Előzmények (korábbi kutatási jegyzeteim a témában):

• 2020. január 28-tól 2020. február 23-ig;
• február 24-től március 6-ig;
• március 7-től március 21-ig;
• március 22-től április 3-ig;
• április 3-től 14-ig;
• április 15-től 25-ig;
• április 26-tól május 15-ig;
• május 16-tól június 1-ig;
• június 1-től június 14-ig;
• június 15-től június 30-ig;
• július 1-től július 20-ig;
• július 21-től augusztus 31-ig;
• szeptember 1-től szeptember 27-ig,
• szeptember 28-tól október 25-ig,
• október 26-tól november 22-ig;
• 2020. november 23-tól 2021. január 8-ig;
• 2021. január 9-től február 7-ig.

A következő időszak egyik legizgalmasabb kérdése virológiai természetű: dominánssá tud-e válni a D614G, az N501Y és az E484K spike-mutációk együttes terjedése, kombinálva az erősebb fertőzőképességet a vakcinaszökő tulajdonságokkal? Ilyen variáns már megjelent a szekvenált vírusok között, nem csupán elméleti lehetőség. Ha ez a "kombós" variáns kerülne előnybe a vírusevolúció folyamata során, az elég kedvezőtlen fejlemény lenne.

Emellett továbbra is "a" központi stratégiai kérdés, hogy tovább tart-e majd a népesség átoltása, mint a védettség, amit a vakcina biztosít? Meddig áll fenn a vírusevolúcióhoz praktikusnak mondható "részleges védettségű populáció + széleskörű terjedés + evolúciót ösztönző plazmakezelések nagyszámú betegnél" képlet? Globálisan érdekes ez a kérdés — aki a pandémia ellen eredményes fellépést akar, az globálisan kérdezi.

Mivel Kínán kívül nagyjából egy éve pörgött fel igazán a járvány, és azóta jegyeznek COVID-haláleseteket, érdemes lehet alább még egyszer áttekinteni a teljes népességre vonatkozó halálozási arány szempontjából a leginkább kiugró adatokat, mielőtt folytatnánk a szokásos napi szintű frissítésekkel. Van egyébként olyan mikrorégió, amelyikben a halálozás a táblázatban szereplő adatokat is meghaladta: Valle d'Aosta, Olaszországban, a svájci és a francia határnál — jelenleg 0,32%-nál jár. Mindeközben a járvány hivatalos globális halálozása 2021.02.08-án reggel 8 órakor 2327437 fő; ehhez jön +714326+n fő konzervatívan dokumentálható addicionális halálozás (Σ=3041763<).

2021.02.08-14.

• Brazília, dokumentált újrafertőződés az E484K mutációval. Kontextusnak: több ilyen volt már, és nagyságrendekkel több dokumentálatlan eset van. Mondjuk az érintett hölgy az első alkalommal lazán kezelte magát prednizonnal kb. az első tünetekre, amit akut vírusos fertőzésnél annyira nem ajánlott próbálgatni.
• Intenzív osztályi mortalitás. Hogy van-e javulás jobb terápia hatására, azt gyakorlatilag nem lehet megállapítani, mert nincsenek korcsoportokra normalizált adatok időszaki bontásban.
• Jelentés a dániai nyércjárványokról.
• Izraelben kezdi láthatóan lenyomni a járványt a vakcináció.
• Interjú Salát Gergellyel. A kínai Sinopharm-vakcináról gondoljunk bármit, a motivációkról gondoljunk bármit, az egy érdekes tény, hogy jelen állás szerint annyira sikeresek az otthoni kitöréseik kezelésével, hogy gyakorlatilag főként exportra termelnek — egyelőre, ha minden igaz.
• Vizsgálat indul a vakcinakeverések hatékonyságáról. Nem kis etikai dilemma ehhez toborozni, és nem kis stratégiai dilemma ebbe önkéntesként beállni, de legalább korrekt vizsgálatot csinálnak ebben a kérdésben.
• Dél-Afrikában leállnak az AstraZenecával, mert úgy ítélik meg, hogy nem elég hatásos a B1351 ellen. A fejlődő országok szempontjából pocsék hír, a COVAX nézhet valami új megoldás után.
• És ez az a variáns, amelyiknek a terjedése éppen látványosan halad... Tirolban (293 megerősített eset). Itt a síszezon, yay.
• Idevág: kijött a szakértői jelentés a tavalyi ischgli síelgetéssel kapcsolatos járványügyi-döntéshozatali kudarcokról.
• A "food desert" sajátos amerikai jelensége mellé ebben a cikkben bejön a "medical desert" is. A COVID társadalmilag egyenlőtlen halálozásának egyik oka pedig a különböző kórházak messze nem egyenletes terhelése.
• Pfizer-BioNTech-vakcinával oltottak között terjedés egy német idősotthonban. Lehet, hogy a súlyos betegséget itt is sikerült megelőzni, ami szuper, viszont látható a "leaky vaccine" probléma, ami nem annyira szuper.
• Dél-Afrikával kapcsolatban érdekes lehet még, hogy a Sinopharm-vakcináról — lényegében a Sinopharmhoz köthető kutatók — kihozták, hogy csak csekély mértékben csökkent a hatásossága a B1351 ellen (preprint).
• Az L452R mutációt hordozó kaliforniai variáns terjedő jelölése CAL20C. Ez volt a legutóbbi Los Angeles-i hullám hátterében.
• 117 évesen átesni a fertőzésen... wow. Sajnos van lesújtó hír is, ez pedig a 100 éves Captain Moore halála.
• Mexikóváros: a kórházakba nem könnyű bejutni, és itt is hiány van orvosi oxigénből.
• A SARS-CoV-2-höz rokonítható koronavírusok előfordulásáról DK-Ázsiában. Különös tekintettel az RmYN02-re és a RacCS203-ra, melyekről SARS-CoV-2-rokon nemzetség tagjaiként beszél a cikk, melyet SC2r-CoV-családként jelöl. A RacCS203 itt az új tag, melyet viszonylag elterjedtnek találtak Thaiföldön, Chachoengsao tartományban. SC1r-CoV-családként említi a cikk az RaTG-13-at és a SARS-CoV-2-t, dacára annak, hogy csak 96%-os a genomegyezés közöttük (a SARS-CoV-2 harmincezer bázisa mellett), és dacára annak, hogy az RaTG-13-ban nincsen furin által hasítható hely az S1/S2 határon. Azon is gondolkodom közben, hogy minél több idő telik el a SARS-CoV-2 tömeges terjedése mellett a világban, annál kevésbé lesz hiteles bizonyíték egy hozzá ténylegesen közeli rokon fellelése valahol az eredet igazolására.
• Mindenesetre íme, a szerzők szerint az "SC1r-CoV-okat hordozó" (= az RaTG-13-at hordozó?) Rhinolophus-repülőkutyák földrajzi elterjedése + a vírus-családfa, ahogyan ők látják (az utóbbi részletet én vágtam be a térkép alá így).

