bocsássa áruba. Egyik jobb, mint a másik.
    • Eredmények Kínából. 1178 fertőzött és 15648 kontakt vizsgálata nyomán látszik a járvány erős klaszterezettsége — 80% másodlagos transzmisszió a fertőzöttek 14%-ától származott —, amellett pedig a fertőzőképesség csúcsidőszaka a tünetek jelentkezése előtt van. Ezeket már korábban is sejtettük, most elég vaskos további eredmények szólnak a fentiek mellett. Ezért különösen fontosak ennél a járványnál a maszkok. De persze nem a szelepes fajták
    • Pápán is komolyan szétterjedt már a vírus.
    • A magyar gazdaságot a második negyedévben ért hatás mértéke. Az Egyesült Államok és a britek például többet zuhantak. Viszont mi vagyunk a függőbb gazdaság, úgyhogy ha a partnerek visszaesnek, akkor sajnos annak jön további hatása t+1 időszakban nálunk. És persze a járványnak sincs vége, sőt.
    • Komoly gazdasági-egzisztenciális fenyegetettség az indiai tibeti közösség soraiban, miután a pulóverbizniszük a járványhoz kapcsolódóan ellehetetlenült.
    • Kalkulátor belső téri aeroszolos transzmisszió kockázatának számításához a Duke Universitytől. A diákok 1%-ának fertőzöttsége mellett, ventiláció nélkül, maszkok viselése nélkül (a maszkok értékét ezért nullára állítva), a félév során 12 foglalkozással kalkulálva (egyenként 90 percesek), 30 négyzetméteres területen, 3 méter belmagasságnál, 30 diákkal... az esély az oktató megfertőződésére: 5% valószínűséggel 0,38% alatt, 95% valószínűséggel 53,39% alatt. Az esély egy diák szemszögéből: 5% valószínűséggel 0,28% alatt; 95% valószínűséggel 44,77% alatt.
    • A fagyasztott áru bűnössége mellett újabb bizonyítékok? Kínai leletek.
    • Jó cikk a Portfolio.hutól az orosz vakcina kapcsán.
    • Tekintve, hogy eddig 233000+ addicionális halálesetet számoltam itt a járvány folyamatának követése során, a Worldometers számlálója pedig most jár 766000 felett, ez sajnos azt jelenti, hogy a járványhoz kapcsolódó halálozás elérte az egymillió főt.
    • Valaki hívja Michal Levittet a Stanfordon: Írországban a modellje szerint hónapok óta nem lenne szabad új eseteknek előfordulniuk.
    • Ha valahol igaz, hogy több teszt = több eset, az a gyerekek korosztálya. Sok eset a gyerekek között is, pl. az USA-ban (is).
    • Az eredet kérdését feszegetik az itt már részletesen tárgyalt 2012-es Jünnan tartományi bányajárvány kapcsán.
    • Ha valaki úgy gondolja, eü. dolgozók között nem fordulnak elő eü. tévhitek és irracionális félelmek... de, előfordulnak. Az ő populációjuk is nagy populáció... Adalékok a témában Izraelből.
    • A kövérség COVID-19-nél, tanulmány. A nőknél nem feltétlenül jelent extra kockázatot, logikusan, tekintve, hogy a zsírszövetek náluk máshogyan oszlanak el, mint a férfiaknál. Utóbbi tényezőről itt lehet olvasni bővebben. Centrális (férfiaknál — hasi) vs. körte alakú eloszlás nőknél (combra, csípőre). A nők zsírtartaléka optimálisabb "aranytartalék", mint ami a férfiaknak jut.

    2020.08.17-21.

    • Dél-Floridában 1200+ valószínű COVID-halálesetről nincs még meg a végső jelentés, ekkora torlódás alakult ki. Miami-Dade: 650, Palm Beach: 500, Broward: 100.
    • New Jersey-ben egymillió fő populációra 1800 haláleset jut, vagyis a populációmortalitás 0,18%... and counting.
    • Már volt itt szó arról, hogy a COVID kiválthatja a küszöbön álló diabéteszt. Itt ezt most gyerekeknél találja egy tanulmány.
    • A svéd Anders Tegnell levelei kerültek nyilvánosságra hozzáférési jog kikényszerítése nyomán. Igazán új dolgot én itt nem látok.
    • Trumpék megint csodaszer-marketingben utaznak: most a leanderkivonatra mentek rá. Rendkívül bizalomgerjesztő, ahogy az érintett biotech cég igazgatója azt terjeszti, a szerük két nap alatt gyógyítja a koronavírust. Mindezt nem publikált eredményekre hivatkozva.
    • A COVID-en átesett magyarokról adatok Dr. Szlávik Jánostól. Krónikus fáradtság 20-25%-nál, PTSD 10%-nál (poszt-traumatikus stressz, gondolom, pl. tartós intubálás, lélegeztetés után, ami sokaknál delíriumot vált ki).
    • Franciaországban a TGV-ről kiraktak egy utast a semmi közepén, mert nem viselt maszkot. 
    • Georgia állam úgy döntött anno (még áprilisban) az újranyitás mellett, hogy tudták, nem lesz elég PPE az eü. dolgozók számára.
    • Az őszi COVID/influenza kombó turnéra készülve sokan az anoszmia (szaglásvesztés) előfordulásától remélik a könnyű differenciáldiagnózist. De az anoszmia nem mindig fordul elő COVID-nél, úgyhogy ez az esetek egy részében működhet csak.
    • Egyre több adat szól amellett, hogy a maszkok széles körű használata nem csak csökkenti a transzmisszió esélyét, de javítja az aszimptomatikus és enyhe lefolyású esetek arányát is.
    • Egyre többször hallom, legutóbb Merkely Bélától, hogy ezúttal nem állhat majd le az élet, ha jön a második hullám. Erről annyit mondanék, hogy rossz gondolat. 1) A múltkor sem állt le  az élet teljesen. 2) Annyira viszont le kellhet állnia adott esetben. 3) Ha 2-est figyelmen kívül hagynánk, akkor sem lenne érdemes ezt kommunikálni, mert a fatalizmust és az együtt-nem-működést erősíti éppen a leállást helyettesíteni hivatott intézkedésekkel kapcsolatban.
    • Az éneklés és az aeroszoldiszperzió közötti összefüggésről már elég szó esett. Természetesen a hangos beszéd is lehet hatékony ezen a téren.
    • Apropó, aeroszolok: nem csak a szájnyíláson (vagy éppen a maszk felett lusta népeknél kikandikáló orrból) származhatnak ilyenek, hanem felületekről is, onnan felrázódva, a porral együtt. Az idézett tanulmány az influenzával bizonyítja ezt, de a SARS-CoV-2 esetében is simán releváns lehet.
    • Járvány nyércek között már az Egyesült Államokban is.
    • Az EuroMOMO mortalitásfigyelő utolsó már valid (késedelmes regisztrációk által nem lehúzott) magyarországi adata a harmincadik hétről: 2,84. Baljós. Konkrétan a "jelentős növekmény" kategória küszöbénél jár, és jelentősen túl van a szokványos ingadozás mozgásterén. 65-74 évesekre szűre 3,35.
    • Közben Belgiumban a provizórikus 33. heti EuroMOMO-adat 8,81. Egy olyan országban, ahol a járvány populációmortalitása már 0,86% feletti. 

    2020.08.22-31.

  • Izraelben is alkalmazzák a sample poolingot, és előálltak egy ügyes megközelítéssel. 384 mintát 48 poolba osztanak, úgy, hogy minden egyes minta hat, unikálisan hozzá tartozó készletet alkotó poolba kerül be, így pl. hat pozitív pool esetén automatikusan tudható, melyik egyéni minta volt pozitív. Több pozitív eredmény esetén pedig algoritmikusan azonosíthatók a pozitív minták. Ez az eleve gazdaságos és laborkapacitást kímélő sample pooling extra-takarékos változata.
  • III. fázisnál járnak monoklonális antitestek, kettő is, úgyhogy a kezelés nem is olyan sokára jelentősen hatékonyabbá válhat a COVID-betegek számára. Tán még profilaktikusan is jól jöhetnek majd.
  • Spanyolországról (BBC). Egyéb érdekességek mellett: kevés a contact-tracer, van kb. 200, miközben dúl a járvány. Az orvosok 800 fős csapatot szerettek volna, a hanyag kormányzat ennyiről gondoskodott.
  • Amerikai halászhajó, ahol a legénység három, dokumentáltan antitestekkel rendelkező tagja nem fertőződött, a maradékból 103/117 igen. Empirikus bizonyíték (valószínűleg) az antitestek hatásosságára nézve. Pontosabban valószínűségi alapon az közel-biztos, hogy a háromból legalább egy vagy kettő ténylegesen ki volt téve az újfafertőződés lehetőségének (120 főből 103 ferőzött mellett). Ráadásul az "antitestesek" közül kettőnek viszonylag szerény volt az antitest-titerje a tesztelés idején, anno. 
  • Újabb adalékok a légszennyezettség és a COVID-mortalitás közötti összefüggésről. Itt konkrétan a finompornak (PM2.5) való kitettség volt a vizsgálat tárgya. 1 μg/m3 növekmény a finompor-tartalomban 8%-os mortalitásnövekményhez vezethet. Tartsuk meg a nagykörúton azt a biciklisávot. Szerintem. És persze tessék tömegközlekedni, de azt maszkban. Vagy biciklizni/gyalogolni. 
  • Az EdScoop listája azon amerikai egyetemekről, ahol digitális oktatás van a járvány miatt. 300 intézmény a listán. A University of North Carolina/Chapel Hill tantermi oktatással nyitott, de egy hét után (négy koleszos klaszter miatt) digitálisra tértek át ők is.
  • Lehet, hogy csak lábjegyzet lesz a SARS-CoV-2 mutációinak történetében, de érdekes cikk Szingapúrból a Lancetben. Egy 382 nukleotid törlődésével kialakult variáns (Δ382; az ORF8-ból törlődött a kérdéses szakasz), mely enyhébb megbetegedéseket okozott csak, 2020. márciusára terjedési zsákutcába juthatott, alulmaradva a versenyben — teszem hozzá én — például a D614G mutációhoz képest.
  • Egy világtérkép a felbukkanó, újra-felbukkanó és esetlegesen felbukkanó patogénekről, lehet nézegetni. 
  • A járványhoz kapcsolódó mortalitásnövekményről. Lásd az alábbi ábrán, korcsoportonként, az európai országokban (EuroMOMO). A 45-64 éveseknél is jelentős (kb. +5000 nagyságrendileg), és az idei görbe szintjére a korábbi évek görbéi nem zárkóznak fel az év végére sem. Az idei helyzet pedig tovább is romolhat akár, ha úgy alakul.
  • sarscov2_excessmortalityeurope.jpg
  • Addicionális halálozás. Dél-Afrika: Sebokeng townshipben (Jo'burgtól délre) legalább tizennégyen fagytak meg, mert sátrakban helyezték el őket a tél közepén a COVID miatti szükséghelyzetben. Peru: kijárási korlátozásokat sértő buli elleni rendőri roham, egymást halálra taposó tömeggel, 13 halott Limában. G.a.h.: +233442+n.
  • Ezt nem linkeltem korábban, de érdekes lehet: T-sejt alapú immunreakciót kimutató teszten dolgozik egy cég a UK-ben.
  • Poll: az amerikai republikánus szavazók (savazók?) 57%-a szerint "elfogadható" annyi haláleset, amennyi a COVID miatt eddig történt. Mondjuk itt annyi kritikám lenne, hogy ezt szerintem nem érdemes így mérni, mert itt a kutatás maga is hozzájárul önerősítő attitűdök stabilizálásához. Magát a kérdést kihívásnak érzi a válaszadó, és "csakazértis" mondja, amit aztán ezért kezd el még határozottabban gondolni.
  • Shit happens...? Újrafertőződés 1000%-ig biztosra dokumentálva, Hongkongban. Áprilisban fertőződött informatikus kigyógyult, Spanyolországból e hónapban újra fertőzötten jött haza. Annak idején is, most is szekvenálták a vírust, ami megfertőzte, és nem azonos variánsok. (Ettől az ilyesmi bekövetkezése nem törvényszerű — reméljük, ritka lesz, mint a fehér holló.) Kieg.: az újrafertőződött személy aszimptomatikus volt. Ha az is marad, ez annak lehet a jele, hogy valami védettsége mégiscsak volt. Szóval nem lényegtelen.
  • Hogyan lehet a Starbucksban két óra alatt sok ott megforduló embert megfertőzni? Aeroszolok révén, alighanem.
  • Egy röpke gondolat, kérdőjellel a végén: ha a SARS-CoV-2 után a hanyatló antitest-titer nyomán lehet újrafertőződni, de közben más embereknél a korábbi koronavírusokra reagáló T-sejtek hatékony keresztreaktivitását tapasztaljuk... mi olyan speciális a SARS-CoV-2-ben, amitől a kifejezetten csak általa fertőzöttek egy részének szervezete relatíve annyival hamarabb elfelejti ezt a kórokozót? Immunológiai természetű lenne a válasz?
  • Bővül a tobzoskák irodalma. A tobzoskák és az amerikai cowboy-csizmák. A tobzoskák és az Eredet. Még nem volt időm olvasni őket, ha ez megtörtént, később írok róluk ide is.
  • A KFC kicsit szüneteltetni látja jónak a finger lickin' good szlogent, járványügyi szempontból megragadva a dolgokat.
  • Kis modellezgetés alapján az jött ki kutatóknak (Uni of Notre Dame in Indiana), hogy márciusra, a különösen tesztszegény időszak végére az USA-ban lehetett vagy százezer eset is akár (a regisztrált 1514 helyett). Nekem ez túl soknak tűnik, de az intuíció persze nem modellparaméter. Hogy sok észrevétlen eset volt, abban nem kételkedem. Kieg.: az intuíció nem modellparaméter, viszont ha az aeroszolosan hatékonyabban terjedő D614G mutációra gondolok, máris adott egy változó, ami magyarázza, miért tartom a százezres számot túlbecslésnek.
  • Ilyen beszámolót olvasni a kapcsolatkövető munka nagy ívben történő el nem végzéséről nagyon-nagyon nem jó jelen állás szerint. Rosszra vezethet, ha így mennek a dolgok. Ebből a cikkből olyan kép rajzolódik ki, miszerint (a fővárosban?) kb. a február eleji színvonalon működne a járványmegelőzés rendszere.   
  • A kórházi fertőzéseknek nem csak Magyarországon volt jelentős szerepe, természetesen. Viszont a UK-ből itt van egy "különös" (valójában nem meglepő, és annál fontosabb) tapasztalat: "They were older, frailer and had pre-existing health conditions. But they also had better outcomes than those admitted with the virus, probably because of faster diagnosis and, therefore, treatment." Ha várjuk, hogy az emberek rosszul legyenek, mielőtt kezelnénk őket, akkor az antivirális szereknek már nem nagyon marad értelme. A vérhigítós kezelés is késő lehet. Az IL-6-blokkolókkal is el lehet késni akkorra.
  • Ez is fontos: orrjáratvégi "agyturkászás" helyett végre lehet majd tesztelni nyálat is. Mármint ott, ahol érdeklődnek a lehetőség iránt, hogy gyorsan megtalálják a fertőzötteket...
  • Bolívia: 20 ezer fő mortalitásnövekmény. Veszem a felét, levonom belőle az eddig már számolt 340-et, és így +9660 haláleset az eredmény, konzervatívan. G.a.h.: +243102+n.
  • Akkor már beszéljünk Venezueláról is. Az ottani helyzet mikrokozmoszaként jelentés Zulia államból, ahol a hivatalos 63 helyett legalább 216-an meghaltak COVID-ben. G.a.h. a különbözet hozzáadásával: +243255+n.
  • Nálunk közben az ország leendő vezető elitje bizonyította rátermettségét az elmúlt napokban az egyetemi gólyatáborok lebonyolításával. Muszáj vót. Ilyen felelős hozzáállással ennek az országnak a következő száz éve is tartogat majd izgalmakat, kalandokat!
  • A Political Capital jó áttekintése az oltásellenességről, köztük — az itthoni kiemelkedő átoltottság mellett sem jelentéktelen — hazai frontokon.
  • A TV2-időjós Barta Sylvia krónikus fáradtsággal és tartós (bár enyhe) neurológiai tünetekkel.
  • Mivel Kínában nincs elég (importált) esetből, a Sinovac Brazíliával állapodott meg az attenuált SARS-CoV-2-alapú vakcinájának a III. fázisos teszteléséről. (Ha nincs a környéken fertőzött, nem lehetne képet kapni a vakcina hatásosságáról.)
  • Újrafertőződések dokumentálva most már Belgiumból és Hollandiából is, de enyhék vagy tünetmentesek, szerencsére. (Bár az USA-ból itt korábban idéztünk esetet, ahol a második menet keményebb volt az érintettnek, az jelen állás szerint valószínűleg a rózsaszín dísztollas fehér holló esete — ritka a ritkán belül.)
  • Görbe: az amerikai munkanélküliségről zajló politikai vitákhoz. Trump persze csak részben felelős a járványhelyzetért, de részben felelős, az biztos.
  • Hollandiában is zajlik az élet, uncivil társadalom stb.
  • Törökországban (is) határozottan rosszra fordultak a dolgok, és orvosi források kételkednek a hivatalos adatokban.
  • Francia, spanyol és brit epidemiológusi helyzetértékelések, a francia a leginkább kompetens. Ő is megerősíti, hogy a jelenleg fertőzött populáció korszerkezete eltér a tavaszitól, és most több a fiatal (még a tavaszi tesztelés deficitessége mellett is). Ez így kevesebb hospitalizációt és halálesetet vetít előre. Viszont ez változhat is még a fertőzések továbbterjedésével.
  • A kormányzatot, sőt a kormányt is érinti a fertőzéshullám, legalább karanténezésként. Az ITM-ben ketten is betegek lettek.
  • Újrafertőződéses eset (Reno, Nevada, USA), a második alkalom vezetett a kórházba. This is called bad news. Márciusban a páciens, 25 éves, torokgyulladás után köhögött, fájt a feje, hasmenése is volt. Aztán májusban mindez lázzal ismétlődött, hipoxiához vezetett, és a beteg légzéstámogatásra szorult
  • Az NBA a kosárcsarnokokat ajánlja az amerikai választások biztonságos lebonyolítása érdekében.
  • Egy fontos összefoglaló anyag. A megelőzés az eü. ellátásban normális körülmények között magában foglalja az enyhéből súlyosba fordulás megelőzésére irányuló kísérletet is betegségek kezelésében. Ez az, amit az ún. fejlett világ nagy része figyelmen kívül hagy a COVID-19 kapcsán, és alapvetően otthonmaradásra intenek, illetve várják a kórházba beeső betegeket. Miközben megfontolandó, hogy legalább a kockázati faktoros fertőzötteket minél korábban, akár tünetek előttől, antivirális szerekkel lenne érdemes kezelni. A jövőben pedig vérplazmával vagy monoklonális antitestekkel. Ehhez persze fel is kell fedezni őket, kapcsolatkövetéssel, teszteléssel. (Megjegyzés: az anyag kínai, és a TCM (Traditional Chinese Medicine) is bele van integrálva, ami nyilván vitákat szülhet, viszont érdekes volt látni, hogy TCM-készítményeket jelenleg szabályos klinikai vizsgálatoknak vetnek alá — ha minden igaz).
  • Úgy tűnik, hogy a gyerekek jó hosszú ideig lehetnek fertőző szimptomatikus vagy aszimptomatikus hordozók. Itt a dél-koreai tanulmány, erre hivatkozik a cikk (n=91 gyerek). A tüneteseknél a mintákban átlagosan 17,6 napon át mutatták ki a vírust. By the way, hidroxiklorokint használtak lopinavir és ritonavir mellett 15%-nál. 
  • Az Egyesült Államokban Trumpék eszkalálnak, és gyorsabban szaladnak a nyájimmunitás után, úgy döntöttek. Tán csak nem a választások és legitimitásuk káoszba fullasztása a céljuk? Az olyan iszonyatosan meglepő volna.
  • Két hazai helyzetértékelés zárásnak, aztán kezdődik a FALL SEMESTER. Merkely Béla és Röst Gergely (matematikus, SZTE). Hát igen, Horvátországból jött be egy csomó fertőzött. És igen, már bőven belföldön terjed ez, nem is tegnap óta.

Nyugat-nílusi láz: fenyegetésprofil és közpolitikai kérdések

Tekintve, hogy az utóbbi időben viszonylag sokat kaszáltam szúnyogfelhőben, gondoltam, egy ilyen bekezdést is elindítok. Azért is tanulságos lesz, mert láthatóvá válik, mennyivel több információ előkerült már a SARS-CoV-2-ről vadonbeli létezésének rövid ideje alatt. Mi több, az összevetésből stratégiai kérdések is megfogalmazhatók a kutatások intenzitásának patogének közötti megoszlását tekintve. Aki nem nézte, van itt korábbról egy hasonló logikájú bejegyzés a Lassa-lázról is.

West Nile Virus (WNV)

  • Felfedezve: 1937, Uganda, a Nyugat-Nílus vidéke.
  • Flavivírus (sárgalázvírus), mint a dengue, a zika, a sárgaláz vagy a japán enkefalitisz vírusa.
  • Pozitív, egyszálú RNS, kb. 12 ezer nukleotiddal. Kettős lipidrétege is van (burok).
  • Fokozatosan globalizálódott. 1953-ra bizonyítottan elérte a Nílus-deltát. 1958-ra Albániában Európán belül először kimutatva. 1999-ben sok vészharangot félrevert, amikor az Egyesült Államokban (New Yorkban) is kimutatták (ha minden igaz, Izraelből és Tunéziából ismert variánst importáltak). Már nálunk is stabilan jelen van, Románia felől, a Duna és mellékfolyói mentén terjedt a felvízi területek felé. 2018-ban lovakat pl. 16 megyében, illetve 83 településen + a főváros egyik kerületében érintett.
  • Eredendően madárpopulációkat fertőz, madár-szúnyog-madár ciklusban (a baromfit is). A varjúfélék (Corvidae) különösen veszélyeztetettek (amerikai varjúféléknél megfigyelt egyedek kétharmada pusztult el úgy, hogy a WNV-t kimutatták belőlük). Nem nagyon generálódtak antitestek a megfigyelt madaraknál. A vírus szempontjából hosszú távon jobb gazdák a WNV-t jobban bíró madarak, nagyobb távolságra juttathatják el a vírust, tartósabban.
  • Több szúnyogfaj is alkalmas az átvitelére. Nálunk pl. a Culex pipiens csípőszúnyog alkalmas vektor. Érdekesség kiegészítésnek: egy szúnyog életében kb. 200 métert tesz meg, hacsak nem kap transzportot valamilyen formában. Miután először iszik fertőzött állat (leggyakrabban madár) véréből, egész életére fertőződik maga is (Steinbrink, A.: Mosquitoes and the Risk of Pathogen Transmission in Europe. In: Benelli, G. és Mehlhorn, H.: Mosquito-Borne Diseases: Implications for Public Health. Parasitology Research Monographs Vol.10, Springer: London, 2018.).
  • Az átvitel történhet emberekre. Lovakra is. Nem kell sok IQ ezek után, hogy belássuk, rágcsálókra is (tekintve, hogy laborban őket is szokták fertőzni WNV-vel). Macskákban, kutyákban is kimutatták, úgyhogy az emlősöket általában is kedvelni látszik. De az emlősök mellett kétéltűeket és hüllőket is megfertőz. A lovak fertőzése egyes eredmények szerint zsákutcás, a többiek viszont csekély mértékben hozzájárulhatnak a fertőzés terjedéséhez maguk is. Emberről emberre érdekes lehetőségek a szervátültetés, véradás, méhen belüli (vertikális) átadás, szoptatásos transzmisszió stb.; hétköznapi kontaktus az aktuális ismeretek szerint nem elég.
  • Érdekes módon szarvasmarhát talán egyáltalán nem fertőz, míg sertéseknél előfordulhat.
  • Az emberi fertőzések nagy része aszimptomatikus. 20% belázasodhat, feje fájhat. A súlyosabb lefolyás az eseteknek talán csak 1%-ában fordul elő, főleg idősebbeket és immunkompromittáltakat érint — de egyáltalán nem csak és kizárólag. A CDC szerint csak az esetek 0,66%-ában van ez (1:150). A súlyosbodással jön magasabb láz, kiterjedtebb és erősebb fájdalmak (fej, ízületek), hányás, nyaki merevség, zavarodottság, eszméletvesztés, látásvesztés, érzéketlenné válás, bénulás — a háttérben poliomielitisszel, agyvelő- és agyhártya-gyulladással. A központi idegrendszert érintő súlyos lefolyás (WNND, West Nile Neuroinvasive Disease) kb. 10%-ban halálos (lovaknál 2018-ban Magyarországon 17,53% volt WNND-nél a CFR, de ez felmehet 30-40%-ra is). (A tünetekről.)
  • A madarak jobban védettek, náluk alacsonyabb lehet a mortalitás (de köztük is van változatosság, lásd a varjúféléket).
  • 2018-ban 200 felett volt az emberi esetszám Magyarországon. Adatok az Egyesült Államokból WNV-halálesetekről — mint látható, a nem-neuroinvazív forma is lehet veszélyes (1999 és 2018 között 2330 halott; ebből 2199-en WNND-vel). 1999 és 2010 között a teljes esetszám 2,5 millió lehetett, és erre jutott 12000 agyhártya- vagy agyvelő-gyulladásos eset. Az EU-ban és környező országokban 2019-ben 50 haláleset volt (az ECDC megdöbbentően pongyolán írta körül ezt az adatot, megjegyzem). Térkép a 2019-es előfordulásról, mint látható, mi eléggé érintettek vagyunk; a 2018-as helyzet amúgy rosszabb volt. (Izgalmas kérdés, hogy a mai körülmények között, a koronavírus-járvány mellett mennyire működik a diagnosztizálás...)
  • Akárcsak COVID-19-nél, itt is vannak ritka komplikációk, amikből hátborzongató esettanulmányok készülhetnek: szívritmuszavarok, a máj, a hasnyálmirigy, a vese vagy éppen a látóideg gyulladása, sőt még vérzéses lefolyást eredményező koagulopátia (véralvadási rendellenesség) is előfordult. Bőrkiütés is akad.
  • A szúnyogok nyála befolyásoló tényező. Csillapítja az immunválaszt, és ennek kitéve a vírus könnyebben árasztja el a gazdát. Egereken pl. kikísérletezték, hogy szúnyogetetésnek való kitettség után beoltva őket azonos dózis vírussal jobban megbetegedtek, mint a szúnyogetetésnek ki nem tettek.
  • Hol jut be a sejtbe? "Several molecules have been implicated as receptors for West Nile virus, including DC-SIGN, mannose receptor, and several glycosaminoglycans" — szóval 2012-ben még nem volt biztos válasz. Azért a dendritikus sejtek a DC-SIGN receptorokkal fontos szerepet játszanak mindenképpen, úgy tűnik (2019-es áttekintés a témában). A neuroinvazivitásban az imént idézett forrás szerint a neutrofilek megfertőzésének képessége és bennük végbemenő replikáció fontos lehet, és "trójai falóban" biztosíthat bejutást idegsejtekbe.
  • Nincs vakcina ellene egyelőre emberi használatra. Vakcinafejlesztés van, az NIH által támogatott programban pl. egereken már működő vakcinával, mely hidrogén-peroxiddal kezelt víruson alapul, és antitesteket és CD8+ T-sejteket generált tartósan, és védelmet adott halálos dózis WNV ellen. Itt egy frissebb összefoglaló a fejlesztések állásáról (2019). Van kísérletezés DNS-vakcinával, gyengített dengue-vírussal (DENV) is stb. A cél állatorvosi és emberi felhasználás egyaránt. A vakcinafejlesztésnél fontos az elsődlegesen védendő populáció figyelembe vétele, ezért a vizsgálatokba pl. idősebb állatokat és idősebb embereket vonnak be. (Lovak számára már van vakcina.)
  • Egyelőre gazdasági megfontolások is visszatartó erőként hatnak: relatíve alacsony prevalencia mellett az egy eset megelőzésére fordítandó költség túl magas lehet univerzális átoltás, de akár még célzott átoltás esetén is.
  • Egészségügyi megfontolás az antitest-mediált fertőzésfokozódás (ADE, Antibody-Dependent Enhancement) lehetősége. A DENV-nek is, a WNV-nek is van több szerotípusa, de pl. az E-fehérjét kódoló szakasz eléggé stabil elem a flavivírusok genomjában, és ha antitesteket generálunk vakcinával valamelyik flavivírus ellen, kérdés, nem vezet-e ez ADE-hez másik flavivírussal történő fertőződésnél. Különböző DENV-fertőzések, vagy pl. DENV és zika között laboratóriumban látható volt ilyen interakció, viszont zika után WNV-re nem reagáltak rosszul a laborban kitett egerek. A WNV E-protein DII-doménjének célzása jobb lehet, mivel ez a szakasz nagyobb mértékben különbözik a többi flavivírustól.
  • A vektorkontroll (lenne) a megoldás, azaz pl. a szúnyoggyérítés. Kevésbé az elavult vegyi, mint inkább a modernebb biológiai. Azon kívül lehet még negyven fokban is hosszú nadrágban, hosszú ujjú felsőben dolgozni, sőt szúnyoghálós arcvédőben, ha nincs mese, és menni kell kaszálni. A szúnyogriasztót is bőkezűen érdemes alkalmazni tartós kitettség esetén. Ha látjuk a szúnyogot landolni és csípni, ne csak nézzük, csapjunk oda (lásd a fentebb a szúnyognyálról elmondottakat).
  • A magasabb környezeti hőmérsékletet kedveli, vagyis a klímaváltozásra reagáló patogén. Nyár elején pl. lassabban jut el a szúnyog nyálmirigyébe, mint a nagyobb meleg idején. A klímaváltozás tehát helyzetbe hozza.
  • Íme, egy eset, ahogy elmeséli, aki átélte (WNND). Alzheimer-gyógyszert kell szednie tartósan, miután az általános fáradtság és visszamaradó fájdalmak mellett a memóriafunkciója is károsodott (COVID-hez széljegyzet: ott egy halottra kb. két neurológiailag tartósan károsodott jut egy adat szerint, amit láttam — ezek az adatok persze episztemológiai okokból nem lehetnek túlzottan pontosak. A betegségteher kapcsán mellesleg ezért nagyon kretének, akik mániákusan csak a halálozást nézik; kétes mentségük, hogy alulinformáltak.).
  • Ebből az esetből pedig (persze nem tökéletes az ön-felidézéses narratíva mint kontroll) még a szúnyogcsípés helye is ismert. Az áldozat általában nagyon alaposan kezelte a releváns bőrfelületeket, saját bevallása szerint a lábát kivéve, amin szandált viselt.
  • A WNND komoly teher az érintett (és háztartása) számára. Csak az anyagi költségeket tekintve is (nem számítva pl. ápolási időt, lelki válságot stb.). Egy kanadai tanulmány, persze az ottani viszonyok mellett, például 21332 USD költséget mutatott ki egyénenként. Egy amerikai tanulmány is hasonló eredményt hoz ki — a szórás nagy; acute flaccid paralysis esetén (nem tudok magyar nevéről) pl. medián = $22628; sáv = $624–$439945. A legtöbb WNND-beteg szerencsére két éven belül felépül azért.
  • Immunitás: a kiinduló feltételezés (CDC) az, hogy életre szerezhető, de valamelyest gyengül is azért. Ezzel az a gond, hogy ilyet szuper-biztos, szinte falszifikálhatatlan, mondani. Episztemológiailag egy, az esetek túlnyomó többségében aszmiptomatikus fertőzésnél nehéz is lenne megtalálni az újrafertőződéseket, mint nem-történéseket.
  • Az idei (2020-as) helyzet: július 16-án találták az első WNV-fertőzéstől elpusztult madár tetemét Németországban. Egy kék cinege az áldozat. Közben Görögországban megvan az első két megerősített emberi eset az idei évben, július 19-én. Kieg.: július 31-re tíz eset megerősítve, közülük egy haláleset.

Folyt. köv. — a bejegyzés még kiegészül.

A koronavírus-járvány rögös útján II.

Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

2020.07.01-02.

    • Újabb merénylet az értelem ellen. Egy olasz orvos meséli, hogy neki mesélték mások, hogy láttak "furcsa" tüdőgyulladásos eseteket "már tavaly decemberben, sőt novemberben is" (szó szerinti idézet, figyeljünk a részletekre). Ebből (tehát abból, amit mesélt valaki arról, amit mások mesélték neki arról, hogy láttak valamit, amiről nem tudták, mi az, régebben, sőt még annál is régebben) többen arra jutottak, hogy már novemberben járvány volt Olaszországban. Hát igen, a koronavírus megtámadja az emberiség központi idegrendszerét, ezt régóta tudjuk. A lombardiai hivatali szféra annyira komoly, hogy azóta már az ottani ügyészek is szajkózzák ezt a dolgot. (Tekintve, hogy a járvány Kínában a nyílt forrásokból elvégezhető, korroborált rekonstrukció alapján, és azzal párhuzamosan a tMRCA-elemzések szerint is valamikor novemberben kezdődött, nem lehetetlen, hogy már akkor valaki Olaszországba repült volna, de felettébb valószínűtlen, hogy ez már akkor nagy helyi járványt idézett volna elő. Időbe telik, míg egy fertőzött beteg lesz.)
    • Esküvői klaszter az indiai Bihar államban. A vőlegény néhány nappal a vőlegényfogadó tilak ceremónia után lett beteg, az esküvőt még végigcsinálta, két napra rá meghalt. Nem tesztelték, ellentétben a későbbi esetekkel. G.a.h.: +163193+n.
    • U.S. Army SERE-kurzus (túlélés különleges műveleti erőknek). Ideális terep a vírusok terjesztéséhez a sárban fetrengés közepette. 110-ből 90 résztvevő lett fertőzött.
    • Az Egyesült Államokban június eleji állás szerint 24 tagállam, köztük Kalifornia, Florida, Észak-Karolina és New York nem jelentette a (protokollok alapján, tehát nem csak úgy össze-vissza) valószínűsíthető COVID-haláleseteket, ragaszkodva a pozitív laborteszthez, ami más járványok esetén nincs így. Az adatkozmetikai gyógyászat élenjárói. És még Kínára panaszkodtak. (New Jersey egyébként azóta közzétette a valószínűsíthető eseteket).
    • Az Egyesült Államokból eddig 25242 extra halálesetet vettem figyelembe. Most itt van újabb tanulmány híre (Yale) a szezonális átlagot meghaladó halálozásról a teljes országra nézve (+122300 május 30-ig bezárólag). Ha konzervatívan nézem, akkor stimmelnek a számok (levonva az addig meghalt hivatalos COVID-haláleseteket), ez alapján nem adok hozzá a g.a.h. mutatóhoz. De korroborációhoz fontos.
    • A közegészségügy nagyon fontos, kivéve, amikor nem az.
    • Nagyon jó kis videós beszámoló kutakodásról a tüneteken átesett, de antitestre negatív emberek ügyében, amihez a készítő "long-haulerekkel" is (persze nem-reprezentatív és relatíve kis mintájú) felmérést végzett. Elmélet arról, hogy a mieloid immunválasz dominanciája esetén adódnak a hosszú távú tünetek, és hogy ilyenkor kevesebb (vagy hamarabb hanyatlik) az antitest-titer (kis immunológiai háttér ehhez itt). Mellékesen az derül ki, ami azért elég jól sejthető volt eddig is, hogy a tesztelés megbízhatósága (mind a PCR-vírusteszt, mind az IgG/IgM antitest-tesztek esetében) elég gáz a gyakorlatban.
    • A trombociták hiperreaktív viselkedéséről COVID-nél. Mindezek hátterében a transzkriptómában kifejeződő változások (egészséges vs. nem-egészséges között sokkal inkább, mint ICU-ra bekerültek és be-nem-kerültek között). Az eltérő génkifejeződések egy része egyébként pl. H1N1-nél is megjelenik, bár "sok" közülük egyedülálló a SARS-CoV-2/COVID kapcsán. Büszke vagyok, mert az emelkedő P-szelektin szerepét ezen a blogon május 7-én előre jeleztem. A reaktív oxigéngyökök szintje is emelkedett, naná — oxidatív stressz.
    • Ez a cikk elviccelődik azon, milyen rossz lehet egy négy órán át tartó rendellenes erekció. Kicsit kiszámíthatóan és olcsón csinálja, és aztán kiderül, hogy a beteg lélegeztetőgépen volt, öntudatlan/leszedálva, és az életéért küzdöttek, amikor ez történt vele. COVID-os, vérrögökkel a péniszében. Ez ma a mainstream sajtó?
    • Merkely Béla nyitott lenne arra, hogy mindenki szűrethesse magát, aki akarja, mert nyilván okkal kér ilyesmit, ha úgy alakul, hogy kérné. Erre másoknak is nyitottnak kellene lenniük. Miért? Mert különben nagy gáz lesz, azért.
    • Merkely egyébként nekem a híreket is folyamatosan követő embernek tűnik. Szóval... csak nem emiatt jelezte, hogy gond lehet? Szerbiában elképzelhető, hogy háromszor annyi áldozata volt a járványnak, és még most is eseteket titkolnak el szép számmal. Az idézett német cikk a témában. Kiszivárgott információ szerint június elejéig a hivatalosan közölt 244 helyett 632-en halhattak meg. A szerb járványügyisek közben alig kaptak adatot, ezek szerint vakon repültek az eltelt időben. Ezek nagyon súlyos dolgok, ha bebizonyosodnak. Kieg.: kicsit utánaolvasva ez sajnos úgy van, ahogy mondják. A kiszivárgott adatokból a pozitívra teszteltek végállapota volt ki- és összeolvasható, intézményi bontásban Nistől Belgrádig, és ebből áll össze a kép, hogy mennyi halálesetet hallgattak el. G.a.h.: +163581+n.

2020.07.03-05.

  • Dr. Hansen tapasztalatai COVID-betegekkel. Amikor a betegek száma áradásszerűen nő, elfogynak a negatív nyomású izolációs szobák, és a lélegeztetésnél mindjárt kevesebb az opció. CT-re küldeni kockázatos is, miközben életmentő is lehet. Volt betege, akinél pneumatocele (tüdőciszta) alakult ki a tüdőgyulladás nyomán. Sok a túlsúlyos beteg (BMI).
  • A kommentek között került elő tegnap, és fontos: számos szegény ország van, ahol a plazmakezelés fertőzéskockázattal járhat (HIV, HCV stb.).
  • Tanulmányok. Pszichotikus epizódok COVID-nél. Multisystem Inflammatory Syndrome in Children (MIS-C) New York államban (amit Kawasakiként írnak le sokszor).
  • Egy teherautósofőr szomorú története Kaliforniából. Júniusig következetesen elszigetelte magát, mivel diabéteszes és túlsúlyos is volt. Aztán elment egy baráti összejövetelre.
  • A sample pooling, amit az információs hadviselés háborús bűnelkövetői letámadtak tudománytalan dologként, jön az Egyesült Államokban.
  • Szerbiában rendkívüli helyzet Belgrádban, és kormánytagok fertőzöttek. Elgondolkodtató lehet.
  • Közben egy kutatási projekt kapcsán a nagy tengerszint feletti magasságon élők/tartózkodók egészségégről olvasgatok éppen, és alapvető, hogy ott csökkent a szívteljesítmény, illetve az oxigénfelvétel, és sztenderd állapot a hipoxia. És akkor gondoljunk bele, hogy Bolíviában mekkora járvány van éppen...
  • Egy másik dolog, amin gondolkodtam, a D-vitamin-szint. Mivel az most átlagosan magasabb a népességben, talán valamivel kevésbé lesz halálos a járvány ezekben a hónapokban. Így is sok ember hal meg, persze, de százalékokban kifejezhető különbség adódhat. Mármint adódhatna, ha lehetne ehhez tökéletes eset-felderítést végezni, de az nyilvánvalóan eléggé macerás, leginkább annyira, hogy lehetetlen. (Ami pedig az Egyesült Államokban és hasonló helyeken történik, azon ez nem sokat segít, ha pl. az intenzív osztályok nem bírják el az áradatot, és betegek nagy számban kapnak szub-optimális ellátást.)
  • A fizikai fogyatékossággal élők fokozott veszélyeztetettsége. Eszembe jutnak erről a vérrögök. Immobilisnak lenni COVID-nél például azért lehet különösen rossz dolog.
  • Santa Clara megyében, Kaliforniában olyan jól sikerült egy értekezlet az iskolák újranyithatóságáról, hogy most karanténban vannak a résztvevők.
  • A Worldometersnél most először hibásak a magyar adatok. A két új eset regisztrálódott, de az újabb elhunyt nem (589 halott a Worldometersen most szereplő 588 helyett). Ilyet eddig még nem láttam itt, azért jegyzem meg. A koronavirus.gov.hu-n ellenőriztem, ott fent van a +1 halott. A CFR így most 14,11%. Kieg.: már javították is.
  • Japán, szezonális átlagot meghaladó mortalitás. Ebből a cikkből vettem eddig figyelembe ilyen adatot, ez márciusra vonatkozott. Ez a cikk most áprilisról tesz említést, +1000 halálozással. Áprilisban 373 COVID-haláleset volt Japánban hivatalosan (amikorról van április 7-i adatom, miszerint 22 ezer lélegeztetőgép több, mint 40%-át használták éppen), így ha 10%-nyi COVID-független extra halálozást számítok, és minden COVID-halálesetet az extra részeként veszek figyelembe, szokás szerint konzervatívan, akkor adódik +564 extra, a járványhoz kötődő haláleset. G.a.h.: +164145+n.
  • Pittsburgh, koronavírus-bulik, ahol a mihamarabbi fertőzés versengés tárgya. Fattening the curve.
  • 81 éves texasi betegtől megtagadták a plazmakezelést, mondván, életkora miatt "nem fért be a vizsgálatba", amelyben a plazmakezelést alkalmazzák. Olyan mértékben sikerült túllőni a kórházi kapacitásokat perspektivikusan, hogy lesz itt még szűkösség nagyobb is.
  • Közben Ausztráliában, ahol most a téli szezon van (11 fok körüli hőmérséklettel), szintén nagyobb járvány van kibontakozóban.
  • Olaszországban pedig Szerbiából sikerült reimportálni a betegséget. Üzleti útról férfi hazatért június 25-én, már beteg volt, de elment bulizni is, meg egy temetésre is. 28-án már kórházi látogatást tett, de pozitív teszt nyomán haza távozott. Július 1. után intenzív osztályra került. Döntéshozók figyelmébe: Szerbia lehet az új Irán?

2020.07.06-08.

  • Esett már szó fentebb a trombociták hiperreaktivitásáról... COVID-nél a tetejében a trombocitákat előállító megakariociták felszaporodása a tüdőben és a szívben (tanulmány, Lancet), ez is hozzájárul a pro-trombotikus állapothoz.
  • Erre a kezdeményezésre is érdemes lesz figyelni hosszabb távon: a COVID-19 Host Genetics Initiative. Korábban írtam itt kutatási eredményekről, melyek az ApoE e4 genotípus fokozott kockázatnak való kitettségét találták. A kutatások viszont itt nem állnak meg, lesz még sok új eredmény, amiből aztán egy nagyobb képet lehet kialakítani.
  • Itt egy friss sajtócikk is a gazdagenetika témájában; még neandervölgyi géneknek is szerepe lehet a történésekben. Erről a tanulmányról számoltak be a cikkben. A 3-as kromoszóma egy régiója a fokozott érdeklődés tárgya, 49400 bázispárnyi. Haplotípus, jellemzően együtt öröklődő gének csoportja. Ilyen hosszú haplotípus akkor adódik, ha jelentős túlélési előny kötődik hozzá, vagy nincs sok rekombináció valamiért ezen a környéken, vagy szerzett programcsomag, pl. neandervölgyiektől. Az idézett kutatás a horvátországi neandervölgyi lelet (Vindija 33.19) DNS-ével találja a legerősebb hasonlóságot (kevésbé adott a szibériai esetében).
  • A mi számainkon elgondolkodtam közben. Ha 286000+ mintavétellel sikerült megtalálni 4189 esetet eddig, akkor egy pozitív esetre jutott közel 70 mintavétel. Tekintve, hogy a CFR nálunk 14% felett van, vagyis minden bizonnyal sok a felderítetlen eset, az egy pozitív tesztre jutó 70 mintavétel a tesztek pocsék szenzitivitását is jelezheti. Persze ha abból indulok ki, hogy egy személynél több mintavételre is szükség lehet (elsőre még nem tesztel pozitívra, vagy a kórházi elbocsátáshoz meg kell nézni, hogy negatív-e már), akkor a 70 felezhető, harmadolható lehet. És van egy csomó szűrésjelleggel elvégzett teszt is az összes mintavételen belül (kórházi műtétre felvétel előttiek pl.). Jó lenne tisztábban látni ezekkel a számokkal kapcsolatban.
  • Izraelben érdekesen alakulnak a dolgok (rosszul). A belbiztonsági szolgálatra, a Shin Betre bízták korábban a kapcsolatkövetést, az pedig meg is csinálta az összes rendelkezésre álló (kém)technológiával, gyorsan. Márciustól májusig vagy 4600 embert különítettek el ez alapján preventíven. Viszont nem annyira alkotmányosan, ha a magánszféra védelmére egy picit adunk, mint azt az izraeli Legfelsőbb Bíróság megállapította. Mostanra újranyitottak (valamennyire), és elkapta őket egy második emelkedő hullám. Netanyahu persze rögtön szerette volna, hogy a Shin Bet újfent nekiveselkedjen az adatgyűjtésnek. Tény, hogy az eü. személyzet nem bírja az iramot már, ilyen esetszámok mellett (össz 30 ezer felett, új esetek naponta százas nagyságrendben). De van pl. peer-2-peer kapcskövetés is a világon, úgyhogy nem biztos, hogy a megfigyelőállamra lenne ehhez szükség feltétlenül, mondják mások. A Knesszet július 1-én mindenesetre megadta a Shin Bet-féle program újraindításához a felhatalmazást, a Legfelsőbb Bíróság által előírtak szerint törvényt alkotva erre a célra. Közben vannak újra komolyabb korlátozó intézkedések, rendkívüli helyzet. Már most 6-7%-os gazdasági visszaesésre, és értelemszerűen további halottakra lehet számítani, egy olyan régióban, ahol sem a demográfiai, sem a gazdasági folyamatok nem tudnak igazán közömbösek lenni — az aktuális hatásoknak a környéken mindenki ki van téve persze. Az impakt nem csak gazdasági és biztonsági, szimbolikusan is jelentős; a járvány az idős holokauszttúlélőket különösen veszélyezteti (az első izraeli halálos áldozat maga is a Shoah túlélője volt). Még egy adalék közben: a Palesztin Hatósággal közös operatív törzs működik járványügyben. Ezzel össze is foglaltam az InfoRádiónak adott interjúmat, meg még egy kicsivel többet is.
  • Egy különösen csúnya történet. Nick Cordero színészről korábban már írtam itt, trombózis miatt elvesztette a lábát COVID-betegként. Ami most derül ki: azóta sem gyógyult fel. Májusban orvosi kómából ébresztették, gyenge maradt, és most meghalt. Hónapok után. 41 éves volt.
  • Érdekes lenne tudni, hány embernél döntöttek az orvosi kóma mellett összesen. Itt egy másik eset, egyelőre túlélő. Az orvosok bizakodók, de szeptember előtt nem nagyon küldik haza. Az egyik dolog, amit az orvosi kómáról tudni érdemes, amikor így, hónapokra alkalmazzák, hogy utána teljes felépülés nem nagyon van.
  • Görögország nem engedélyez beutazást Szerbiából. Just sayin'.
  • Probléma a HIV/AIDS kezelését szolgáló szerek elérhetőségével a láthatáron számos országban. 2019-ben 8,3 millióan szedtek antiretrovirális szereket (ARV-ket). 73 ország jelzi, hogy fogytán a készletei.
  • Spanyolország, adatok az IgG antitestek előfordulásáról (szereprevalencia). Országos szinten 5% körül. 
  • Térjünk vissza egy kicsit a vírus eredetéhez. A denevér-tobzoska-oda-vissza-rekombináció-zoonózis elmélet (Occam borotvája jelen állás szerint veszélyes rá) és William Gallagher copy-choice error elmélete mellé ugye van más is, amihez ez a Times-cikk szépen összeszedi a Shi Zhengli-féle kutatócsoport tevékenységének furcsaságait: hogy az RaBtCoV/4991 és az RaTG13 azonosságát elhallgatták publikációkban; és hogy a 2012-es bányajárványról sem számoltak be, aminek kapcsán ezt a vírust felfedezték, miközben egyébként gain-of-function kutatásokkal is foglalkoztak; és hogy ezek a dolgok valahogyan azután sem kerültek elő általuk egyenesen megemlítve, miután az RaTG13 és a SARS-CoV-2 96,2%-os genomegyezéséről maguk számoltak be.
  • Immunválasz. Ez a tanulmány koronavírusokra és köztük a SARS-CoV-2-re keresztreaktív CD4+ T-sejteket talált fertőzésnek ki nem tettek 40-60%-ánál. Ez nem feltétlenül véd a fertőzéstől, védhet viszont súlyos betegség ellen. De ezen a ponton ez csak spekuláció, ez is fontos.
  • Közben egy francia vizsgálat (a tanulmányt még nem láttam) azt hozza ki, hogy a hagyományosan endemikus emberi koronavírusok elleni antitestek jelenlétével nem asszociálódik védettség a SARS-CoV-2-vel szemben (szerencsére antitest-mediált fertőzésfokozódás, ADE) jelét sem találták, ha jól értem, amire "facilitációként" utalnak a cikkben (egyébként még kvázi-Kawasaki-szindrómát mutató gyerekeket is néztek).
  • A két imént idézett tanulmány nincs feltétlenül ellentmondásban: fertőzés kevésbé súlyos megbetegedéssel már olyasmi lenne, aminek örülne mindenki.
  • Megint egy szomorú történet.
  • Klaszterek Borsod-Abaúj-Zemplén megyében? A válasz: Mezőkövesd, iskolai értekezlet. A Corvinuson júniusban személyesen megrendezett záróvizsgákon az én részvételemmel működött bizottságokban ezért biztosítottam magam is a vizsgázók és a bizottsági tagok egymástól kb. három-három méterre történő eltávolítását, kapcsoltam le a légkondit, és nyitottam ablakot-ajtót kereszthuzathoz (ezeknek a lépéseknek a célszerűségét az egyetem vezetésének is jeleztem, akik köszönettel vették a javaslatokat). Az egyetem biztosított kézfertőtlenítőt és maszkokat is mindenütt (maszkot viseltünk végig), úgyhogy a feltételek adottak voltak a megfelelő lebonyolításhoz. Viszont ez azt is előre jelzi, mennyire nem egyszerű tömegintézményeket működtetni aszimptomatikus hordozók potenciális jelenléte mellett.
  • Trump beindította a kivonulást a WHO-ból (egy évet vehet igénybe, jöhet közben vezércsere). Innentől az amerikai elnökválasztás hivatalosan is IQ-teszt a választóknak.
  • Egy jó kis videóanyag (Vox) a zoonózisok növekvő valószínűségéről. Érdekes pl. amit a madár-biodiverzitás csökkenéséről említ a nyugat-nílusi lázzal kapcsolatban. Az ún. "higítási hatásnak" (dilution effect) a denevérek által érintett ökoszisztémákban is jelentősége van.
  • Jair Bolsonaro brazil elnök pozitív koronavírusra, és tünetei is vannak. 65 éves. Mellette szól a katonamúltja, és hogy láthatóan nem puhult el nagyon. Viszont 2018-ban egy merénylő csúnyán megkéselte.
  • Június 17-ig 768 eü. dolgozó hallhatott meg az Egyesült Államokban. Közben minden eddiginél nagyobb tömegben özönlenek a kórházakba fertőzöttek, köztük "simán átvészelem" felkiáltással önző emberek, akik majd további eü. dolgozókat ölnek meg, akik az ő nem annyira sima kezelésükkel lesznek elfoglalva. (Oroszországban eddig 562 eü. dolgozó halt meg közben.) Kieg.: ha valaki nem érti, miért fertőződnek meg és halnak meg eü. dolgozók annyian, itt egy rezidens elmagyarázza (nagyobb fertőző dózis, akár több alkalommal, a rajtad lévő eü. maszk nem feltétlenül véd attól, amit a páciens egyenesen az arcodba köhög , lehetetlen távolságot tartani mindenkitől stb.).
  • Egy klaszter története Heilongjiang tartományból. Olyan, aszimptomatikus fertőzött indíthatta, aki a második fertőzöttel egy liftet használt, de nem egy időben vele (és másképp sem kerültek szoros, közvetlen kapcsolatba.)
  • Lemondott az izraeli tisztifőorvos, és a távozás apropóján hosszan leírta, hogy miért: legelőször is az elsietett újranyitás miatt. Itt a bejegyzése a Facebookról. Leírja, mennyire rossz a helyzet, mi várható, és hogy reméli, hogy téved.
  • Sátoraljaújhelyi tábor kárpátaljai és délvidéki gyerekekkel. Ki gondolta volna, hogy ez lesz...?
  • Erősen pozitív eredmények hidroxiklorokin használatával Michiganből. (Mint ismeretes, júniusban az amerikai FDA elrendelte a HXQ rendkívüli felhasználásának beszüntetését arra hivatkozva, hogy nem ad látható mortalitási előnyt, illetve mellesleg még azért is, mert a remdesivirrel együtt nem szerencsés (a remdesiv hatását redukáló) a használata; mint ugyancsak ismeretes, a remdesivir átlagos terápiás költsége 3120 dolcsi.)
  • Az Egyesült Államokban a Paycheck Protection Program kedvezményezettjeinek (kölcsönöket kaptak) a listája került napvilágra. 521 milliárd dolláros program, és kaptak belőle milliós kölcsönöket "udvari" érdekeltségek is bőven. Van mit nézni ezen is, de a Federal Reserve kötvényvásárlási programja sem akármi, a maga 7 milliárd dollárjával (and counting). Óriási cégeket is finanszíroz, mesterséges részvényárfolyamokat generál, közpénzből védve vagyonos befektetők érdekeit, és ebből még buborék is lehet, ami kipukkanáskor természetesen shortolható.
  • Közben a pozitív tesztek aránya emelkedik 27 amerikai szövetségi tagállamban.
  • Belgrád, tüntetések a korlátozó intézkedések ellen.

2020.07.09-10.

  • Január 9-én történt az első hivatalos, megerősített haláleset Kínában. Azóta fél év telt el, és 552 ezer áldozata van hivatalosan a járványnak (a Worldometerst használom, mert a Johns Hopkins kevésbé naprakész a hivatalos adatokkal).
  • De mennyit érnek a hivatalos adatok? Indiában teljesen egyértelmű, hogy az adatok a kórházakban meghaltakat mutatják csak, miközben van, aki meghal, míg kórházba próbál eljutni, és vannak sokan, akik meg sem próbálják ezt. Egyes helyeken még a kórházi eseteket sem jelentik nagyon, pl. Nyugat-Bengálban, utasításra. És általában szeretik sokat nézegetni a kórházi eseteket utólag, hogy nem-e véletlenül mégis inkább muslicacsípéstől-e haltak-e meg az emberek. Közben a legfejlettebb országokban is jellemző, hogy ahol nagy a járvány, sokan vagy félnek a kórháztól, vagy reménykednek, hogy a "megfázásukra" biztosan nem a kórház a válasz, és így otthon halnak meg nagy számban, mint pl. az itt említett 51 éves nő Houstonban. A helyi orosz járványstatisztikák kb. annyira tűnnek komolynak, mint a választási eredményeik: sok a 99-esre végződő számadat például, valószínűtlenül sok (ahogyan a választásokon a kerek számok szoktak náluk gyakoriak lenni például a hatsó-közép-szibériai jellegű választókörzetekben). Mexikóban az Országos Népességregiszter hivatala kihozta, hogy március 19. és június 19. között nem 20394-en haltak meg COVID-19-ben, hanem 38815-en, ami nem olyan meglepő, amint tisztázzuk, hogy a korábbi, a világstatisztikák szempontjából továbbra is egyetlen mérvadó adat csak a kórházban elhunyt, laboratóriumilag megerősített eseteket rögzíti, miközben kevés a tesztkitjük, és tízből egy influenzatünetekkel jelentkezőt tesztelnek csak le a kórházakban.
  • Mexikóban én eddig 3208 addicionális halálozást számoltam, így a most adódó 18421 fő különbözetből ezt kivonom. Ezzel (15213) a g.a.h. = +179358+n.
  • És akkor még nem beszéltünk egy csomó másik országról, ahol a titkolózás/tagadás vagy a teljes tehetetlenség a politika lényege. Úgyhogy a globális halálozás jelenleg konzervatívan nézve: 552000+179000=731000.
  • Ez a cikk Svédországról egy parádés kutatásról számol be, mely körültekintő statisztikai elemzéssel kimutatja, amit nyilvános információk alapján hónapokkal ez előtt tudni lehetett: hogy Svédországban az idősebb betegeknek nem nagyon adtak intenzív osztályi kezelést, inkább hagyták őket a triázsolás jegyében.
  • Nem túl emberi állapotok Arizonában, egy, az országban illegálisan tartózkodókat fogva tartó központban. Egy CoreCivic nevű (már a neve is lenyűgöző) cég igazgatja a tábort az ICE szerződő feleként, 300 alkalmazottjukból 127-en teszteltek eddig pozitívan, így a bent tartottak sokszor nem tudnak kijönni a cellájukból, nem jutnak fürdési lehetőséghez (Arizonában, nyáron...) stb. 
  • Tulsa, Oklahoma, a nagy Trump-gyűlés korábbi helyszíne, megugrott az esetek száma.
  • A templomi szertartások is a terjedés terepét képezik.
  • A spanyol szeroprevalencia-tanulmány. Van itt térkép is, hogy meg lehessen nézni, mennyi Valenciában a seroprevalencia (elnézést, ezt nem hagyhattam ki). Érdekes a foglalkozási táblázat is: eü. dolgozók, rendőrök, idősotthoni dolgozók magasabb arányban. Magasabb szeroprevalencia a nagyobb településeken. Stb. Érdekes még az is, hogy a COVID-szerű tüneteken átesettek és antitestekre pozitívak közül csak 16,4-19,5% volt PCR-tesztelve annak idején (a sáv abból adódik, hogy kétféle antitest-tesztet is használtak a spanyol kutatók, korroborációhoz), és közülük, azaz a PCR-tesztelt ÉS tüneteken átesettek ÉS antitestekre pozitívak közül csak 75,1-78,8% volt pozitív a PCR-teszten. A PCR-tesztek megbízhatóságáról ez azért mond valamit... Ami a PCR-tesztelés alacsony arányát illeti: a kezdet kezdetén csak a súlyos eseteket tesztelték, később pedig elkezdték használni az ujjvég-böködős antitest-gyorsteszteket a fertőzöttség kimutatására (IgM-re), és ez alapján regisztráltak eseteket (ezért volt végtelenül pofátlan dolog, hogy később haláleseteket vontak le az adatokból arra hivatkozva, hogy nem volt PCR-teszt megerősítésnek ezeknél).
  • Módszertani széljegyzet: a spanyol tanulmány a kétszeres teszteléssel úgy járt el, ahogyan kell. Ezek után már igazán leírhatjuk, hogy az olyan kutatók, akik — velük ellentétben — korroborálatlan eredményekkel szórakoztatták a népet, nyájimmunitáshoz közeli állapotot ígérve nekik, szinte csalogatva őket a veszély közelébe, gyakorlatilag hanyagságból elkövetett népirtással vádolhatók. Nehéz szebben kifejezni, ha pl. azt nézzük, ami az Egyesült Államokban a kórházak túlterheléséhez vezető módon elszabadult.
  • Más dolgok. A T-sejteknek jelző (γ-interferon által indukált) IP10-es molekula szintje tartósan magasan több COVID-betegnél, felépülés után is. Intézményesített káosz az immunrendszerben. Emellett szó esik itt a betegek egy részénél durván hanyatlott T-sejt-állományról is (nem annyira meglepő, ha egyszer a vírus fertőzni tudja ezeket, bár legalább nem replikálódik bennük, mint korábbról tudjuk).
  • Mezőkövesd, "négyes iskola". Több érintett tanár más településen lakott, és Tard már most biztosan érintett.
  • Ravazdon egy ukrán vendégmunkást találtak fertőzöttnek. A sátoraljaújhelyi történet is biztosan alakul közben, még ha nem is úszunk az információk áradatában.
  • A neurológiai tünetekről egy összegzés. Agyi duzzanat, Capgras-szindróma, Guillain-Barré stb. A súlyosabb neurológiai elváltozások nem feltétlenül jártak együtt súlyos légúti tünetekkel.
  • Közben George Floyd ügyében már annyit láttam az elmúlt napokban (újra) az érvelést, miszerint a fentaniltól halt meg, csak véletlenül pont akkor, amikor mellékkörülményként két rendőr nyomta a nyakát és a mellkasát nyolc percen át és a könyörgése ellenére, hogy íme, egy korrekt beszámoló a toxikológiai eredményekről, elemzéssel. Még a wooden chest syndrome lehetőségére is kitér, és hogy itt miért nem az történt.
  • Nincs ökoturizmus, több az orvvadászat
  • 24 éves srác halála Floridában. Alighanem a vérrögök miatt.
  • Egy brit állampolgár élményei Szerbiából a koronavírussal, az elmúlt hónapban.
  • A tartós tünetekről COVID-19-nél (JAMA), Olaszországból. Átlagosan 60,3 nappal az első tünetek jelentkezése után 143 részt venni kész, és már nem pozitívra tesztelő személyből csak 18 (12,6%) volt teljesen tünetmentes. Fáradtság (53,1%) és nehezebb légzés (43,4%) voltak a leggyakoribbak.
  • Nem reagáltam közben a vírus aeroszolizációjáról szóló vitákra. Még tavasszal arra jutottam, hogy a cseppek általi fertőzés és némi aeroszolizáció egyszerre van jelen. Ezt akár tarthatnám is, de a D614G mutáció szétterjedése óta alighanem nagyobb lett az aeroszolizáció szerepe.
  • Nyolc kérdés. Nyomozatilag (Daniel Lucey járványügyi nyomozótól). 
  • Mi történik, amikor a BBC a járvány kezdeteiről kérdezgetne embereket Wuhanban? A hivatalos szervek nem válaszolnak a megkeresésekre. A Huanan Seafood Markettól elhajtják őket. COVID-áldozat hozzátartozójával a beszélgetést civil ruhás rendőrök igyekeznek megakadályozni.
  • És akkor még tegyük hozzá, amit Shi Zhenglitől idéznek februárból, ahol társadalmi médiás bejegyzésben azt üzente a laboratóriumi balesetről elmélkedőknek, hogy "az életemre eszküszöm, hogy a mi laborunknak ehhez semmi köze", a pletykát terjesztők pedig "fogják be a büdös pofájukat". Ez nem igazán egy felelősen eljáró tudósember megnyilvánulása, úgyhogy ezt is gondosan feljegyzem magamnak a kis noteszembe.
  • Újra-megbetegedések, talán visszaesésként, talán újrafertőződésként, talán új mutációval fertőződésként (egyik sem jó hír) :(

2020.07.11-12.