• Mint fentebb már említettük, Lombardiában még csak a népesség 0,27%-a halt meg, Valle d'Aostában pedig 0,32%, úgyhogy az olasz kormány nyitja a sípályákat. Túl azon, hogy ez egy izgalmas rekordkísérlet annak kiderítésére, hogy a népességnek mekkora hányadával tud végezni a koronavírus-járvány, nekünk is kellemetlen lesz, mivel az alpesi síkomplexumokban már terjed a vakcinaszökő dél-afrikai vírusvariáns. Ez van. 2019 óta egy olyan katasztrófafilmet nézünk, ahol vannak hülyék, akik a műfaj hagyományának megfelelően mindig rossz döntéseket hoznának... és sokfelé ők a döntéshozók, úgyhogy meg is hozzák ezeket a döntéseket. Az olasz döntésért lelkesedő nyitáspártiak figyelmébe: veletek együtt leszek szomorú, amikor minden zárva lesz, mert most fontos volt síelgetni szabadon. Kieg.: az olasz kormány végül belátónak bizonyult, last minute jelleggel.
• Melbourne-i szállodai tapasztalatok alapján valószínű, hogy az inhalálók használata nagyon hatékony aeroszolos terjesztéshez vezethet. A belélegzett aeroszolok kifelé is megtalálják az utat.
• Dél-Afrikából eddig 29805 fő addicionális halálozást számoltam. A legfrissebb halálozástöbbleti adat 138 ezer fő, úgyhogy ennek felét véve (69000), és levonva az eddigieket, kijön +39195 fő. G.a.h.: +753521+n. Eastern Cape tartomány különösen súlyosan érintett. A bruttó halálozás elérheti a népesség 0,34%-át.
• Ohióban a jövő héten fognak lejelenteni +4000 halálesetet, mert ezeket október-november folyamán tévesen kihagyták a számlálásból. Némi leegyszerűsítéssel egyébként az a probléma forrása, hogy a kórházi adatokat számolják elsődlegesen.
• Tavaly írtam a járványtagadó tanzániai vezetésről. Hát, most itt van egy vérzéses esetekkel járó járványszerűség, gyorsan ki is rúgták azt a közegészségügyi tisztviselőt, aki pedzegette, hogy ez járványszerű. Biztosan nem ebola például. Ha a vezetés azt mondja. Egyébként is, tán az ebolában is csak a gyengébbek halnak meg, nem lehet itt gond.
• Trump viszonylag súlyos beteg volt annak idején. Véroxigén 90 alatt, állítólag, szemben a korábbi beszámolókkal.
• Tegnap felhoztam itt Tanzániát. Itt egy cikk különféle "okosságokkal" John Magufulitól, Tanzánia elnökétől a COVID-dal kapcsolatban. (1): "The president even praised Chinese Foreign Minister Wang Yi for not wearing a face mask during a visit this month, calling it another sign that Tanzania is free of the virus." (2): "If the white man was able to come up with vaccinations, then vaccinations for AIDS would have been brought, tuberculosis would be a thing of the past, vaccines for malaria and cancer would have been found. Be firm. Vaccines are inappropriate". Még egy kis kontextus ehhez. Magufuli nem nagy barátja a sajtószabadságnak sem. Szóval akár ebolajárványuk is lehet. A vért hányós eseteik Chunya körzetben történtek, a kongói határhoz viszonylag közel (ahol megint történés van sajnos).
• Ha már filovírusok (mint az Ebola, a Marburg, a Reston stb.), a Lloviu-vírus szekvenálását Kemenesi Gáborék csinálták meg tavaly, Magyarországon elhullott denevérekből dolgozva (embereket valószínűleg nem fertőző patogénről van szó). Ez nagyon off-topic a COVID-hoz képest, de... végül nem is. Denevérrel írott történetek XXVII. (Kieg.: cikk a témában. A dolgok úgy kezdődtek, hogy elhullott kb. 500 denevér a Bükkben, 2013-ban. Az orrukban alvadt vér volt.)
• Riport a long COVID-ról, Kaliforniából (Vox).
• A manausi P1-es variánsnál is a korábbiaknál gyorsabbnak találják a terjedést a brazil szervek.
• A bevezetőben jelzett B117+E484K variáns jól terjed, azt mutatják a genomszekvenálások.
• A magasabb jövedelműek gyorsabban jutnak vakcinához az Egyesült Államok nagy egyenlőtlenségek jellemezte szövetségi államaiban.
• Tanulási nehézségekkel küzdők újraélesztése szükségtelenné nyilvánítva. Hátrányok a vakcináció terén is, az emelkedett COVID-halálozási kockázat ellenére is. Nem, ez nem Németország az 1930-as években. Ez a járványfasizmus mai intézményesülése, történetesen az Egyesült Királyságban.
• Merkely Béla: "Mondok egy komoly számot: négymillió magyar már átesett a fertőzésen". Most az "átesett" szó kialakult vulgárvirológiai értelmezéseiről inkább nem beszélnék, de azért én is mondok egy komolyat erről a négymilliós becslésről: no fucking way.