  • Sárgahasú szavannacerkóf vese-epitheliumi sejtjein (Vero E6 sejtkultúrán) végzett kísérletben (Bouhaddou et al.) az látszott, hogy a SARS-CoV-2 újraírja a sejtben a fehérje-foszforilációs folyamatokat (melyek során P⁺O₃²⁻ csoportok adódnak fehérjékhez). A kazein 2 kináz erős aktivációját látták továbbá, méghozzá úgy, hogy a sejten filopodiális nyúlványok keletkeznek, melyek szerepet játszanak a vírus bejutásában egyik sejtből a másikba. Hangsúlyozandó, hogy ezt nem emberi sejtekben látták, és in vitro. Itt a tanulmány. Így néz ki a dolog, pásztázó elektronmikroszkóppal (C) és transzmissziós elektronmikroszkóppal (H); a Bouhaddou et al.-féle tanulmány illusztrációi közül (igen, a kis vackok a képen vírusrészecskék).
  • sarscov2_veroe6filopodiawithvirions.jpg
  • Egy másik tanulmány is nagyot megy most: ez a BCG-vakcina hatásosságát mutatja ki a szerzők szerint most már extra-extra gondosan statisztikailag, a mortalitás csökkentését tekintve. Holnap olvasom alaposabban, itt van az anyag. Elöljáróban: ugye itt statisztikai asszociációról van szó, aminél mindig probléma, hogy végig kellene tudni követni a kauzális folyamatot is; azzal kapcsolatban pedig a logikus elvárás, hogy nem-specifikus immunstimuláció BCG nyomán egy életre azért nincs, inkább csak évekre van.
  • És akkor essünk neki. Ezeket a közrejátszó változókat igyekeztek kiiktatni, hogy izolálják az okozatiságot a BCG és a COVID-mortalitás között: "stage of the COVID-19 epidemic, development, rurality, population density, and age structure". Az "epidemic stage" változót az első esettől eltelt idő szabványosításával igyekeztek kezelni. A tesztelési politika változónak az adatokra nézve destruktív hatásáról sajnos lövésük nincs, és ezt azzal próbálták semlegesíteni, hogy a "kevésbé manipulálható" haláleset-számokat nézték. Hát, ha abban Spanyolországot és az Egyesült Királyságot hasonlítja össze valaki, nem kevés manipulációt talál pedig. És még egy szépséghiba, de nem a szerzők hibája: a kéziratot május 1-én adták le bírálatra (az adataik pedig akkor legalább napokkal korábbi időszak végén frissültek utoljára). Az nagyon régen volt. Shit happened since then.
  • És még egy tanulmány. Keresztreaktív T memóriasejtekről review. A hagyományos koronavírusok által esetlegesen szerzett relatív védettség lehetőségéről. Enyhébb megbetegedés, aszimptomatikus hordozás a lehetséges következmények között. A H1N1-nél is volt köze ennek a szokatlan halálozási mintázathoz, vagyis hogy ott pl. fiatal felnőttek veszélyeztetettebbek voltak, mint idősebbek, akik átestek másik H1N1-en évtizedekkel korábban. Pedzegettük ezeket a dolgokat itt már korábban is.
  • Kína beszél eltitkolt, ismeretlen eredetű tüdőgyulladásos esetekről Kazahsztánban, és annyi igazság van a dologban, hogy a kazahoknál nem a "nem is a koronavírusba halt bele" c. játék kedvelt az illetékesek részéről, hanem a "tüdőgyulladás volt az, nem feltétlenül koronavírus" c. játék. A kazah adatok szerint az év első felében a tavalyi 1172 helyett 1780 "tüdőgyulladásként" leírt haláleset volt, miközben COVID-ben negyvenezer esetre jutott kétszáz haláleset június végéig. A különbözettel g.a.h.: 179966+n. 
  • Trump tegnap már viselt maszkot egy nyilvános jelenésnél.
  • Ezt az embert egy kicsit — lehet, hogy ez csak ezrelékekben mérhető, de azért — Trump ölte meg, no meg a sötét középkoriság promóciójával uralkodni vágyók tábora.
  • Az amerikai haderőnek eddig 41 tagja halt meg COVID-ben.

2020.07.13-15.

  • Járvány az okinawai amerikai bázison.
  • Járvány Idlibben, Szíriában (ez a felkelés utolsó bástyája lényegében).
  • A koronavirus.gov.hu-n most éppen az a fő üzenet, parafrázissal élve, hogy a vírus a külföld nevű helyen van, és nem szabad hagyni, hogy belemenjen a Magyarország nevű országba. Ijesztő, hogy ma milyen IQ-szintre lövik be a hatékony politikai kommunikációt. De meglepő nem ez volt számomra tegnap, hanem amikor kiderült, hogy Szerbiában csak közepesen súlyosnak minősítették a helyzetet, és hogy sárgának sorolták be őket (a piros a legsúlyosabb). 
  • Újrafertőződésről jelentés, újabb. Nyilván nincs ennek kitéve mindenki egyhamar, de hogy ilyen rövid időn (hat héten) belül is van, aki igen, az több, mint kellemetlen az összkép szempontjából. Pláne ha az újfrafertőződöttek észlelésének jelenlegi valószínűségét is figyelembe vesszük; ugyanis x idővel ez előtt n lélekszámmal kisebb populációból az újrafertőződés p valószínűsége mellett egy töredékpopuláció tagjainak a kihalászásáról van szó.
  • A City University of New York (CUNY) 46 faculty- és alumni-tagot és diákot veszített eddig COVID-ben (huszan a faculty soraiból).
  • Az Európai Parlament kezdeményezése egy Technology Access Pool létrehozására, ami a szabadalmi jogokat is magában foglalnál a COVID kezelésének kontextusában történő innovációra. Izgalmas kérdés, mert nem csak a hozzáférés a világérdek, hanem az is, hogy valaki innováljon, és legyen mihez hozzáférni. A részvétel ugyanakkor önkéntes alapú lenne, úgyhogy inkább a non-profit szektort érinti.
  • Tanulmány sok adattal a szívet érő károsodásról COVID-nél, a szív ultrahangos vizsgálata alapján, n=1272 (ebből 73% volt megerősített COVID, 27% valószínű). A nők 29, a férfiak 71%-ánál mutatott ki abnormalitást a scan. 901 résztvevőnek nem volt korábban szívbetegsége, és közülük is 46%-nál abnormalitás. Ha pedig az enyhe eseteket nézzük külön (benne CVD előzménye lehetőség), ott is 15%-nál abnormalitás.
  • Az Index furcsának találja, hogy az Egyesült Államok csak sárga besorolást kapott nálunk. Gulyás Gergely kifejtésében ez azt jelenti:, hogy "Nem magyar állampolgárok esetén sárga jelzésű ország állampolgárai ugyanolyan feltételekkel léphetnek be, mint a magyar állampolgárok, vörös jelzésű országból történő belépésre viszont nincs lehetőség".
  • Eset pszichotikus epizóddal. Fejfájást a legféltettebb titkok dömpingszerű megvallása követett halálfélelem hatása alatt, majd a kórházban már profétának képzelte magát a páciens — és akkor leszedálták. 
  • A méhlepény (placenta) sejtjein nem fejeződik ki ACE2 és TMPRSS2, úgyhogy a SARS-CoV-2-nek ez sivatag. Bár kifejeződik itt furin és CD147 (baszigin), az ACE2 és a TMPRSS2 hiánya eldönteni látszik a meccset. (Más vírusok nagyon is célba találnak itt, pl. zika, CMV, Lassa.)
  • Az aszimptomatikus hordozók tüdeje is károsodik. Miközben a tüdejük ugyanolyan beszűrődéseket mutathat, mint a tüneteseké.
  • Eastern Cape Province, Dél-Afrika. Nagyon rossz kórházi állapotok.
  • Az amerikai kórházak most már nem a járványügynek, hanem a Fehér Háznak küldik majd az adatokat, mert így... sokkal jobbak lesznek majd az adatok...
  • Tunézia. Örülünk, hogy az arab ún. tavaszból legalább itt demokrácia lett, de azért közegészségügyi célzattal megosztani kézmosásra figyelmeztető pósztot a Korán szúráinak stílusában írva börtönbüntetéshez vezethet.
  • Japán, színház utáni klaszter. Mind a 800 nézőt magas kockázatú kontaktnak minősítették az alapján, amit eddig találtak.

2020.07.16-19.

  • Egy röpke gondolat: ha az antitest-titerek hanyatlanak, akkor a szeroprevalencia-tanulmányok eredménye lefelé hibázik valamennyit szinte biztosan.
  • Egyelőre nem tisztázott argentin hajós eset (h/t Epikurosz). A tengerészek közül szinte mindenki PCR-pozitív lett 35 nappal indulás után. Elméletem, hogy indulás előtt fertőződött, 1-2 hétig inkubáló aszimptomatikus fertőzött ürített vírust a fedélzeten egy-két hétig, és az fertőzte meg a többieket (náluk is hozzászámítva a lappangási időt). De ha más volt a fertőzés vektora, azt nagyon érdekes lesz kideríteni. Felszökött-e a hajóra például fertőzött rágcsálópopuláció, akik ijedtükben letüsszögték a kapitány macskáját? Ilyesmikre is lehet gondolni, félig komolyan megfogalmazva.
  • Pakisztánban is vannak rejtve maradó halálesetek. A linkelt cikkben egy esetről van beszámoló, ezt majd levonom az összesítésből utólag, ha lesz jobb adat. Addig g.a.h.: 179967+n.
  • Egy 24 éves texasi nő 79 napi kezelés után távozhat a kórházból
  • Az alsó végtagi trombózisokról COVID-nél.
  • Gyerekek is nagy számban lesznek fertőzöttek.
  • Még a nem-elhanyagolható keresztimmunitás irányába mutató eredmények.
  • És ha már keresztimmunitás, egy kicsit többet akarok majd olvasgatni az OC43-as koronavírusról (ha már február óta emlegetem) és az 1889-1892-es pandémiáról (hívták "orosz" és "ázsiai" "influenzának" is), amelyet lehet, hogy ez a bétakoronavírus okozott, a SARS-CoV-2 méltatlanul kevés figyelmet kapó távoli kuzinja, akkor friss zoonotikus patogénként. A tMRCA-elemzés alapján is erős egybeesésnek tűnik, hogy éppen akkoriban történhetett az OC43 kitörése az emberi populációba, és a tünetekről és a járvány egyéb jellegzetességeiről szóló anekdotikus megfigyelések is erre utalnak: férfiak lettek inkább betegek, és sok volt a neurológiai/központi idegrendszeri komplikáció. Itt is jelentős volt a kockázat az életkorral összefüggésben: míg az 5-14 éves korcsoportnál csekély volt csupán, 70 év felett volt a legnagyobb. Csak Nagy-Britanniában lehetett vagy százezer+ áldozata három nagyobb hullám nyomán (ebbe persze "sima"/szezonális influenzás esetek jelentős számban keveredhettek az akkori viszonyok között; mások egyébként négy hullámot említenek Nagy-Britanniában, és 125 ezer áldozatot). Érdekessége ennek a járványnak, hogy megmutatta, légi közlekedés nélkül is lehetséges már a gyors szétterjedés: a meglévő vasútvonalak és viszonylag gyors tengerhajózási összeköttetések elegendők voltak ehhez.
  • 1062 PCR-vizsgálattal igazolt kórházi fertőzés, és ebből 260 elhunyt a járvány első szakaszában nálunk. A járvány felderített részének tekintélyes része (a fertőzöttek majdnem negyede, az elhunytak közel fele), de persze volt a járványnak felderítetlen része is.
  • Spanyolországban százezer nyércet készülnek leölni a nyércek között ott is kitört járvány miatt. 
  • A szerbiai tüntetések a július 7. utáni napokban kicsit bonyibbak voltak, mint ha pusztán a "korlátozó intézkedések" ellen lettek volna. Mint kiderül, az egyik kiváltó ok egy olyan férfi esete volt, akinek az apja nem jutott lélegeztetőgéphez, meghalt, majd csak nem akarták megerősíteni, hogy a koronavírus áldozata lenne. Amikor a fia ezt videóra mondta, a videó pedig népszerű lett, a szerb elnök válaszul hazugnak nevezte, mire ő bemutatta a dokumentumokat az esetről egy újabb videóban. A tüntető tömegben pedig elég sokan viseltek maszkot felvételek tanúsága szerint.
  • Látom, milyen szigorú szabályok mellett zajlanak jelenleg teniszversenyek, Forma-1 stb. Buborékban dolgozó csapatok. Teniszütő-koccantás kézfogás helyett. Maszkviselés. A közös tevékenység érdeke, hogy ne legyenek lazák. Csinálják, hogy folytatni is tudják. És látom közben azt is, hogy annak idején szabadtéri órákat tartottak sok iskolában a spanyolnátha miatt. Miért olyan magától értetődő ezek után menedzsernek-politikusnak, hogy az iskolanyitásokkal beltérbe össze kell zárni beszélgetni tömegeket? (A totálisan-fatálisan zsúfolt egyetemi termekről még nem is beszéltem, ahol mindig beesik pár hallgató végigbulizott éjszakák után, köhi-köhi kíséretében.) Tanulságos egyébként a teniszversenyekről szólva, hogy a bemutató versenyekből álló "pótszezont" beindító belgrádi tornát persze kellően hanyag módon sikerült megrendezni, maszk senkin, labdaszedők-vonalbírók normális létszámban, a játékosok meccs végén ölelkeztek, teli lelátó előtt játszottak stb. Meg is lett az eredménye, amiből azután az is tanult, aki enélkül nem tért volna jobb belátásra.
  • Élő Anitának ezt a cikkét még nem kritizáltam, pedig ez most kijár. Írja pl.: "A belgrádi tiltakozások politikai háttere összetett, de jól mutatta, hogy a főként fiatalokból álló tüntetők nehezen tűrik az újabb korlátozásokat". Meg lehet nézni két ponttal fentebb itt, hogy erről szóltak-e a belgrádi tüntetések. Nem. "A megoldás a fertőzöttek gyors felderítése" - írja aztán, amiről maga is kihozza, hogy nálunk nem fog működni, mert... nem fog. "A cél, hogy ne legyen szükség az egész ország lezárására, csak a valóban fertőzött közösségeket izolálják" - vezeti tovább a gondolatmenetet a saját maga által is lehetetlennek ítélt feltétel meglétéből kiindulva. "Az osztrák járványügyi rendszer települési szintig mérlegeli a kockázatot. Nem egyedülálló ebben, ugyanezt csinálják a britek is" - teszi hozzá. De Ausztria/Nagy-Britannia és Magyarország között van némi különbség nem csak a tesztelés gyakorlatát, hanem az ország központosítottságának mértékét és (a britek esetében) a méretét tekintve is. Budapestnek nem lehet egy kerületét lezárni, Budapest lezárása pedig az ország szempontjából sokkal súlyosabb változás. Én aztán szeretném elkerülni ezeket a lezárásokat-korlátozásokat, csak arról nincs fogalmam sem ezen a ponton, hogy ezt a magyar feltételek között hogyan lehetne elkerülni tömeges emberveszteség nélkül.
  • Vertikális transzmisszió, dacára a fentebb a méhlepénnyel kapcsolatban találtaknak. First ever definitive case, úgyhogy azért ez nem jelenti, hogy ez lenne a norma.
  • Nobel-különdíjat ennek a dublini ír orvosnak. Ezt a kísérletet már rég el kellett volna végezni ebben a formában (a hülyék kedvéért). Kamera be, maszk(ok) fel, pulzoximéter az ujjra. A vér-oxigénszint hat maszk felvétele után sem esik le.
  • A SARS-CoV-2 által promótált bakteriális kolonizációról a tüdőben (Prevotella, Veillonella, Capnocytophaga, Fusobacterium, Oribacterium és Bacteroides által). Ezeknek szerepe lehet emelkedett IL-6, szívkárosodás, vérrögképződés, ARDS, szepszis és egyebek kapcsán is, a SARS-CoV-2 saját hatásain túl.
  • Ez itt pedig a gombás felülfertőzésekről egy tanulmány, aspergillosisra fókuszálva. Ezekben persze a szteroidos kezelés (dexametazon) is szerepet játszhat.
  • Tanulmány: nem mindegy, mi minden fertőződik még meg a vadonban a szennyvíz révén, downstream.
  • A SARS-CoV-2 annyira megütötte a jackpotot vírusszempontból, hogy az ACE2-höz kötődés és a furin hasítási hely révén szinte mindenféle sejthez hozzáfér, és a tetejében megzavarja a vérnyomás-szabályozást, a sóháztartást és a glükózmetabolizmust is. Most itt ez a tanulmány: eszerint a lipidmetabolizmust is. Cserébe viszont lehet gondolkodni koleszterincsökkentő gyógyszerek bevetésén (sztatinokról már korábbról van adat, hogy pozitívan alakítják a túlélési arányt).
  • Nem annyira jó jelek a véradás biztonságosságát illetően: egy hónapja aszimptomatikus, fertőzésen átesett szemény donációjában is sikerült kiszúrni a SARS-CoV-2 RNS-ét. Silver lining, hogy vélhetően alacsony vírusszám mellett, és akkor talán nem volt olyan nagyon fertőző, vélik a szerzők.
  • Anno megállapítottam, hogy a járvány halálozása globális szinten nyilván nem fogja meghaladni a szív- és érrendszeri betegségek éves halálozását. De azt ne feledjük el, hogy helyenként, időről időre, a járvány nagyobb fellángolásaiban sokkal többen is meghalhatnak, mint ahányan egy átlagos napon meghalhatnak egyéb okok következtében. Íme, Arizona tegnapi adatai (COVID július 18-án vs. napi átlagos halálozás egyéb okokból Arizonában):

sarscov2_deaths_in_arizona_18july2020.png

  • Az iskolás korú gyerekek nagyon is terjesztik a koronavírust (és egyéb eredmények). Dél-koreai tanulmány.
  • Amúgy pedig újszülöttek is ki vannak téve a fertőzésnek, nagy számban is. 
  • Kijött közben a State Department 2018-as sürgönye a Wuhan Institute of Virology biztonsági problémáiról, és amint megszerzem, linkelem is majd. Egyelőre a nyilvánosságra hozatal a Washington Post paywallja mögé történt, úgyhogy várom, hogy valaki más is megossza, és ezzel ténylegesen nyilvánossá tegye. Közben végre sikerült letöltenem, csak egy másik számítógépről kellett rámennem, hogy élvezhessem a limitált free accesst.
  • A kontent: a WIV építési munkálatai csak 2015. január 31-re fejeződtek be. Kevés volt a jól képzett szakember az ideális feltöltéséhez. Tekintve, hogy Kína akkor már épített Harbinban (állatorvosi célokra) másik BSL-4-es labort is, ez a hiány elég érdekfeszítőnek tűnt, de a sürgöny szerint lehetőséget adott mind nemzetközi képzésben, mind együttműködésben amerikai szakemberek belépésére is (említés történik a University of Texas és a U.S. NIH már meglévő programjairól). A kínai szabályozás a sürgöny keltéig (2018. január 19.) csak a Nipah, az ebola és a xinjiangi vérzéses lázat okozó vírus (egy krími-kongói variáns) használatát engedélyezte nekik P4-es patogének közül. A sürgöny ugyanakkor megjegyzi, hogy a (P4-nek ironikus módon besorolatlan, hisz még nem kellően megismert) denevér-koronavírusok kutatgatása máris milyen sikeres a WIV-nél.
  • Trumpék döntéshozataláról összefoglaló (NYT). Mark Meadows (Fehér Ház, kabinetfőnök) és csapata játszotta a döntő szerepet, míg Trump elnökösdit játszott a kertben, és Deborah L. Birx közegészségügyi tanácsadóként a tudomány hitelét adta az optimista megközelítéshez. A stratégiát pedig úgy határozták meg: "authority handoff". A szövetségi tagállamoknak passzolták a labdát, hogy ne nekik kelljen már vesződniük vele, nem azért akarták a hatalmat, hogy holmi problémákat kelljen megoldaniuk. (Mi ezt itt menet közben végig követtük, persze.)
  • Nagykőrösön esetek egy csomagolóüzemben. A felderített aktív esetek száma (is) növekvőben Magyarországon.
  • Egy izraeli óvónő hiába figyelmeztette a szülőket, hogy karanténozott családtag mellől ne küldjenek gyereket az óvodába. Mostanra pedig meghalt. Izraelben május óta 1335 novendék/diák és 691 "faculty" fertőződött meg az intézményekben.
  • Rouhani iráni elnök szerint 25 millió fertőzöttjük is lehetett akár mostanra (gondolom, ezt valamilyen szerológiai mintából sikerült kivetíteni). Namármost, nekik 14188 halálesetük volt hivatalosan, de náluk azt is biztosan lehet tudni, hogy ezek az adataik kitaláltak. Eddig 4652 extra halálesetet sikerült dokumentálni náluk kellő valószínűséggel. Sejthető, hogy még ezek ÉS a hivatalos adatok összeadása mellett is csak (jelentős) alábecslést kapunk.
  • Járvány a járványt felderítő kapcsolatkövető központban (UK).
  • Brazília, az őshonos népességet ellátó eü. szolgálatnak vagy 1000 tagja fertőződhetett, amit az NY Times kicsit szenzációéhesen úgy tálal, mintha konkrétan ők fertőzték volna le az őshonos népességet "segíteni igyekeztükben". Ami nem lenne amúgy lehetetlen, de dokumentálva itt nincs ilyen.
  • Boris Johnson és egy rakás egyéb politikus kinyilvánította mostanra, hogy "nem szeretnének újabb lockdownt". Magyarul inkább a tömegirtást preferálják. Nagyon szép. Az NHS részéről mindenesetre jelezték, hogy nem lesz jó vége... Hogy világos legyen: én sem szeretnék második lockdownt, de itt az életért és a járványért egyszerre kell majd harcolni legalább ősztől, és nem szabad bedőlni a szociopatáknak, akik azt terjesztik, hogy választás van a kettő között. Majd ha lesz vakcina, akkor lehet (de még akkor is csak szerény keretek között) kívánságműsort rendezni.
  • Új infók az argentin hajóról, ahol 35 napi hajózás után jelentkezett a járvány látható formában. A 35 valójában D+49, azaz 49 napot kellhet magyarázni, mert indulás előtt volt negatív teszt és két hét önkarantén a legénységnek. Lehetőségek: 49 napot lehet magyarázni két hetes inkubációkkal és aszimptomatikus fertőzöttől való kiindulással. Az is lehet, hogy a vírus valamiféle optimális körülmények között a környezetben maradt meg valahol néhány napig, és úgy került aszimptomatikusnak megmaradó hordozó szervezetébe. És az is lehet, hogy az önkarantén csak olyan Maradona-jelleggel volt betartva egyesek részéről. Akár ez mind szerepet játszhatott. Vagy a kapitány macskája (ha volt neki).
  • A humán kapcsolatkövetés realitásai az Egyesült Királyságban. Országos szinten 21,8% sunnyog, és azt mondja, senkivel nem volt kontaktban. Blackburn tájékán pedig a kontaktok felét nem sikerült elérni, hogy meg legyenek egyáltalán szólítva az ügyben, miközben éppen újraindult arrafelé az exponenciális növekedés.
  • Béta-interferon-inhaláció kedvezőnek tűnő előzetes eredményeiről.

Folyt. új bekezdésben!

A koronavírus-járvány rögös útján, tovább

Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

2020.06.15.

  • Így vált a COVID-19 az egyik vezető globális halálozási okká, vizualizáció. (Kieg.: A G7 is megosztotta az ábrát, és számos kommentelő írta felháborodva, hogy de hiszen rákban többen halnak meg. Hát, nem fogom sajnálni a koronavírust, de ez a sorsa, úgy tűnik. "Á, hát hol van ez az influenzához képest", mondogatták anno egyesek. Miután az a szöveg nem jött be, most a rákkal és a szív- és érrendszeri betegségekkel jönnek. Azokat a SARS-CoV-2 nem fogja tudni lekörözni. De ha mégis sikerülne neki (mondom, nem fog sikerülni neki, csak az irónia kedvéért írom), akkor mi következne? Hogy "nem ebben fogunk kihalni"?)
  • Erről eszembe jutott még valami. Május 24-én volt az itt közölt adat szerint 256795 maláriás haláleset idén (2018-ban csak 405 ezer volt egész évben). Úgyhogy elmondom, hogyan lehet az afrikai országokban olyan alacsony a halálozási arány COVID-nél. Úgy, ha pl. a szokásosnál többen halnak meg maláriában. Mármint hivatalosan. Ehhez rossz szándék nem kell. Lázas beteg fájdalmakkal meghal, mélyreható vizsgálódás nélkül nincs nagy különbség ott, ahol ehhez hozzászoktak, és nincs nagyon eü. infrastruktúra.
  • Peking eddig egész jól megúszta. Kezelni fogják a helyzetet, de a fővárosban ez nagyobb zavar forrása, mint Wuhanban.
  • Arról, hogy az Indiából jövő adatok mennyire problémásak. Orvosilag évente a halálesetek 22%-át vizsgálják csak. Kieg.: e szerint a forrás szerint a halálesetek 70%-át regisztrálják csak (normális körülmények között...), és azok ötödére igaz, hogy van orvosilag megállapított halálok.
  • Spanyolország egészen hihetetlenül pofátlanul jár el a koronavírusos halálesetek (nem-)jelentésével. Ugyanitt adat arról, hogy eddig volt minimum +43000 szezonális átlagot meghaladó halálozás idén. Eddig 4500 halálesetet számoltam el ilyen kategóriában összesen, úgyhogy itt konzervatívan, de a 43000 háromnegyedét figyelembe fogom venni (tekintve a már eddig is komolytalan adatszolgáltatást), és abból vonom le a 4500-at (kijön 27750). G.a.h.: +111168+n. (Kieg.: spanyol újságírók utánamentek a dolognak, és tekintve, hogy mit hoztak ki közvetlenül COVID-hoz kötődő halálesetnek (16436), ami a jéghegynek csak a vízből az eü. rendszer szenzorai számára kilátszó része, nem lőttem itt mellé sajnos.)
  • Mint Svédország, Spanyolország vagy Nicaragua esete mutatja, a valóságtagadó (eufemisztikusan lásd még: "post-truth") politizálás bal- és jobboldalon is előfordul, és ronda egy nyavalyája az emberiségnek.
  • Apropó, Nicaragua és járványtagadó vezetés. Costa Rica elég komoly negatív kicsordulási hatást kap tőlük a munkásmigráció kapcsán. Korábban már a Pan-American Health Organization határozott intervencióját is kérték a szomszédok háza táján.
  • Kísérletek egy új szerrel (TRV027), mely egyszerre blokkolja az AT-II-t és pótolja az AT 1-7 hatását, hogy normalizálja a vérnyomást, és ezzel segítsen kezelni a vérrögképződéssel kapcsolatos problémákat is.
  • Ebből az elemzésből (a KKI-től, Németh Ferenc munkája) megtudható pl., hogy Észak-Koszovóban jelenleg is Szerbia rendelkezik effektíve a közegészségügyi intézkedésekről, és a koronavírus-tesztjeik is Szerbiába mennek.
  • Burundi elnöke, Pierre Nkurunziza elhunyt, minden valószínűség szerint COVID-ben. Ő lenne a második halott az országban, de jaj, ő maga gondolta úgy, hogy a járvány felesleges para, elég gyakorolni a vallást buzgósággal, ezért őt nem is tesztelték. A felesége még korábban Kenyába repült kezelést kapni, az Aga Khan Foundation ottani kórházában. G.a.h.: +111169+n.

2020.06.16.

  • Ez a tanulmány kihozta, hogy a belga eü. személyzetnél nem volt nagy a betegekkel érintkezés rizikója (nyilván PPE-kkel és protokollokkal menedzselték sikeresen) — egyéb tényezők inkább determinálták, ha fertőzöttek lettek (pl. háztartásban beteg). A belga ápolók viszont nem egészen elégedettek a támogatással, amit kaptak, és éppen perre mennek emiatt.
  • Új-Zélandon újra van eset. Két nő jött haza Angliából, és méltányossági alapon lerövidítették a karanténjukat, hogy meglátogathassanak egy halálán lévő családtagot — 650 kilométerre, Aucklandből Wellingtonba hajtottak ehhez.
  • Nálunk egy új esetet találtak (meg). A CFR tovább emelkedett, most már 13,85%.
  • Bangladesben leégett egy kórházi szükségrészleg, öt COVID-beteg meghalt. G.a.h.: +111174+n.

2020.06.17.

  • Egy csöppet over-the-top cím a BBC-n: "Dexamethasone proves first life-saving drug". Szteroidokat természetesen eddig is használtak a túlpörgött immunrendszer fékezésére a súlyos eseteknél. Itt állítólag olyan jók az eredmények, hogy egyharmaddal csökkenthető lehet a lélegeztetőgépre szorulóknál a halálozás. Úgy legyen! Az előbb-utóbb beérő finomhangolások a kezelésben idővel mindenképpen csökkentik az Infection Fatality Rate-et. És akkor jöhetnek majd a boldog tudatlanok magyarázni, hogy nem is volt olyan halálos ez a vírus. Hiszen eddig "csak" félmillióan haltak meg benne, akik "nyilván" mind amúgy is gyakorlatilag halottak voltak (a javuló kezeléssel persze lehet, hogy mégsem...). Legyen meg a boldog tudatlanok akarata.
  • Úgy tűnik, Kínában komolyan aggódnak amiatt, hogy esetleg a fagyasztott lazaccal hozták be a vírust.
  • Aggódnak a vírus terjedésének gyorsasága miatt is.
  • És éppen az ilyen esetek miatt különös (értsd: feltárandó, megalapozott magyarázatra szorul), amit például Magyarországon látunk. Nálunk minden jel (a szennyvizes adatok, a halálesetek számának lelassult növekedése, illetve az európai mortalitásfigyelőnél látható normális halálozási mutató) arra utal jelenleg, hogy szerencsére elmaradt ez a fajta robbanás. (A regisztrált esetek számát nem érdemes nézni — mára a CFR megint tovább nőtt, most éppen 13,9%.) Kórházi dolgozók tették ki közben az ismert fertőzöttek 15%-át, és csak egy személy halt meg közülük (600-nál több fertőzött közül, és 564 másik haláleset mellett), miközben pl. Oroszországban már 416 eü. dolgozó halt meg a ma reggeli állás szerint. Szerencsénk van? A korai korlátozások és a szerencse a magyarázat, együttesen? Nem mindegy, az esetleges következő hullám elé tekintve. 
  • Indiában közben halálozási rekord, részben adatkiigazítások miatt. Sajnos a vasúti kocsik kórházzá konvertálása pontosan jelezte, mennyire súlyosra fordult az ottani helyzet. Kétezernél több halott egy nap alatt, a hivatalos adatok szerint.
  • India és Kína között összecsapások voltak a Himalája térségében.
  • Minneapolist nem követtem egy darabig. A városi tanács deklarálta, hogy teljesen fel akarják oszlatni a városi rendőrséget, mert a reform nem elég, de ezzel messze nincs vége a történetnek. A rendőrség nagy reformok ígéretével igyekszik kivenni a szelet a kezdeményezés vitorlájából. Ezzel egyfajta alkufolyamat zajlik, ha jól érzékelem. A városi tanács döntése látszólag a "Defund the Police" kezdeményezéssel rezonál — sajnos nem feltétlenül konstruktívan. Ahelyett, hogy lenne egy egészséges vita arról, hogy milyen feladatokkal nem kellene terhelni a rendőrséget, vagy hogy maga a rendőrség mitől működne jobban, a különféle támogató és ellenzőtáborok tüzét fűti a deklaráció. Közösségi egymás nyakába borulásról álmodnak az egyik, anarchiáról rémálmodnak a másik oldalon — megoldásokra pedig a valóságban van szükség.

2020.06.18.

    • Németország. Újabb húsfeldolgozós klaszter. Fagyos munkakörülmények, zsúfolt munkásszállók kelet-európai munkásoknak. És a kötelező idiotizmus a munkaadók részéről: "biztos otthonról hozták magukkal ezek".
    • A hondurasi elnök és felesége is pozitívak, az elnök beteg.
    • Az iskolák is lehetnek jelentős terjedés terepe. Izrael.
    • A night out in Florida. Klaszterek, klaszterek, klaszterek.
    • Adatkészlet arról, ki mennyiszer szolidarított meg, és kiket, a járvánnyal kapcsolatban az EU-ban. A németek vezető helye nem lepett meg, de érdekes pl. a cseheket ott látni a szolidaritási toplistán.
    • A BBC 27 ország excess mortality adatai alapján minimum 130 ezerre teszi a járvány (közvetlen és közvetett, pl. kieső eü. ellátás miatti) áldozatainak számát a hivatalos adatok felett (mindenhol megnézve, mennyi az "other excess deaths", tehát minden COVID-19-es halálesetet extrának tekintve, konzervatívan). Én ugyebár külön dolgozom, all-source jelleggel, ugyanezen a mutatón, nézzük, mi számít az ő adataik közül az én mutatóm esetében. (Korábban figyelembe vett számokat levonva, a különbözetet egységesen mindenütt 10%-kal csökkentve, azaz feltételezve, hogy járvány nélkül is mindenhol lett volna ennyi excess mortality.) Chile: +1963. Ecuador: +7749. Jakarta: +2983. Irán: +3988. Japán: +225. Hollandia: +3376. Peru: +11463. Portugália: +1383. Dél-Korea: +1107 (itt feleztem, azaz többet levontam, a különösen intenzív tesztelésükre tekintettel). Thaiföld: +2084. Az Egyesült Államokból eddig 9548 halálesetet vettem figyelembe, így: +15694. G.a.h.: +111174+52015+n=+163189+n. (Ha valakiben felmerül a kérdés, hogy lehet az én konzervatívabb számítási módom mellett több a végső számadat, mint a BBC-nél: én több országból néztem, és a BBC által vizsgált adatok származási periódusánál jóval tágabb időszakban, az addicionális halálozást.)
    • Azt jó tudni, hogy a hivatalos kínai lazacpánik közepette legalább a kínai CDC azért nem az importlazacot gyanúsítja elsősorban.
    • Trump szerint a koronavírus kihalóban. Pence is megtartotta a kötelező kis "mission accomplished" beszédét.
    • A brazil őshonos népességet nem kíméli a vírus.
    • Na, akkor dolgozzunk egy kicsit. Ez a paper a D614G mutációt azonosította (az S-fehérjében) jelentősen nagyobb transzmisszivitás (és a virionon nagyobb mennyiségben és stabilabban kifejeződő S-fehérjék) forrásaként. Ennek a szekvenciája, a 614-es pozíció környékén (1273 aminosavból): SNQVAVLYQDVNCTEVPVATH helyébe lép SNQVAVLYQGVNCTEVPVATH (614-nél glicin lép az aszpartát helyébe; a Wuhan-Hu-1-esnél pl. még aszpartát volt). Kérdés: a Magyarországon izolált vírusoknál jelen volt-e ez a mutáció? Ha az alábbi idővonalat követjük, a G térnyerése a nálunk viszonylag korán bevezetett korlátozó intézkedéseket követi.

sarscov2_d614gmutation.jpg

  • Hipotézis: ezt a mutációt sikerült volna kizárni a korlátozásokkal? Lényeges kérdés, mert akkor a nemzetközi forgalom újbóli élénkülése mellett a G térnyerése újra elképzelhető.
  • Még mielőtt én böngészhettem volna át néhány vírusgenom-szekvenciát, szembejött ez a paper itt. Ezek szerint a hCoV-19/Hungary/mbl1/2020 pl. hordozza a D614G mutációt. Ezt március 17-én töltötték föl, GISAID kódja 416426. Budapestről származik. Tehát itt volt, legalább egy izolált vírusnál jelen. By the way, itt a P4715L mutáció is adott az RdRp-ben (RNS-dependens RNS-polimeráz), amelyről szintén az a tapasztalat, hogy a releváns változások egyike.
  • Kérdés, mi a helyzet a többiekkel? Hungary/SRC-00066/2020 (Baranya, GISAID 435403), Hungary/SRC-1788lc/2020 (Szeged, GISAID 435425), Hungary/MBL-469/2020 (Balassagyarmat, 435424), Hungary/MBL-465/2020 (Balassagyarmat, 435423), Hungary/MBL-464/2020 (Balassagyarmat, 435422), Hungary/mbl2/2020 (Baranya, 418483), Hungary/SRC-01136/2020 (Baranya, 435418), Hungary/MBL-003/2020 (Balatonfüred, 435421), Hungary/SRC-02801w/2020 (Békésszentandrás, 435428), Hungary/SRC-03670w/2020 (Kecskemét, 435430), Hungary/SRC-00105w/2020 (Kecskemét, 435426), Hungary/SRC-00126/2020 (Baranya, 435405), Hungary/SRC-00055/2020 (Baranya, 435419), Hungary/SRC-00417/2020 (Baranya, 435409), Hungary/mbl49/2020 (Baranya, 416744), Hungary/SRC-00067/2020 (Baranya, 435404), Hungary/SRC-00419/2020 (Baranya, 435410), Hungary/SRC-00792/2020 (Baranya, 435412), Hungary/SRC-00620/2020 (Baranya, 435416). Megjegyzés: kicsit sok a Baranya (PTE, értem én) — a nagyobb diverzitás jobb képet adna.
  • No, itt egy másik paper. Ez 3/3 magyarországi szekvenciában találta meg a D614G-t. Sajnos nem jelöli, melyikeknél a fenti listából. Mindenesetre így 3-4 példányról tudunk, ahol a D614G megvolt. Ez így azt sugallja, hogy nem ez a magyarázat a vírus "nyaralására" Magyarországon.
  • Egy 1983-as tanulmány az északkeleti országrészről. Szerológiai vizsgálat, 2881 mintából 58% volt pozitív OC43-as koronavírus elleni antitestekre. Hoppá. 15-19 év közöttieknél 70% a szint. Ez már inkább lehet része a magyarázatnak, amit keresek — bár 1983 régen volt... Mennyi lehet a keresztimmunitás?
  • Mielőtt túlzottan örülni kezdenénk, azért megjegyzem, hogy a CFR tovább nőtt mára. Most már 13,92%.
  • Kínai tanulmány. (Csak) 3,2-3,8%-os szeropozitivitás Wuhanban (még március és április eleje között mérve, ami IgG/IgM szempontból nem közömbös).
  • Újságíróknak, akik ezt olvassák, és támaszkodnak rá: az én időm is drága. Nyilván tök jó, hogy így összeszedem ezeket a dolgokat, plusz közzéteszem vele együtt a saját elemzésemet is — ugyanilyen jó, ha hivatkoznak is rá, amikor innét találnak hasznos anyagokat és információkat. Habilitált docens vagyok a Corvinuson, úgyhogy igazán nem kell szemérmesen elhallgatni a forrást.

2020.06.19.

2020.06.20-21.

  • Készül Trump nagy kampányeseménye Tulsában, Oklahomában. Állítólag tesznek majd ki maszkokat is önkéntes használatra, de a résztvevők számára mostanra vallási kérdés, hogy nem nagyon akarnak ilyesmit viselni. Figyelembe véve a paramétereket (résztvevők száma, fertőzöttek vélhető aránya a populációban, szuperterjesztők vélhető aránya stb., akár néhány száz fertőzés is összejöhet egy ilyen alkalommal).
  • Floridában betelőben a kórházi intenzív osztályok. (Arizona sem áll jól.)
  • A CFR nálunk tovább nőtt, most már 13,95%.
  • 18 éves COVID-beteg férfi kettős tüdőátültetése Olaszországban.
  • Ez a cikk megy most köröket a magyar interneten. Országok erős BCG-átoltottsággal és anélkül, összehasonlítva. Kár, hogy nem is. Mert miközben a teljes adatuniverzumra elvégezhető lenne az elemzés, a szerző kiválasztott nyolc ilyen + nyolc olyan országot. Az önkényes szelekció pedig nem túl meglepő módon torzítja az BCG-átoltottság szerepének megítélését, nem reprezentatív. Type I error. Itt lehet tanulmányozni a BCG-vel kapcsolatos országadatokat. 

2020.06.22-23.

    • A húsfeldolgozók (pl. Gütersloh) hatása az R0-ra Németországban. A Bundeswehr is részt vesz a tömeges tesztelés megszervezésében a környéken, és elképzelhető, hogy lesznek mobilitási korlátozások is.
    • Victoria állam, Ausztrália. Családi és szállodai klaszterek.
    • Egyre inkább úgy találják sokan, hogy a terjedésben a kb. 20%-ot kitevő szuperterjesztők játszhatják a domináns szerepet, miközben mások nem terjesztők egyáltalán. A szuperterjesztők jelentőségét illetően nem kételkedem, a tömeges nem-terjesztésben viszont nagyon is. Azért itt egy hongkongi tanulmány is, amelyik a szuperterjesztők dominanciáját találja megállapíthatónak. Mint az alábbi ábrán látható, sok volt a "szociális" közegben történő terjedés (baráti kör, szabadidős tevékenység másokkal), és a munka- és a családi kapcsolatok kisebb szerepet játszottak az itt megfigyelt esetekben. Ez a szórakozóhelyeknek, a tornatermeknek vagy éppen a bent fogyasztó vendégekben reménykedő éttermeknek pl. rossz hír lehetne, ha a politikusoknak az emberi élet védelme lenne a legfontosabb. (Mondjuk ahhoz elég hosszú azért a memóriám, hogy emlékezzek, Kínában pont a háztartáson belüli transzmissziót találták gyakorinak, és ez vezetett anno az erős aeroszolizáció feltételezésével szembemenő következtetésre. Mostanra viszonylag egyértelműen látszik, hogy van itt ez is, az is.)

 sarscov2_hongkongstudy_superspreadingdominates.png

2020.06.24-25.

  • A járvány kezelése Thaiföldön. Nagy hangsúlyt fektettek a kapcsolatkövetésre, mivel az költséghatékony. A lakosság fegyelmezett maszkviselőnek bizonyult — 95%-os normakövetés, azt írja a cikk. A piroslámpás iparágat nagyrészt leállították a járvány idejére.
  • Jájj. Eddig nem figyeltem, miket mondott Trump Tulsában, a kampánygyűlésén, pedig kitett magáért most is. Hogy ő lelassíttatta a tesztelést, hogy ne legyen már annyi eset, és azzal együtt hülyenegatívsajtó. Később persze elmondta azt is, hogy nem azt mondta, amit mindenki hallott, hogy mondott.
  • Nálunk közben meghaladta a 14%-ot a CFR.
  • Izrael: hogyan lesz egy 24 éves kosárlabdázó srác magas vérnyomásos, vérhígító tartós szedésére utalt, depressziós stb. A COVID-tól.
  • Nem fáradnék a link előkeresésével. John Ioannidis kihozta egy paperében, hogy 0,04% körül lehet a SARS-CoV-2 fertőzés-halálozási aránya. Miközben Belgiumnak lassan a 0,1%-a halott a járvány miatt. Ezt az embert tegnap kellett volna kidobni a Stanfordról. Vagy nem is tudom... muszáj volt egyáltalán beengedni oda?
  • Másik kedvenceim, a svédek kormányzatilag panaszkodnak, hogy a környező országok utazási korlátozásai velük szemben "mindennél fájdalmasabbak". Azért egy COVID-betegnek lehet, hogy vannak nagyobb fájdalmai is.
  • Az utazási korlátozások feloldásánál pedig ez a felelős megközelítés. Buborékképzés. Például ezt csinálja Új-Zéland a Fidzsi-szigetekkel. Ők nem kicsit következetesebben, mint az európai kormányok, de azért még az európai kormányokat is foglalkoztatja valamennyire, hogy kinek nyitják ki az ajtót a járványügyi megfontolásokat figyelembe véve.
  • Az Egyesült Királyságban végül elég lesz 1-2 méter az emberek közé a tömött szórakozóhelyeken. Nem bízzák a véletlenre.
  • Itt említik, hogy már Egyiptomban is meghalt közel-száz eü. dolgozó. Ez globálisan már 1500+ eü. dolgozó így.
  • A COVID-19 esetenként diabéteszhez vezethet. In vitro tenyésztett hasnyálmirigyekkel is vannak eredmények, de az organoidos eredmények mellé még további kutatás kell majd.
  • Houston, you have a problem.
  • Tanulmány nőkről (n=91412, CDC). A terhes nők 31,5%-a kapott kórházi kezelést (mondjuk a nagyobb arány részben nyilván az extra óvatosság következménye is, megjegyzem). A nem-terhes nőknek csak 5,8%-a. 
  • A probléma léptéke: az Egyesült Királyságban jelenleg százezres nagyságrendben kellene önkaranténezniük magukat az embereknek ahhoz, hogy a terjedés kezelhető legyen (ez a kapcsolatkövetésből gyűjtött adatok eredménye; meg is kérték az érintetteket egyébként).
  • Még pár gondolat az Egyesült Államokról. Breonna Taylor eü. dolgozó lelövése után nem volt még robbanás — március közepén —, mivel éppen akkor mindenki inkább bezárkózott. Pedig az az incidens is tökéletes lehetett volna gyújtózsinórnak. Derek Chauvin rendőr brutalitása félelmetesen hatékony időzítéssel gyújtotta lángra a közharagot. Mi lesz, ha legközelebb a rendőrségnek széles körű kijárási korlátozásokat kell majd betartatnia tömegekkel? A járványügyi helyzet ebbe az irányba tart.

2020.06.26-28.

  • Jemenben azon versenyeznek a houthik és a kormányerők által ellenőrzött régiók, hogy ki tudja jobban eltagadni a járványt.
  • Az utóhatások, miután szociopata, valóságtagadó politikusok elhitetik a népekkel, hogy a gravitáció véleménykérdés. 
  • UK, élelmiszergyári kitörések, a terjedés terepének a közös étkezdei ebédelés és a közös kocsiztatás tűnik.
  • Ez egy jó kis elemzés (h/t @rdos). A regressziós modellből az jön ki, hogy a június 2-i esetszámot nagyban determinálja (85%-ig) a kijárási korlátozások bevezetésekori esetszám (a járványszerűen gördülő teher mértéke), az első eset és a kijárási korlátozások bevezetése között eltelt idő (gyors intézkedés), a tesztelés mennyisége, illetve a népsűrűség. A népsűrűség a legkevésbé jelentős. A kijárási korlátozások szigorúsága kevésbé számít, mint a gyorsaság, illetve a gördülő teher induláskori mértéke. A tesztelésmennyiség sajnos fontos "zaj" forrása viszont, mivel a magyarázandó változó értékének a bizonytalanságához kapcsolódik. A modell pontossága tehát leértékelődik azzal, ha olyan értékeket magyaráz jól, amelyek nem valósak — ezt kénytelen vagyok hozzátenni. De intuitíven nem tűnnek helytelennek a járványpolitika számára adódó következtetések (=több tesztelést; gyors, határozott intézkedést; szigorúság tekintetében a pragmatizmus megengedhető az előbbi kettő teljesülése esetén).
  • A franciák nem tudnak leakadni a HXQ együtt-használatáról azitromicinnel, de az eredmények náluk (n=3737, ebből 3119 kapta a HXQ-s kúrát, 618-an mást) a HXQ javára szólnak.
  • Orvosi protokollok témában itt a NEWS-pontszám számítási metódusa, ma találkoztam vele. Testhő 35 fok alatt +3 pont. 
  • A világgazdasági kilátások negatív módosulása (--4,9%) az IMF előrejelzésében (h/t @orsklutsch).
  • Miért van Peruban nagy járvány a hosszú lockdown ellenére is? Mindennap bevásárlás, nincs fridzsider a háztartások 40%-ában. 70% az informális gazdaságban dolgozik, nincs otthonmaradás. COVID-segélyt a bankban kell felvenni személyesen. Sok a túlzsúfolt háztartás.
  • Kenya, motorbicklis taxisok tüntetése a korlátozások ellen. A rendőrség három embert lelőtt. G.a.h.: +163192+n.
  • Ha elindul a dilivonat... Barcelonában 2019. márciusi szennyvíz-mintából sikerült (erősen gyaníthatóan fals) pozitívat kihozni. A kutatók 5 perccel "felfedezésük" után persze arra is rájöttek, hogy jó ez a kis médiahekknek is beillő reveláció, de azt sem árt majd hozzátenni, hogy "de nem tőlünk indult, mi ezzel nem azt mondjuk". Úgyhogy ezt rögtön hozzá is tették az eredményeikhez. Pedig ha annyira nyitottak a revizionizmusra, akkor miért ne lehetne akár nekiugrani a barcelonai élővilágnak? Vizsgálódjunk szabadon. Csak hát a józan észt ennyire nem vetkőzték le azért. Albert Bosch kutatásvezető nem átallotta azta mondani, hogy "sok a kínai Barcelonában", lehetséges magyarázatot sejtetőleg. Kedvenc kommentem a Twitterről: "Con esa basura de herramienta que es la PCR que usan para comprobar el virus sarscov2 van a encontrar este bicho hasta en muestras del pleistoceno". 
  • Másik kedvenc kommentem a témában: "El coronavirus es catalán", ami a spanyol (kasztíliai) kontextusban különösen ironikusan hat.
  • A sajtó ügyeletes idiótái persze most majd leírják kijelentő módban, hogy a vírus "már tavaly márciusban itt volt". 
  • A vírus szerkezetéről. Az RxxR furin hasítási hely itt RRAR, és ennek a papernek a szerzői in vitro azt tapasztalták, hogy a balról második R nélkül a furin általi hasítás nem működik jól. Vagyis ez egy funkcionálisan optimalizáltan jól működő szerkezeti alegység. Ez a tanulmány viszont arra jut, hogy a furin fontos, de a TMPRSS2 (transzmembrán szerin proteáz 2-es) általi hasíthatóság is fontos, és mindkettőre szükség van, ami feltételessé teszi a furin hasítási hely jelentőségét.
  • A strandolásról. Kedves sajtó! Kicsit azért szabad gondolkodni. Nem a parton heverészéstől fog megfertőződni a kedves fürdőző. Nem is attól, hogy a következő család másfél vagy két méterre van-e tőle a parton, szellős kültéren. Akkor fertőződnek meg, amikor mennek harapni vagy inni valamit. Vagy éppen mosdót használni. Sorban állnak, tömeggel vegyülnek. Kézmosás nélkül összefogdosnak dolgokat. És persze nem mindegy, hogy egy háztartás tagjai vagy több háztartás tagjai mennek-e együtt a partra, mert az utóbbi esetben a keveredésük is a terjedés útja lehet.
  • A nem-házhozszállítós/helybeni éttermi költés és a koronavírus-esetszámok növekedésének összefüggése a JPMorgan elemzésében (Egyesült Államok).
  • Az új magyar tesztelési politika a régire vált vissza, mintha nem lenne tegnap, amiből bármit tanulhattunk volna. Ismert fertőzött kontaktod van-e? Tüneteket mutatsz-e? Ha nem, akkor nem vagy tesztelhető. Csakhogy ezt a betegséget gyakran preszimptomatikusan, 1-2 nappal az onset előtt álló emberek terjesztik — innentől így csak a kapcsolatkövetéssel integrált pro-aktív tesztelés menthetné a helyzetet, ha jön a második hullám, és ezúttal kevésbé szerencsésen alakulnak a dolgok.  
  • Egy jó interjú arról (Kucsera Csaba szociológussal), miért nagyon gáz differenciálatlanul "idősözni" a koronavírus-járvány kontextusában, úgy, ahogyan az jellemzően történik. 

2020.06.29-30.

  • Michigani étterem, ahonnét villámgyorsan szétterjedt a koronavírus. Michigani bár, ahol megtörtént ugyanez. Ilyen "hatékonysághoz" talán a személyzet fertőzöttsége és a légkondi is szükséges lehetett, megkockáztatom (ottani viszonylatban meleg van most arrafelé).
  • A barcelonai "pozitív" eredményről közben megtudtam, hogy negatív kontroll nélkül végezték; egy vizsgálatra elég mintájuk volt fagyasztott szennyvízből, amit ezzel el is használtak; az eredményük pedig késői (39. ciklusban történt!) amplifikáció volt az RdRp-t kódoló génre (IP2 és IP4), amelyik a legkevésbé megbízható teszt valódi pozitivitás tekintetében (specificity), és ezért korroborációnak az E génre pozitív teszt elvárt általános protokoll szerint (és az itt negatív eredményt hozott). Tegyük hozzá, hogy ezen kívül már "csak" a józan ész szól az ellen, hogy Barcelonában 2019. márciusában SARS-járvány lett volna. Az, hogy egy ilyen eredménnyel a médiához rohantak az egyetemi sajtósok... Inkább nem is kommentálom. Aki akarja, érti.
  • Van némi izgalom a poliooltás immunstimuláns (nem-specifikus) használatával kapcsolatban (a koronavírus elleni védekezésként), csak hát a polio kapcsán elég hosszú a memóriám, hogy Szíriából emlékezzek a cVDPV (circulating vaccine-derived poliovirus) okozta járványos megbetegedésekre néhány évvel ez előttről. Ez a beoltott személyekkel kapcsolatba kerülő átoltatlan népességre jelent veszélyt.
  • Nálunk a "bemeneti" CFR (halottak / összes, eddig felderített eset) közben 14,02% a reggeli adatok beérkezte előtt. Az új adatokkal 14,11%, miután négyen meghaltak, és csak három új esetet sikerült találni. Ehhez tegyük hozzá, hogy a halálozás kb. háromhetes késést tartalmazó indikátor, és látszik, hogy baj van a felderítéssel. Márpedig csak a felderítés alapján tudhatnánk időben, ha baj van. (Ha valaki a bemeneti CFR terminuson töri a fejét, a kimeneti nálam a halottak / halottak+gyógyultak arány, vagyis a lezárt eseteken belüli arány, ami most 17,8% nálunk).
  • A Vox anyaga a rendőri militarizációról az Egyesült Államokban, így többek között az 1990-ből eredő 1033-as program szerepéről is, amivel a katonaság által leselejtezett eszközöket (gépkarabélyokat, aknabiztos járműveket stb.) beszerezheti az alsó-bölényfalvi rendőri erő is. Mindez a közelmúlt robbanásában nagy szerepet játszott, értelemszerűen.
  • Most már biztosabban lehet tudni: Bálint György, azaz "Bálint gazda" koronavírusos volt. Három teszt kellett, míg lett egy pozitív eredménye, ami kérdéseket vet fel bennem a teszt szenzitivitásának esetlegesen kritikusan rossz voltát illetően — és hogy ez mennyire befolyásolja náluk a járványügyi felderítést úgy általában, látva a már említett, felszökőben lévő CFR-t. Közben a mintavétel is lehet persze rossz, ha nem elég gondosan csinálják, például mert nem elég jók az eszközök hozzá. Éppen a napokban láttam a tévében olyan mintavételt, ahol a szájpadlásról gyűjtöttek hozzá egy kis nyálat törletnek, ami sajnos nem igazán eredményes módszer.
  • Hörcsögös tanulmány. A maszkviselés véd. Előbb másokat, de még a felhasználót is. De azért legyünk rá felkészülve, hogy akár idősebb embereknek is el kellhet magyaráznunk, hogy ha maszkot viselünk a jelenlétükben, az nem azt jelenti, hogy "mi jobban félünk, mint ők", hanem hogy legelőször is őket védjük ezzel magunktól. Mi tőlük pedig kevésbé leszünk megvédve, mint ők tőlünk. Úgyhogy ne aggódjanak, mi bátrak vagyunk. Személyes élmény alapján...

sarscov2_hamsters.jpg

  • Az EU az amerikaiaknak nem tervezni megnyitni a határait július 1-től. Közegészségügyi szempontból csak azt lehet mondani, hogy szerencsére. 
  • Alakulóban a lista még, így néz ki a BBC szerint mostAlgeria, Australia, Canada, Georgia, Japan, Montenegro, Morocco, New Zealand, Rwanda, Serbia, South Korea, Thailand, Tunisia and Uruguay. Algériánál, Marokkónál nyilván a francia befolyás segíthetett, hogy beférjenek, mert azért ideálisnak nem nevezhető a helyzetük. De ha már itt tartunk, Kanadáé sem. És Ausztrália sem kifejezetten "biztonságos" annyira. De persze Európa sem az. A listáról QMV-döntés születik (országok 55+%-a, a népesség 65+%-ával). A demokráciadeficit szó itt azért eszembe jut. A BBC szerint a németek és a spanyolok óvatosak akartak lenni (a németekről elhiszem), a görögök és a portugálok viszont nem annyira (turizmusérdek). Halkan megjegyzem, hogy aranystenderd tekintetében a beutazási kockázat menedzselésénél valószínűségekből kell kiindulni, és népességarányosan nézni a fertőzöttség előfordulását (aktív esetek százezer főre). Ha a menedzselés, azaz nem az elkerülés a cél. Itt, úgy tűnik, ez a helyzet.
  • Megint a Voxtól. Miért van annyi fülöp-szigeteki ápoló az Egyesült Államokban? Hogyan alakult ki az ehhez kapcsolódó migrációs csatorna, a maga push és pull tényezőivel, stakeholdereivel. Adat innen: 2018-ban 141 ezer fülöp-szigeteki ápoló volt az USA-ban, 371 ezer további külföldi születésű ápoló máshonnan. A COVID-válságban májusig harmincan haltak meg közülük.
  • Kínában átment a nemzetbiztonsági törvény, ami annyira nemzetbiztonsági, hogy ez alapján még nemzetbiztonságot is lehet majd tanítani hongkongi iskolásoknak.
  • Új H1N1 a láthatáron?
  • Narendra Modi létrehozta a PM Cares pénzügyi alapot Indiában (Prime Minister's Citizen Assistance and Relief in Emergency Situations). Látszólag az amerikai mintára, ahol van a gazdasági segítségnyújtáshoz egyének és vállalatok számára a Coronavirus Aid, Relief, and Economic Security Act, azaz a CARES Act. Csak ez itt "PM Cares", és ez így a szokásos "a politikusbácsi (a te pénzedből) szeret téged, törődik veled" című sláger lenyomása is, amit máig megdöbbentő lelkesedéssel zabálnak az emberek világszerte.
  • Ma (06.30.) 10 új fertőzöttet találtak Magyarországon, és itt van mellé ez a hír: 10 váci kézilabdázó pozitív. Az van, kedves honfitársaim, hogy ez a 10 ember kapta valakitől a fertőzést. Lehet, hogy az intézményeink úgy érzik, a munkájuk el van végezve, de kérdezném, hogy egészen komolyan a sportolók jelentik azt a populációt, amelyet fokozottan kívánunk védeni másokhoz képest...?
  • Újabb példa a járvány rejtett áldozataira. Egy ópioidfüggő hölgy halála az Egyesült Államokban, aki a tanácsadás és a gyógykezelés elmaradása miatt esett vissza, és halt meg, vélhetően fentaniltúladagolásban. G.a.h.: +163192+n.

Holnaptól új bejegyzésben folytatom!

A koronavírus-járvány a lazítások után II.

Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

2020.06.02.