2020.02.15-28.

• Q677P és Q677H. The new shit in town?
• A perui külügyminiszterről két állítással találkozunk lemondása kapcsán: (1) "soron kívül" kapott oltást, mondják róla. (2) "önkéntesként" kapta, a Sinopharm-vakcina vizsgálatában, mondja ő. Ha vizsgálati résztvevő lett volna, akkor persze nem nagyon tudhatná, hogy ő a vakcinát kapta. Hacsak nem csinált három héttel később egy antitest-vizsgálatot, huncut módon. Igazából az eset részletei mellett ezek után az is kérdéses nekem, hogy lehet-e még valódi vak beosztásos vizsgálatokat csinálni egyáltalán.
• Bhután sikerei a koronavírus ellen. Apró szépséghiba, hogy itt is áll, hogy "ha nem tesztelsz, nem vesztesz". Viszont kontaktkutatásban nagyot produkáltak, és az ilyen esetek láttán kénytelen az ember állandóan arra gondolni, hogy a fejlett országok bizonyos értelemben választották ezt a járványt. Nem teljesen tudatosan — de ahol nem fektetnek olyan primitív, de hatásos dolgokba, mint a kontaktkutatás, és ehelyett inkább elnézik a járvány futását, ott végső soron, az eredményeket tekintve mégiscsak ez mondható el.
• Azért ezen a ponton kiakasztó, és lassan nagyon komoly kérdéseket vet fel, hogy miért csak és kizárólag Peter Daszaket lehet megtalálni kérdésekkel a járvány eredetével kapcsolatban. Kecske + káposzta, stb.
• Mára érezhetően többen pedzegetik, hogy felelőtlenség volt az afrikai adatsivatagba Rorschach-teszt módjára mágikus védettséget beleképzelni.
• A világélelmezési helyzet is alakulgat.
• Havi öt antigén-gyorsteszt Ausztriában minden polgárnak.
• A dél-afrikai variáns (B1351) ugyanolyan valószínűséggel fertőzte a múltban a COVID-on átesetteket, mint az át-nem-esetteket, a Novavax-vakcina vizsgálatának placebo-csoportjában. Sőt, ez kifejezetten a súlyos esetekre is igaz — pedig már az is elég figyelemre méltó lehetett volna, hogy volt közöttük súlyos eset egyáltalán.
• Kanada, épületen belüli terjedés.
• Már írtam itt arról, hogy Izrael többek között kvázi-biolaborként jutott sok vakcinához. Friss cikk a Válaszon, további adalékokkal, például: "döntő szerepe volt annak is, hogy Netanjahu közeli kapcsolatot épített ki a Pfizer görög vezérigazgatójával, Albert Bourlával, aki híres thesszaloniki zsidó családból származik. A második világháború egyik legmegrendítőbb tragédiája, hogy a nácik Thesszaloniki spanyol eredetű szefárd zsidói közül alig hagytak életben valakit. Albert Bourla nagyszülei a túlélők között voltak. Megvolt a kapcsolati háló, a miniszterelnök meg tudta győzni a világ első engedélyezett oltóanyagának gyártóját, hogy kössenek előnyös üzletet."
• Ezen a ponton kijelenthetjük, hogy a WHO-vizsgálatban résztvevők bohóckodni vannak ott Kínában. A Wall Street Journal is kapisgálja már, hogy gáz van. Kecskék mentek káposzta után nyomozni. Érdekkonfliktusok állnak fenn. 
• Izgalmas kérdés, hogy képes Kína akadályozni BioNTech-vakcinák eladását Tajvan számára, és hogy pontosan miért, milyen szándékkal, minek a reményében? Tajvan ugyanis azt sugalmazza, hogy ez történhetett.
• A Palesztin Hatóság orosz donációs Szputnyik-vakcinát küld Gázába, Izrael engedélyével.
• Az E484K-mutációt is hordozó, a brit és a dél-afrikai variáns "legjobb" tulajdonságait ötvöző változat Ausztráliában is feltűnt, karanténhotelben.
• Kezdődnek a UK-ben a vírusfertőzéses kísérletek, 90 résztvevővel.
• Az orosz Vektor közben a permafrostból kiolvadó tetemekben kezd prehistorikus vírusok keresésébe.
• Wunderbar. A kaliforniai variáns L452R mutációja és a brit variáns 69-70del törlődése is megjelenik most már együtt az egyik új variáns esetében.
• Indiában a járvány szinte lecsengő szakaszba ért, az adatokból úgy tűnik. Az adatokból. Magyarázat erre pedig nem nagyon adódik.
• Észak-Koreában "nincsen járvány", csak maszkviselés, és valamiért vakcinát is hekkelnének maguknak.
• A Princetonon összedobtak pár hasznos dolgot az afrikai országok járványhelyzetének értékeléséhez.
• A neandertáli génekről ezúttal pozitív megvilágításban. Túlélési előnnyel asszociált haplotípus.
• Elnézést, hogy hirtelenjében a Daily Mail ismertetését linkelem csak. MRI alapján pl. ujjak üszkösödésével kapcsolatos problémákról COVID-nél. Fénykép is van, lehet kapaszkodni.
• A hazai vonalon történő dolgokról nem írtam, de talán nem is kell a kommentárom ahhoz, hogy látható legyen, nyitásról "kozultálgatgatni" nem túl sok értelme van, ha tényleg felcsap egy harmadik hullám.
• Szomorú történet, embertelenül rosszul megírt cikk.
• Az AstraZeneca marketingjének nem annyira tesz jót, hogy Dél-Afrikában leálltak vele, sem a kérdés, hogy végül is jó-e 65 év felett. Közben nyilvánosságra került az EU és az AstraZeneca közötti szerződés. És már Lengyelországban is észlelték a dél-afrikai változatot.
• Mivel a Pfizer elég látványosan működött Izraelben már egy dózis után is, kialakult egy ténylegesen szakmai, adatalapú vita arról, hogy a második dózis menetrendszerű beadása-e most a prioritás.
• Kieg. az AstraZeneca-történethez: minden másképp volt. EU-s szerződés egy nappal a brit előtt, azonos feltételekkel. 
• Vakcinációs adatok, Magyarország, hasznos.
• Ezt hívják jó üzletnek, ha összejön. Izrael szíriai fogoly szabadságát váltja meg a szíriai vakcináció támogatásával. Aligha hiányzik nekik egy járványgóc fekete lyuk a szomszédságban, szóval miért ne. Szputnyik beszerzésére vonatkozik a megállapodás.