  • Tüdőátültetés koronavírusra pozitív betegnél, aki már hosszabb ideje ecmós/műtüdős kezelésen volt, magyar orvos csinálta, Lang György, de Klagenfurtban Bécsben, amúgy a világon először (víruspozitív betegnél). Erről a műtétről remélem, hamarosan részletesen is olvashatunk. Gratulálunk!
  • John Oliver — a voting-by-mail és általában a szavazás kihívásairól, koronavírus idején. Az az igazság, hogy JO vicces, mint általában, de itt az elemzés nem tökéletes. A csalások lehetőségét pl. egyének szempontjából nézi, miközben az ilyesmi szervezett politikai bűnözés részeként valósulhat meg elsősorban.
  • Arról, hogyan "épül föl" egy "látványos" gazdasági mentőcsomag.
  • A Twin Cities Riots kapcsán komolyan elszabadulóban az őrület. Sok az erőszakos eset, erőszakos rendőrök, erőszakos tüntetők, erőszakos ellentüntetők mind vannak, és persze az interneten is mindenki mindent megtesz az aktivizmus jegyében, ami elképzelhető, a milíciaszcénára épülő szélsőjobbtól a szélsőbal Antifáig. A karanténból eleve frusztráltan, sok esetben állástalanul kitörni készülő embereket sikerült jól felhergelni, a minneapolisi rendőrök lángra lobbantották a parázsló tüzet. Louisville-ben, Kentuckyban a rendőröknek sikerült megint teljesen értelmetlenül megölniük valakit, véletlenül fekete-amerikai az illető. És ebben még a Nemzeti Gárda is benne volt. Washington, D.C.-ben egy ausztrál stáb operatőrét ütötte meg egy rohamrendőr ököllel az immár megszokott, rendkívül szakszerű intézkedés jegyében.
  • Ha lenne oltás, tízből heten adatnák be maguknak (USA). Ha republikánusokról beszélünk, akkor csak tízből hatan. Jut eszembe, milyen szuper lesz, amennyiben lesz egyáltalán oltás, most már nem egy, hanem két szezonális oltásra befizetni évente. A "just the flu" tábor erről vajon mit gondol? "Just another flu?"
  • A KKP stratégiája szempontjából jó időzítéssel jelentkező koronavírusos klaszter Hongkongban, lehet korlátozni a gyülekezés lehetőségét a social distancing jegyében.
  • Minnesotából is hallottam egyébként olyat, hogy a tüntetéseken őrizetbe vetteknél "kapcsolatkutatást" csináltak, volt képük konkrétan contact-tracingnek leírni és eü. indoklást adni hozzá.
  • Ismét vissza Kínához. Az AP által megszerzett belső információk szerint a WHO is éppen eléggé frusztrált volt a kínai együttműködési készség korlátaival januárban, a járvány elején. (Itt az AP cikke is.) Többek között a vírusgenom megosztása sem zajlott olyan készségesen, mint azt utóbb többek beállították.
  • Az első megerősített koronavírusos haláleset Cox's Bazarban, a rohingja menekültek között Bangladesben.

2020.06.03.

  • Törökországban jók az eredmények a hidroxiklorokinnal, és, ami nagyon fontos, a HXQ-t korai kezelésként adják, hiszen vírusreplikáció ellen való, és ezt a kiterjedt és gyors tesztelésük és kapcsolatkövető munkájuk teszi lehetővé. 
  • Újabb hangok a tudomány világából, akik a SARS-CoV-2 eredetét firtatják, alapvetően már korábban tárgyalt okokból (emlékeztetőül: filogenetikai rendetlenség, furcsa pontmutációs mintázat az RaTG-13-as denevér-koronavírussal összevetésben, időarányosan csekély genetikai polimorfizmus a SARS-CoV-1-essel összevetésben; miközben az E protein ezzel együtt is szignifikánsan mutálódik a 0%-os baseline-különbséghez képest az RaTG-13-assal összevetésben; a patogenitást kritikus mértékben fokozó furin hasítási hely beszúródása; a vírus eleve adott jó adaptálódottsága nyérceknél és vadászmenyéteknél (is) + hogy egy ilyen vírus pont Wuhanból indul).
  • Most láttam adatokat a német, brit, olasz és amerikai mobilitási adatokról. A németek 34%-kal az alapvonal-érték felett, az Egyesült Államok 8%-on, az olaszok -11%-on, a britek -22%-on (a hétközi cikluscsúcson).
  • Egy olasz orvos, Alberto Zangrillo, a milánói San Raffele kórház főorvosa bedobta a diskurzusba, hogy a koronavírus veszít a virulenciájából, és már nem mérnek olyan vírusszámokat, mint korábban, a teszteltek mintáiban. Ez nagyon érdekes, csak az a probléma, hogy akik világszinten nézik a járványt, mint pl. én, nem látnak ilyesmit az adatokban. A SARS-CoV-2 terjed és öl továbbra is, meleg éghajlaton is.
  • Oroszországban a koronavírus-osztályokon nyitva felejtett kórházi ablakok közegészségügyi fenyegetése fokozódik, ez már a negyedik eset. G.a.h.: +75049+n.
  • Hu Weifeng 42 éves urológus orvos Wuhanból (Li Wenliang kollégája volt) négy hónapi kezelés után hunyt el. Még áprilisban agyi vérömleny keletkezett nála, azóta kómában volt.
  • Orosz és kínai részről a szokásos wedge-driving (éket verő) stratégiát nyomatják a társadalmi médián keresztül az Egyesült Államokban a Twin Cities Riots kapcsán.
  • Akik ennek a vírusnak a kontextusában "V-shaped recovery"-t (VSR) emlegettek, eddig jellemzően a gazdaság talpra állásáról beszéltek, méghozzá optimistán. Iránban a járványügyi lazítások után látható mostanra egy perfekt VSR, csakhogy ez itt sajnos a vírus terjedésére vonatkozik :(
  • Apropó, gazdaság: a Világbank előrejelzése szerint a globális szegénység nőni fog a koronavírus-recesszió miatt, az ázsiai pénzügyi válság óta először, 8,2-ről 8,6%-ra. Plusz 30+ millió ember, akik napi 1,9 dollár alatt élnének majd, ezek szerint.
  • Egy in silico tanulmány, szóval várni kell, mielőtt bárhová ugrik ez alapján az ember (ahogyan korábban a SARS-CoV-2 porfirinhoz kötődéséről szólónál is), de ha bejön, ami itt kijött, átnevezem a SARS-CoV-2-t a humán jackpot vírusnak. A furin hasítási hely már eddig is komoly érdeklődés tárgya volt, de a tetejében ennek a szerkezete — (P)RRAR--SVAS — egyezni látszik a humán epitheliális sejtek nátriumcsatorna alfa-alegységének (ez is egy transzmembrán protein, mint az ACE2) furin által hasított részével (ENaC-α; RRAR--SVAS szekvenciával). Ha ez így van élő sejtekben is, akkor ez plusz egy kellemetlen betegségmechanizmus lehet, mivel ez a sejtek sóháztartását zavarja meg.
  • A furin hasítási helynek egyébként már beceneve is van az amerikai diskurzusban: "the new hanging chad". Ez visszautalás a 2000-es elnökválasztás során Floridában történtekre. Akkoriban ott lyuggatókártyás voksolást használtak, és, ahogyan a BKV-jegyeken is előfordul, a lyuggatás nem sikerült mindig tökéletesen. Sokszor nem. A "chad", vagyis a lyukfecni, hogy erre kifejezést rögtönözzek, lóghatott a lyuk szélétől egy el nem szakadt ponton ("hanging chad"), vagy éppen a papír domborulatából látszott, hogy ott alighanem át kellett volna ütnie a gépnek a papírt a választó akarata szerint ("pregnant chad"). Márpedig a 2000-es floridai egy olyan választás volt, amin az egész elnökválasztás állt vagy bukott Al Gore szempontjából (it was hanging in the air...). Ám a Legfelsőbb Bíróság végül leállította a floridai szavazatok újraszámlálását, és így ifj. Bush vitte el a floridai elektorokat anélkül, hogy az újraszámlálás végeredménye alapján tudnánk, hogyan befolyásolták a lógós lyukfecnik az eredményt. Ezek után érthető lehet, hogy a kifejezés a SARS-CoV-2 eredetével kapcsolatos kételyekre utal.

2020.06.04.

  • Ezt már akartam linkelni korábban, Anders Tegnell félig-meddig beismerte, hogy tévedett. Ebben-abban. A helyzet az, hogy Svédország egymagában is sokat tett a járványhelyzet világszintű romlásáért. Persze messze nem minden rajtuk múlott, de a hatásuk világszintű volt.
  • Dr. Hansen George Floyd haláláról, precízen. (Közben kiderült egyébként, hogy még áprilisban átesett a koronavíruson. Az orrából vett post-mortem minta pozitív. Viszont már április 3-án pozitív volt, szóval itt csak a vírus-RNS-töredékek kimutatásáról van szó, nem aktív fertőzésről.)
  • Egy videó a tüntetésekkel párhuzamosan zajló fosztogatásokról. Azt érdemes látni, hogy a kereskedőnek ez rossz, de a márkák nyernek rajta, baromi jó reklám nekik, és ez is állandósít egy állapotot, ahol oktatás és egyéb befektetések helyett a surranók lesznek magasabbra értékeltek jelentős tömegek által. A surranók beszerzését (is) megnehezítő, és ezeket annál értékesebbé emelő jövedelmi különbségekről (az Egyesült Államokban) érdemes megnézni ezt a rövid dokut. A békés tüntetéseket hiányolók pedig nem ártana, ha belátnák, hogy csak azért, mert ki tudják keresni a legdurvább híreket, amik az előfeltevéseikben megerősítik őket, most is békés a tüntetések nagyobb része. De ha már békés tüntetésekről beszélünk, érdemes visszanézni, hogyan reagált Donald Trump a fekete NFL-játékosok békés tüntetésére 2016-ban — hogy mennyire hisz ez az ember a szólásszabadságban. Leginkább a saját szólásszabadságában hisz, elvei nyilvánvalóan nincsenek.
  • Mexikóban tegnap 1092-en haltak meg hivatalosan COVID-19-ben. 
  • Nálunk 406 beteget ápolnak közben kórházban. Húsz százalékos hospitalizációs rátából kivetítve az 2030 aktív esetet jelenthet, bár ez erősen bizonytalan, mert aki enyhén beteg, 5-10 nap alatt túl lehet rajta, a kórházba kerülők pedig sokáig ott maradhatnak, kezelésre szorulva. A 13,63%-os CFR-t torznak feltételezve, 2%-os CFR-ből kiindulva 26950 jön ki teljes esetszámként, amiben már lezárult esetek is benne vannak úgy. 
  • A Reuters külön statisztikát vezet az Egyesült Királyságban elhunytakról, akiknél a halotti bizonyítvány említi a COVID-19-et. Ebben persze lehet olyan is, akinek a fejére esett egy tégla, miközben fertőzött volt. Így tartanak június 3-ig 50059-nél. Ezt a "téglás" esetekre tekintettel leviszem 49 ezerre, majd levonok belőle egy tizenkettedet, tekintettel arra, hogy szezonális átlagot meghaladó halálozást egy április közepi hétre már figyelembe vettem, és 12 hete van COVID-19-es halálozás az Egyesült Királyságban. Így jön ki akkor 44917 (ez konzervatív számítás, mivel az említett áprilisi hét valójában kiemelkedő halálozást hozott, nem átlagosat, a 12 hetes időszakot tekintve). Június 3-ig volt 39728 haláleset hivatalosan, a különbözet így 5189. G.a.h.: +80238+n. Ugyanez a cikk említ egyébként 62 ezres szezonális átlagot meghaladó halálozást erre az évre, lásd itt is és itt is. Utóbbi forrásból végre kiderül, hogy ez a március 21-től május 22-ig terjedő 9 hetes időszakra értendő. Ha ebből levonok 11854-et (április 11-17-es adat, amit ismertem korábban), akkor marad 50146. Ha ezek után az (50146-44917)/4 formulával számolok, extra konzervatívan (hogy a 44917-es érték lefelé becslő voltát tekintetbe vegyem, ami itt máskülönben inflálná a g.a.h. mutatót), akkor g.a.h.: +80238+1307+n=81545+n. 1000 bocs a sok számért — így lehet ennyi különféle adatból valami valósághoz közelit kihozni.
  • A prosztataműtéten átesett, vagy éppen a férfiasan kopasz férfiak és egyéb releváns alpopulációk vizsgálata alapján egyre jobban látszik az androgén hormonok és a rosszabb COVID-19-es mortalitás közötti összefüggés.
  • Moszkva, Dagesztán és Cseljabinszk után Szentpétervárról is vannak adatok a szezonális átlagot meghaladó halálozásról. Májusban +1400 haláleset az évtizedes átlaghoz képest. Hivatalosan csak 171 a halottak száma. Ha az 1400 felével nézem a különbözetet, akkor g.a.h.: +82074+n.
  • Úgy tűnik, sokan betegek hónapokig enyhénél rosszabb tünetekkel. Csoportjuk is van a Facebookon. Sokan fiatalok.

2020.06.05.

  • Új-Zéland lehet az első országok egyike (az első az OECD-országok közül), amelyik száznál több eset után eljuthat a járvány teljes felszámolásáig. Még van egy aktív esetük. Ha a dolog összejön, és végül a beutazás is lehetséges lesz, onnantól új típusú izgalmak kezdődnek.
  • Jemenben elapadóban a segély, elsősorban az Öböl-országok miatt, akik eddig a fő donorok voltak (érdekeltségükből adódóan szórtak a bombák mellé pénzt is Jemenre). Az OCHA (humanitárius ügyek hivatala, ENSZ) részéről így látják a dolgot: "General health services in 189 of the country's 369 hospitals start to close in three weeks. Water and sanitation services for 8.5 million people, including 3 million children, close in three weeks. Nutrition support for 2.5 million malnourished starving children will start to close in eight to 10 weeks."
  • A Lancetben megjelents HXQ-tanulmányt a Surgisphere cég bizarr és hozzáférhetetlen adataival visszavonták.
  • Magyarországon 16 új eset tegnap, 3 haláleset mellett. Emlékeztetőül: 2%-os valós CFR-t feltételezve azt, ha nálunk közben 13% feletti a nominális CFR (az összes regisztrált esetet tekintve), és tovább nő, csak úgy lehet értelmezni, hogy a járvány felderítetlensége is növekszik vele együtt. Az lehet, hogy nyáron kevesebb a súlyos eset, de erről jobb lenne biztosat tudni, és nem csak spekulálni, különösen az exponenciális növekedés lehetőségére tekintettel.
  • Törökország, kijárási korlátozások.
  • Trump 1990-ben lájkolta, amit a Tienanmen téren látott 1989-ben. A teljes releváns idézet: "A: (...) Russia is out of control and the leadership knows it. That’s my problem with Gorbachev. Not a firm enough hand. Q: You mean firm hand as in China? A: When the students poured into Tiananmen Square, the Chinese government almost blew it. Then they were vicious, they were horrible, but they put it down with strength. That shows you the power of strength." (Q=Question, A=Answer) A lelet talán legsokkolóbb vonatkozása, hogy ezek szerint tud következetes lenni.
  • A University of Minnesota kísérlete a HXQ post-exposure prophylaxisként történő használatával. Interneten át lehetett résztvevőnek beszállni, önbevallás alapján azonosított kitettség nyomán, önbevallás alapján azonosított, teszt útján meg nem erősített megbetegedésekben számolva az eredményt a kísérleti és a kontrollcsoportban (n=821). A kontrollok 14,3%-ban, a HXQ-t szedők 11,8%-ban betegedtek meg, ami statisztikailag nem szignifikáns. Csak sajnos ezzel a módszertannal semmi nem tud olyan nagyon szignifikáns lenni, az a bajom :( Ez így nem egy szabályos RCT.
  • A stroke és a neurológiai problémák diagnosztizálásának és kezelésének nehézségeiről COVID-nél. Reflexek és koordináció vizsgálata szedálásnál kizárva. MRI-re átvinni nem lehet csak úgy az intenzívről, ráadásul fertőzésveszélyhez vezet. A hordozható MRI épp oly jól jöhet, mint a tüdőnél a hordozható ultrahang. By the way, a cikk arra is kitér, hogy a lélegeztetőgépen leszedálva tartott betegek 70-75%-ánál delíriumos állapot léphet fel.

2020.06.06.

  • Ezt a threadet fogom itt feldolgozgatni. Nagyon érdekes gondolatmenetekkel a SARS-CoV-2 lehetséges eredetéről. A szót William Gallagher végzi (mikrobiológus). Az RaTG13 és a SARS-CoV-2 S-fehérjéjét nézi, a furin hasítási hellyel az S1/S2 funkcionálisegység-határon, és az azt kódoló nukleotidszekvenciát, 288 nukleotid hosszúságban. Miközben az aminosavszekvencia a furin hasítási helyet leszámítva egyezést mutat, a nukeotidszekvencia 19 pontmutációt tartalmaz kodonok ingatag pozíciójú (wobble-position) záró nukleotidjainál (6,6%-os eltérés). Ezek mutálódásának időigényét illetően Gallagher a H1N1 influenzavírus analógiáját veszi alapul, és az alapján végez tMRCA-elemzést (time to Most Recent Common Ancestor). Így jön ki a threadben némi korrekció után -38,5 év számítása szerint az RaTG13 és a SARS-CoV-2 közös elődjének, illetve az evolúciós szétválás pillanatának időbeli helyeként. Megjegyzés: túl azon, hogy a tMRCA becslésében vannak bizonytalanságok, szerény ismereteim alapján elég furánk tűnik nekem, hogy két eltérő RNS-vírusnál ilyen lazán azonos változás-időigényt feltételezzünk. Ha a koronavírus pl. lassabban mutálódik, akkor a 19 pontmutáció különbséget wobble positionöknél egy ekkora szakaszon hosszabb idő elteltével lehetne csak magyarázni... nem? (Módszertani megjegyzés: "The reliability of (tMRCA) analysis is dependent on the validity of the molecular clock hypothesis, which assumes that the evolutionary rate is roughly constant in the lineages of a phylogenetic tree".)
  • A 12 nuleotidos szekvencia a PRRA-beszúródás hátterében: CCTCGGCGGGCA (a T helyére U-t kell igazából képzelni, timin helyett uracilt, mivel ez RNS, nem DNS). Gallagher ezek után a Rousettus-repülőkutyákból/nagydenevérektől izolált HKU9-es denevér-CoV esetében talál hasonló szekvenciát egy résnyi hibával, amit egy copy-choice (másolási) hibával magyaráz, vagyis hogy egy sejtben, ahol egyszerre két különböző vírus replikálódott, a replikációhoz használt RNS-dependens RNS-polimeráz rosszul másolt, és így keveredett be egy elem máshonnan. Megjegyzés: színkóddal jelölöm az így magyarázott egyezést a furin hasítási helynél (zölddel), a furin hasítási helyen kívüli egyezést (sötétkékkel), pirossal egy elárvult adenint (A) a furin hasítási helyet kódoló szekvencia végén, és egy citozint a CTT kodon nyitó nuleotidjaként a SARS-CoV-2-nél, mert ennek fontos szerepe van.

HKU9 gcatttgtacaga------cctcggcgggcctctgt

CoV-2 tatcagactcagacttgctcctcggcgggcacgtagt

  • Az előző pont végén említett citozinnal együtt bekerül a szekvenciába egy palindróma: CAGAC (aláhúzva fent). Gallagher elmélete szerint ez idézte elő az RNS-polimeráz által elkövetett copy-choice hibát, és hogy az bemásolt egy ilyen, vagy nagyon hasonló, később csendesen mutálódott szakaszt a HKU9-ből (megj.: a GCC és a GCA is alanint kódol, tehát PRRA-t látunk a HKU9-esnél is). Alapvetően az RNS-polimeráz "dadogásáról" (stuttering) volna tehát szó ezek szerint.
  • Még egy megjegyzés: a furin hasítási hely a PRRAR szekvenciával teljes, tehát a beszúródáson túl van plusz egy arginin (R) ott. Azt CGT nuleotidszekvencia kódolja, úgyhogy ezt meg lilával jelölöm a SARS-CoV-2 nukleotidszekvenciájában.
  • A következő kritikus állítás ezek után az, hogy Jünnan tartományban, ahonnan az RaTG13-ast fellelték, a Rhinolophus affinis egy példányából (közepes termetű patkósorrú denevérből), a Rousettus-repülőkutyák/nagydenevérek is előfordulnak, és a két faj képviselői így gyakran osztoznak barlangi tereken. (A tobzoskákról hozzáteszi, hogy azok elég félős, magányos lények, úgyhogy messze nem ideális jelöltek rendszeres oda-vissza fertőződés lehetséges alanyaként denevérekkel.)
  • Következtetés: az a bizonyos "new hanging chad" még sok vitát fog szülni, mivel "Gallagher (denevérsejtekben) dadogó RNS-polimeráz elmélete" is csak egy további elmélet, a nap végén, a "nem-konszenzusos (furin hasítási helyet tartalmazó) mutáció emberi sejtekkel való találkozás nyomán történt konszenzusossá válásáról szóló" és a "furin hasítási helyet beillesztő wuhani gain-of-function kutatások szerepét firtató" másik két elmélet mellé.
  • Más témák. 2,5 millió új állás májusban az amerikai gazdaságban, kicsit csökkentette ez a munkanélküliség durva megugrását (amúgy az azért még mindig magas). Kieg.: hmm. Ott is szeretnek játszani az ilyen adatokkal. A fizetés nélkülire küldött dolgozókkal a munkanélküliség inkább 16%-os lehet (ezzel a bruttó/effektív munkanélküliségi mutatóval áprilisban 20% körül lehetett).
  • San Joséban (USA) egy közösségi aktivistát, aki a rendőrséget a rasszizmussal kapcsolatban érzékenyítő tréningeket tartott rendszeresen, rendőrruhában gumilövedékkel lövöldöző gyerekek úgy meglőtték igazi ok nélkül, hogy nem biztos, hogy lehet még gyereke. A történet másik "szívet melengető" momentuma az autós említése, aki azért tett ki "Blue Lives Matter" (="a rendőrök élete is számít") matricát az autójára, hogy ne büntessék meg gyorshajtásért.
  • Trump közben ilyen reakciókat kap katonai körökből, miután a katonaság bevetését ígérgette a tüntetések ellen.
  • A járvány miatti intenzív, megelőző jellegű antibiotikumhasználat elleni ajánlások, a mikrobiális rezisztencia fokozódását elkerülendő.
  • Oxigénhiány Peruban.
  • A napokban szó esett itt az androgén hormonok szerepéről, és a kopaszodásról, mint rizikót indikáló faktorról. Mint kiderül, ezt "Gabrin-jelnek" is hívják újabban (Gabrin sign), Frank Gabrin miatt, akinek a története itt olvasható. New York-i sürgősségis orvos volt, COVID-ben halt meg.
  • Oroszországban elhunyt egészségügyi dolgozók listája. Sokan vannak. Jelen állás szerint 363-an, ami azt jelenti, hogy a hivatalos orosz halálozási adatok... ööö... különösek. (A fő listát külön, másik listán a más országokban meghaltak, vélhetően orosz állampolgárok követik, Moldovából, Ukrajnából, külön a Luhanszki Népköztársaságból (ЛНР), Belaruszból, Kirgizisztánból, Kazahsztánból.) Hogy ebből gyorsan valami értelmező adatot is generáljak: 179-n voltak közöttük 60 év alattiak (azaz a 60 éveseket már nem számoltam ebbe bele). Nem csak a 60 alattiakat nézve: 56 volt köztük dagesztáni, 96 moszkvai, 31 szentéptervári, 57 Moszkva körzetéből (Московская область), Jaroszlavszkaja oblaszty: 4, Krasznodar és körzete: 7, Komiföld: 3, Szentpétervár körzete (Ленинградская область): 5, Ingusföld: 2, Csecsen Köztársaság: 7, Uljanovszk: 2, Kurszk és körzete: 9, Nyizsnij Novgorod: 5, Ivanovszkaja oblaszty: 2, Penza: 7, Rosztov-na-Donu: 1, Észak-Oszétia: 6, Tatársztán: 2, Tula: 3.
  • A fenti adatot a 60 év alattiakról érdemes átgondolni stratégiaian. Különösen ott, ahol nincs elég orvosi PPE, az eü. személyzet nagy valószínűséggel erős dózisban kapja a vírust a transzmissziónál, akár többször is, ismételten. A halálozási mutató így akár rosszabb is lehet az általános populációénál esetükben. Ha csak eü. dolgozókat veszítenénk el miatta, ezt a járványt már akkor is fontos lenne megfelelően kezelni :(
  • Immunológiai vizsgálatból már korábban felvetődött, hogy lehet némi keresztimmunitás a hagyományosan az emberi populációban keringő koronavírusokkal. Didier Raoult is erre jutott Franciaországban, méghozzá a gyerekek alacsonyabb fertőzöttségét próbálja magyarázni ezzel. Itt beszél erről Raoult maga, messzire jutó következtetésekkel, amelyeket egyelőre azért finoman szólva nem sikerült megalapozni empirikusan. Figyelmet viszont érdemel a dolog, az biztos. Kompartmentmodellezésben pl. mekkora az S populáció (Susceptibles)? Hány embert kell átoltani? Meddig adott keresztvédettség, ha adott? Stb.
  • Palkovics László egyiptomi megfelelője, Khalid Atef Abdul Ghaffar állítólag azt nyilatkozta, hogy Egyiptomban már 9000 felett a halottak száma, azaz jóval több, mint a laboratóriumi úton megerősített (akkori) 959. Várnék ennek a figyelembe vételével, mert a közlő az Anadolu Agency állami török hírügynökség, és Törökország és Egyiptom nincsenek jóban Líbia miatt — utóbbi Haftarékat támogatja, előbbi az ENSZ által elismert vezetést, az ottani polgárháborúban.

2020.06.07.

2020.06.08.

  • Itt ez a friss paper, az egyik szerzője Yuri Deigin, akiről már írtam korábban, a másik Rossana Segreto (Innsbrucki Egyetem). Ezt fogom ma feldolgozni először is. Ez a "laboratóriumi eredet" elméletből indul ki.
  • Először is, a "PRRA beszúródásról". Ha úgy nézzük, akkor nem illeszkedik "keretbe", vagyis nem pont egy nukleotidhármas kodon határától egy másik kodon határáig tart, közrefogva 4 kodont. Lásd alább:

sarscov2_insertionoutofframe.jpg

    • A következtetés az RaTG13-as denevér-CoV-val összevetésben adódik, és az M789-es pangolin-CoV-val történő összevetés is megerősíti. TCA (RNS-nél igazából UCA) kódol a keret előtt egy szerint (S). A végén az adeninből (a) viszont uracil lesz (t, azaz helyesen u) a SARS-CoV-2-nél. Az adenin (a), ha úgy tetszik, a PRRA-t kódoló keret másik határa elé került itt át. A beszúródott rész így "UCCUCGGCGGGC". Ez akkor magyarázza az elárvult adenint. És a beszúródás akkor csak végeredményben PRRA.
    • Az arginint (R) kódolhatja CGG, CGC, CGA és CGU is, és a SARS-CoV-2 és az RaTG13 esetében az előforduló arginineket érdekes módon csak az esetek 5%-ában kódolja CGG. Itt pedig mindjárt két ilyen is van egymás mellett, és ezt Deigin és Segreto különösnek látják.
    • És itt jön egy kritikus állítás: "The CGGCGG insert includes a FauI restriction site, of which there are six instances in CoV2 and four instances in  RaTG13 (and 2 in MP789). The serendipitous location of the FauI site could allow using restriction fragment length polymorphism (RFLP) techniques for cloning or screening for mutations, as the new furin site is prone to deletions in vitro." Megjegyzés: a CGGCGGG lehet, így, együtt figyelemre méltó szekvencia ilyen szempontból, azaz akkor, ha az említett restrikciós enzimmel tördeléshez (az eljárásról bővebben) felismerőhelyet keresünk. Hogy itt a megfelelő irányból olvasva van ilyen (GGGCG), éppen a furin hasítási helyet létrehozó beszúródásnál, az érdekes lehet, erre utal a szöveg "szerencsés együttállásként" kutatói szempontból. A mondat vége pedig arra, amit Vero-E6-os majom-sejtkultúrákban lehetett látni laboratóriumban, vagyis hogy az emberi szervezetben a vírusnak a cutting edge-et biztosító furin hasítási hely gyorsan törlődni hajlamos — emiatt praktikus, hogy a restrikciós enzimmel gyorsan lehet szűrni mutációkra.
    • Szó esett korábban az RmYN02 denevér-CoV-ról, ahol van egy "PAA" a genomban. Ezt beszúródásként írták le, azzal, hogy lám, az ilyesmi természetes, Deiginék viszont közlik a ZC45-ös denevér-CoV genomjának megfelelő szakaszát, ahol látszik, hogy a PAA ott nem beszúródás, hanem inkább nem-csendes pontmutációs változás. Lásd alább. Zölddel bekereteztem az egyező aminosav-szekvenciákat. Megjegyzés: megnéztem közben a ZC45-ös szekvenciáját, hogy lássam, mi jön a jobb végen, amit ez a szelvény nem mutat, és az látszik, hogy konkrétan az RmYN02-ben törlődés van. Nemhogy nincs benne beszúródás, de rövidebb. RmYN02: SYNSPAA------RVGTNSIIAYAM. ZC45: SYHTASIL----RSTSQKAIVAYTM. (A 6/4 helykihagyás abban, ahogy leírtam, azt mutatja, ahol a SARS-CoV-2-nél PRRA van.)

sarscov2_rmyn02covnoinsertionjustmutation.jpg

  • Egy érdekes további részlet Deiginéktől, korrektül hivatkozva, szakfolyóiratban is meg lett írva annak idején. Az RaTG13 olyan bányából származott Tongguanzhenből (Mojiang, Yunnan; alternatív átírásban: Tian Junhua), amelyet denevérek kolonizáltak, majd a velük együtt a nyomaik (denevérguanó) kitakarítására odarendelt bányászok közül hatan súlyos tüdőgyulladást kaptak, és hárman meghaltak.Ez 2012-ben történt. Amit a kutatók az esetek egyik lehetséges kórokozójának találtak, az egy paramyxovírus volt, MojV (Mojiang paramyxovirus) néven regisztrálták, rágcsálókból kimutatva. De ugyanonnan előkerült egy csomó denevér-koronavírus is, köztük — 2013-ban — az RaTG13 is; a beteg bányászko eseteit pedig végül fungus-fertőzéssel magyarázták. De a legérdekesebb, hogy a bányászok közül négynél (!) volt SARS-IgG-antitest, illetve olyan antitest, ami legalábbis kereszt-reagált a SARS-antitestvizsgálatnál... (Kieg.: Egy azóta nyilvánosságra került és lefordított kínai disszertáció szerint ott volt a környéken a "SARS-doktor" Zhong Nanshan is, a páciensek gomba elleni gyógyszert pedig nem kaptak.) Mindez alighanem nyomós ok volt a kutatócsoport maradására az MojV azonosítása után is. Egyáltalán: biztosak voltak ők a MojV-t illetően, ha SARS-antitestvizsgálatra is időt fordítottak? Kétlem. Talán pont ezért maradtak. (Emlékeztetőül: az IgG az IgM után jelenik meg, vagyis múltbéli fertőzést jelez.) Kieg.: ebben a cikkben, amelyikhez Shiéket is megkérdezték, a denevérguanó borította helyeken előforduló gombához kötik a mojiangi bányászok tüdőgyulladását. Ez a következetlenség nem kicsit megdöbbentő, a korábban említett publikáció nyomán. Hogy lett a MojV helyében egy fungus a gyanúsított? Eleve nem volt komoly bizonyíték a MojV mellett? 
  • Más dolgok innentől. Az Egyesült Államokban a rendőrség sajátos kultúrájáról minden karikírozás mellett is jó adalékokkal John Oliver. 2014-ből pedig Jon Stewart teljesen ugyanerről. Persze, a rendőrség az Egyesült Államokban decentralizált, tudom. És voltak letérdelő rendőrök, tiltakozók stb. De a rendőri kultúra amúgy meglehetősen homogén. San Franciscóban vettem részt egyszer az ott rögtönzött kiállítás látogatójaként, még 2013-ban, a nyitott érdeklődés jegyében egy rendőri demonstráción, ahol egyrészt szomorú dolgokat láttam, mivel egy olyan országban, ahol sok a lőfegyver, bizony, sok rendőr meghal szolgálat közben, és erősen érthető, ha ezt a rendőrök kemény stresszként élik meg. Másrészt viszont letaglózóan pátoszos légköre volt az eseménynek, az volt a szubjektív benyomásom. A szervezők szentnek láttatták magukat egy bűnös vagy éppen a szolgálatukra nem eléggé méltó társadalom ellenében, és ez a szemlélet hosszú távon biztosan nem egészséges... Még egy adalékot ehhez: Eric Garner halála után nem volt a mostanihoz hasonlóan nagy robbanás, és ennek nyilván számos tényezője lehet. A most zajló járvány, és az azt megelőző lockdown és elbocsátás-hullám biztosan ezek között van.
  • Lengyelországban lett a hétvégén lazán 1100+ fertőzés. Ehhez a szénbányához köthetők (Zofiówka). Klaszterek környékünkön. Nálunk ilyen biztosan nem történhet...?
  • Most már általában is ajánlja a WHO a maszkviselést. Korábban csak beteget gondozóknak és beteg személyeknek ajánlotta. Nem siették el.

2020.06.09.

  • Nicaragua. Hát, kijelenthetjük, hogy a járvánnyal kapcsolatos hivatalos halálozás duplázódási idejének növekedésében most már a korrupt/hülye kormányzatok is komoly mennyiségi tényezőként számítanak. Valóságtagadó vezetés, és minimum 980 atipikus pneumóniás haláleset (köztük vezetők is szép számmal), a hivatalos 46 COVID-19-es helyett. G.a.h.: +83010+n.
  • Ez a járvány a legcsökönyösebb elemzőt is alázatra tanítja. Lehet, hogy kénytelen leszek revideálni a járvány októberi kezdetének lehetőségét? Indirekt indikátorok wuhani magatartás-változási mintázatokról, tavalyrül. Nézzük részletesen. Kórházi forgalom a környéken parkoló autókban mérve, műholdas képek alapján:

sarscov2_hospitaltraffic_wuhan.jpg

  • Az októberi vonalat én húztam be, hogy érzékelhető legyen, a szezonális átlagtól való eltérés már akkor határozott volt, ezek szerint (108 dél körül, tiszta ég mellett készült kép alapján, kereskedelmi műholdas szolgáltatótól). Nyilván végig kell majd olvasnom a tanulmányt, preprintként meglesz.
  • Közben viszont nem egyértelmű a kép más indikátorokat tekintve. Íme, az internetes keresések. A légúti és hasi panaszok együtt-járása decemberben annak ellenére kiváltott nagyobb érdeklődést az internetezőknél, hogy hivatalosan még nem volt semmi. Tehát decemberben, és nem októberben, és ez azért is figyelemre méltó, mert kontrollnak közben ott van, hogy a szezonális influenza mennyi keresést vált ki általában. Az ábra jobb oldalán a "May 2019" alighanem "May 2020" akart lenni.

sarscov2_internetsearchtrendswuhan.jpg

  • Itt a teljes tanulmány akkor. Kicsit túlterhelt a szerver, lassú lehet letölteni :)
  • Az egyik legérdekesebb dolog kimaradt a fent idézett sajtóbeszámolóból. Ebből is az derül ki, hogy a kép nem egyértelmű, pontosabban a kórházak közelében parkoló autók egyelőre magányos indikátort jelentenek. A nem egészen pontosan tisztázott eredetű kínai kórházi betegadatok ugyanis csak november elejétől jeleznek ugrást "influenzaszerű" esetekben. Akkor viszont nagyon, 2017/2018 és 2018/2019 teléhez képest, tehát akkor 2019. november eleje lehet a járvány indulása ténylegesen — és ez, ismerve a november 25-én megbetegedett Connor Reed esetét, illetve egy, kínai források által említett november 17-én kórházba került esetet, plauzibilis. Szó szerint így írja le a forrást a tanulmány: "Three yearly influenza-like-illness cycles (c, turquoise, right side axis) from two Wuhan hospitals plotted alongside confirmed COVID-19 case counts (c, purple, left side axis) extracted from open-source disease data." Az adatok alább.

sarscov2_harvardstudy_diseasesignal.jpg

  • Ha a kórházakban nem volt több járványos beteg, akkor hogyan függene össze ilyesmivel az autóparkolói forgalom visszaesése...? Szóval én egyelőre úgy látom, hogy a tanulmány lelete nem forradalmi, bár érdekes, és később még visszatérhetünk rá. Mindenesetre a saját három indikátorukból kettő nem októberi kezdetre utal. 
  • Új forrás tárgyalása innentől. A mai egy zsúfolt nap lesz, már látom. Itt a következő izgalmas gondolatmenet, amit meg lehet nézni részletesen (Matt Ridley).
  • Mond pár meggondolatlanságot, megalapozatlanságot arról, hogy a SARS-CoV-2 CFR-je 0,28% alatt lenne, amit azért nehéz az adatokból pókerarccal levonni. Ugyancsak alaptalan a "május óta politikától függetlenül mindenhol visszavonulóban a vírus" kijelentés, nem is értem, miért nehéz megnézni az adatok tényleges állását. Azt ugyanis (nem "visszavonulást", hanem lassulást) a szezonalitásnál jobban magyarázza a kijárási és a nemzetközi utazási korlátozások impaktja, az eredményesebbé váló kórházi kezelési protokoll, vagy pl. globális szinten a hazug és a gyenge kapacitású kormányzatok adatokkal kapcsolatos tevékenysége.
  • Nagyon érdekes viszont — és hihető — az elmélet arról, hogy az 1889/1890-es, észlelés szintjén Oroszországból indult járvány hátterében az OC43-as koronavírus állhatott (itt az erre jutó tanulmány 2005-ből). Erre a vírusra már korábban is utaltam itt úgy, mint "most underreported pathogen ever", és pedzegettem, hogy az éves influenzahalálozási projekciók valószínűleg a koronavírusok, talán éppen az OC43-as "kárára" csalnak.
  • És az is bizonyos, hogy a számos országban bevezetett kijárási korlátozások szelekciós nyomásként jelentkező környezeti változást hoztak a vírus számára. Ellentétben Ridley-vel, én azt gondolom, hogy a szelekciós nyomás első következménye a hosszabb lappangási idő, de amellett az erősődő átadhatóság és ugyanakkor a korlátozott virulencia is lehet implikáció. Így tud a vírus nehezebb körülmények Szóval pont az ellenkezője lehet a tényleges következmény annak, amit ő hipotetizál az írása végén.
  • Ami pedig a keresztimmunitást illeti, valamennyi lehet, igen. Nem biztos, hogy szeretnénk kipróbálni, hogy mennyi, a populáció szintjén, de azért lesz, akit ez ment meg (illetve lehet, hogy van, akit ez már megmentett). És hozzátenném, hogy fertőződéstől túl sokakat nem véd meg, mert ahhoz túl sok klasztert láttunk közel-teljes átfertőződéssel, ugyebár.
  • Más dolgok. Tudjuk, mit (nem) csinálnának az amerikai epidemiológusok idén nyáron (n=511). Persze náluk mások/rosszabbak a trendek és a helyzet, mint nálunk (amennyire ez megítélhető, most). Beltéri baráti találkozóra (small dinner party) 46% 3-12 hónap múlva menne (ez nyilván értekezletekre is értelmezhető, pláne ha van az asztalon pogi); 40% 3-12 hónap múlva tömegközlekedne; 54% 3-12 hó múltán dolgozna közös irodában kollégával/kollégákkal; 56% 3-12 hó múlva enne helyben étteremben; 42% temetésre vagy esküvőre csak egy év múltán menne (ez az, ami az átlagos embernek fel sem nagyon vetődik megfontolás tárgyaként); 64% egy év múltán menne tömegrendezvényre (event, concert or play); 52% egy év múlva fontolná meg a maszkhasználat mellőzését.
  • Böröcz József az "európai" "jóság" és "fölény" konstrukciójának hosszú ideje leleplezője és kritikusa, és most a járvány kontextusában pedzegeti, hogyan hathat ebből a szempontból pl. Kelet-Európa egyelőre jobb helyzete.
  • Dél-Korea: új klaszterek, az egyik pl. egy asztalitenisz-klubban. Biztosak vagyunk benne, hogy ilyen nálunk nem történhet...?
  • A lombardiai járvány epidemiológiai elemzése a cogodnoi kezdetektől (januártól). Nem volt sok aszimptomatikus hordozó, és kb. ugyanakkora volt náluk a vírusszám, mint a szimptomatikusaknál (vagyis az ereiket nekik is rombolta a vírus bőven). 47% került kórházba, 16% került intenzív osztályra 5626 elemzett páciensből. Férfiak többségben. 25 év felett a nagy többség (94 nem). A lombardiai eü. rendszerről sokat elmond, hogy 55 év alatt ezek között a páciensek között nem volt halott.
  • COVID-19-es és influenzás elhunytak tüdejének összehasonlítása. Utóbbiak tüdejének nagyobb volt pl. a súlya. Az ACE2-kifejező sejtek aránya magasabb volt a COVID-osoknál, de az influenzásoknál is meghaladta a kontrollcsoportos tüdőkét. Itt is előjön az angiogenezis a léghólyagocskák körüli kapillárisoknál. "Intussusceptive angiogenesis" =  belülről induló érképződés. Az influenzásoknál ilyen nem volt. Ábra is van róla, íme:

sarscov2_intussusceptiveangiogenesis.jpg

  • És itt egy fontos tanulmány (Imperial College London) arról, mennyi életet menthettek meg a kijárási korlátozások. 3,1 millió haláleset elkerülve Európában (fentebb a lombardiai tanulmány is erre jutott egyébként, tehát hogy a gyors korlátozások mentették a helyzetet a vereség kapujából). Persze ez csak egy módszeres projekció, de mindenképpen érdemi válasz a prevenciós paradoxonra, amikor emberek azt hiszik, "nem haltak meg sokan, tehát nem is volt szükség prevencióra".
  • És egy szuper ábra, ahol látszik a furin működése a Golgi-készülékben.
  • Klaszter Dél-Bulgáriában, egy játékgyár alkalmazottai. Nálunk ilyen biztosan nem történhet...?

2020.06.10.

  • Brazíliában vissza kell térni a korábbi, teljes körű adatszolgáltatáshoz, az ottani Legfelsőbb Bíróság bírájának döntése.
  • A járványról Skóciában, epidemiológiai szempontból, preprint. Területi evolúció szempontjából érdekes, hogy nem a Glasgow-Edinburgh tengely volt az első közvetlenül érintett rész (az első eset olaszból jött, rögbimeccsről, haza Tayside-ba); a hálózatelemzés pedig azt valószínűsítené hipotetikusan. Géntérkép: elég elterjedt nem-csendes pontmutáció az S-fehérjét kódoló szakaszban, az izolált vírusok enyhe többségénél (a Wuhan-Hu-1-eshez képest).
  • Vírusreplikáció különféle szövetekben, in vitro és ex vivo. A szem-kötőhártyával kapcsolatban a legérdekesebbek az eredmények. Lehet a szemen át fertőződni.
  • Egy koreai call-centeres klaszter. 43,5% lefertőződött egy emeleten, csak 1,9% maradt aszimptomatikus közülük. Megkockáztatom, hogy a légkondinak volt szerepe.
  • Továbbképzéshez: a furin szerepéről proprotein konvertázként. Tanulságos, hogy 2002-es cikk, és egyből belecsap a lecsóba, a biohadviselési/bioterror applikáció lehetőségét említve. Azért is jó a cikk, mert világosan leírja, hogy a furinnak nem csak a Golgi-készülékben, a transz-Golgi-hálózatban (TGN, trans-Golgi network) lehet szerepe (intracellulárisan), hanem pl. a sejtfelszínen is. Ott is hasíthat. A háromkomponenses anthraxtoxint pl. ott segíti győzelemhez. Ha jól értem, akkor egyelőre nyitott kérdés, hogy pontosan mi történik a SARS-CoV-2-es esetében.
  • Ez itt az irónia helye lesz. Szóval... annyira, de annyira vártam, hogy a hivatalos kínai járványösszefoglaló majd megvilágít bizonyos részleteket a járvány kezdetével kapcsolatban... de nem :( So sad :(((( 

2020.06.11.

  • Ez a nem túl jól megírt (ezt a nyelvezetére és a strukturáltságára értem) paper azt a lehetőséget veti fel, hogy a vírus S-fehérjéjében az aminosavak töltésének jellege és eloszlása jelentőséggel bírhat a sejtmembránokhoz kötődésben, ion-ion kölcsönhatásokon, azaz ún. sóhídakon keresztül, és hogy ez még a receptorkötő doménen (RBD) belüli receptorkötő motívumon (RBM) belüli furin hasítási hely argininjainak esetében is jelentőséggel bírhat.
  • A magas glükózszint a kockázati faktor diabétesznél, úgyhogy a kezelt diabétesz nem olyan veszélyes, minta frissen felfedezett.
  • US Open, eredmények, lásd alább. Texas és Arizona a tankönyvi V-shaped recoveryt mutatják a vírus szemszögéből. (És mindez még nem mutatja a tüntetéshullám hatását, az csak később jön...)

sarscov2_usreopening.jpg

  • Ez a beszélgetés (május elejéről) eddig elkerülte a figyelmemet. DTK Zacher Gáborral, aki elmeséli, hogy Hatvanban az egyetlen SARS-CoV-2-pozitív beteg, akivel találkozott, húgyúti fertőzéssel került be, légúti panaszok nélkül. Érdekes. Vesekárosodás a SARS-CoV-2 miatt? 
  • Még egy DTK-beszélgetés, és ez a járvány kapcsán erőre kapott telemedicina miatt fokozottan érdekes lehet, Meskó Bertalannal.
  • Egy új paper (U.S. NIH) gépi tanulással és emberi erővel a koronavírusok és a magas esethalálozású koronavírusok (high-CFR coronaviruses: SARS1, SARS2 + MERS) közötti nukleotidszekvencia-beli különbségekről. 11 releváns régiót találtak, a legtöbb a nukleokapszidot és a spike-ot érinti, ezek között némely nukleotidszekvencia-eltérés az aminosav-szekvenciában is kifejeződik beszúródás, törlődés  vagy helyettesítődés formájában. A reggel elsőként idézett tanulmányt is erősíti, hogy a releváns proteinek töltése szignifikáns (erős pozitív töltés), és mintázatuk egy részüknél (háromnál), úgy tűnik, nukleáris lokalizációs szignállá áll össze (NLS, Nuclear Localisation Signal), vagyis szerepet játszhat a vírus bejutásában a célsejtekbe, egy esetben pedig nukleáris exportszignállá (NES, Nuclear Export Signal), vagyis ott éppen a kijutásban játszhat szerepet, érdekes módon. Ráadásul ezek a CFR-el arányosan erősődőnek mutatkozó mintázatok a koronavírusok között.
  • A spike-ban van továbbá egy, a high-CFR koronavírusoknál előforduló beszúródás, mely meghosszabbítja az α-hélix formát öltő összekötő régiót (négy aminosavval) a spike hidrofób fúziós peptidje és az azt körülárnyékoló két ismétlődő, hathélixes szerkezetű amiosav-heptád egyike (HR1) között.
  • Végül a zoonózisok elemzéséhez különböző beszúródásokat találtak külön-külön az egyes high-CFR koronavírusok és legközelebbi ismert állati (lehetséges) elődjeik összevetésénél, ami három különböző evolúciós eseményre utal értelemszerűen. A SARS-CoV-2-es esetében a kritikus beszúródás nagyobb hidrofób interakciós felületet ad az ACE2 receptorral, illetve ion-ion kölcsönhatást és hidrogénkötéseket alapoz meg. Ez magyarázhatja, miért annyival (10-20x) nagyobb a SARS-CoV-2-es spike-jának affinitása az ACE2-es receptorral a SARS-CoV-1-hez képest.

2020.06.12.

  • Egy cikk a vérrögökkel kapcsolatos problémákról orvosi-gyakorlati szempontból. Eredetiben: "Parcha says he recently treated a 30-year-old who attempted to fight the virus at home. Due to clotting issues, he now has permanent heart damage. Parcha says if the patient had come in three days earlier, it could have changed his life." Mint korábban említettem: a "csak a krónikus betegek halnak meg" tábor figyelmébe ajánlható, hogy a SARS-CoV-2 saját maga is csinál krónikus beteget emberekből. Ördögi kör.
  • Még egy kis horror. A huszonéves chicagói beteg két hónapja volt mesterségesen lélegeztetve. A vírus által szétlyuggatott, és a mellkasfalra feltapadt tüdejének a helyére 10 órás műtéttel sikerült egészségeset ültetni. (Tegyük hozzá, hogy ezzel nem biztos, hogy hosszú időre megmentették. A tüdőátültetés egy éves túlélési aránya 80% felett van valamivel. Három év után 55-70%. A fiatalabbak arányai jobbak.) Ha valaki jól viseli az ilyesmit, íme, a transzplantáción átesett hölgy régi tüdeje.
  • Orange County, Kalifornia. Lázadás a masz8kviselési rendelet ellen, fenyegető üzenetek az ezt támogató tisztviselőknek, végül a nyomás hatására a maszkviselési kötelezettség feloldása. Exponenciális járványnövekedés mellett.
  • Egy fülöp-szigeteki nő halála, aki haza akart jutni, de a kijárási korlátozások miatt sem buszjáratot, sem fuvart szerezni nem tudott, és végül magára hagyva, egy gyaloghídon találtak rá. G.a.h.: +83011+n. (Halkan jelzem, hogy a járvány teljes halálozása rég félmillió felett van.)
  • Erősen úgy tűnik, hogy Derek Chauvin minneapolisi rendőrnek személyes indítéka lehetett George Floyd meggyilkolására.
  • Nálunk a wastewater-based epidemiology is kedvező eredményeket hozott eddig: "A tiszti főorvos ... beszélt a szennyvízvizsgálatokról ... Budapesten mindhárom szennyvíztelepről vettek mintát, így a főváros egész lakosságát látják. Ez alapján még mindig ki tudják mutatni a vírust a fővárosban, de jelentősen, egy nagyságrenddel csökkent a vírus kópiaszáma." 
  • Indiában közösségek vesznek oxigénkoncentrátort, pulzoximétereket, hogy valahogyan életeket mentsenek majd.
  • És közben még aminosav-szekvenciákkal is volt időm foglalkozni, és arra az érdekes dologra lettem figyelmes, hogy ez a paper (visszavont anyag, l. a 4. oldalt) és ez a másik (tegnap tárgyaltam itt, l. itt is a 4. oldalt) részben azonos beszúródásokról beszél. A 72-es pozíció az utóbbinál = 80-as pozíció az előbbinél (a második T helye a GTNGTKR beszúródásból). A HKNNKS beszúródásból a K a 150-es pozícióban van az utóbbi paperben, 154-es pozícióban az előbbinél. 680 tájékán jön mindkettőnél a PRRA (kontrollnak említem). Az előbbi paper volt az ominózus indiai paper, amelyik rámutatott, hogy a TNGTKR és a HKNNKS szekvenciák jelen vannak a HIV-1 gp120-as burok-glikoproteinjében is, amelyik ott fontos szerepet játszik a CD4-es T-sejtekbe történő behatolásban.

2020.06.13.

  • A magas fruktóztartalmú kukoricaszirup igen kedvezőtlen hatásairól (Dr. Seheult). Az amerikaiakkal évente átlagosan 24 kiló felett etet az ipar ebből a csodából. Hozzájárul túlsúlyhoz, diabéteszhez, szív- és érrendszeri betegséghez, és még az oxidatív stresszhez is az erekben.
  • Már a korona sem a régi? Egy tanulmány szerint olyan koronavírus-változat terjed újabban, ahol a vírusrészecskéből négyszer-ötször több spike meredezik célsejtek után áhítozva. A háttérben itt a teljes paper. A D614G mutációs stabilizálja is a spike-ot, úgy tűnik. (Emlékeztetőül: az S-protein áll S1 és S2 funkcionális alegységekből. Előbbi receptort köt, utóbbi az ezt követő fúziós folyamatot vezérli.)
  • Trump rájött, hogy esetleg még Mexikóra lehet ráfogni a balhét.
  • Egy érdekes thread arról, hogy a diagnosztizálás mennyivel bonyolultabb, ha különféle bőrszínű embereket kell kezelni. Lásd az alábbi ábrát a COVID kapcsán is előforduló Kawasaki-szindrómáról.

sarscov2_kawasaki_skincolor.jpg

  • Peking eddig viszonylag megúszta, most ott a járvány, pont egy piachoz kapcsolódóan. Persze a kínaiaktól újabban már megszokott kőkemény reakció is megvan. Több tucat fertőzöttet megtaláltak a tünetek jelentkezése előtt.

2020.06.14.

  • Ezt már szeretem. Újságírók, akik képesek kutatóként is gondolkodni, ha kell. Megnézték a harvardi tanulmányt, amelyik a minap a járvány augusztusi kezdetét vizionálta háromból egy saját indikátor alapján, kettő saját ellenében, és a Baidu-kereséseket elvégezték más keresőszavakkal is. Ha nem a "hasmenéses tünetet" nézzük, hanem például simán a "hasmenést" vagy a "légzési nehézséget", akkor december előtt csökkenő trend volt ezeknél. Stanford, Harvard... sok nagynevű egyetem produkált pocsék kutatásokat az elmúlt hónapokban.
  • Amennyiben szociopaták uralkodását az "ügyes" jelzővel illethetjük, Trumpék ügyesen csináltak szövetségi tagállami szintű kérdést a koronavírusból, és szépen kivonultak a téma tárgyalásából.
  • Japán tanulmány. 61 klasztert rekonstruáltak, 22-nél nagyjából biztosan megvan az index-eset, a legtöbb 20-39 év közötti pre- vagy aszimptomatikus hordozó volt. Tanulságos az egyetemek működésének átgondolása szempontjából.
  • A kínai piaci epidemiológiai nyomozás részleteiről bővebben.
  • Nálunk a ma reggeli adatok beérkezése előtt 13,75%-on a CFR (esethalálozási ráta). A reggeli adatok beérkeztével már 13,81%. V. ö.: a belgáknál jelenleg 16,1%. Az olaszoknál 14,49%. A briteknél 14,15%. A svédeknél 9,56%. A spanyoloknál 9,3%. Az amerikaiaknál 5,48%. A braziloknál 5,02%. Ezek nagyjából a legrosszabbul állók, és egyébként nem a vírus halálosságában van igazán nagy különbség, azt hiszem, ez megkockáztatható hipotézisként. Mint említettem, azt életszerű feltételezni, hogy ha a CFR eleve magas, és a tetejében emelkedik, akkor a járvány felderítetlensége nő. Mivel pedig egyébként szám szerint, arányosan nézve sokat tesztelünk, ebből elvileg az is következhet, hogy azok a tesztek... nem sokat érnek. Például sok lehet a fals negatív. Ez csak egy lehetőség, de olyan számok mellett, amikkel itt találkozunk (teszteltek száma, megerősített pozitívok száma, elhunytak száma), az ellentmondásokat például ez oldhatja fel.
  • Müller Viktor (ELTE, biológus) arról, hogy neki is meglepetés volt a lazítások után a gyors terjedés elmaradása nálunk, de hogy ebben biztosan szerepet játszik, hogy az emberek most már nem töltenek huzamosabb időt együtt nagy számban zárt terekben. Hogy szeptembertől mi lesz, az persze más kérdés, úgy értékeli. 
  • Cancer Alley, az út menti sáv Baton Routge és New Orleans között, sok olaj- és vegyipari létesítménnyel, a rák mellett a légúti betegségek magasabb előfordulásával. COVID-19-ben is élpozícióban, sok fekete-amerikai lakossal. Ebből kivetítve: az anyagilag megengedhető, és ezzel összefüggésben sokszor egészségtelenebb lakhatási körülmények is hozzájárulnak a magasabb fekete-amerikai halálozáshoz a járvány során. A legcsúnyább csavar a történetben, hogy a fekete-amerikaiak lakta terület nem feltétlenül volt valaha egészségtelenebb más térségeknél, viszont naná, hogy véletlenül oda települt az ipar.
  • Indiában a járvány átüti a kórházikapacitás-plafont, jönnek az átalakított vasúti kocsik. A hivatalos indiai halálozási adatok sajnos egészen biztosan aluljelentettek.
  • Ebből a cikkből kiderül a tavaszi iráni metilalkohol-mérgezések áldozatainak teljes száma. Mint ismeretes, elterjedt az a helytelen nézet, hogy a szesz megvéd, és ebből lett ez a probléma. 796-an haltak meg (ebből korábban 390-et számoltam a magam részéről). Ugyaninnen: egy házaspár az Egyesült Államokban, akik klorokin-foszfátot ittak megelőző gyógymódként (még márciusban) és ez után a férj meghalt. G.a.h.: +83418+n. A SARS-CoV-2 nevű baleset áldozatainak száma így 517020 este 7 órai állás szerint (konzervatív számítással).
  • Zárásnak még egy kis irodalom a (balesetes) laboratóriumi eredetű fertőzésekről (LAIs, Laboratory-Acquired Infections).

Folyt. köv. Június 15-től új bejegyzésben majd (14-én még itt).

A koronavírus-járvány a lazítások után

 Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

2020.05.16.

  • Boncolás nyomán a citokinvihar hatásairól COVID-19-ben elhunyt betegeknél. Az előző bejegyzés legvégén, a kommentek között retorikailag rákérdeztem, hogy Klaus Püschel német patológus, aki mostanában sok kört ment a médiában egyes helyeken, és azzal szórakoztatja a nagyérdeműt, hogy nem látott még embert, aki a koronavírustól halt volna meg, mert mind beteg volt már előtte is, vajon mit szólna egy ilyen tanulmányhoz. És akkor elém került ez a Spiegel-cikk, ahol ő is szóba kerül, hasonló felfogásban gondolkodó patológusokkal együtt. "They all had in common that they suffered from severe malfunction of their blood vessels," nyilatkozza a cikkben pl. Alexander Tzankov bázeli orvos. "The cause of death tended to be a respiratory tract infection, a lung infection, a pulmonary embolism or a combination of all three. The most common pre-existing conditions found by the pathologists pertained to the cardiovascular system or the lungs", számol be a Spiegel ezek után Püschel leleteiről is. És így már értem. Úgy tűnik, hogy ezeknek a patológusoknak nehezükre esett megérteni, hogy a SARS-CoV-2 mit tesz az érfalakkal és a szívvel. A vaszkulitiszt/endothelialitiszt, az oxidatív stresszt, és egyebeket. Mindössze annyit tévednek, hogy (legalább részben) összekeverik az okozatot az okkal.
  • Kieg. az iméntihez: itt egy tanulmány, mely férfiak esetében 13, nők esetében 11 életévnyi veszteséggel számol átlagosan a páciensek populációjából vett minta vizsgálata alapján.
  • Lehet, hogy izgalmas dolgok is előkerülnek majd ebből a kiszivárgott kínai járvány-adatbázisból, az eü. rendszer katonai ágából. Amit most lehet látni (effektíve még nem publikáltak semmit): (1) itt sem fog kiderülni, hogy hány katona fertőződött meg a Népi Felszabadító Hadseregből, vagy éppen a börtönökben (h/t rdos); (2) februártól indulnak az esetek, szóval nincsenek ebben az adatbázisban az ismert időrendet megelőző esetek.
  • Apropó, ismert időrend. A Lancetben még korábban megjelent tanulmányból a kritikus idővonal e tárgyban íme, alább, a saját kiemeléseimmel:

sarscov2_timeline_lancet.jpg

  • Mint látható, az ábra kicsit torzít, mert a december 1. és 10. közötti időszak napjai nincsenek megjelenítve, utána pedig időarányos szakaszok következnek az időtengelyen. A december 1-én megjelent eset egyike azoknak, amelyeknek nem volt köze a Huanan piachoz — háromból egy december 10-inek már volt folyamatos kapcsolata a piaccal. Bár elvileg "illness onset" dátuma a december 10., a tanulmányból dekódolható, hogy a december 15-i esetek egyike ennek a férfinak a felesége volt. Viszont akkor a december 10. valójában a hospitalizáció napja, amit megelőzően a férfi 7 napig köhögött és lázas volt, illetve légszomja alakult ki. Az inkubációs időt is figyelembe véve így ez az eset december 1. előtt fertőződhetett.
  • Fontos adalék az ügyben, hogy az SCMP talált valamilyen "kínai kormányzati" adatokat, melyek szerint egy 55 éves személy lehetett koronavírusos beteg már november 17-én. Laboratóriumi megerősítés a fentebb idézett Lancet-tanulmány szerint csak december 16. utáni esetekre van sajnos, így nehéz megítélni, nem egy influenzás beteget nézegetünk-e éppen a nyomozás izgalmában. Arról sincs szó, hogy a november 17-i (akkor kórházba került?) betegnek volt-e köze a Huanan piachoz; a kérdés fel sem vetődik a cikkben.
  • Ahogy már tegnap felvetettem, Tanzánia sajnos tényleg a COVID World Tour nevű globális shitshow következő állomása. Idézem: "Abdul*, a close relative of Kwikima, said when they visited the department of health at the Ilala municipal council on April 30 to discuss the burial, they saw the worker on duty open a book titled Mazishi ya COVID-19- Swahili for "COVID-19 burials" - and that Kwikima was the 256th name in the book." Azok után, ami a cikkben szerepel, nincs kétségem az információ hitelessége felől, pláne a hivatalos adatok nem túl életszerű eloszlását látva, és tudva, hogy a tanzániai laborok teljesítményét maga a tanzániai elnök, John Magufuli is megkérdőjelezte. Mivel április 30-ig csak 16 halálesetet jegyeztek hivatalosan, globálisan a g.a.h.: +65285+n.
  • Vissza a sejteken belülre. Egy nagyon érdekes tanulmány a mikroRNS-ek (miRNA) szerepéről, in silico. SARS-CoV-2-re specifikus 315 mikroRNS hatása, és ezek sajnos az életkorral csökkenő mennyiségben vannak jelen a szervezetben. 
  • Április 28-i naplóbejegyzés egy vidéki kórház osztályvezetőjétől, a Válasz Online közlésében: "Kétoldali tüdőgyulladás, láz, komoly oxigénhiányos állapot. COVID-gyanú nincs, mert a beteg nem teljesítette az esetdefiníciót, nem járt külföldön." Ez csak egy vicc, ugye? Értem én a tréfát.
  • A Theodore Roosevelt repülőgép-hordozó legénységéből néhány tengerész tesztje úja pozitív lett — a tesztre influenzaszerű tünetek kapcsán került sor. Nyilván figyelni kell majd erre a szálra is.