2021.02.22-28.

• A várható élettartam csökkenése az Egyesült Államokban, egyenetlenül különféle etnikai csoportok tagjai között.
• Az Egyesült Királyságban a kontaktkutatással kifejezetten az új variánsokat próbálják levadászni jelenleg, és egész eredményesen, úgy tűnik.
• Tüdőátültetés, sajnos fertőzött személytől (akit negatívra teszteltek, mielőtt a szerveit felhasználták volna). Az átültetést végző sebész megfertőződött, majd meggyógyult. A személy, akinél az átültetést végezték, három nappal a transzplantáció után beteg lett, majd ekmóra került, és két hónappal az operáció után meghalt. A szervdonor vektor voltát a vírusgenom alapján is megerősítették.
• Kretén iskolai menedzsment, Kanada: a tanárok által a szellőzés érdekében kinyitogatott ablakokat lezárták.
• Jelentős hír: Jordániában február 15-én menekülttábori oltóközpont nyílt az óriási Zaatari táborban (gyakorlatilag egy nagyvárosról beszélünk).
• Új-Zélandon bolti dolgozó pozitív, ezért minden vásárlót értesítettek, így: "Therefore anyone who was at Kmart Botany, 500 Ti Rakau Drive, Botany Downs, at these times is considered a casual plus contact. If you are a casual plus contact, you are advised to immediately isolate at home and call Healthline on 0800 358 5453 for advice on isolation timeframes and testing requirements". Tanulságos, úgy gondolom, még mindig.
  
• Iskolák, szellőztetés. Legalább azért, hogy jobban tanuljanak — ha másért nem.
• USD10000 felett a kísérleti majmok ára a kínai forrás elapadása óta. Kellenének stratégiai majomtartalékok, pedzegetik egyesek — rézuszmajmok és makákók, főleg. Megjegyzem, egy tenyészprogramnak a biobiztonság szempontjából is van jelentősége, lásd pl. a Marburg- és a Reston-vírusok esetét korábbról, ahol importált majmokkal sikerült vírust is importálni.
• A WHO-vizsgálóbizottság ausztrál tagjától, Dominic Dwyertől. "We spoke to the scientists there. We heard that scientists’ blood samples, which are routinely taken and stored, were tested for signs they had been infected. No evidence of antibodies to the coronavirus was found. We looked at their biosecurity audits. No evidence" = Dwyer szerint: "Extremely unlikely the virus escaped from a lab". Az extrém szó használata itt elég... extrém.
• A WHO tavaly nyári kínai látogatásáról közben egy 2020. augusztus 10.i keltezésű anyag szivárgott ki, benne ezzel: "it appears that little had been done in terms of epidemiological investigations around Wuhan since January 2020. The data presented orally gave a few more details than what was presented at the emergency committee meetings in January 2020. No PowerPoint presentations were made and no documents were shared".
• A kiszivárgott anyagról szóló cikkből továbbra is, a fentebb idézett Dominic Dwyertől idézve: "Dominic Dwyer, an Australian infectious disease expert who was part of the investigation team, recently told reporters that the WHO had requested raw patient data from Chinese counterparts during its January 2021 mission but was only given a summary.Dwyer told Reuters that sharing anonymised raw data was standard practice for an outbreak investigation. He said raw data was particularly important in efforts to understand Covid-19 as only half of 174 initial cases had exposure to the now shuttered market where the virus was first detected.Advertisement“That’s why we’ve persisted to ask for that,” Dwyer said. “Why that doesn’t happen, I couldn’t comment.”"
• San Marino is beszerzett nagyobb adag Szputnyikot. Eddig nem jutottak vakcinához.
• A kaliforniai variáns gyorsabban is terjed és antitestszökő is. Emlékeztetőül, ezek a mutációi: ORF1a: I4205V; ORF1b: D1183Y; S: S13I; W152C; L452R.
• Már tényleg nem sokára itt lesz a Johnson and Johnson vakcina is. Ez jó hír. Viszont ez is vektoros, és kicsit a vektorok elhasználhatóságán tűnődöm ezzel kapcsolatban.
• Foglalkozási kockázatok mértéke a COVID-dal összefüggésben. A szakácsoktól a tanítókig terjedő spektrum 2020. októberi kaliforniai állapotok szerint, l. a 7. oldalon. A szakácsoknál 60%-os, a tanítóknál 28%-os növekmény az elvárható halálozáshoz képest.
• Vakcinadiplomácia: Izrael Jeruzsálem főváros státusának érvényesítéséért ad vakcinákat Csehországnak és Hondurasnak.
• Peruban gyűrűzik a "Vacunagate", a libanoni honatyák sem maradhattak le ezen a vonalon. Kieg. (II.26.): NYT-cikk, dél-amerikai körképpel a témában. Brazília, Suriname, Peru, Argentína.
• Orbán Viktor állítólag a Sinopharm vakcináját kapja majd.
• A Portfolio.hu szerkesztősége állást foglalt (elemzéssel támogatva) a hazai lazítás ellen, sőt.
• A variánsradaron újabb konfiguráció tűnt fel, ezúttal New Yorkból. Mutációk: L5F, T95I, D253G, "E484K or S477N", D614G, A701V. A variáns neve B.1.526.
• Svéd tweetből veszem, sokatmondó tényleg. Jacinda Ardern új-zélandi miniszterelnök 2020. márciusban: "I  will not tolerate tens of thousands of New Zealanders dying from COVID19". Stefan Löfven svéd miniszterelnök 2020. áprilisban: "We will count the dead in thousands. It is just as well that we prepare for it." Az adatokban ezek után az elvárható "apró kis különbségek" meg is mutatkoznak.
• Még egy részlet a WHO-féle "vizsgálatról". A jelentésükben állítólag az első jelenleg ismert beteg (egy negyvenes éveiben járó irodai dolgozó, férfi, házas, gyermekes) kontaktjainak felkutatását kérik. Tekintve, hogy a kínaiak nem hülyék (és ilyesmire nyilván maguktól is gondolhattak volna), és hogy a WHO a kínaiakat biztosan nem nézi hülyének... 
• Érdekelne egyébként, hogy ha korábban november 17-én kórházba felvett 55 éves páciens volt az első ismert eset, ez a negyvenes irodista mikor és hogyan került a látótérbe. A WHO felől csepegtettek olyan információkat az elmúlt napokban, hogy 2019 őszén korábbról is voltak esetek Kínában.
• A lengyel kormány hozott egy döntést, rendeletben, miszerint "az EU-ban forgalomba hozatalra engedélyezett" (dopuszczona do obrotu w Unii Europejskiej) vakcina felvételéről szóló igazolással vagy negatív teszttel lehet 14 nap karanténezés nélkül Lengyelországba belépni. Ezek hiányában karanténezéssel lehet. Most majd lehet kergetni az értelmezési kérdéseket. Az "EU-ban" nem feltétlenül ugyanaz, mint az "EU által", például (w Unii, albo prez Unię). Mindenesetre izgalmas, hogy miniszterelnökünk ezek után mivel oltakozik.
  