2020.05.17.

  • Gyógyszer-ellátás, amerikai függőségek Indiától, többek között a hidroxiklorokinnal kapcsolatban, az Indira Gandhi-féle 1970-es szabadalmi törvényig visszavezetve.
  • Egy fontos exkluzív interjú a CNN-en, dr. Zhong Nanshannal, a kínai kormányzat eü. főtanácsadójával, aki az első SARS-járvány idején tűnt ki annak idején. Highlights: (1) a kínai lakosság nagy része továbbra is fertőzetlen, azaz fertőzhető, és jöhet második hullám (európai és észak-amerikai illuzionisták figyelmébe ajánlott tanács is lehet); (2) Január 28-ig volt szerinte probléma az adatokkal, addig gáz volt a helyzet ezen a téren szerinte is. Idézem: ""I didn't believe the results, so I (kept) asking ... you have to give me the real number," he said. "I suppose they were very reluctant to answer my question.""
  • G.a.h.: +65287+n. Az ilyen eseteket, mint ez, vagy ez, nehéz máshogyan számolni.

2020.05.18.

  • Az év legnaivabb mondata a Portfolio.hu-n., az új, laboratóriumilag megerősített fertőzések száma kapcsán (+26). "Utoljára egy hete jelentettek ilyen alacsony adatot." Igen, utoljára egy hete volt vasárnapról hétfőre virradó éjjel. Egyébként pedig Dél-Koreában ennyi új eset kapcsán verik a vészharangot. Az esethalálozás nálunk 13% felett — ha a hivatalos adatokból indulunk ki. Utóbbi annyiban mindenképpen jelentős, hogy ha valakinél tesztelés történik, és kimutatják a fertőzést, annak ténylegesen ilyenek az esélyei, amennyiben az életkortól és krónikus betegségektől elvonatkoztatunk.
  • A SARS-CoV-2 közben így terjed valójában: exponenciálisan. Egy dermatológiai konferencia résztvevőinek a története. Szemtől szemben üldögélés, kézfogás, taxizás. A transzmisszió idején az index-eset pre-szimptomatikus volt, később belázasodott. Az eredmény 85%-os átfertőzöttség. Csak ketten maradtak aszimptomatikusak (17%) a fertőzöttek közül. 
  • Fitness táncórák Dél-Koreában. Az intenzív beltéri testmozgás mellett kiabáló instruktoroktól óvakodj, az ő tüdejük tartalma a te tüdőd tartalma is végül.
  • Különféle infarktusok is előfordulnak a koronavírusos vérrögképződés eredményeként, ezt már tudjuk. Itt van három eset leírása hasüregi infarktussal.
  • Még nem néztem végig teljesen, de itt egy jó videó a renin-angiotenzin rendszerről., bár még az ACEI/ARB-kezeléssel kapcsolatos klinikai adatok nagy része előttről. Tekintve, hogy az angiotenzionogént a máj, az azt hasító renint pedig a vese termeli, a vírus támadása ezekben a szövetekben is hatással van a rendszerre, megkockáztatom — túl az ACE2-es receptorok lekötésén.
  • 12 boncolás tanulságai Németországból (Püschel is a szerzők között, úgyhogy ezek szerint most már látott koronavírustól meghalt beteget). Vérrögök, diffúz alveoláris károsodás (DAD), limfociták behatolása, elnehezedett, folyadékkal telt tüdők, a vírus-RNS jelenléte nagy mennyiségben különféle szervekben 5/12 páciensnél. Terápiás szempontból a heparinkezelés vérkép megfigyelése nyomán nyilván alap, innentől.
  • Az orosz illetékesek — nem meglepő módon — játszanak az adatokkal, és a boncolás függvényében különbséget tesznek a "died of" és a "died with" esetek között, hogy aztán csak az előbbieket kelljen számítaniuk, és így produkáljanak jobb esethalálozási arányt. Ennek a mértéke: áprilisban a valószínűsíthető eseteken elvégzett boncolások nyomán Moszkvában csak 639 esetben erősítették meg a koronavírust a halál okaként, és ez ment a WHO-nak is küldött statisztikák közé. Az esetek 60%-át leírták másnak. Vagyis mintegy 958 esetet hagytak figyelmen kívül. G.a.h.: +66245+n. Kieg.: a Financial Times a szezonális átlagot meghaladó moszkvai halálozásról.
  • Az Egyesült Államokban a szezonális átlagot meghaladó halálozásról. Minden COVID-19-es halálesetet extrának tekintve, azt kivonva a teljes extra adatból (konzervatívan) a következők jönnek ki az általam eddig nem számított államok esetében. Kalifornia: +400 (III.15-Iv.25.); Virginia: +200 (III.15-IV.18.); Dél Karolina és Arizona: +100+100 (III.15.-IV.18.); Mississippi: +50 (III.15.-IV.11.); Vermont: +50 (III.15.-IV.18.); Utah: +30 (III.15.-IV.25.); Washington, D.C.: +10 (III.15.-IV.11.); New Hampshire: +10 (III.15.-IV.25.); Wyoming: +60 (III.15.-IV.11.). G.a.h.: +66245+1010+n=+67255+n.
  • John Olivertől két kiváló fellépés. A "buborékligázásról" gondolkodó sportszövetségekről. És az amerikai postaszolgálat (USPS) messze a koronavírusnál korábbról, és konkrétan törvényhozóktól eredő válságáról (lásd: Postal Accountability and Enhancement Act). Az előre fizetendő egészségbiztosítási járulékok miatti kötelező tartalékolás, és különféle szolgáltatások árplafonjának szabályozása után jön a mániákusan közszolgáltatásokat gyilkoló politikusok támadása, akik előbb-utóbb nyereséges működést és önfenntartást várnának talán még az általános iskoláktól is.
  • A fertőzöttek tartós egészségkárosodásairól. A nyájimmunitás illúziójáért folytatott küzdelem a "nyáj" egy részének lepusztításával járhat. A folytatás a shitshow szellemében: mivel ők már krónikus betegek lesznek, egyesek szerint gyakorlatilag félig halottnak tekinthetők, és egy "ügyes" kórboncnok még azt is megállapíthatja majd évek múltán, ha úgy alakul, hogy nem is a COVID-19 volt az igazi bajuk.
  • Visszaeső újra-pozitív eset, Ausztrália.
  • 7-6-5-8-11-30: a halottak hivatalos számának duplázódásához szükséges napok száma az elmúlt hat duplázódási ciklusra visszatekintve. Így vagyunk a nap végére 320 ezernél.

2020.05.19.

  • A szennyvízcsövek kis hibái virális aeroszolokkal lephetnek be helyiségeket. A fürdőszobában és másutt időről időre érzett rossz szagok ennek a lehetőségét jelezhetik. Modellezték, fizikailag.
  • A minden vizsgálat nélkül is a WHO-t bűnbaknak megtevő Egyesült Államok miatt a WHO támogatná, hogy független vizsgálat induljon a járvány kialakulásáról, de ezt Kína csak akkor fogadja el, ha egészen-egészen független az a vizsgálat. WHO politics.
  • Gyógyszerpolitizálás. Japán és a favipiravir. Idős betegeknél jó lehet, de terhes asszonyoknál születési rendellenességekhez vezethet.
  • Mivel mára csak 21 új esetet találtak, és számomra nem világos, mi működik nálunk máshogyan, mint odakinn, a nagyvilágban, körkép. Az átfertőzöttség Magyarországon nagyon alacsony, ez nem akadálya a járványnak. Van már autós vírustesztelési lehetőség, de napi 100 a kapacitás, az ár pedig 26900 Ft. Friss klaszterek Ausztriában, Hagenbrunnban a postaszolgálat a katonaság részvételével tud tovább működni.  De tegnapra csak 27 új esetet találtak. Szerbiában tegnap 89, Romániában 156, Ukrajnában 325 új eset. A szlovéneknél nem volt, Szlovákiában egy, a horvátoknál csak kettő. Nem mindegy, ki mennyit tesztel, persze.  Már csak az a kérdés, hogy a szlovén-szlovák tengely, vagy a szerb-ukrán-román klaszter részei vagyunk-e.
  • Apropó, átfertőzöttség. A Merkely-féle H-UNCOVER-vizsgálat saját számításaik szerint 2,7 ezrelékes eredmény felé tendál, ami igen hasonló esetszámmá konvertálható, mint amit a napokban projektáltam a dél-koreai CFR-ből kiindulva. Szóval akkor reálisan 20 ezer feletti lehet az esetszám Magyarországon. Kieg.: azt viszont nem tudom, hogy jön ki a 2,7 ezrelék, ha "1524 vérmintából 9 volt pozitív" (antitestekre). Ez fura. Úgy a tényleges esetszám magasabb is lehet.
  • Az Index cikke arról, milyen magatartás a célszerű a relatív lazaság állapotában. Általában nem rossz, de pl. leírják, hogy "a közös ételhez csak tiszta evőeszközzel nyúljunk", ami félreértésekre adhat okot. A szánkba tett, azaz ott összenyálazott evőeszközzel már ne nyúljunk újra oda. Az már nem tiszta.
  • Adatok arról, hogy a beltéri transzmisszió dominál ebben a járványban.
  • Az Index azt írja, hogy Trump hülye, és ez nyilván igaz, de a cink+hidroxiklorokin kitettség utáni profilaxis kombóval nem feltétlenül jár rosszul, az a helyzi. Aki tanácsokat ad neki az ügyben, nem hülye. Trump szívét (vagy a kavargó sötét anyagot, ami a helyén van) nyilván megfelelően monitorozzák is közben. Sean P. Conley az orvos neve. PEP-ként vetődött fel a kombó fogyasztása, azaz mint Post-Exposure Prophylaxis, miután a Fehér Házban is lett pár eset. Talán éppen ez alapján a dél-koreai tanulmány alapján döntöttek róla, többek között. Így megy ez — a fontos emberek esélyei "természetesen" jobbak az átlagos emberekénél.
  • A svéd "csoda". Itt egy részletesebb tanulmány is: férfiaknál 3, nőknél 2 év veszteséget mutat ki várható élettartam tekintetében a tizenharmadiktól a tanulmány zárásakor figyelembe vett tizenhatodik hétig tartó időszak eredményeként (amit a naptári évre kompenzálhat még az, ha később kevesebben halnak meg, de ezt a kutatók nem tartják túl valószínűnek). 
  • A COVID-19 World Tour nevű globális shitshow szerves része, amikor az ember szembesül azzal, hogy kritikán aluli morális integritással kormányozni a világon mindenütt lehetséges. Floridában is. Innentől számomra az amerikai adatok megbízhatóságánál is van egy kis bizonytalansági faktor. Meg egy kis diszkomfort.
  • Ioannidisék a Stanfordon ilyen finanszírozási háttérrel produkálták a "következtetéseiket" (=következődéseiket) arról, hogy mennyire nagy az átfertőzöttség már Kaliforniában. Jut eszembe, Michael "két hónap alatt kiég a járvány" Levitt is a Stanfordon kutató. Ez most csak úgy az eszembe jutott, mivel a hír a Stanforddal kapcsolatos. Szabad asszociáció.
  • Egy floridai férfi és a felesége esete. "Fake crisis"-hívő volt a férfi.
  • Egy 2005-ös tanulmány New Havenből az akkor újnak számított NL63-as koronavírus egy ottani variánsa és a Kawasaki autoimmun betegségre emlékeztető kondíció előfordulása közötti összefüggésről. Megjegyzi, hogy korábban is voltak adatok a Kawasaki hullámszerű jelentkezéséről téli hónapokban, jellemzően 3 hónapnál idősebb gyermekeknél.
  • OMG. Március elején írtam ezen a blogon a december eleji wuhani esetek kezeléséről: "Érdekes volt látni, milyen jól felkészültek voltak a kínai orvosok az ARDS kezelésére már a kezdet kezdetén (hasra fektetés, leszedálva lélegeztetés, kis légzési térfogatú lélegeztetés stb.)" Ezek után tényleg a levegőt kapkodom döbbenetemben, mert elképzelhető, hogy az amerikai halálozási statisztikákat rossz orvosi gyakorlat rontja. Nem gondoltam volna, de úgy tűnik, hogy sok kórházban máig pumpálják a betegekbe a levegőt, ahogyan a csövön kifér

2020.05.20.

  • Kiváló elemzés a húsipar helyzetéről a G7-en. A húsüzemek járványproblémája felbukkant már az Egyesült Államokban és Németországban is, többek között. Okok: "A feladat nagyon munkaintenzív, ezért a munkafolyamat egyes pontjain szorosan egymás mellé állítják a fizikai erőt kifejtő, szaporán lélegző dolgozókat" + méretgazdaságosság miatt a nagy üzemek a nyerők, és a nagy verseny miatt feszített munkatempó van.
  • Dagesztán. A helyi eü. miniszter, Dzhamaludin Gadzhiibragimov a központi adatokkal szemben (3553 eset, 32 halott) közölte egy Instagram-interjúban (!), hogy a valódi helyzet 13 ezer feletti esetszám és 657 halott. Igaz, nem tudnak különbséget tenni tüdőgyulladás és tüdőgyulladás között, de egyrészt nincs már influenzaszezon, másrészt a COVID-19 nem feltétlenül tüdőgyulladásként öl, úgyhogy az adat abszolút mérvadó. Abba nem jó belegondolni, hogy Gadzsiibragimov szerint "Basically, the same [treatment] methodology is used for both", azaz hogy szerinte minden tüdőgyulladást ugyanúgy kell kezelni alapvetően. G.a.h.: +67255+625+n=+67880+n.
  • Íme, a "k" terjedési mutató: a terjedés diszperziós faktora (avagy klaszteresedési mutatója). Értéke 0 és 1 között, a 0-közeli jelent terjedést kevesektől sokak felé, az 1-hez közeli jelent 1o1 (one-on-one) terjedést. Tekintve, hogy a SARS-CoV-2-nél a k valószínűleg alacsony, a klaszterek megelőzése nagy szerepet játszhat.
  • Hollandiában a nyércfarmokon terjed egy ideje a fertőzés, most egy nyércnek sikerült megfertőznie egy ott dolgozó embert; új zoonózis. Szerintem semmi extra nincs benne — az igazi "extra" az, hogy Kínában egyetlen zoonózis-incidens vezetett a járványhoz (ha az állatok között járvány van, több ilyen is lehetett volna). Egyéb érdekes részletek: 2024-ig engedélyezett a nyérctenyésztés a hollandoknál, addig a nyércbunda a kínai, a koreai, a török és a görög piacra megy. Stratégiai olvasat: a nyércekkel is kell kezdeni valamit, ha ezt a járványt fel akarja számolni AZ EMBER.
  • Ilyen orvosok vesznek oda ebben a járványban, miközben idióták előadást tartanak arról, hogy az áldozatok igazából nem számítanak.
  • És akkor egy kis IR (International Relations). Mivel a válság Kínának és az Egyesült Államoknak is rossz, az anarchia fog fokozódni a nk-i rendszerben. A szerző Kevin Rudd, volt ausztrál miniszterelnök és külügymin.
  • Wastewater-Based Epidemiology hazánkban is. (H/t Epikurosz.) Ajkán, Budapesten, Debrecenben, Győrben, Miskolcon, Nagykanizsán, Pécsen, Szegeden és Veszprémben — ami a megyei adatok ismeretében nekem jónak tűnik.
  • Egy igazán jó összegzés a magyar járványhelyzetről és az eddigi intézkedésekről. Alá tudnám írni — bár azt meg kell, hogy mondjam, hogy ősznél korábban is el tudok képzelni jelentős terjedést.
  • Egy érdekes érv a nyájimmunitás-szerűségre aspirálóknak: "We likely need >75-80% immunity or more, which means a cost of harming 3-4 to protect 1". Ki lehet számolni ezt, valóban, és a tetejében ez még optimista, mert ugye az az 1 sincs megvédve, ha pl. egy év elteltével bye-bye, immunitás.
  • A WION tudósításait érdemes figyelni. A nem szoros ellenőrzés alatt álló laboratóriumokat Kína a vírusminták megsemmisítésére utasította "másodlagos katasztrófák megelőzése érdekében" még a járvány elején (kora januárban) (idézett forrás: Liu Dengfeng, a kínai Országos Eü. Bizottság funkcionáriusa; korroborációhoz). Miután a "harcos farkas" diplomaták ellentámadásai nem váltak be, Kína finomabb hangra váltott, és pl. Jackie Chant vetette be az imidzse javításáért Indiában. Kínai-ausztráliai kereskedelmi háború, miután Ausztrália támogatná Tajvan megfigyelői státusát legalább a World Health Assemblyben. Konteó-offenzíva az izraeli kínai nagykövet halála körül.
  • Új-Zélandon a vírus lehetséges laboratóriumi eredetéről cikkeznek közben, kutatás alapján, mivel az elemzés szerint "data does not point to cross-species transmission of the virus at the market".
  • Itt a tanulmány, amelyikre hivatkoznak. A tobzoskaelméletet gyengének találja. A SARS-CoV-2 emberi adaptálódásának mértékét pedig figyelemre méltónak, tekintve, hogy kevesebb genetikai polimorfizmust produkál, mint a szelekciós nyomásnak (adaptáció tekintetében) anno jobban kitett SARS(-1) annak idején, ami arra utal, hogy már a kezdet kezdetén megfelelően adaptálódott lehetett. Íme, ábrán, a tanulmányból.

sars_cov2_sarsvssarscov2_genetic_polymorphism.jpg

  • Az oxfordi csimpánz-adenovírusos vakcina közben nem akar működni; a kísérleti majmaik megfertőződtek, vírust ürítettek. A Moderna nevű cég egyelőre jól halad egy mRNA-vakcinával, akárcsak a kínai Sinovac a maga inaktivált vírusrészecskés vakcinájával — utóbbi már komolyabb próbát is kiállt. A Moderna sajnos még lufi is lehet, már, erősen elkapkodott módon scale-up manufacturing kapacitásba fektetnek, a tőzsde pedig rövid ideig szárnyalt a hír hallatán — nekem erősen az az érzésem, hogy a befektetők motiválása irányítja a kommunikációt.
  • Kínának sok kintlévősége van a járvány és a gazdasági válság sújtotta országokban, és már érkeznek is a jelzések, hogy adósság-átstrukturálásra vagy -elengedésre lenne szükség.
  • Észak-Kína: eltérő klinikai kép, módosult betegséglefolyás? Hosszabb inkubáció? Nem örülünk.
  • A nap végére: ez saját elemzés az MTA-TK-JTI blogján, Hoffmann Tamás nemzetközi jogász kollégával társszerzőként. Global Public Health meets International Law. Az R2P elv és a pandémia összefüggéseiről.

2020.05.21.

  • Itt a következő zseni. Isaac Ben-Israel, matematikus. Megnézte, hogy a világ országaiban többnyire 40 nap alatt eljön a halálesetek számának csúcspontja, és ebből levonta, hogy ez akkor így "természetes". Szerintem ez az ember sokkal okosabb annál, hogy ekkora baromságokat mondjon — úgyhogy furcsának találom a dolgot. Mikor kérdőre vonták, hogy ugyan mitől lenne ez így természetszerűleg, beavatkozás, gazdaság leállítása stb. nélkül is, szinte cinikusan ható válaszokat adott. "The numbers speak for themselves", mondta a számok nevében. Aztán kicsit őszintébben: "I have no explanation. There are all kinds of speculations. Maybe it’s related to climate, or the virus has a life-span of its own." A mondat utóbbi részével egyben azt is jelezte, hogy a vírusokról segédfogalma sincs.
  • Indiai cikk adatokkal arról, hogy a mumbai rendőrök között a hidroxiklorokin-szulfátos (pre-exposure!) profilaxis kúra  (PREP) jó hatással lehet, nem-szignifikáns mértékű különbséggel a kúrát követők javára.
  • A furin hasítási helyről. Német kutatók úgy találják, hogy alapvető stratégiai jelentősége van a sejtek fertőzésében. Ebből a tanulmányból mellékelem a listát humán, denevér- és tobzoska-koronavírusokról. A hosszú listában sehol máshol nincs ott ez a furin hasítási hely. A PRRA szekvenciát kell nézni, ott van, ni.

sarscov2_betacoronaviruses_unique_furin_cleavage_site.jpg

  • Apropó, módszertan. A német kutatók generáltak mutáns S-fehérjéket, hogy a SARS-CoV-2 saját S-fehérjéjének (és azon belül a furin hasítási helynek) a funkcióját jobban értsék, de ők nem kombinálták az S-fehérjét HIV-1-el, mint ahogy azt Shi Zhengliék tették. Hanem, ahogy azt írtam anno kritikaként Shi Zhengliékről itt én is, Shi Zhengliékkel ellentétben a labormunka-biztos VSV-vírust használták vektornak. 
  • A német kutatók egyébként konzervatív következtetésre jutnak: "It will thus be interesting to determine how the multibasic motif was acquired by SARS-CoV-2, and a recent study suggested that a recombination event might have been responsible". Azért ez így a levegőben lóg nagyon.
  • A dél-koreai CDC tanulmánya arról, hogy az újra-pozitív esetek nem fertőzőek. Szoros kontaktjaikat ellenőrizték (700+ főt), és nem volt köztük pozitív lelet. Az érdekes ugyanakkor, hogy az újra-pozitívak közül az új pozitív teszt idején sokan (44,7%) mutattak tüneteket (köhögés, torokgyulladás), és ezt csak egy részüknél lehetett más fertőzéssel magyarázni.
  • Amerikai tanulmány (Uni of Washington). 1,3%-os CFR-t hoz ki az Egyesült Államokban. Prognózis: "the conservative estimate of 20 percent of the US population becoming infected by the end of this year could result in the number of deaths climbing to between 350,000 and 1.2 million. However, (the authors) were quick to add that these projections are subject to change depending on the public health response".

2020.05.22.

  • Írtam itt korábban a veleszületett immunrendszer részeként fontos szerepet játszó intracelluláris tollszerű receptorokról, és hogy már a SARS is kicselezte ezeket sokszor. Úgy tűnik, a SARS-CoV-2 rendkívül jó eredményességgel kerüli el az I. típusú interferon (IFN-I) válaszadást, ami viszont több mechanizmuson keresztül idővel túl nagy citokinválaszt indít be. Az IFN-I-blokkolás is egy komoly fegyvertény a vírus részéről, bár a végén a gazdát elpusztíthatja a citokinvihar (ahogy a cikk írja: "ez egy fegyverkezési verseny, de határfeltételekkel"). Itt a cikkben hivatkozott áttekintő tanulmány az IFN-I-válasz elkerülését szolgáló vírusstratégiákról (általában mindenféle vírus esetében). A tollszerű és a citoszol-beli RIG-I receptoroktől elhatárolódás valamilyen membrán vagy burok mögött, vagy éppen az aktiválódott receptorok által elindított, az IFN-I-válaszhoz vezető kaszkád blokkolása valamilyen ponton szerepet játszó molekulák vírusfehérjék általi lekötésével stb. Ez még csak a kezdet...
  • Közben arra jutottam, hogy elég fontos lenne tudnunk a magyar járványügytől a jelenleg ismert fertőzötteknél tapasztalt valószínűsíthető inkubációs időt. Ha igaz, hogy Kínában most hosszabb inkubációs időket látnak, akkor nálunk a tegnap előtti +42, a tegnapi +43 és a mai +37 eset még a kijárási korlátozások idejéből származhat akár, vagyis akkor a fogékony-fertőzött érintkezések számának valószínűsíthető növekedése (SI) még csak ez után fejti majd ki a hatását. A hosszabb inkubációs idő lehet akár a globálisan életbe léptetett kontaktredukciós intézkedések miatti szelekciós nyomás eredménye is, úgyhogy már csak ezért is érdekes lenne ezt jobban megnézni.
  • Egy kósza gondolat közben. A vadászmenyétek a Mustelidae családba tartoznak. A SARS-CoV-2 pedig úgy terjed a szintén ebbe a családba tartozó nyércek között, mintha csak hazatért volna közéjük. És hol van sok vadászmenyét...? Nos, hát, pl. virológiai laboratóriumokban, kísérleti állatként. Azt már megállapította konkrét kutatás is, hogy a vadászmenyétek erősen fogékonyak a SARS-CoV-2-fertőzésre. Lásd itt is. Az utóbbi kettőből az előbbi, vagyis ez a tanulmány konkrétan kínai kísérletezés eredményeit közli például.
  • Arról, hogy a szerzett immunitással kapcsolatos kilátások nem túl jók, és hogy a vakcinafejlesztés sem feltétlenül befutó. 
  • Pont azon gondolkodtam, hogy Csecsenföldre kicsit jobban rá kellene nézni, mert ha Dagesztánban gáz van, akkor náluk is rossz lehet a helyzet. Hát, Ramzan Kagyirov kórházba került Moszkvában.
  • Igazából nem lep ez meg, de a svédek úgy tartották nyitva az iskolákat, hogy egyáltalán nem próbálták a gyerekek között követni a járvány terjedését, vagy adatokat gyűjteni erről. Ha valakinek még kétségei lettek volna arról, hogy amit csináltak, az felelőtlen volt.

2020.05.23.

  • A mai napot is egy kósza gondolattal kezdeném. Tekintve, hogy mennyire rövid távúak a kilátások a szerzett immunitással, nem árt már most leszögezni, hogy a járványnak varázsütésre nem lehet véget vetni egy vakcina révén, még ha elérhetővé is válik. A járvány felszámolásához az kell majd, hogy az addigra lassuló terjedés mellett kőkeményen menjen a kapcsolatkövetés, és az útjába lehessen állni a további fertőzéseknek gyűrű-vakcinációval, vagyis körbeoltva a fertőzöttek kontaktjait (ahogy anno a fekete himlőnél is történt). A végén a kapcsolatkövető munkát tehát nem lehet megspórolni, vagy ha mégis azt teszik, akkor marad a járvány.
  • A kapcsolatkövetéssel jelenleg számos ország gondban van, például Kanada is. Ontarióban pl. jelen állás szerint az esetek kétharmadában nem tudják vagy nem próbálják felderíteni a fertőzés forrását.
  • Eközben a dél-koreaiak 46 ezer embernek mentek utána, hogy az Itaewon-klasztert felszámolják. Immár a második hullámot zárták rövidre anélkül, hogy általánosan leállították volna az életet.
  • Az eü. ellátásban keletkező alapvető zavar közben életeket követel még relatíve alacsony esetszám mellett is, ezért is óriási hiba nem foglalkozni a járvány elvágásával. Újabb ilyen eset nálunk, egy fiatal nő agyhártya-gyulladással. G.a.h.: +67881+n.
  • Hongkong megmaradt autonómiája komoly támadás alatt.
  • Oroszországban is hamar nekiláttak embereken kísérletezni a fejlesztett vakcinával (egy adenovírus-vektoros verziójuk van).

2020.05.24.

  • Az új esetek számának alakulását figyelni nálunk eléggé uninformatív, ha lehet ilyet mondani. Hetek óta hétvégén nyugszik, hét közben kel a járvány, fittyet hányva a tipikus járványmatematikára. Úgyhogy elkezdtem nézni a karanténozottak számát, és abban van egy kis mozgás: május 22-én 11668, május 23-án 11704, május 24-én 11934 fő hatóságilag elkülönítve. Ez érdekes, mert ez +266 fő, miközben az aktív esetek száma elvileg csökkent ezekben a napokban.
  • Jemenben is gondok lesznek. Az MSF 68 halottról tud saját eseteiből április 30. és május 17. között. A hivatalos adatok szerint május 17-én csak 20 halott volt. Ez minimum +48 haláleset. G.a.h.: +67929+n.
  • A cikk szalagcíme sokat sejtet, aztán annyival nem leszünk okosabbak mégsem. 125/980-as esethalálozás mellett a részleges izolációban élő dél-amerikai őshonos lakosságokra azért mindenképpen érdemes figyelni, mert immunológiailag extra naiv populációk lehetnek.
  • Missouri, US. Két fodrász (egy fodrászatnál) 140 klienst tett ki fertőzésveszélynek, miután már szimptomatikus állapotban dolgoztak. Minden vendég adatai fel voltak írva, így a helyi járványügyisek meg tudták keresni őket. "I'm going to be honest with you: We can't have many more of these. We can't make this a regular habit or our capabilities as a community will be strained", mondja erre a megyei eü. hivatal, jelezve, hogy ennyire sok embert már nem lehet tartósan követni... Jó ég, mi lett volna, ha a vendégek adatai nincsenek felírva?

2020.05.25.

  • Már csökkent itthon a karanténezettek száma (11810-re). Ez figyelemre méltó. A "csak +15 eset" kevésbé, mert vasárnap mindig visszaesés van a tesztelésben.
  • Kis történelem: a 2004-es SARS-minijárvány hátteréről. Mint ismeretes, ott elismerten laborbaleset történt.
  • A Virology blogon közben újra ránéztek a furin hasítási hely kérdésére — csak a gondolatmenet jellemzése végett idézem. Parafrázisban: "Hm, hát akkor a polibázisos furin hasítási hely tényleg jelentős, úgy tűnik. Honnét kerülhetett oda? Hát, nem tudjuk, de biztos odakombinálódott valahogyan. És mivel kínai kutatók közben kikutattak egy 61%-ig hasonló (azaz nem igazán közeli rokon, mintegy 10000+ bázissal különböző) másik denevér-koronavírust (RmYN02), az első olyat, amelyiknek szintén van egy S-fehérjés beszúródott aminosav-szekvenciája éppen az S1-S2 funkcionális elemek (az S1 a receptorkötésért, az S2 a fúzióért felel), ezért az ilyesmi akkor "biztosan" előfordul természetes körülmények között gyakrabban is, nincs ebben semmi különös." Ez egyébként lehetségesnek lehetséges. Kimérák a természetben is jönnek létre (pl. a 2009-es H1N1-influenza vírusa), de a jelenlegi ismereteink nem zárnak ki alternatív lehetőségeket sem (laborbaleset).
  • Az RmYN02 beszúródása PAA (9 nukleotidos kód); a SARS-CoV-2-nél PRRA van az S1-S2 határon (12 nukleotidos kód); P=prolin, A=alanin, R=arginin.
  • Egy érdekes, hosszú elemzés a témában, végigvesz mindent, egy aranybánya. A szerző bizonyos Yuri Deigin. Mint írásából kitűnik, az "odakombinálódott" elmélettel az a különös, hogy a SARS-CoV-2 esetében nem egyszeri rekombinációról van szó. A SARS-CoV-2-t természetes produktumként csak több, rekombinációt eredményező véletlen találkozással lehet magyarázni (egyszerre fertőzött állati egyed egyszerre fertőzött sejtjében) az RaTG13 denevérCoV, a P2V/2017-es és a (2019-es) MP789 tobzoska-CoV koronavírusok között, akkora a "filogenetikai rendetlenség". A SARS-CoV-2-nél az S-fehérje receptorkötő doménje, vagy éppen az ORF1ab génje esetében is, eltérő pontokon van hasonlóság az RaTG13-mal egyfelől, és a tobzoska-CoV-okkal másfelől. De a többször rekombinációs magyarázat még mindig nem magyarázza a furin hasítási hely történetét...
  • Apropó, koronavírusok furin hasítási hellyel, itt van egy ábra az imént idézett forrásból. Szóval van jó pár ilyen, köztük a MERS és az OC43 is, de ezek nem a SARS-CoV-2 igazán közeli rokonai (a MERS tevékről ugrott, az OC43 pedig szarvasmarhákról) - lásd a felé mutató rózsaszín nyalábot az egyébként sárga kvadránsban alább. További filogenetikai rendetlenség.

sarscov2_coronaviruses_with_furin_cleaveage_site.png

  • Kísérletek, ahol furin hasítási helyet illesztettek be laborban SARS- és más releváns koronavírusokba. 2006 (USA). 2008 (Japán). 2009 (USA). 2015 (Hollandia)2019 (Kína). A zárójelben közölt országinfók legelőször is annyiban érdekesek itt, hogy ezt a beillesztést nem egy helyen csinálták már meg laborokban, és nem egyszer, és nem is csak tegnap. Az utóbbi, a kínai eset pedig közel van érdeklődésünk helyéhez, és ott például konkrétan HKU4-es denevér-CoV-ba ültették be a furin hasítási helyet.
  • Az RaTG13-vírus fellelésének helye is megvan közben az itt tárgyalt tanulmányban: a Jünnan tartománybeli Puer városa alá tartozó Mocsiang megye, egy ottani bánya.
  • További fontos eleme a Deigin-féle cikknek a 2002-ből, Ralph Barictól és csapatától eredő cDNA (complementary DNA=egyszálú RNS-ből szintetizált DNS) technológia rövid leírása, amivel szintetizálhatók/klónozhatók és szerkeszthetők RNS-vírusok, és amivel már 2003-ban dolgoztak a SARS-on is. Példaként íme, egy 2006-os spanyol kutatás SARS cDNA-klónnal.
  • Baricék a cDNA-technológiát tökélyre vitték, és eljutottak a "no-see-um" (észrevehetetlen) szintetizálásig. És rendszeresen dolgoztak kimérákon sokakkal, így Shi Zhengliékkel is kollaborációban, például ismételve és variálva egymás kísérleteit.
  • Ezt a kollaborációt a 2014-2017-es amerikai GOF (gain of function) kutatási moratórium is ösztönözte.
  • További, a 2002-2003-as SARS-CoV-ot érintő laborbalesetek. Szingapúr, 2003. Tajvan, 2003. A 2004-es kínai incidens pedig nem egyszeri volt, hanem kétszeri
  • Mindebből egy lehetőség következik, ami mellett nem szól konkrét bizonyíték, viszont nem is söpörhető le az asztalról, ha fegyelmezetten gondolkodik az ember. Shi Zenglinek és az ő laborjának egy esetleges balesethez egyébként nem is feltétlenül kellett, hogy köze legyen. Az övéhez hasonló kutatások is tudnak járványszerűen terjedni egy szakmai közösségen belül. Az emberre közvetlenül veszélyes vírusok, köztük gain-of-function kimérák rutinszerű, növekvő számú laboratóriumban végzett szintetizálása pedig egészen bizonyosan kockázatos
  • Hogy a témával sokan foglalkoznak jelenleg, azt az internetes keresők forgalmából az alábbi egyszerű indikátorral mutatnám ki. Íme. Screenshotok két perccel ezelőttről, Bing és Google.

sarscov2_mojiangvirus_binggoogle_20200525.jpg

  • Hogy legyen itt más is közben. Epikurosztól jött ez a review előtti anyag. Immunválaszok vizsgálata. Amerikai tanulmány, 71 beteg vizsgálata. A páciensek heterogének és jól tipizálhatók. Egyharmaduknál alig van immunválasz. Elgondolkodtam, honnan ismerős az egyharmados arány kapcsolódó kontextusban? Innen: Shanghaiban a vizsgáltak egyharmadánál nem találtak kielégítő antitest-mennyiséget.
  • Kevesebb az extrémen korai koraszülött a dánoknál a kijárási korlátozások (és a járvány) idején. "The reasons are unclear", szóval lesz miért vizsgálódni.

2020.05.26.

  • Ezzel a tanulmánnyal kezdem, hogy a víruseredet kérdését ezúttal a természetes felbukkanás mellett szóló érvek kapcsán is vizsgáljuk. Marha-koronavírussal kísérleteztek a kutatók, szarvasmarha- és emberi sejtkultúrákon (pl. HRT-18-ason). A sejttenyészeteken való "áthaladást" követően a produktum-vírusok konszenzusos genetikai szekvenciája a várakozásoknak megfelelően eltért a sejtekkel való találkozás előttitől. Ami igazán érdekes: jó pár esetben megjelent egy SRRR furin hasítási hely az S-fehérje S2-es funkcionális elemében. Mivel ez evolúciós léptékkel gyors és konzisztensen végbement változás volt, a kutatók arra a következtetésre jutottak, hogy ezek nem "de novo" mutációk voltak, hanem olyan, nem-konszenzusos szekvenciák, melyek eleve jelen voltak, és a szelekciós nyomás hatására lettek konszenzusossá a víruspopulációban. Ebből két tanulság adódik: 1) ilyesmi megeshet laborban, ahogy itt történt; 2) megeshet a természetben is.
  • Wuhanban megcsinálták közben a sample poolingot (csoportban összekeverős tesztelés a hatékonyság érdekében), hogy 10 nap alatt mintát vegyenek mindenkitől, és gyorsan eredmények is legyenek, az újra-kitörést megelőzendő.
  • A D-vitaminról és hiányának jelentőségéről már sok tanulmány született, és alighanem lehet köze ennek az északi országokban élő sötétebb bőrszínű emberek rosszabb rizikószintjét tekintve is. Szó esik erről a svéd-szomáliak kapcsán is ebben a rövid elemzésben.
  • Kevesebben haltak meg ebben a szezonban az influenzától? Valószínű.
  • A WHO "azonnali második csúcsok" lehetőségére figyelmeztet. Az teljesen jogos észrevétel tőlük, hogy a "hullámok" alapvetően az emberek fejében létező fogalmak. A vírus szimplán csak terjed, folyamatosan, ahogyan tud. Viszont azért nehéz az ilyen figyelmeztetéssel eredményt elérni, mert a halottak számában a változás mindig késéssel követi az esetszám növekedését, az esetszám növekedése pedig késéssel követi a fertőzés terjedését, pláne olyan országokban, ahol nem tesztelnek eleget, és nem érdeklődnek az "enyhe" esetek iránt. Akár egy hónapnál több is lehet a különbség. Így aztán könnyű beleszaladni dolgokba.
  • Dr. Seheulttől közben itt van egyszerű, de nagyszerű formában az ábra, amit én kicsit bonyolultabban közöltem korábban, a COVID-19 hipotetizált mechanizmusáról az erekben.

sarscov2_rogerseheult_mechanism.jpg

  • Az NEJM-ből itt van egy jó tanulmány az erek patológiájáról. Kulcsszó az angiogenezis — a tüdő az erekben bekövetkező mikrotrombotikus események miatt gyakorlatilag új érpályákat keres a forgalom lebonyolítására.
  • Erős kritika a magyarországi járványhelyzettel kapcsolatban egészség-gazdaságtani szempontból (Molnár Márk Péter). A járvány betegei kapcsán olyan ráfordítások, amilyeneket más eü. problémáknál a politikának esze ágában sincs megtennie. Közben az intézményekben élő legveszélyeztetettebbek védelme gyengén sikerült, pedig olyan korai volt a kijárási korlátozásokról/kontaktredukcióról intézkedés, hogy a rengeteg ellátás elmaradása mint annak rejtett költsége, és az ehhez kapcsolódó egészségvesztés megkérdőjelezheti az intézkedés helyességét.
  • Mégiscsak lenne keresztimmunitás a humán koronavírusok között a T-sejteken keresztül...? Legalábbis azoknál, akiknél a SARS-CoV-2 kivált komolyabb immunválaszt B- és T-sejtekkel (van, akinél nem). Nem kicsit jelentős kérdés pl. vakcinafejlesztés, vagy akár a stratégiai kilátások értékelésének szempontjából. Elképzelhető, hogy korábbi humánkoronavírus-klaszterek jelentik a terjedés korlátját azokon a helyeken, ahol relatíve lassabb a terjedés? A SARS-CoV-2 terjedési hálózata a korábbi koronavírus-hálózatok közötti térbe ékelődik be? Ezt egyelőre csak merész hipotézisként vetem fel. 
  • Nigériában (Rivers State) szaglás- és ízlelésvesztéssel járó betegségben 11 halott, nyomoznak. SARS-CoV-2?
  • A nyércfarmi esetekből Hollandiában már hét lett összesen, most egy család - nyilván körbeadták, és talán csak az egyikük kapta a nyércektől.
  • Itt ausztrál kutatók mondják, hogy a laborbaleset-elméletet komolyabban kellene venni. Lehet, hogy a válasz kényelmetlen a tudósoknak, de nem lehet kényelmetlen a tudománynak — ez lenne lényegében az üzenet.
  • Mexikóvárosban az év első öt hónapjára 8072-vel haladja meg a szezonális átlagot a halálozás, közben a SARS-CoV-2 1655 halálesetet okozott. G.a.h. a különbözet felével így: +74346+n.
  • A hivatalos spanyol halálozási adatot közben lefelé revideálták, mert az áldozatok világszinten, nem-konzervatív módszerrel (de reálisan) százezres nagyságrendűre becsülhető alulszámlálása mellett nyilván pont ez kell most a tisztánlátáshoz... a politikusoknak. Indoklásul kétszer számolt esetekre hivatkoztak, és olyan esetekre, ahol nem volt PCR-tesztes megerősítés — az utóbbi indoklás alapján utólag ezt csinálni elég sunyi húzás. Az adatok professzionális káoszosítását bejelentő tisztviselő, Fernando Simón hétpróbás... ööö... tisztviselő. Ő volt az, aki még a spanyol járvány robbanásának pillanataiban sem látta, miért kellene a tömegrendezvényeket elkerülni. Ezennel az 1900 levont spanyol eset fele (csak a fele, a konzervativizmus jegyében) megy a járvány addicionális halálozásának kategóriájába. Szégyen. G.a.h.: +75296+n.
  • A vízben és talajban éldegélő, de azért embert fertőzni is képes Chromobacterium violaceum, mely pl. a violacein nevű antibiotikumot is előállítja, vírusölő faktorokat is kiválaszt (CbAE-1 és CbAE-2), melyek hatékonyak a SARS-CoV-2, a dengue, a zika és a HIV ellen is például, egy új kutatás eredményei szerint (h/t Epikurosz).
  • Az ilyen kutatások miatt (itt történetesen a leronlimab szerepéről gyulladáscsökkentésben, CCL5 és IL-6 csökkentésére) valószínűleg jobb később megbetegedni a koronavírustól, ha nagyon muszáj. Majd akkor, ha már lezajlott sok randomizált kontrollvizsgálat, és kifinomultabbak lesznek a kezelési protokollok. Egy ilyen komplex betegségnél ez sokat számíthat, pláne kumulatívan.

2020.05.27.

  • Leporoltam egy kicsit a 2009-2010-es H1N1-es aktát, mert most már van értelme nagyobb ívű összehasonlításokat tenni, úgyhogy ma az első egypár pont erről szól, aztán vissza a SARS-2-eshez. A H1N1 első tizenhét hónapjában (2009. áprilistól 2010. augusztusig) projekciók alapján 212200 haláleset (range: 105 700–395 600) volt hozzá köthető a légúti fertőzéssel közvetlenül összefüggésben, és további 83300 (range: 46 000–179 900) a fertőzéssel kapcsolódó kardiovaszkuláris kondíciók miatt. Úgy, hogy a H1N1-et nem igazán próbálták feltartóztatni (összesen volt 18500 laboratóriumi teszttel megerősített haláleset 2010 augusztusáig). Ez azt jelenti, hogy a SARS-CoV-2 tizenhét hónap alatt lazán hozta, sőt túlszárnyalta ezt a szintet minden erőfeszítés ellenére (bár egyes politikusok, rettenthetetlen menedzserek és egyéb "influenzerek" azért dolgoztak ezeknek az erőfeszítéseknek az aláásásáért, mint láthattuk számos alkalommal).
  • Nagy különbség a H1N1-nél, hogy ennyi haláleset ott minden valószínűség szerint jóval nagyobb számú esetből adódott, a SARS-CoV-2-éhez képest legalább egy, de inkább két nagyságrenddel kisebb esethalálozási arány mellett.
  • Ugyancsak nagy különbség a H1N1 esetében, hogy az áldozatok mintegy 80%-a lehetett 65 év alatti. Köztük a terhes nők fokozott kockázatnak voltak kitéve. (Egészség-gazdaságtanosok ilyenkor nekiállnak a várható hátralévő életévek értékét tekintve kalkulációkat végezni, Disability-Adjusted Life Years stb.)
  • Vérrögökkel itt is voltak gondok a H1N1-nél is, bőven.
  • Még a tengeri vidrák is elkapták a H1N1-et, pl. Washington államban sikerült ezt náluk kimutatni. Arról jut eszembe, ami most a nyércekkel történik Hollandiában.
  • Visszatérve a SARS-CoV-2-höz, újabb genetikai tényező szerepéről vannak kutatási eredmények, miután az Egyesült Királyságban feltűnt, hogy a demencia szignifikáns komorbiditás volt COVID-19-nél. Így derül fény az ApoE e4 genotípus kockázati faktor voltára.
  • Vajon mi folyik Venezuelában? Az Orinoco folyón kívül. Egész Dél-Amerika megborulóban éppen, náluk meg a nyomor közepéből szerény kis jelentések jönnek.
  • Így néz ki a járvány terjedése, pl. akár napjainkban is. Temetés (nem koronavírusos elhunyt temetése), összejönnek családok stb.
  • Ez egy nagyon jó cikk arról, hogyan lenne enyhíthető a járvány terhe, de a legjobb megoldást kihagyja a számításból: a járvány felszámolását.
  • Információk arról, hogyan blokkolja a veleszületett immunválaszt a SARS-CoV-2, lehet kapaszkodni. Tanulmány. A fő hisztokompatibilitási komplex (MHC, Major Histocompatibility Complex) részét képező gének termékeiként a sejt felszínén jelenlévő, antigén-prezentáló molekulákat hatástalanítja (MHC-I), és így a fertőzött, de fertőzöttként meg nem jelölt sejtek ellen nem lép fel az immunrendszer citotoxikus T-sejtekkel. Idézek egy kicsit eredetiből is, mert virológiailag figyelemre méltó: "Here, we show that the viral protein encoded from open reading frame 8 (ORF8) of SARS-CoV-2, which shares the least homology with SARS-CoV among all the viral proteins, can directly interact with MHC-I molecules and significantly down-regulates their surface expression on various cell types." Szóval ez az ORF8-as leolvasásikeret-szekvencia is érdekes, új, patogenitást fokozó kis fejlemény, indítótól a záró kodonig.
  • Az amerikai Vöröskereszt egy kommunikációs vezetője hunyt el 51 évesen COVID-ben, hosszú betegség után. Talán éppen ő volt a százezredik az Egyesült Államokban — ezt nem kutatóként teszem hozzá.
  • Cseljabinszk, Oroszország. Itt eddig 18 halálesetet nem számoltak az "alapbetegségekre" hivatkozva az orosz adatmágusok. G.a.h.: +74364+n.

2020.05.28.

  • Klaszterek Magyarországon. Miközben csendesen csordogál járványunk csermelye, és napról napra hasonló számok jönnek az új esetekről szóló jelentésekben — ami a járványmatematikával nincs egyébként annyira összhangban, pláne kijárási korlátozások után, és nagyon pro-aktív tesztelés és kapcsolatkövetés nélkül, ugye —, hírek két friss klaszterről. Buják, Nógrád megye, honvédségi üdülő. Budaörs, óvoda/bölcsőde. Pár nappal korábbról ott a piliscsabai klaszter is. Ha valakinek kétségei lennének: ez tehát ugyanaz a vírus, mint amelyik a világban máshol is terjed, méghozzá gyorsan, ha hagyják. Kérdés: Mi állítja meg egy klaszter létrejöttét például egy tömött budapesti szórakozóhelyen? Amilyen van már jelenleg is, a nagy fellazulás eredményeként.
  • Emlékeztetőül: az Egyesült Államokban Trump február 2-án mondta, hogy "We pretty much shut it down coming in from China." Nem volt az olyan régen.
  • Remek cikk Dagesztánról és Csecsenföldről a BBC orosz kiadásától. Előbb a Moszkvából hazaözönlöttek hozták a vírust. Aztán nekik körbe kellett mindenkit látogatni, mert a szokás úgy diktálja, ha már otthon járnak — úgyhogy nem tartottak kéthetes önelszigetelést. Aztán jöttek a szokásos nagy esküvők és még inkább a temetések. Három napig szorosan együtt, akár ezer ember is, ilyen alkalmakon. Utóbbiakon nem megjelenni elfogadhatatlan tiszteletlenség, ez viszont jól előreláthatóan a fertőzés terjedéséhez vezetett. Az eredmény komoly átfertőződés, de legalább a helyi közösségek erősek, megszervezik a saját válaszadásukat valamilyen szinten. Családok, falusi tanácsok (dzsamatok) és szorokovkák (Сороковка; ami lényegében karanténbrigádnak felel meg szó szerinti fordításban).
  • A vérrögök a tüdőben, ezúttal fekete-amerikaiak boncolása nyomán. A tanulmány maga.
  • Egy egészséges, huszonhét éves ember is meghalhat COVID-ben.
  • Közben egy még jobb oktatóvideó a renin-angiotenzin rendszerről, mint amiket eddig linkeltem. a sheddase (kb. "leválasztáz") enzim szerepét is mutatja az ACE2 aktív, AT-II-est célzó formájának felszabadításában a transzmembrán elhelyezkedésű fehérjemolekuláról.
  • Ma láttam az RTL Klub híradóját, ahol felvetették, hogy Dzsudzsák Balázs azért szeghetett meg karantén-előírásokat, mert diplomáciai útlevele van, és akkor "diplomáciai mentességet élvez". Nos, nem. A diplomáciai útlevele természetesen nem mentesíti jogszabályok betartása alól sehol, Magyarországon pedig a diplomáciai útlevelét főként arra használhatja, hogy igazolja a személyazonosságát, ha kell, és csak az van nála. Azért az, hogy Dominic Cummings megúszhatja Angliában, még mindig jobban meglep.
  • Minneapolis, az ereje teljében lévő Iszlám Államot idéző rendőri erőszak, zavargások. Elképesztő ezt így összehozni egy járvány közepén. A rendőrök által meggyilkolt George Floyd egyébként étteremben dolgozott, és a korlátozások idején elvesztette az állását, úgy hírlik, ezért volt az utcán, amikor belekötöttek.

2020.05.29.

A nap fotója kezdésnek: Khalid Abdullah (Reuters). Houthi járőr Szanaában, Jemenben. Már Szíriában is láttam, hogy a harcoló feleknél alapfelszerelés az eü. maszk.

sarscov2_yemen_militia.jpg

  • Mint ismeretes, Oroszországban Moszkvából vitték haza a fertőzést sokan az ország távoli szegleteibe, pl. a Kaukázusba, sőt még a határokon túlra, Közép-Ázsiába is, a belső, illetve poszt-szovjet kvázi-belső migrációból, miután a korlátozások enyhültek. Most India van soron, jön a lazulás, mennek az emberek ki a városokból, az ottani belső migrációból, és olyan helyekre viszik a vírust, ahol az emberekből még csak számok sem lesznek, ha a járvány áldozatául esnek.
  • Talán mondani sem kell, a kieső eü. ellátás miatt is van halálozás Indiában (is). Ez a cikk egy dialízises esetet említ. G.a.h.: +74365+n.
  • Az Egyesült Államokban is kiürül az eü. rendszer, és elmaradnak a betegek, részben önszántukból, részben az elektív beavatkozások, részben egyéb terápiás kezelések leállása miatt.
  • Az 4,5 éves mozgó átlagot meghaladó halálozás Magyarországon, EuroMOMO. Vetettem az adatokra egy pillantást, és a következő a helyzet: a tavalyi év 48. hete óta van a mutató pozitív tartományban, nyilván lehet ez influenza és egyebek miatt. Az idei 9. héttől a 16. hétig egy sztenderd eltérésen felüli az állás. Ez a közelében sincs az olasz vagy a belga helyzetnek, nyilván, de azért igen figyelemre méltó, azt mondom. A 12. héten pl. 1,91 az érték; 65 év felettiek esetében pedig 2,04. Az volt március vége. Amikor kevesebben voltak az utakon, és ez a szezonális átlagot jelentősen alulmúló közútibaleset-számot produkált az év első négy hónapjában, úgy, hogy abból igazából csak másfél hónapra voltak érvényesek a korlátozások).

sarscov2_hungarymortalityzscore.jpg

  • Közben járványunk csermelye csendesen csordogál továbbra is, az elmúlt három nap eredménye tesztelt új eseteket tekinte +22, +23, +25, de most majd jön a hétvége, és hát ilyenkor a vírus is tudja, hogy nem illik terjednie stb. Kieg. május 30-án: a tippem "az adatok lenyugvásáról" nem egészen jött be, szombatra +26.
  • Tanulságos adatok Érdről: 80 teszt, 66 eset, 6 halott a mérleg május 24-ig bezárólag.
  • Adatok arról, hogy a korai hidroxiklorokinos kezelés jó lehet. A korai. Azaz nem a retardált tanulmányok által tesztelt késői. További adatok a klorokin hasznosságáról, egy másik tanulmányban. (Preprintek.)
  • A nagy Lancet-féle HXQ-tanulmányról pedig, amelyik kihozta, hogy a HXQ nem is jó... ööö... már megint zavartan dörzsölgetem a szemeimet, mert az ott használt adatok tényleg komolytalannak tűnnek. Shitty science strikes again?
  • Ezen a ponton kénytelen vagyok csúnyákat gondolni, mert az bizony érdekes tény, hogy a HXQ a maláriánál és a lupusnál közben működik, ez pedig jó ideje adott tömeges használatot jelent. 
  • A CNN minneapolisi tüntetésekről tudósító stábját se szó, se beszéd, letartóztatták, élő adás közben, miközben Trump a tüntetők szétverését követeli a Twitteren. Sajnos a következő választás az Egyesült Államokban már tényleg a demokráciáról fog szólni, ez fejeződik ki abban, ahogyan különböző szereplők viselkednek. És bár Trump levitte a mércét mélyre, ez annyival lejjebb viszi még onnan is, hogy az esemény ún. demonstrációs hatása globálisan érezhető lehet majd. Magyarán felbátorítólag fog hatni sok rezsimre világszerte.
  • Jemenben a Save the Children szerint kb. 400-an halhattak meg az elmúlt héten csak Adenben. Ez +300 konzervatívan nézve a hivatalos adatokon felül, amik egy polgárháborús ország esetében nem sokat érnek. G.a.h.: +74665+n.
  • Palkó Judit háziorvos kitüntetése, miután az iráni hallgató esetében ő kapcsolt kellően gyorsan, hogy ez koronavírus lesz, annak idején, még februárban. Gratulálunk!
  • Kínai közlemény szerint a Huanan Seafood Market inkább szuperterjesztős incidens helyszíne volt, mint a Ground Zero, és ezt alapvetően nem nehéz elfogadni egyéb, ráutaló bizonyítékok alapján. A legfőbb új információ, hogy a piacon talált állatokból vett minták közül egyik sem volt pozitív a vírusra.
  • Ha turistaként COVID-beteg leszel, Ciprus ingyen eü. ellátást biztosít.
  • Oroszországban Moszkva és környéke esetében beismertek több száz korábban koronavírusosnak be nem számított halálesetet (+922), de ez a nemzetközi adatszolgáltatásban egyelőre nem jelent meg. Ha majd megjelenik, akkor levonom a g.a.h.-ból.
  • Egy jó cikk a koloniális mentalitás szerepéről abban, ahogy a nyugati országok benézték a járványt, és azon túl még a kérdés egyéb vonatkozásairól is.

2020.05.30.

  • A Florida Today beszerezte információkikérés útján az idehaza kérés nélkül is megosztott egyéni alapbetegség-adatokat, köztük a 25 legfiatalabb floridai áldozat alapbetegségeiről is mindent. A tézisük persze az, hogy ezek az emberek amúgy is rossz állapotban voltak, csak hát én nem tudom, hogy valakinek az asztma miért lenne elég ok a halálra önmagában, vagy mondjuk a szteroidokkal kezelt látóideggyulladás, vagy hogy mi van azzal a négy beteggel, akiknél semmilyen alapbetegség nem volt, de még a diabéteszeseket sem gondolnám effektíve halálra ítéltnek. Egy betegnél az influenza A-t sikerült kimutatni, pontosabban csak azt, úgyhogy őt is leírták nem "tisztán" koronavírusos halottnak. Az érvelés lényege, ha jól értem, az, hogy "ezeket az embereket felesleges védenünk, mert ha védenénk őket, akkor nem halnának meg". (Így néz ki a fasizmus 2020-ban.) A több esetben is megfigyelt hiperlipidémia annyiban mindenképpen érdekes, hogy az LDL-koleszterin és a trigliceridek jelentőségét mutatja COVID-19-nél, ahogy azt eddig is hipotetizálni lehetett. 
  • Ugyancsak Florida. Több ottani újság is megírta, hogy vannak adatok, amikből egyesek megpróbálnak kihozni valamit, pedig nincs is ott semmi látnivaló. Ha az ember bírja cérnával, a végén még az adatokig is eljut, és naná, hogy van ott látnivaló. Ennyire ugrott meg Floridában a tüdőgyulladásos + influenzaszerű tünetek nyomán történt halálesetek száma január 20. után valamikor (talán április környékén, nehezen leolvasható az ábráról) — a fekete vonal jelzi, egyértelműen a szezonális átlag fölé megy.

sarscov2_floridapneumonia.jpg

  • A HXQ+cink jól működött egy texasi idősgondozóban is, korán kezdett kezelésként, az első pozitívra tesztelt személy tüneteinek jelentkezése után, azzal, hogy gyakorlatilag profilaxisként (PEP) adták a többieknek.
  • Indiában is vannak kormányzati adatmágusok, naná. Ezt a cikket anno nem linkeltem. Május 7-ig a delhi Manohar Lohia, a Lady Hardinge Medical College és a Delhi and Jhajjar AIIMS kórházak 116 COVID-os halálesetet jelentettek, de a szövetségi állami kormányzat egy nagyon független bizottsággal is megvizsgáltatta az eseteket, hogy csak az "elsődlegesen" a koronavírus miatt elhunytakat számolják aztán, és így lett a 116-ból 33. G.a.h.: +74748+n.
  • Nagyon jó összefoglaló Trump fenyegetőzéséről a WHO-ból való kilépéssel kapcsolatban.

2020.05.31.

  • A Lancet-tanulmányról, amelyik kihozta, hogy a HXQ még veszélyes is lehet. Az egyik szerző konkrétan start-up vállalkozó, és orvosi adatok szállításában utazik. Az adatai pedig komolytalanok.
  • A koronavírus rejtett halálozásának egy további aspektusa: ha valakit koronavírusosan operáltak, 30 napon belül a szokásosnál nagyobb eséllyel hal meg, pl. DIC vagy tromboembóliás esemény következtében; 14,9% helyett 23,8% a 30 napon belüli mortalitás.
  • Tüntetések, zavargások + gyújtogatás és fosztogatások is, az Egyesült Államokban többfelé. Ez így biztosan hatással lesz a járvány terjedésére. Louisville, Kentucky: egy rendőr gázpatronnal az NBC riporterét lőtte meg teljesen tudatosan. Már a Bellingcat is foglalkozik a jelenséggel. Mostanra lőttek külföldi újságírókra is. Egy másik riportert megvakítottak. Trump közben lehetővé teszi az amúgy is egy paramilitáris erőre emlékeztető rendőrségnek, hogy katonai eszközöket szerezhessenek be korlátlanul. Újabb módon tesz alapvető hozzájárulást a közegészségügyi katasztrófához az Egyesült Államokban. Egyben azt is világosan kifejezi, melyik közszolgáltatásba fektet szívesebben a hatalmi elit, az emberek gyógyításába, vagy a fegyelmezésükbe.
  • A koronavírus mellett nem volt egyszerű a felkészülés, de tegnap sikerült a SpaceX élőszemélyzetes indítása.
  • Más: a Wastewater-Based Epidemiologyról (szennyvíz-epidemiológia) bővebben ebben a disszertációban (Meleg Edina, PTE). Érdekes volt megtudni, hogy már az 1960-as években megtörténtek az első hazai szennyvíz-virológiai vizsgálatok, a gyermekbénulás elleni oltásokhoz kapcsolódóan, ezekkel az eredményekkel egészítve ki az oltóprogram értékelését.

2020.06.01.

  • Floridával már két napja foglalkoztam, és most már a CDC-től is volt, aki elismerte, hogy szignifikáns adatokról van szó a szezonális átlagot meghaladó tüdőgyulladásos halálozások esetében. Kb. +300 esetről, akiket nem teszteltek koronavírusra, de minden bizonnyal a járvány áldozatai. Senki nem akarta eltitkolni ezt egyébként. Mutatja viszont, hogy mennyire hajlamosak vagyunk inflálni az influenzaadatokat, mivel teszt nélkül hagyományosan automatikusan oda húznak be minden tüdőgyulladásos halálesetet. G.a.h.: +75048+n.
  • A koronavírus részben genetikai okokból, részben gazdasági körülményekkel és társadalmi egyenlőtlenségekkel összefüggésben arányon felül öl a fekete-amerikaiak és az őshonos népesség körében. Projekciók alapján azonos (lefelé nivellált) esethalálozási arányok mellett vagy tizenötezer nem-fehér amerikai lenne még életben.
  • Svédország továbbra is pocsékul áll, vezető helyen az egymillió főre jutó napi halálesetek számában.
  • Európai arisztokrata bulika Spanyolországban, fertőzöttekkel.
  • Fontos trend. Görögország a briteknek nem nyitja ki egyelőre a kaput. Dánia és Norvégia Svédországgal szemben folytat hasonló politikát, tekintettel a járványügyi helyzetre. Remélhetőleg ez fontos ösztönzőt jelenthet majd hülyepolitikusok és hülyejárványügyisek számára, hogy a járvány felszámolásának szükségességéről elgondolkodjanak.
  • Németországban és Hollandiában már permanens szennyvíz-megfigyelő rendszerben gondolkodnak, hogy korán észleljék, ha a koronavírusos esetek száma valahol megugrik. 

Holnaptól új bejegyzés következik majd.

süti beállítások módosítása