• És közben EU-s vakcinaútlevelet látnának már egyes tagországok.
• A parameter.sk dokumentumfilmje a dunaszerdahelyi COVID-osztályról.
• A Moderna-vakcina kvóta alatti magyar beszerzéséről. Kieg.: mindezt kormányzatilag a Moderna relatív drágaságával magyarázni a drágább Sinopharm beszerzése közben igényelte a vastag bőrt, az már biztos.
• Török gyerek megvágta, török gyerek gyógyítsa? Szijjártó Péter. És az oltási hajlandóság.
• Tűméretek problémája. H/t Dobson Szabolcs, Facebook. A Sinopharm a zsírral kevésbé kipárnázott kínai anatómiával tervezett, úgy tűnik.
• Gyorstalpaló ahhoz, hogyan kell értelmezni 94%-os és hasonló vakcinahatékonyságokat, amikor pl. Izraelből már tömegesen jönnek az adatok ezzel kapcsolatban.
• S: N679S. Ezzel a mutációval találtak gyermek fertőzöttet rekordmagas vírusszámmal még tavaly szeptemberben.
  
• Kontaktkutatás iskolákban. Mindenki fertőz mindenkit. HIHETETLEN (nem az), de még diák tanárt is. Őrület.
• Az iménti témában, gyerekek fertőződéséhez adalékul, Franciaországból. A brit variáns rendesen fertőzi őket, éppenséggel akár jobban is, mint másokat. Mintha éppen ez lenne az egyik fő evolúciós előnye.
• Egy cikk a Science-en, mely megpendíti a VAERD-vel kapcsolatos kérdéseket is az inaktivált vírusos vakcinákkal összefüggésben. Az egyértelműség kedvéért: nem várja senki, hogy egy ilyen vakcina VAERD-hez vezethet, de a tudományban adatokkal szokás dolgozni, és ahhoz a III. fázis adatai alapvető inputot kellene, hogy képezzenek.
• Ezt még nem linkeltem, de érdekes spekuláció az AAT (alfa-antitripszin) lehetséges szerepéről a D614G mutációval rendelkező variánsok fertőzékenységének földrajzilag egyenetlen alakulásában, konkrétan India vonatkozásában. A háttérben feltételezés arról, hogy a D614G tüskéjéből nem csak több van, és stabilabb, de van rajta még plusz egy hasítási hely is, neutrofil-elasztáz által hasítható — itt a tanulmány. Ezzel lényegében neutrofilek által mediált fertőzésfokozódásról beszélnek. In silico eredmény, tegyük hozzá.
• Idősotthon, súlyosabb újrafertőződésekkel. Esettanulmány Kentuckyból.
• Kínai tanulmány a BMJ-ben a kínai halálozástöbbletről: "Except in Wuhan, no increase in overall mortality was found during the three months of the covid-19 outbreak in other parts of China." Akkor pedig Wuhanban van a kutya elásva, ugyebár.
• Az afrikai adatsivatagról, először is egy érdekes és nyilvánvaló jelentőségű adalék: "in Africa it is only Egypt, South Africa, Tunisia, Algeria, Cape Verde, São Tomé and Príncipe, Seychelles and Mauritius that have what are called functioning, compulsory and universal civil registration systems - known as CRVS systems - which record deaths". (Európában Albániában és Monacóban nincs CRVS használatban.)
• Ugyanonnan: Egyiptomban tavaly csak május és augusztus között volt 68 ezer fő halálozástöbblet, 5421 fő hivatalos halálozás mellett 2020. aug. 31-ig. Ez a szokásos konzervatív módszeremmel (a többlet felét számolva): +34000 fő. G.a.h.: +787521+n.
• Tadzsikisztánban tavaly volt hivatalosan 90 COVID-haláleset, és 41743 fő halálozás, ami 26%-kal haladja meg a 2015-2019-es átlagot. Ebből következtetve volt 8613 fő halálozástöbblet. A különbözet 8523, amit itt 100%-ban figyelembe veszek a nyilvánvalóan komolytalan hivatalos adatokra tekintettel. G.a.h.: +797044+n.

2021.03.01-07.

• A Bamlanivimab mAb-kezelés előtt nem árt megnézni, hogy "Erik", vagyis az E484K mutáció ott van-e. Hogy értelme legyen a kezelésnek.
• A CNN "megfejtése" arról, mit toltak el a cseheknél. Én leegyszerűsítem. Jön Politikus Benő. Benő ránéz a számokra. 280 esetről vagy 720 esetről, vagy éppen 28 halottról vagy 72 halottról az jut eszébe, hogy "már csak 280/28", vagy "már csak 720/72". Nem az jut Benő eszébe, hogy "nem nulla". Ennyike :( Mindössze ennyire van szükség ahhoz, hogy eltolják a járványkezelést, és egy kis "meakulpázást" követően már jöjjenek is az újabb lezárások. 
• Mindent vagy semmit. A magyar védettségi igazolványban nem lesz benne, hogy kit, mivel oltottak. Így most vagy gond nélkül elfogadja majd minden másik EU-ország vagy nem.
• Kocsmai kvízjáték 300 eset forrásánál British Columbiában.
• A Pfizer-vakcina vizsgálatából magas BMI (testtömeg-index) esetén alacsonyabb antitest-titerek jönnek ki a második dózis után. De — félreértések elkerülése végett — a tanulmány alapján a túlsúlyos embereket is bőven megéri oltani: "The geometric mean concentration of antibodies among the vaccinated subjects after booster dose (285.9 AU/mL 95% CI: 249.5-327.7); was higher than that of human convalescent sera (39.4 AU/mL, 95% CI: 33.1-46.9), with p<0.0001." A túlsúlyos oltottaknál is magasabb az Ab-titer, mint a fertőzésen átesetteknél.
• Tatabánya, jelentős számú felmondás, például a radiológián, a kardiológián. A magyar egészségügyi rendszer válsága fokozódik. Nem jókor. Inkább katasztrofálisan rosszkor.
  
• Jahn Ferenc Dél-Pesti Kórház II. sz. Belgyógyászat, jelentős számú felmondás. 
• Szent Imre kórház, Budapest. 5/28 orvos és 17/54 ápoló távozik az intenzívről.
• Az Egyesült Államokban a J/J-féle Jansen-vakcinánál alacsonyabb hatékonyság jött ki, amit befolyásolhatott, hogy a legdurvább járványidőszakban tesztelték. És egy dózissal, booster nélkül. Így viszont meg kell küzdeni a társadalmi percepciókkal, hogy az eddig aluloltott, rosszabb helyzetű társadalmi csoportoknak küldése nem valamiféle diszkrimináció.
• Fertőződött magzat hipoxiásan jött a világra, aztán még egy A107G mutációt is kitermelt. (Svédország)
• Szlovákia is vesz Szputnyikot.
• Ha valaki még mindig nem értené, hogy az új variánsokkal a gyerekeken keresztül fűthető ez a járvány. Adatok Olaszországból.
• Egy lelkes svéd kutató, Jonas Ludvigsson elhallgatta a gyerekekkel kapcsolatos járványadatokat, hogy a "svéd stratégiát" ne zavarhassák meg olyan aljas dolgok, mint például a makacs tények. Tudott a gyerekek körében magasabb halálozásról, de egy befolyásos NEJM-levélpublikációban inkább más következtetésre jutott. És persze a tavalyi év egyik legundorítóbb förmedvényének, a Great Barrington Declarationnek az egyik aláírója is volt (korábban tételesen végigvettem ezen a blogon, hogy hol hamis az a szöveg, és hogy miféle dolgokért felelősek a hozzájárulók a járvány kapcsán). Remélem, hogy az ilyen embereket elkergetik végül a szakmából. A Karolinska Institutnak mindenesetre azt sem hiszem el, ha kérdeznek, amíg ilyen emberek dolgoznak ott.
• A magyar egészségügy közben tovább döcög, megint egy kicsit erőtlenebbül, ilyen fordulatoknak köszönhetően. Kb. 5500 eü. dolgozó azért távozik.
• A magyar oktatási rendszer problémájának is látom közben, hogy a pedagógusoknak csak 38%-a regisztrált oltásra. Tudom, a kínai vakcinával kapcsolatos zavaró kommunikáció stb., de azért ez akkor is kevés. Mondjuk a PDSZ szerint 85% akarja az oltást, de tartok tőle, hogy ennek az alapja valamiféle nem-egészen-tökéletesen-reprezentatív felmérés.
  
• Trump hiányában most az egyes szövetségi tagállamok hülyeségére van igény az Egyesült Államokban. A texasi kormányzó vezetésével többen is lazítások mellett döntöttek, pl. maszkviselés terén, még viszonylag alacsony átoltottság mellett. Az üzletek pedig nyithatnak teljes kapacitással. Kicsit olyan, mintha a maszkviselés oldásával jól ki akarnának tolni ezekkel az üzletekkel, nehogy biztonságosan nyitva maradhassanak. Trump hiányában a felelősséghárítás pedig most nem Washingtonból a szövetségi tagállamok felé irányul, hanem utóbbiak felől a megyei szint felé.
• Igazából eddig is volt már eredmény a kardiomiociták fertőzhetőségéről és a közöttük végzett pusztításról, de itt van egy újabb tanulmány.
• Úgy tűnik, hogy a T-sejtes keresztimmunitás (CD4+, CD8+) tekintetében nem olyan rossz a helyzet az új mutációkkal szemben. Tulajdonképpen a "kereszt" szó használata nem is annyira indokolt.
• Lehet, hogy a vakcináció segít a long COVID egyes esetein is? Némi nem-reprezentatív adat. És igazából nehéz bármit kiolvasni belőle. Mondjuk az AstraZeneca az oltott, 3-6 hónapnál hosszabb ideig long-COVID-osoknál nem jön ki jól az összehasonlításból, de nem tekintem perdöntőnek az itt hallottakat.
• A pajzsmirigy és a long-COVID összefüggése épp úgy érdekes egyébként, mint a pajzsmirigy szerepe (pl. károsodása) COVID alatt. Ezt most csak felírom, aztán később nézem az irodalmat.
• 2020. március 5.: What the actual fuck? Miért kellett regisztrálni a vakcinainfón, ha most ez van?
• Olaszország blokkolt egy Ausztráliába irányuló vakcinaszállítmányt, mondván, Ausztrália jelenleg nem "vulnerable", minek az most oda. A franciák és az Európai Bizottság is helyeselték a lépést.
• Az Egyesült Államokban a demokrata oldalon Cuomo NY-i kormányzó csapata sem tartózkodott a halottak számának szépítgetésétől.
• 17000 fős becslés az eü. dolgozók közötti halottakról, globálisan. Alábecslés. A Guardian monitorozása 3507 főnél jár csak az Egyesült Államokból.
  
• Ilyen az élet, tavaly tavaszról most kerül elém ez az olasz jelentés. STEMIVEL ("ST-elevációs infarktus") kerültek kórházba jópáran annak idején minden egyéb tünet nélkül — annyira, hogy ki is adták ajánlásban, hogy aki így érkezik, azt tesztelni kell azonnal. A magyar járványügy figyelmébe külön ajánlom a cikket "alapbetegségek" témában.
• Oroszország: +130230 fő addicionális haláleset felszámítva eddig. Tekintve, hogy a pandémia elejétől január végéig 394 ezer fős szezonális halálozástöbblet van Oroszországban, aminek konzervatívan a felét szoktam figyelembe venni, ez legalább +66770 fő járványhalálozás. G.a.h: +863814+n.
• Viszonylag sokféle dolgot tanultam életemben, hogy lehetőleg jó elemző legyek, de én erre nem vagyok felkészülve. Lesz — nem lesz — dezinformáció, hogy nem lesz — elhalasztódik — mégis van. A behívottak közül annak, aki a magyar viszonyok nálam jobb elemzőjeként számított erre. Le a kalappal a valódi tehetségek előtt!
• A brit variáns sajnos a dán adatok szerint is (64%-kal) jobb eséllyel küld kórházba. 
• Meanwhile in Boise, Idaho: az idahói gyerekekkel maszkot égettetős tüntikére egyszerűen nincsenek szavak. 

2021.03-08-14.

• A kínai Országos Népi Gyűlés tagjait a Sinopharm-vakcinával oltották be. Ezt ma Dobson Szabolcsnál láttam a Facebookon. Kritikusan megjegyezném, hogy a vak bizalom nem azonos a nem-tudott dolgok ismeretével, ugyebár. Egyébként 99%, hogy nem lesz semmi gond (gondunk és gondjuk), de hát a III. fázis... anyway.
• Izrael: 4,7 millió oltás után 153 súlyos mellékhatás csak (0,0032%). Ezek között volt szívmegállás és mellhártya-gyulladás például. Az ilyen esetekből 62/153 az első dózis után jelentkezett, 75%-nak volt valamilyen komolyabb alapbetegsége. Az enyhébb mellékhatások (pl. Bell-parézis) a 153-on felül értendők, ha jól olvasom ki a cikkből.
• Az NYT koronavariáns-követője.
• Az AstraZenecával kapcsolatban vizsgálódnak az osztrák hatóságok, egy tüdőembóliás és egy DIC-es eset kapcsán, volt-e okozati kapcsolat stb., ahogy ilyenkor kell. (Az érintettek klinikai dolgozók Zwettlben, a DIC-es eset halállal végződött.)
• Az alábbi ábrán tanulságok levonása érdekében jelöltem dolgokat. Izrael. Kilencmilliós népességű ország. Volt 800000+ regisztrált esetük, 5891 haláleset mellett. 53%-os az átoltottság. És ez történt február 20. óta a fertőzésének számával:

• Következtetések: (1) vakcinák nélkül most nagyon csúnya lenne az ottani helyzet; (2) vakcinákkal együtt is növekedésnek indulhat az esetek száma a még átoltatlan népesség soraiban (="hullám", bár ez itt láthatóan nyomottabb, mint a vakcinák által nem korlátozott terjedésnél); (3) Magyarországon az esetszámot az izraeli CFR alapján "normalizálva" 2168000 esetet kapunk. Nyilvánvaló, hogy Magyarországon bőven van még tere a járványnak, és bőven lesz tere két hét múlva is, akárhogyan is csűrjük-csavarjuk a számokat. A halálozási adatok pedig nem lesznek szépek két hét múlva.
• Igen fontos cikk a Telexen. Március eleji adatok arról, melyik vakcinából mennyit adtak be eddig nálunk, és mennyi van raktáron. Pfizer: 665873 beadva + 108667 raktáron; Moderna: 22912 beadva + 57488 raktáron; AstraZeneca: 83556 beadva + 160744 raktáron; Sinopharm: 158062 beadva + 391938 raktáron; Szputnyik: 19582 beadva + 26418 raktáron. Pfizerből, Modernából és AstraZenecából raktáron: 326899. Sinopharm és Szputnyik beadva: 177644. Következtetések: (1) a Sinopharm és a Szputnyik nem volt nélkülözhetetlen a vakcináció dinamikus folytatásához, mint ahogyan azt állították; (2) on the other hand, sikerült 158062 embert beoltaniuk az ezek szerint nem nélkülözhetetlen Sinopharm első dózisával.
• Oroszországban jelenleg 3,5% körüli az átoltottság - az exportra termelésnek itt jóval nagyobb ára van, mint Kínában, ahol nincs járvány.
• Adatok a Szputnyikról. Érdekes látni, hol van (már létező vagy tervezett) gyártókapacitás Oroszországon kívül. India, Dél-Korea, Olaszország, Kazahsztán. Ebből India és Dél-Korea a legfontosabb, 300 és 150 millió tervezett dózissal.
• Ha minden igaz, Izraelben a 935 februári COVID-halálesetből 239 volt túl az első oltáson, de ezek szerint még nem a védettség időablakában. Kieg.: egy brit vizsgálatban (REACT-2) 21 nappal az első Pfizer- vagy Moderna-dózis után a 80 év felettieknek például csak a 34,7%-a rendelkezett kimutatható antitest-titerrel, míg a 60-69 éves korcsoport esetében 70,6%. Két dózis után már a 80 év felettieknél is felmegy 87,8%-ra ez az érték.
• 50 év felett közben a 88%-ot is elérte már az átoltottság/átfertőzöttség Izraelben.
• Spanyol tanulmány: a gyerekek is fertőnek, és hasonló vírusszámokat produkálnak, mint a fertőzött felnőttek. Még az aszimptomatikus gyerekek is.
• Interjú Karikó Katalinnal. Két érdekes részlet: (1): "Míg az mRNS-t lehetséges nagy tételben létrehozni, és az azt körbeölelő lipidburok négyféle lipidjéből kettőt bárhol be lehet szerezni, valójában az ionizálható lipid szintézise jelenti a legnagyobb kihívást." (2): "Sokan kérdezik, miért kell -70 fokon tartani a vakcinát. Itt szintén az a helyzet állt elő, hogy erről van a legtöbb ismeretünk. Ha a 3-4 évvel korábban lefagyasztott mRNS-eket kivettük a tárolásból, utána teljes mértékben használhatók voltak. Nem volt tapasztalatunk arról, mi történik -20 fokon. Most úgy állunk, hogy az utóbbi hűtési hőmérsékleten a vakcina hat hónapig áll el, de utána ki kell dobni."
• A járvány hatása a gyermekvállalásra, gyermekek születésére. 9 hónappal a pandémia kezdete után megmutatkozik. És negatív.
• A Favipiravir vényköteles otthoni felhasználása figyelemre méltó fejlemény nálunk. Ha a tesztelés gyorsan lezajlik, és mindenki más (háziorvos, beteg) is gyorsan lép, meg lehet vele előzni súlyos eseteket. Minél közelebb kerülünk az ezer lélegeztetett ellátása körül fennálló kapacitáshatárhoz, melyet dr. Merkely Béla körvonalazott a napokban, annál nagyobb jelentősége lehet ennek. Mint több más antivirális szer, ez is nukleotidanalóg, vagyis trójai falovunkként vágtat a tett helyszínére, hogy a vírus RNS-dependens RNS-polimerázának a működésébe jól bezavarjon, és a vírus-RNS-be beépülve azt működésképtelenné tegye. Kieg.: tanulmányok a hatásosságáról itt (review) és itt (RCT).
• Egy vizsgálat, sok adattal, ahol a long COVID úgy alakult ki 32%-nál, hogy a pozitívra tesztelés utáni első tíz napban nem volt tünetük. További bizonyíték, hogy a long COVID predikciója nem következik az akut fertőzés lefolyásának súlyosságából. Emlékeztetőül pedig: a long COVID okai között lehet pl. szervi károsodások elhúzódó hatásainak jelentkezése, virális fertőzés utáni kimerültség, intenzív osztályi kezelés utóhatása, elhúzódó tünetesség (talán perszisztáló fertőzés miatt), plusz autoimmun zavar is.
• A pollen a levegőben ugyanúgy súlyosbíthatja a COVID lefolyását, mint a szálló por és az egyéb légszennyezettség.
• Gazdaszervezeten belüli evolúciós folyamatok - within-host evolúció. Bonyolult, de további insightok a nem-csendes pontmutációk terjedését illetően.
• Hárommillió AstraZeneca-oltás után van jelentve 22 thromboembóliás esemény (poszt-vakcinációsan, de nem automatikusan post hoc ergo propter hoc). Az ABV5300-as szériához kötődik 4 ilyen. Vizsgálatok, leállások. Dánia, Norvégia, Izland az AZ-vakcinákkal teljesen, Olaszország, Észto., Letto., Litvánia és Luxemburg csak konkrétan az ABV5300-as szériával. (Széria = "sarzs".)
• Izraelben is, többek között, zajlik már a vakcinatesztelés gyerekeknél. Pfizer, AstraZeneca in.
• Bértámogatásban részesülő munkavállalók arányának EU-s összehasonlítása: Magyarország az utolsó helyen. Közben március 10-i állás szerint Mo. a második helyen a beadott első dózisok lakosságarányos számával, első helyen a beszerzett készletet tekintve. Ha nagyon belegondolunk, ebben összefüggés is felfedezhető.
• Fontos cikk a Politicón Josh Rogintól a járvány eredetéről.
• Fentebb idéztem izraeli adatokat arról, hányan haltak meg az első oltásuk után, még a védettség időablakán kívül. A dózisok távolítása egymástól lehet egyes eredmények szerint hatásos a kialakított immunválasz szempontjából, de az halott embereknek nem használ. Közben pedig itt van eredmény arról, hogy mivel a rákbetegeknél is gyenge az immunválasz az első dózis után, a booster shotnak hamarabb kell jönnie. Ha engem kérdeznek, immunkompromittáltaknál és 65 év felettieknél nem érdemes a dózisok távolításával játszani.
• Excess deaths, hozzászámítások az FT nyomkövetéséből származó adatokból, január végéig, február elejéig bezárólag jellemzően. Portugáliából eddig volt 4917, most +6278. Ecuadorból volt eddig 17578, most +2076. Csehországból eddig volt 2886, most +6685. Lengyelországból volt eddig 8273, most +26481. Ausztriából volt eddig 3191, most +1723. Bulgáriából volt eddig 4701, most +4647. Svédországból volt eddig 3708, most +2176. Franciaországból volt eddig 24183, most +7751. Németországból volt eddig 12127, most +12273. Az Egyesült Királyságból volt eddig 40650, most +17826. Hollandiából volt eddig 8593, most +1215. Izraelből volt 200 eddig, most +1859. Mexikóból volt eddig 100965, most +66797. Bolíviából volt eddig 10000, most +4653. Belgiumból eddig nem volt adatom, most +10084. Brazíliából eddig nem volt adat, msot konzervatívan +111000. Összesen: +283416. G.a.h.: +1147338+n.
• Kurz kancellár Ausztria részéről az EU-s országok eltérő lakosságarányos vakcinaellátottságát látva megpendítette, hogy szerinte itt különalkukat köthettek egyesek, Málta, Hollandia és Horvátország például.

Folytatás újabb bejegyzésben, itt.